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32497例正常听力孕龄女性耳聋基因携带率与突变谱调查 被引量:11
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作者 刘畅 张彦 +5 位作者 丁红珂 吴菁 麦明琴 曾玉坤 刘玲 尹爱华 《分子诊断与治疗杂志》 2017年第5期325-327,340,共4页
目的在正常听力孕龄人群中开展耳聋基因携带率与突变谱调查,为耳聋基因筛查、遗传咨询、疾病管理提供数据。方法 32 497例听力正常且无耳聋家族史的孕龄女性在我院医学遗传中心门诊接受遗传咨询后,接受耳聋基因芯片筛查。对于检测结果... 目的在正常听力孕龄人群中开展耳聋基因携带率与突变谱调查,为耳聋基因筛查、遗传咨询、疾病管理提供数据。方法 32 497例听力正常且无耳聋家族史的孕龄女性在我院医学遗传中心门诊接受遗传咨询后,接受耳聋基因芯片筛查。对于检测结果提示为常染色体隐性遗传耳聋基因突变携带者,建议其配偶进行进一步耳聋基因检测。对于夫妇均为耳聋基因突变携带的家庭,给予遗传咨询与风险评估,必要时提供产前耳聋基因诊断。结果 32 497位听力正常且无耳聋家族史的孕龄女性中,1 181例携带遗传性耳聋基因突变,携带率为3.63%。其中,1 117例携带常染色体隐性遗传的耳聋基因杂合突变,包括4种常见的GJB2基因突变665例,2种常见的SLC26A4基因突变407例,GJB3基因突变45例。此外,64例携带与氨基糖甙类药物诱导性耳聋密切相关的线粒体DNA 12S rRNA基因突变。结论在正常听力的孕龄人群中开展耳聋基因携带率与突变谱的研究,对优生优育与遗传咨询具有重要意义。 展开更多
关键词 耳聋 携带率 突变谱
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广东地区地中海贫血孕妇全血微量元素含量分析 被引量:4
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作者 兰菲菲 梁凯玲 +1 位作者 杜丽 尹爱华 《分子诊断与治疗杂志》 2015年第6期397-400,354,共4页
目的探讨广东地区地中海贫血孕妇全血中锌、铁、钙、铜、镁、钠、钾、铅8种微量元素的含量,了解地中海贫血孕妇检测微量元素含量的必要性,为合理营养和治疗提供科学依据。方法选择247例基因诊断结果为地中海贫血的孕妇(α和β地中海贫血... 目的探讨广东地区地中海贫血孕妇全血中锌、铁、钙、铜、镁、钠、钾、铅8种微量元素的含量,了解地中海贫血孕妇检测微量元素含量的必要性,为合理营养和治疗提供科学依据。方法选择247例基因诊断结果为地中海贫血的孕妇(α和β地中海贫血组)、249例无地中海贫血的孕妇(正常对照组)和203例未怀孕的地中海贫血患者(未孕地贫组),分析全血8种微量元素的含量并进行统计学分析。结果地中海贫血孕妇全血铁元素含量明显低于正常对照组(P<0.05),与未怀孕的地中海贫血患者相比没有显著统计学意义,其他微量元素的含量与正常对照组和未怀孕的地中海贫血患者相比没有显著统计学意义。结论地中海贫血孕妇应及时监测铁元素含量,以便尽早采取干预和治疗措施,以免影响孕妇和胎儿健康。 展开更多
关键词 地中海贫血 微量元素 孕妇
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产前超声结合NGS在一例MCPH5型胎儿产前诊断中的应用 被引量:1
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作者 曾玉坤 刘渊 +2 位作者 余丽华 刘玲 丁红珂 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第5期863-866,共4页
目的针对有不良孕产史且妊娠超声再次发现胎儿头围偏小家系,探寻致病基因及变异位点,为临床后续进行遗传咨询及产前诊断提供科学依据。方法查询并收集胎儿超声检查结果,采集脐血及夫妻双方外周血样本提取DNA,使用高通量测序的方法结合... 目的针对有不良孕产史且妊娠超声再次发现胎儿头围偏小家系,探寻致病基因及变异位点,为临床后续进行遗传咨询及产前诊断提供科学依据。方法查询并收集胎儿超声检查结果,采集脐血及夫妻双方外周血样本提取DNA,使用高通量测序的方法结合生物信息学分析筛选可能致病的基因及变异位点,并针对相应变异位点进行家系Sanger测序验证。结果胎儿超声结果提示双顶径及头围明显小于孕周,高通量检测结果提示疾病相关基因ASPM存在c.6970dupA杂合复合c.7541delA杂合疑似致病变异。结论通过影像学检测提示信息,结合NGS方法快速诊断MCPH5型胎儿一例。 展开更多
关键词 原发性小头畸形 ASPM基因 产前诊断
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EDA基因外显子缺失所致外胚层发育不良家系的基因型研究及产前诊断 被引量:1
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作者 丁红珂 余丽华 +5 位作者 曾玉坤 刘玲 尹爱华 卢建 张彦 兰菲菲 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第7期852-855,共4页
目的分析X连锁少汗型外胚层发育不良患儿的致病基因,为先证者家庭提供遗传咨询和产前诊断.方法利用高通量测序技术检测先证者的相关致病基因,依据检测结果的缺失提示,进一步采用染色体微阵列技术检测缺失范围.根据染色体微阵列的缺失区... 目的分析X连锁少汗型外胚层发育不良患儿的致病基因,为先证者家庭提供遗传咨询和产前诊断.方法利用高通量测序技术检测先证者的相关致病基因,依据检测结果的缺失提示,进一步采用染色体微阵列技术检测缺失范围.根据染色体微阵列的缺失区域设计断点PCR引物,对包含断点的PCR产物进行Sanger测序确定缺失范围,并验证先证者母亲基因型,结合基因诊断结果对家系第三胎进行产前分子诊断.结果高通量测序发现先证者EDA基因第一外显子编码区缺失.染色体微阵列检测到X染色体存在约267 kb片段缺失,包含EDA基因第一外显子.断点PCR产物Sanger测序发现先证者存在267808 bp半合子缺失,母亲为杂合缺失携带者.胎儿产前分子诊断结果未发现存在该区域缺失.结论EDA基因第一外显子及上下游区域的缺失是导致先证者临床表现的主要原因,结合多种分子检测手段有助于明确因拷贝数目变异所致的遗传性疾病,并通过断点PCR的方法对该家系进行了快速的携带者验证及产前诊断,为该家庭的临床诊断和遗传咨询提供了遗传学证据. 展开更多
关键词 少汗型外胚层发育不良 EDA基因第一外显子 高通量测序 染色体微阵列分析 拷贝数变异
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2例3M综合征产前诊断的病例报道及文献复习 被引量:1
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作者 王逾男 汪安石 +3 位作者 熊盈 曾玉坤 余丽华 何天文 《分子诊断与治疗杂志》 2022年第12期2180-2183,共4页
目的利用高通量测序技术为两例严重宫内生长发育迟缓胎儿揭示遗传学病因。方法分析2017年至今本院产前诊断中心就诊的两例3M综合征胎儿产前超声表现及产前诊断结果。采集先证胎儿羊水及其家庭成员的外周血,进行父母子医学外显测序检测... 目的利用高通量测序技术为两例严重宫内生长发育迟缓胎儿揭示遗传学病因。方法分析2017年至今本院产前诊断中心就诊的两例3M综合征胎儿产前超声表现及产前诊断结果。采集先证胎儿羊水及其家庭成员的外周血,进行父母子医学外显测序检测。并采用生物信息学方法针对致病基因突变位点进行预测,鉴定其致病性。结果医学外显结果提示本研究中两例胎儿CUL7基因均存在复合杂合变异,且变异均遗传自父母,Sanger测序结果与高通量测序结果一致。两对夫妻经遗传咨询后,均决定放弃本次妊娠。胎儿一尸检结果符合3M综合征诊断,胎儿二父母拒绝进一步尸检及大体检查。结论本研究利用高通量测序技术成功鉴定了两例CUL7基因复合杂合变异导致的中国人3M综合征的新变异,新变异的发现丰富了中国人群的胎儿宫内生长发育迟缓的遗传信息。 展开更多
关键词 3M综合征 高通量测序技术 新变异 胎儿宫内发育迟缓
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遗传性球形红细胞增多症家系ANK1基因新发剪切位点突变的不典型表型及表型差异探讨
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作者 丁红珂 潘小英 +6 位作者 吴新华 张彦 吴菁 刘玲 曾玉坤 余丽华 兰菲菲 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2019年第3期1-5,共5页
目的对疑似遗传性球形红细胞增多症家系进行基因检测,探讨家系成员的不典型表型及表型差异。方法利用核心家系医学外显子测序进行基因突变检测,一代测序验证结果。根据家系检测发现的基因突变情况,充分知情同意后行第二胎产前诊断。结... 目的对疑似遗传性球形红细胞增多症家系进行基因检测,探讨家系成员的不典型表型及表型差异。方法利用核心家系医学外显子测序进行基因突变检测,一代测序验证结果。根据家系检测发现的基因突变情况,充分知情同意后行第二胎产前诊断。结果外显子测序发现先证者ANK1基因存在一个剪切位点c.4381+1delG杂合突变,遗传自父亲。该位点在物种间高度保守,生物信息学软件预测提示c.4381+1delG可能影响剪切,本实验室参考人群(2000人)外显子数据中未发现此突变位点,提示人群频率低。产前诊断结果提示胎儿遗传了父亲的基因突变。结论在遗传性球形红细胞增多症家系中首次发现ANK1基因c.4381+1delG杂合突变,数据库中未见报道,丰富了ANK1基因突变谱。先证者及父亲携带基因突变,但没有典型的临床表现且表型存在差异,可能是因为该突变未导致锚蛋白功能全部丧失,红细胞膜损伤程度较低,并且不同个体间存在遗传背景差异所致。胎儿遗传了父亲突变位点,为胎儿今后的发病风险提供遗传咨询信息。 展开更多
关键词 遗传性球形红细胞增多症 ANK1基因突变 表型差异
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pGL3-BMP2荧光素酶报告基因载体的构建及鉴定
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作者 钟良英 丁红珂 +3 位作者 刘敏 黄彬 何小洪 陈培松 《中国优生与遗传杂志》 2013年第9期15-17,28,F0002,共5页
目的扩增BMP2基因下游110kb处的预测有增强子功能的非编码序列,将其插入pGL3-promoter载体,构建该长片段的真核表达系统。方法在所设计的上下游引物的5’端加入BamHⅠ酶切位点,采用聚合酶链反应(PCR)的方法从短指畸形患者外周血提取的DN... 目的扩增BMP2基因下游110kb处的预测有增强子功能的非编码序列,将其插入pGL3-promoter载体,构建该长片段的真核表达系统。方法在所设计的上下游引物的5’端加入BamHⅠ酶切位点,采用聚合酶链反应(PCR)的方法从短指畸形患者外周血提取的DNA中扩增BMP2基因下游区域预测有增强子功能的一段长约5kb的非编码序列。首先将扩增的目标片段与PGEM-T载体连接,连接产物转化DH5α感受态细菌,经蓝白斑筛选出的阳性克隆通过电泳、酶切鉴定后进行测序验证是否为插入的目标序列,测序正确后提取重组质粒。利用限制性内切酶BamHⅠ同时酶切插入目标序列的质粒和pGL3-promoter载体,将酶切完全的目标序列与线性pGL3-promoter空质粒载体在Solution I快速连接酶的作用下进行连接反应,构建目标序列的真核表达载体。结果经过酶切和测序证实含有4.8kb长的目标序列的分子克隆和真核表达载体构建成功。结论实验成功克隆了BMP2基因下游区域预测有增强子功能的一段长约5kb的非编码序列,并构建了pGL3-promoter-enhancer真核表达载体,为进一步验证该序列可能的调控功能奠定了基础。 展开更多
关键词 BMP2基因 非编码区域 长片段分子克隆 pGL3-promoter载体
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中国一短指畸形家系20p12.2-12.3中非编码区的SNPs报道
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作者 钟良英 丁红珂 +3 位作者 刘敏 黄彬 谢英俊 何秋莹 《中国优生与遗传杂志》 2013年第7期11-13,共3页
目的研究中国一短指畸形家系致病位点已明确的连锁定位区域20p12.2-12.3中10个候选基因非编码区的单核苷酸多态性(SNP)检测。方法选取家系中的先证者和一个非患者,提取基因组DNA,针对20p12.2-12.3区域中的10个候选基因的外显子、外显子... 目的研究中国一短指畸形家系致病位点已明确的连锁定位区域20p12.2-12.3中10个候选基因非编码区的单核苷酸多态性(SNP)检测。方法选取家系中的先证者和一个非患者,提取基因组DNA,针对20p12.2-12.3区域中的10个候选基因的外显子、外显子-内含子交界区的PCR产物测序,鉴定基因非编码区的SNPs,并将所得结果在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的SNP数据库(dbSNP)中进行查询和比较。结果在所研究对象中共发现43个SNPs:其中5个位于UTR区,38个位于内含子区域;其中41个为替换型SNPs,1个为插入型SNPs,1个为缺失型SNPs;其中有5个SNPs在数据库中未见报道。结论在中国一短指畸形致病基因已明确的家系中,通过对两个个体定位区域中10个候选基因非编码区的单核苷酸多态性的检测,丰富了中国人群这一区域的多态性数据。 展开更多
关键词 20p12 2-12 3 非编码区 单核苷酸多态性 短指畸形
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高通量测序在一罕见脊柱肋骨发育不全病例诊断中的应用
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作者 曾玉坤 丁红珂 +2 位作者 刘玲 余丽华 张彦 《分子诊断与治疗杂志》 2021年第10期1599-1602,1606,共5页
目的分析一超声结构异常胎儿可能的致病基因及突变位点,为临床遗传咨询提供指导。方法对一超声检测提示脊柱发育异常的胎儿行医学外显子组测序,采用生物信息学方法针对致病基因突变位点进行氨基酸保守型分析及蛋白二、三级结构预测,鉴... 目的分析一超声结构异常胎儿可能的致病基因及突变位点,为临床遗传咨询提供指导。方法对一超声检测提示脊柱发育异常的胎儿行医学外显子组测序,采用生物信息学方法针对致病基因突变位点进行氨基酸保守型分析及蛋白二、三级结构预测,鉴定其致病性。结果发现与胎儿临床表现相关的致病基因HES7存在c.674T>C(p.F225S)纯合变异,该位点分别遗传自父母,通过分析预测,变异位点能使得蛋白质二级、三级结构相比原始结构发生较显著变化。结论HES7基因c.674T>C(p.F225S)位点的纯合突变可能是导致胎儿脊柱发育异常的致病因素,与Ⅳ型脊椎肋骨发育不全(SCDO4)疾病的发生相关。 展开更多
关键词 高通量测序 Ⅳ型脊柱肋骨发育不全 HES7基因
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国内第二例WDR62基因复合杂合突变导致的小头畸形病例报道
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作者 余丽华 丁红珂 +4 位作者 周伟宁 张彦 曾玉坤 刘玲 尹爱华 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2018年第3期53-56,共4页
小头畸形2型(MIM#604317)主要由WDR62基因(NM_001083961)突变引起,属于常染色体隐性遗传的神经发育障碍性疾病。WDR62基因位于19号染色体长臂1区3带,包含32个外显子和31个内含子,编码1523个氨基酸的蛋白质,含有15个WD重复元件。WDR62基... 小头畸形2型(MIM#604317)主要由WDR62基因(NM_001083961)突变引起,属于常染色体隐性遗传的神经发育障碍性疾病。WDR62基因位于19号染色体长臂1区3带,包含32个外显子和31个内含子,编码1523个氨基酸的蛋白质,含有15个WD重复元件。WDR62基因突变已被公认是造成小头畸形的第二大主要因素,这类患者主要以头围减少、轻度至重度精神发育迟滞为特征,但有部分临床症状表现差异较大,如大脑皮质畸形、性格行为、皮肤问题等[1-3]。 展开更多
关键词 基因突变 小头畸形 病例报道 常染色体隐性遗传 发育障碍性疾病 复合 国内 精神发育迟滞
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一例结节性硬化症患儿的基因诊断
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作者 张彦 丁红珂 +1 位作者 尹爱华 张小庄 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期770-773,共4页
目的探明1例结节性硬化症患儿的致病基因突变。方法针对TSCl、TSC2基因突变高发的11个外显子设计扩增引物,并对患儿及父母外周血基因组DNA进行扩增。对扩增产物进行DNA测序,对测序结果进行序列比对及生物信息学分析。结果发现患儿TSC... 目的探明1例结节性硬化症患儿的致病基因突变。方法针对TSCl、TSC2基因突变高发的11个外显子设计扩增引物,并对患儿及父母外周血基因组DNA进行扩增。对扩增产物进行DNA测序,对测序结果进行序列比对及生物信息学分析。结果发现患儿TSC2基因C.4493G〉C单碱基杂合突变,该突变导致第1498位编码氨基酸从丝氨酸变为苏氨酸(P.Serl498Thr)。父母TSC2基因相应位置未检测到突变。结论TSC2基因c.4493G〉C单碱基错义突变可能是该结节性硬化症患儿的致病突变,该突变系新发突变。 展开更多
关键词 结节性硬化症 Bourneville病 遗传检测
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二代测序技术在东南亚缺失型α珠蛋白生成障碍性贫血夫妇胚胎植入前遗传学检测中的应用 被引量:1
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作者 何天文 周伟宁 +5 位作者 卢建 李静姝 陈创奇 董云巧 杜丽 尹爱华 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第4期397-401,共5页
目的探讨二代测序技术在东南亚缺失型(――^SEA)α珠蛋白生成障碍性贫血(以下简称“地贫”)夫妇胚胎植入前遗传学检测中的应用价值。方法选取1对2017年12月于广东省妇幼保健院就诊的东南亚缺失型α地贫不孕不育夫妇。选择――^SEA缺失... 目的探讨二代测序技术在东南亚缺失型(――^SEA)α珠蛋白生成障碍性贫血(以下简称“地贫”)夫妇胚胎植入前遗传学检测中的应用价值。方法选取1对2017年12月于广东省妇幼保健院就诊的东南亚缺失型α地贫不孕不育夫妇。选择――^SEA缺失区域为目标区域,在其上下游2 Mb区域内选择高密度紧密连锁的单核苷酸多态性(SNP)位点作为遗传连锁标记,多重PCR和二代测序后选择有效SNP位点构建家系成员SNP单体型,确定夫妇携带致病的风险染色体。对活检获得的滋养层细胞进行全基因组扩增和多重PCR后,采用二代测序对胚胎――^SEA缺失区域直接测序和构建胚胎SNP单体型连锁分析进行植入前遗传学检测。Sanger测序验证――^SEA的二代测序结果。对正常和东南亚缺失型α地贫的胚胎进行了低深度的染色体非整倍性筛查。结果胚胎――^SEA缺失区域直接测序、胚胎SNP单体型连锁分析和Sanger测序结果显示,活检的12个囊胚中4个为正常(αα/αα),7个为东南亚缺失型α地贫(――^SEA/αα),1个为重型α地贫(――^SEA/――^SEA)。11个正常和东南亚缺失型α地贫囊胚中有8个为整倍体,3个为非整倍体。选择正常和发育良好的整倍体胚胎植入母体子宫后,足月分娩了1例健康婴儿。结论采用二代测序可对东南亚缺失型α地贫夫妇进行胚胎植入前遗传学检测,阻断了东南亚缺失型α地贫在该家系中的再发风险,同时可以避免选择非整倍体胚胎而导致的流产问题。 展开更多
关键词 二代测序 东南亚缺失型α地贫 植入前遗传学检测
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