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基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型
1
作者
孙希野
蒋灿
+4 位作者
罗旭
舒佩
王森
周科讯
黄媚娟
《四川大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期335-345,共11页
为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因...
为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因组图谱(TCGA)-ESCA队列中进行验证,同时分析不同风险组肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况.结果显示训练队列中低风险组的生存明显优于高风险组(P<0.05).训练队列中低风险组与高风险组患者相比有更多CD4+T细胞,低风险组中CD8A、GZMB、PRF1的表达水平高于高风险组(P<0.05).以上结果表明基于焦亡和铁死亡基因组学所构建的ESCA预后模型可为食管癌患者的临床治疗提供参考.
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关键词
食管癌
焦亡
铁死亡
预后风险模型
公共数据库
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职称材料
题名
基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型
1
作者
孙希野
蒋灿
罗旭
舒佩
王森
周科讯
黄媚娟
机构
四川大学华西
医院
肿瘤中心胸部肿瘤科
四川大学华西
医院
心内科
成都
上
锦
南府
医院
心内科
中国科学院
成都
计算机应用研究所
中国科学院大学
四川大学华西
医院
临床试验中心
四川大学华西
医院
肿瘤中心腹部肿瘤科
出处
《四川大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期335-345,共11页
基金
四川大学华西医院临床研究孵化项目重点项目(2021HXFH055)。
文摘
为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因组图谱(TCGA)-ESCA队列中进行验证,同时分析不同风险组肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况.结果显示训练队列中低风险组的生存明显优于高风险组(P<0.05).训练队列中低风险组与高风险组患者相比有更多CD4+T细胞,低风险组中CD8A、GZMB、PRF1的表达水平高于高风险组(P<0.05).以上结果表明基于焦亡和铁死亡基因组学所构建的ESCA预后模型可为食管癌患者的临床治疗提供参考.
关键词
食管癌
焦亡
铁死亡
预后风险模型
公共数据库
Keywords
Esophageal cancer
Pyroptosis
Ferroptosis
Prognostic risk model
Public database
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型
孙希野
蒋灿
罗旭
舒佩
王森
周科讯
黄媚娟
《四川大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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