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利用肿瘤基因组数据库探索多梳基因在肝细胞肝癌中的表达
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作者 姚文敏 袁观斗 何松青 《中华实验外科杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期1088-1090,共3页
目的利用肿瘤基因组数据库（TCGA）探索多梳基因（PcG）在肝细胞肝癌（HCC）中的表达。方法从TCGA数据库中下载PcG在HCC中表达的RNA测序数据，其中包含HCC样本371例和其中与其对应的癌旁正常肝组织样本50例，多梳家族抑制复合物1（PRC1... 目的利用肿瘤基因组数据库（TCGA）探索多梳基因（PcG）在肝细胞肝癌（HCC）中的表达。方法从TCGA数据库中下载PcG在HCC中表达的RNA测序数据，其中包含HCC样本371例和其中与其对应的癌旁正常肝组织样本50例，多梳家族抑制复合物1（PRC1）基因20个，多梳家族抑制复合物2（PRC2）基因11个，共计31个PcG的RNA测序结果，分组整理后利用统计软件进行统计分析各基因在肝癌组织和癌旁正常肝组织中的表达差异。结果PRC1基因中表达上调的基因有11个，下调的有5个，表达没有变化的4个；PRC2基因中表达上调的基因有8个，下调的有1个，表达没有变化的2个。结论PcG在HCC中的表达变化复杂，以表达上调为主。利用TCGA数据库探索不同基因在肿瘤中的表达是一个快速而有效的筛查方法，有利于临床医生快速有效筛查感兴趣的目的研究基因。 展开更多
关键词 多梳基因 多梳家族抑制复合物 肿瘤基因组数据库 癌 肝细胞
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