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题名壮方消积化肝方通过调控铁死亡治疗肝癌的作用机制
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作者
蒋俊娥
王振常
罗艺徽
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机构
广西中医药大学研究生院
广西国际壮医医院脾胃肝病科二区
广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室
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出处
《广西医学》
CAS
2024年第9期1373-1382,共10页
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基金
国家自然科学基金(81960910)
广西自然科学基金(2020GXNSFDA297021)
+3 种基金
2023年广西中医药多学科交叉创新团队项目(GZKJ2311)
广西中医药重点学科中医肝胆病学学科项目(GZXK-Z-20-06)
王振常广西名中医工作室建设项目(GZY2024024)
广西中医药大学校级课题重点项目(2023ZD009)。
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文摘
目的 基于网络药理学及生物信息学方法探讨壮方消积化肝方通过调控铁死亡治疗肝癌的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选消积化肝方的活性成分及其作用靶点;通过Dis Ge NET、Gene Cards?、OMIM?数据库筛选肝癌相关靶点;通过Gene Cards?、Ferr Db数据库筛选铁死亡相关靶点。将上述三类靶点的交集靶点导入STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,并利用Cytoscape 3.8.0软件基于拓扑参数对交集靶点进行排序。通过Metascape数据库对交集靶点进行功能及通路富集分析。利用Cytoscape 3.8.0软件构建“消积化肝方活性成分-交集靶点-KEGG信号通路”网络,通过度值筛选核心活性成分。利用GEPIA2数据库分析交集靶点在正常肝组织与肝癌组织中的表达差异,以筛选核心靶点。使用Auto Dock Tools 1.5.6软件对核心活性成分及核心靶点对应蛋白进行分子对接分析。结果 获得消积化肝方活性成分的作用靶点197个、肝癌相关靶点1 578个、铁死亡相关靶点692个,取交集后获得交集靶点36个。交集靶点参与的生物学过程主要有程序性细胞死亡的正向调控、凋亡信号通路的调控等,富集的细胞组分主要有膜筏、膜微区等,涉及的分子功能主要有RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录因子结合等;交集靶点主要富集的信号通路包括癌症相关通路、白细胞介素17信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、缺氧诱导因子1信号通路等。筛选得到槲皮素、山柰酚、异鼠李素、异泽兰黄素4个核心活性成分,PARP1、CAV1、CDKN2A、HSPB1、NQO1 5个核心靶点。分子对接分析结果提示,核心活性成分与核心靶点对应蛋白具有较强的结合力。结论 壮方消积化肝方中的槲皮素、山柰酚、异鼠李素、异泽兰黄素等核心活性成分,可能通过作用于PARP1、CAV1、CDKN2A、HSPB1、NQO1等基因来调控铁
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关键词
肝癌
消积化肝方
壮医药
铁死亡
作用机制
网络药理学
生物信息学
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Keywords
Liver cancer
Xiaoji Huagan Prescription
Zhuang Medicine
Ferroptosis
Mechanism
Network pharmacology
Bioinformatics
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分类号
R285
[医药卫生—中药学]
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