基于线粒体COI基因序列探讨广西钦州湾牡蛎的遗传分化 被引量：18

1

作者 李咏梅 陈秀荔 +6 位作者 彭敏 马宁 黎铭 杨春玲 蒋伟明 曾地刚 陈晓汉 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2009年第3期60-65,共6页

【目的】初步了解我国广西钦州湾牡蛎的遗传多样性及其分类和系统进化情况。【方法】以采自广西钦州湾的37个白肉牡蛎和29个红肉牡蛎个体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)的部分序列进行PCR扩增和序列比对,检测牡蛎的遗传多样... 【目的】初步了解我国广西钦州湾牡蛎的遗传多样性及其分类和系统进化情况。【方法】以采自广西钦州湾的37个白肉牡蛎和29个红肉牡蛎个体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)的部分序列进行PCR扩增和序列比对,检测牡蛎的遗传多样性;计算牡蛎不同单倍型及GenBank中已登载的4种牡蛎间的遗传距离,采用聚类分析方法,构建其NJ和UPGMA系统进化树。【结果】66个白肉牡蛎和红肉牡蛎线粒体COI基因片段的PCR产物大小约为600 bp,扩增产物纯化并去除引物序列后获得约535 bp的核苷酸序列;碱基组成平均为:T 37.5%,C18.2%,A 23.8%,G 20.5%,A+T 60.5%,C+G 39.5%,A+T含量高于G+C含量。运用DNAStar软件对66个钦州湾牡蛎序列进行比对,白肉牡蛎中共检测到4个多态位点,包括3个转换位点和1个颠换位点,有4种单倍型;红肉牡蛎中共检测到26个多态位点,转换位点和颠换位点各13个,有3种单倍型。GenBank中香港牡蛎COI序列与白肉牡蛎的遗传距离为0.000,有明巨牡蛎COI序列与红肉牡蛎的遗传距离为0.011,白肉牡蛎与红肉牡蛎的遗传距离为0.146;NJ和UPGMA系统进化树表明,白肉牡蛎与红肉牡蛎亲缘关系较远,白肉牡蛎与香港牡蛎聚为一支,红肉牡蛎与有明巨牡蛎聚为一支。【结论】序列特征、遗传距离和系统进化树分析结果表明,COI基因可用于牡蛎的种类鉴定和系统发育分析。 展开更多

关键词 牡蛎 COI基因 线粒体 广西

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钦州湾牡蛎线粒体16S rRNA和COⅠ基因片段的序列变异分析 被引量：14

2

作者 李咏梅 陈秀荔 +1 位作者 赵永贞 陈晓汉 《广东海洋大学学报》 CAS 2009年第3期11-18,共8页

利用线粒体16S rRNA基因和线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因片段初步研究钦州湾牡蛎(Ostrea)的物种组成。以特异引物进行PCR扩增,对扩增产物进行纯化、测序,分析表明,16S rRNA基因部分长度为413bp,COⅠ基因... 利用线粒体16S rRNA基因和线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因片段初步研究钦州湾牡蛎(Ostrea)的物种组成。以特异引物进行PCR扩增,对扩增产物进行纯化、测序,分析表明,16S rRNA基因部分长度为413bp,COⅠ基因部分长度为535bp,2种牡蛎序列的碱基组成均显示出较高的A+T比例:16S rRNA基因59.8%;COⅠ基因60.5%。对位排序比较表明,16S rRNA片段种内个体间变异较小,存在7个变异位点,4种单倍型,其中包括5个转换位点突变,2个颠换位点突变;COⅠ片段有30个碱基存在变异,7种单倍型,其中包括16个转换位点突变,14个颠换位点突变。运用MEGA4软件计算出不同个体间的遗传距离,并构建了NJ和UPGMA系统树。香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)16S rRNA和COⅠ序列与白肉牡蛎的遗传距离均为0.000,有明巨牡蛎(Crassostrea ariakensis)16S rRNA和COⅠ序列和红肉牡蛎(red meat ostrea)的遗传距离分别为0.000和0.011,白肉牡蛎16S rRNA和COⅠ序列和红肉牡蛎之间的遗传距离分别为0.035和0.146。结果表明,钦州湾牡蛎分为2个不同的种,线粒体16S rRNA和COⅠ基因在种间存在明显的多态性,证实了16S rRNA和COⅠ基因序列适用于牡蛎的系统学分析。 展开更多

关键词 牡蛎 线粒体 16SRRNA基因 COⅠ基因 序列分析 钦州湾

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对虾白斑病毒VP15基因的RNA干扰体外研究

3

作者 黎铭 陈晓汉 +8 位作者 马春霞 蒋伟明 马宁 熊建华 彭金霞 陈秀荔 彭敏 曾地刚 李咏梅 《水生态学杂志》 北大核心 2010年第5期56-61,共6页

VP15是南美白对虾WSSV病毒的一个核衣壳蛋白基因。采用体外干扰实验筛选对VP15具有针对性的siRNA。实验构建了真核表达载体pEGFP-VP15,并将设计的siRNA以及pEGFP-VP15共转染BHK细胞。采用Western blot方法检测GFP-VP15融合蛋白的表达,... VP15是南美白对虾WSSV病毒的一个核衣壳蛋白基因。采用体外干扰实验筛选对VP15具有针对性的siRNA。实验构建了真核表达载体pEGFP-VP15,并将设计的siRNA以及pEGFP-VP15共转染BHK细胞。采用Western blot方法检测GFP-VP15融合蛋白的表达,半定量RT-PCR方法检验siRNA抑制VP15基因转录的效果。实验结果表明,pEGFP-VP15在PK细胞正常表达,设计的3对siRNA对GFP-VP15的mRNA转录均有不同程度的干扰效果;其中,siRNA1的干扰效果最为显著。实验结果为下一步对虾体内干扰WSSV病毒复制研究以及筛选更多的特异siRNA建立基础。 展开更多

关键词 WSSV VP15 RNA 干扰

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尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)不同月龄性状的主成分与判别分析 被引量：23

4

作者 唐瞻杨 肖俊 +4 位作者 李莉萍 朱佳杰 罗永巨 黄姻 甘西 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期288-293,共6页

采用主成分与判别分析的方法,研究尼罗罗非鱼形态性状的增长规律,并判定其最佳生长季节体格与月龄的关系。选择2—5月龄尼罗罗非鱼各100尾,测量体长、头长、躯干长、体高、尾柄长、尾柄高、体宽和体重共8个性状,并对其进行主成分与判别... 采用主成分与判别分析的方法,研究尼罗罗非鱼形态性状的增长规律,并判定其最佳生长季节体格与月龄的关系。选择2—5月龄尼罗罗非鱼各100尾,测量体长、头长、躯干长、体高、尾柄长、尾柄高、体宽和体重共8个性状,并对其进行主成分与判别分析。主成分分析结果表明:尼罗罗非鱼各月龄的体型特征参数间均有不同程度的正相关(P<0.05),体重与体长、体高的相关性最显著;不同月龄尼罗罗非鱼性状的主成分有所不同,主成分1:2—5月龄均相同为增重因子;主成分2:2—4月龄均为尾柄因子,而5月龄是躯干因子;主成分3:2月龄是头部因子,3—4月龄是躯干因子,5月龄是尾柄因子。通过建立判别式来判断错过最佳生长季节尼罗罗非鱼的体格与大小相符的月龄,判别结果表明,总的判别准确率为99.25%,其中2—4月龄尼罗罗非鱼的判别准确率为100%。 展开更多

关键词 尼罗罗非鱼 主成分分析 判别分析

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吉富罗非鱼家系构建及抗病力检测 被引量：19

5

作者 朱佳杰 李莉萍 +3 位作者 唐瞻杨 周宇 罗永巨 甘西 《南方水产科学》 CAS 北大核心 2012年第6期22-27,共6页

文章以吉富罗非鱼(GIFT strain Oreochromis niloticus)为研究对象,按照1雄配1雌原则进行家系配对,待家系鱼生长至50～60 g·尾-1时人工感染无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(菌株GD001)。通过对GD001菌株半数致死浓度测定及... 文章以吉富罗非鱼(GIFT strain Oreochromis niloticus)为研究对象,按照1雄配1雌原则进行家系配对,待家系鱼生长至50～60 g·尾-1时人工感染无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(菌株GD001)。通过对GD001菌株半数致死浓度测定及各家系感染死亡率的统计,研究了GD001无乳链球菌感染对各家系吉富罗非鱼抗病力的影响。结果表明,1)配对成功家系67个,经繁殖性能筛选后留种53个,家系留种率为79.1%;2)GD001菌株的半数致死浓度为4×108cfu·mL-1,感染后2～6d为死亡高峰期;3)GD001菌感染53个家系后有11个家系的成活率在90%以上,15个家系的成活率在70%～89%,19个家系的成活率在30%～69%,8个家系的成活率低于30%,表明不同家系对GD001菌株的抗病力存在着显著的差异(P<0.05)。 展开更多

关键词 吉富罗非鱼 家系 抗病力 无乳链球菌

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罗非鱼育种研究进展 被引量：15

6

作者 肖俊 甘西 罗永巨 《湖南科技大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第1期106-112,共7页

罗非鱼是世界性的养殖鱼类,同时也是我国水产业重要养殖品种.我国罗非鱼产业发展迅速,罗非鱼养殖产量、产值和出口额均居世界第一位.但由于引种时间较长,我国罗非鱼繁殖也较普遍的存在种质退化的问题.针对罗非鱼育种研究,从选择育种、... 罗非鱼是世界性的养殖鱼类,同时也是我国水产业重要养殖品种.我国罗非鱼产业发展迅速,罗非鱼养殖产量、产值和出口额均居世界第一位.但由于引种时间较长,我国罗非鱼繁殖也较普遍的存在种质退化的问题.针对罗非鱼育种研究,从选择育种、杂交育种、细胞工程育种及分子辅助育种几个方面对其育种的基本原理和应用技术进行了系统的阐述,希望较全面的反应国内外罗非鱼育种研究的进展和动态,并对今后科研工作者开展罗非鱼良种繁育工作提供参考. 展开更多

关键词 罗非鱼 品种 育种

原文传递

尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)生长相关分析及生长模型构建 被引量：10

7

作者 肖俊 凌正宝 +6 位作者 唐瞻杨 罗永巨 郭忠宝 郭恩彦 严欣 张明 甘西 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1272-1278,共7页

运用Pearson相关分析对尼罗罗非鱼可量性状进行分析,并采用Logistic、Gompertz、Bertallanffy三种非线性模型对尼罗罗非鱼生长相关参数进行生长模型构建,以研究尼罗罗非鱼的生长发育规律。结果表明:尼罗罗非鱼各形态性状与体重之间的相... 运用Pearson相关分析对尼罗罗非鱼可量性状进行分析,并采用Logistic、Gompertz、Bertallanffy三种非线性模型对尼罗罗非鱼生长相关参数进行生长模型构建,以研究尼罗罗非鱼的生长发育规律。结果表明:尼罗罗非鱼各形态性状与体重之间的相关系数均达到极显著水平(P<0.01),体重与全长、体长、体高的相关性相对显著,与尾柄长的相关性不明显。生长模型研究结果表明:三种模型均能很好地模拟尼罗罗非鱼生长曲线,拟合度(R2)均高于0.983,其中以Logistic模型的拟合度最高(R2=0.991),运用这3种模型对尼罗罗非鱼进行生长曲线的拟合和比较分析较为可行。 展开更多

关键词 尼罗罗非鱼 相关分析 生长模型

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凡纳滨对虾MT基因序列及其在卵巢发育和低温胁迫中的表达分析 被引量：8

8

作者 彭金霞 房振峰 +7 位作者 韦嫔媛 胡睿宇 李咏梅 蒋伟明 陈秀荔 赵永贞 李文红 陈晓汉 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期678-683,共6页

在低温处理仔虾全长cDNA文库的筛选测序中,获得凡纳滨对虾(Litopenaeus vannmei)金属硫蛋白基因全长cDNA序列,该序列含有425个碱基,包含177 bp开放阅读框,上游98 bp的非编码区及下游150 bp的非编码区,编码58个氨基酸,其中半胱氨酸含量丰... 在低温处理仔虾全长cDNA文库的筛选测序中,获得凡纳滨对虾(Litopenaeus vannmei)金属硫蛋白基因全长cDNA序列,该序列含有425个碱基,包含177 bp开放阅读框,上游98 bp的非编码区及下游150 bp的非编码区,编码58个氨基酸,其中半胱氨酸含量丰富,富含金属硫蛋白典型的Cys-X(1-3)-Cys结构。多序列比对表明,凡纳滨对虾MT蛋白序列与美洲螯龙虾(Homarus americanus)MT蛋白序列具最高同源性72.4%。Real-time PCR结果表明,凡纳滨对虾MT基因在卵巢组织中呈优势表达,在不同发育期的卵巢中的表达量都很高,在低温处理凡纳滨对虾肝胰腺组织中上调表达。实验所得结果为研究凡纳滨对虾金属硫蛋白基因在生殖发育和低温应激中的功能提供了参考。 展开更多

关键词 凡纳滨对虾 金属硫蛋白 低温 卵巢

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凡纳滨对虾养殖池塘pH值、碱度、硬度和CO_2浓度作用机理与调控 被引量：7

9

作者 王大鹏 何安尤 +2 位作者 谢达祥 李长伙 陈晓汉 《江苏农业科学》 北大核心 2013年第5期352-353,共2页

分析了pH值、碱度、硬度和CO2浓度之间的相互作用机理,从促进光合作用、对氨及重金属毒性的影响等方面阐述了各指标在凡纳滨对虾养殖水质管理中的重要性,并提出了以碱度和硬度作为重点池塘水质调控指标的概念,以农业石灰作为碱度和硬度... 分析了pH值、碱度、硬度和CO2浓度之间的相互作用机理,从促进光合作用、对氨及重金属毒性的影响等方面阐述了各指标在凡纳滨对虾养殖水质管理中的重要性,并提出了以碱度和硬度作为重点池塘水质调控指标的概念,以农业石灰作为碱度和硬度的调节剂,以农业石膏作为硬度的单独调节剂,维持池塘水质稳定,提高凡纳滨对虾养殖成功率。 展开更多

关键词 PH值 碱度 硬度 CO2浓度 凡纳滨对虾 池塘养殖

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温度诱导对吉富罗非鱼雄性率的影响 被引量：5

10

作者 朱佳杰 李莉萍 +6 位作者 甘西 唐瞻杨 谢尔登 林勇 陈忠 黄姻 罗永巨 《安徽农业科学》 CAS 2012年第2期830-831,862,共3页

[目的]研究温度诱导对吉富罗非鱼鱼苗雄性率的影响,为大规模通过温度诱导生产高雄性率吉富罗非鱼鱼苗奠定基础。[方法]以吉富罗非鱼(genetically improved farmed tilapia)家系鱼苗为研究材料,探讨不同温度、不同发育时期和处理时间对... [目的]研究温度诱导对吉富罗非鱼鱼苗雄性率的影响,为大规模通过温度诱导生产高雄性率吉富罗非鱼鱼苗奠定基础。[方法]以吉富罗非鱼(genetically improved farmed tilapia)家系鱼苗为研究材料,探讨不同温度、不同发育时期和处理时间对鱼苗雄性率的影响。[结果]不同温度持续诱导卵黄囊发育第5天的鱼苗10 d后,CK和试验组之间雄性率差异极显著(P<0.01),各组的雄性率呈一个抛物线状,以36.0℃诱导的雄性率最高,达到89.5%;卵黄囊发育第0天、第5天和第10天鱼苗经36.0℃持续诱导10 d,3组间的雄性率差异显著(P<0.05),以第0天组诱导效果最佳,雄性率达到96.1%;对卵黄囊发育第5天鱼苗36.0℃进行不同时间诱导结果显示,7d的雄性率最低为79.4%,超过10 d的雄性率均达到91%,7 d组与其他试验组间差异显著。[结论]高温诱导能显著提高吉富罗非鱼鱼苗的雄性率,其中以第0天卵黄囊苗36.0℃持续诱导10 d以上的雄性率效果最佳。 展开更多

关键词 吉富罗非鱼 温度 雄性率

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低温胁迫对罗非鱼生理生化指标的影响 被引量：5

11

作者 黄姻 唐章生 +5 位作者 林勇 陈忠 杨慧赞 张永德 彭婷 张妍 《水产科技情报》 北大核心 2012年第4期193-197,共5页

为研究低温胁迫对尼罗罗非鱼血液生理生化指标的影响,进行了不同温度下尼罗罗非鱼血液生化指标的影响试验。研究发现:⑴在外界环境温度从28℃降至16℃时,罗非鱼血液中的谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、葡萄糖(GLU)含量均有下降或显... 为研究低温胁迫对尼罗罗非鱼血液生理生化指标的影响,进行了不同温度下尼罗罗非鱼血液生化指标的影响试验。研究发现:⑴在外界环境温度从28℃降至16℃时,罗非鱼血液中的谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、葡萄糖(GLU)含量均有下降或显著下降;但当温度继续降至10℃时,这些指标均显著上升,恢复或超过常温下的水平。⑵血红蛋白浓度(HGB)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)和平均红细胞血红蛋白浓度(MCHC)3个指标均明显升高。相对于16℃组,12℃组的红细胞分布宽度变异系数(RDW-CV)显著下降;但相对于28℃组,10℃组RDW-CV的变化不显著。相对于16℃或12℃组,10℃组的平均血小板体积(MPV)和血小板比率(P-LCR)均显著升高,但是10℃组与28℃组间差异均不显著。⑶相关分析结果表明,HGB、MCH、MCHC与胁迫温度显著相关,平均红细胞压积(MCV)与水温呈正相关,其中MCV和MCHC两个指标呈极显著负相关。HGB、MCH、MCHC和MCV可作为低温胁迫的生理指标。 展开更多

关键词 低温胁迫 罗非鱼 生理生化指标

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分子标记技术在牡蛎遗传育种中应用研究进展 被引量：3

12

作者 陈秀荔 李咏梅 陈晓汉 《广西农业科学》 CSCD 2008年第5期691-695,共5页

牡蛎是一种重要的经济双壳贝类,利用分子标记技术研究牡蛎的遗传多样性,对牡蛎的遗传育种具有重要意义。文章综述了几种常见的DNA标记技术如RFLP、RAPD、AFLP、微卫星、SNP和EST等在牡蛎遗传育种中的应用及其在牡蛎遗传多样性与遗传图... 牡蛎是一种重要的经济双壳贝类,利用分子标记技术研究牡蛎的遗传多样性,对牡蛎的遗传育种具有重要意义。文章综述了几种常见的DNA标记技术如RFLP、RAPD、AFLP、微卫星、SNP和EST等在牡蛎遗传育种中的应用及其在牡蛎遗传多样性与遗传图谱构建等方面的研究进展,分析了分子标记技术在牡蛎遗传育种研究中存在的问题,提出今后应建立包括牡蛎品种的形态学和分子信息在内的种质库,研究牡蛎的遗传多样性,并应用分子标记技术标记一些特异性基因,进行牡蛎的遗传选育。 展开更多

关键词 分子标记 牡蛎 遗传多样性 遗传图谱

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斜带石斑鱼苗种繁育生物饵料选择与培养 被引量：2

13

作者 王大鹏 谢达祥 +2 位作者 李长伙 曹占旺 甘西 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第8期241-243,共3页

根据广西的自然条件和产业现状,选择单胞藻、轮虫、丰年虫无节幼体、南美白对虾无节幼体作为斜带石斑鱼苗种繁育的生物饵料系列,并阐述了培养方法及生产实践中的一些经验。

关键词 斜带石斑鱼 苗种繁育 生物饵料

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罗非鱼种鱼性能测定方案探讨

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作者 唐章生 林勇 +2 位作者 杨慧赞 张永德 陈忠 《贺州学院学报》 2012年第2期144-146,共3页

制定罗非鱼种鱼性能测定方案,须从生产性能测定的一般原则、育种材料养殖性能评估试验和现场性能测定的技术规程等方面进行探讨。只有这样做出的方案,才能为罗非鱼育种工作提供参考依据。

关键词 罗非鱼 生产性能 测定方案

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