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LncRNA LBX2-AS1在结肠癌中生物信息学分析及初步验证
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作者 李梦婷 韦柳萍 张志杰 《中国医药科学》 2024年第13期4-7,28,共5页
目的基于生物信息学角度探讨长链非编码RNA(LncRNA)LBX2反义RNA1(LBX2-AS1)对结肠癌预后的影响并进行初步验证。方法在基因表达交互分析(GEPIA)数据库查找并明确与结肠癌预后密切相关的基因LBX2-AS1,在UCSCxena数据库中下载结肠癌数据集... 目的基于生物信息学角度探讨长链非编码RNA(LncRNA)LBX2反义RNA1(LBX2-AS1)对结肠癌预后的影响并进行初步验证。方法在基因表达交互分析(GEPIA)数据库查找并明确与结肠癌预后密切相关的基因LBX2-AS1,在UCSCxena数据库中下载结肠癌数据集(TCGA-COAD)及生存信息,并分为LBX2-AS1高低表达组后绘制生存曲线。分别检测临床标本结肠癌及癌旁组织中LBX2-AS1的表达并分析其与结肠癌临床病理特征的相关性。沉默SW480细胞株LBX2-AS1表达后,通过细胞增殖实验、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验检测各组细胞的增殖、侵袭和转移能力。结果通过GEPIA数据库检索发现LBX2-AS1与结肠癌患者的预后密切相关。UCSCxena数据库下载TCGA-COAD的生存信息分析提示,随着生存时间延长,高表达LBX2-AS1组存活例数明显少于低表达组;与癌旁组织比较,LBX2-AS1在结肠癌组织中明显高表达,且表达水平与患者年龄、性别临床参数无关,与结肠癌的病理分期及淋巴结转移呈正相关。沉默LBX2-AS1后结肠癌细胞SW480细胞增殖率明显降低,划痕距离明显增宽,侵袭细胞数明显减少,差异有统计学意义(P<0.05)。结论基于生物信息学分析,结合临床数据及细胞实验验证,LncRNA LBX2-AS1在结肠癌中起促癌作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA LBX2-AS1 结肠癌 侵袭 转移
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