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相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术 被引量:59
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作者 任羽 王得元 张银东 《中国农学通报》 CSCD 2004年第6期11-13,22,共4页
SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区... SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同以及物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。扩增产物用变性的聚丙烯酰胺凝胶分离,然后用放射自显影检测。本文在阐述SRAP的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、比较基因组学、杂种优势预测等方面的研究进展及应用前景。 展开更多
关键词 相关序列扩增多态性 SRAP 分子标记 技术原理 遗传图谱 遗传多样性 基因定位 比较基因组学 杂种优势预测
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应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系 被引量:10
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作者 任羽 张银东 +1 位作者 尹俊梅 王得元 《热带作物学报》 CSCD 2008年第1期47-52,共6页
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引... 将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。31个自交系间的相似系数为0.133~0.997。聚类分析将31个自交系分为:在相似系数D为0.55处,将辣椒的2个变种分开;在相似系数D为0.67处,将辣椒分为4类。结果显示,SRAP是辣椒自交系研究中一种较好标记,其分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。 展开更多
关键词 辣椒 SRAP 聚类分析
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一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化 被引量:26
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作者 杜晓华 王得元 巩振辉 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第9期45-49,54,共6页
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSA... 了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18bp的引物,引物的3’端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35C的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20ng,Mg^2+浓度为2.5mmol/L,dNTPs浓度为0.2mmol/L,TaqDNA聚合酶用量为1.5U,2条引物浓度均为600nmol/L;RSAP技术重复性好,适用性广泛,是一种操作简便、产率中等、稳定可靠的DNA标记技术。 展开更多
关键词 限制性位点扩增多态性 DNA标记技术 蔬菜育种
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用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因 被引量:16
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作者 王得元 王鸣 郑学勤 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期99-101,87,共4页
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0... 根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0 标记可能与保持系中的保持基因相连锁。对侯选标记OPK 1 7550 进行了克隆和部分序列分析 ,为利用混合群体分离法 (BSA)对分离群体中的不同单株进行SCAR分析的标记验证工作奠定了基础。 展开更多
关键词 雄性不育基因 RAPD分析 辣椒 细胞质雄性不育系 RAPD标记 近等基因系 分析原理 序列分析 验证工作 SCAR 分离群体 混合群体 保持系 分离法 连锁 单株
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分子标记预测作物杂种优势的研究进展 被引量:7
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作者 任羽 王得元 张银东 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第3期401-406,共6页
杂种优势育种是蔬菜作物的一种重要育种技术。国内外利用RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记技术开展了作物杂种优势预测的方法研究,取得了富有启示性的研究结果。本文分析和述评了国内外作物杂种优势分子预测的遗传距离法、杂种优... 杂种优势育种是蔬菜作物的一种重要育种技术。国内外利用RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记技术开展了作物杂种优势预测的方法研究,取得了富有启示性的研究结果。本文分析和述评了国内外作物杂种优势分子预测的遗传距离法、杂种优势类群法、QTL法认为基于QTL的杂种优势类群和遗传距离相结合的方法将是作物杂种优势预测研究今后的研究重点和热点,并最有可能在育种实践中得以应用。 展开更多
关键词 分子标记 预测预报 杂种优势 蔬菜作物
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辣椒自交系的基因型值分析 被引量:1
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作者 任羽 王得元 +1 位作者 尹俊梅 张银东 《中国农学通报》 CSCD 2006年第3期53-56,共4页
利用Steuclid遗传距离对31个自交系的10个性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicumannuumvar.grossum变种群和Capsicumannuumvar.longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分... 利用Steuclid遗传距离对31个自交系的10个性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicumannuumvar.grossum变种群和Capsicumannuumvar.longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分为5类。第一类:7号,灯笼椒变种;第二类:9号和5号,植株较高大、晚熟、感病;第三类:25号,中抗、矮杆、早熟;第四类:6、12、10、19、14、11、29、31、30、24、16、20、18、17、21、15、13、23、22、8、4号,这一类在熟性、抗性方面属于中间类型,在植株高度方面存在较大的差异;第五类:27、26、28、3、2、1号,植株高大、晚熟、抗病。这种分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。 展开更多
关键词 辣椒 基因型值 聚类分析
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