为了解穿心莲(Andrographis paniculata)的研究现状和学科发展,通过科学网(Web of Science,WoS)核心合集搜索2001—2020年发表的穿心莲SCI学术论文,结合文献计量学描述性和关联性指标,明确穿心莲近20年的科研态势。结果表明:(1)2019—2...为了解穿心莲(Andrographis paniculata)的研究现状和学科发展,通过科学网(Web of Science,WoS)核心合集搜索2001—2020年发表的穿心莲SCI学术论文,结合文献计量学描述性和关联性指标,明确穿心莲近20年的科研态势。结果表明:(1)2019—2020年穿心莲的年发文量突破100篇,多数以穿心莲内酯的抑癌功能为核心展开。(2)虽然发文量最多的国家是印度、中国和马来西亚,但中国与美国和澳大利亚的合著关系最近。结合发文量、H指数与论文年均被引数,美国仅凭中国发文量1/5的产出就达到与中国持平的国际影响力,成果受到高度重视,中国穿心莲论文质量仍需提高。(3)印度科学工业研究理事会(CSIR)和新加坡国立大学是被引频次最高的穿心莲科研机构。台湾中华医科大学、中国科学院、上海中医药大学和中山医学大学是中国主要的穿心莲科研机构。(4)穿心莲发文量前3名作者均来自中国。(5)新加坡国立大学Wong W S F团队于2009年发表穿心莲至今为止影响因子最高(21.4)的学术论文,阐明穿心莲内酯缓解哮喘的分子机制。“天然抗生素”穿心莲内酯抑制新型冠状病毒蛋白活性的功能公开引起国际学者的高度重视,关于穿心莲药理药效和高产稳产等基础研究将更加深入。展开更多
本研究对穿心莲叶绿体基因组密码子使用偏性进行了分析,并探究造成密码子偏好性的主要影响因素。利用软件R Studio、Excel 2019和在线软件CUSP、Codon W 1.4.2等对筛选出的53个蛋白编码区进行计算分析,得到了53个编码蛋白质的基因序列(c...本研究对穿心莲叶绿体基因组密码子使用偏性进行了分析,并探究造成密码子偏好性的主要影响因素。利用软件R Studio、Excel 2019和在线软件CUSP、Codon W 1.4.2等对筛选出的53个蛋白编码区进行计算分析,得到了53个编码蛋白质的基因序列(coding DNA sequence,CDS)的碱基组成和有效密码子数(effective number of codon,ENC),以及通过相对同义密码子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)分析确定了最优密码子。结果表明,穿心莲GC_(all)平均含量为38.52%,其中第1、2位碱基的GC含量均远高于第3位碱基;ENC值的平均值为48.024,且ENC值大于45的占75.47%,穿心莲偏性较弱;通过ENC-plot绘图分析、PR2-plot绘图分析以及中性绘图分析确定了密码子偏好性在主要受到选择的影响的同时还受到突变因素影响;共确定了UUU、UUA、CUU等18个最优密码子,均为A/U结尾。该研究为完善穿心莲叶绿体基因组学、植物鉴定等方面提供数据参考。展开更多
文摘为了解穿心莲(Andrographis paniculata)的研究现状和学科发展,通过科学网(Web of Science,WoS)核心合集搜索2001—2020年发表的穿心莲SCI学术论文,结合文献计量学描述性和关联性指标,明确穿心莲近20年的科研态势。结果表明:(1)2019—2020年穿心莲的年发文量突破100篇,多数以穿心莲内酯的抑癌功能为核心展开。(2)虽然发文量最多的国家是印度、中国和马来西亚,但中国与美国和澳大利亚的合著关系最近。结合发文量、H指数与论文年均被引数,美国仅凭中国发文量1/5的产出就达到与中国持平的国际影响力,成果受到高度重视,中国穿心莲论文质量仍需提高。(3)印度科学工业研究理事会(CSIR)和新加坡国立大学是被引频次最高的穿心莲科研机构。台湾中华医科大学、中国科学院、上海中医药大学和中山医学大学是中国主要的穿心莲科研机构。(4)穿心莲发文量前3名作者均来自中国。(5)新加坡国立大学Wong W S F团队于2009年发表穿心莲至今为止影响因子最高(21.4)的学术论文,阐明穿心莲内酯缓解哮喘的分子机制。“天然抗生素”穿心莲内酯抑制新型冠状病毒蛋白活性的功能公开引起国际学者的高度重视,关于穿心莲药理药效和高产稳产等基础研究将更加深入。
文摘本研究对穿心莲叶绿体基因组密码子使用偏性进行了分析,并探究造成密码子偏好性的主要影响因素。利用软件R Studio、Excel 2019和在线软件CUSP、Codon W 1.4.2等对筛选出的53个蛋白编码区进行计算分析,得到了53个编码蛋白质的基因序列(coding DNA sequence,CDS)的碱基组成和有效密码子数(effective number of codon,ENC),以及通过相对同义密码子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)分析确定了最优密码子。结果表明,穿心莲GC_(all)平均含量为38.52%,其中第1、2位碱基的GC含量均远高于第3位碱基;ENC值的平均值为48.024,且ENC值大于45的占75.47%,穿心莲偏性较弱;通过ENC-plot绘图分析、PR2-plot绘图分析以及中性绘图分析确定了密码子偏好性在主要受到选择的影响的同时还受到突变因素影响;共确定了UUU、UUA、CUU等18个最优密码子,均为A/U结尾。该研究为完善穿心莲叶绿体基因组学、植物鉴定等方面提供数据参考。
