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相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术
被引量:
59
1
作者
任羽
王得元
张银东
《中国农学通报》
CSCD
2004年第6期11-13,22,共4页
SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区...
SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同以及物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。扩增产物用变性的聚丙烯酰胺凝胶分离,然后用放射自显影检测。本文在阐述SRAP的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、比较基因组学、杂种优势预测等方面的研究进展及应用前景。
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关键词
相关序列扩增多态性
SRAP
分子标记
技术原理
遗传图谱
遗传多样性
基因定位
比较基因组学
杂种优势预测
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职称材料
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
被引量:
10
2
作者
任羽
张银东
+1 位作者
尹俊梅
王得元
《热带作物学报》
CSCD
2008年第1期47-52,共6页
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引...
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。31个自交系间的相似系数为0.133~0.997。聚类分析将31个自交系分为:在相似系数D为0.55处,将辣椒的2个变种分开;在相似系数D为0.67处,将辣椒分为4类。结果显示,SRAP是辣椒自交系研究中一种较好标记,其分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
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关键词
辣椒
SRAP
聚类分析
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职称材料
一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
被引量:
26
3
作者
杜晓华
王得元
巩振辉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2006年第9期45-49,54,共6页
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSA...
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18bp的引物,引物的3’端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35C的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20ng,Mg^2+浓度为2.5mmol/L,dNTPs浓度为0.2mmol/L,TaqDNA聚合酶用量为1.5U,2条引物浓度均为600nmol/L;RSAP技术重复性好,适用性广泛,是一种操作简便、产率中等、稳定可靠的DNA标记技术。
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关键词
限制性位点扩增多态性
DNA标记技术
蔬菜育种
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职称材料
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
被引量:
16
4
作者
王得元
王鸣
郑学勤
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期99-101,87,共4页
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0...
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0 标记可能与保持系中的保持基因相连锁。对侯选标记OPK 1 7550 进行了克隆和部分序列分析 ,为利用混合群体分离法 (BSA)对分离群体中的不同单株进行SCAR分析的标记验证工作奠定了基础。
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关键词
雄性不育基因
RAPD分析
辣椒
细胞质雄性不育系
RAPD标记
近等基因系
分析原理
序列分析
验证工作
SCAR
分离群体
混合群体
保持系
分离法
连锁
单株
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职称材料
分子标记预测作物杂种优势的研究进展
被引量:
7
5
作者
任羽
王得元
张银东
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2004年第3期401-406,共6页
杂种优势育种是蔬菜作物的一种重要育种技术。国内外利用RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记技术开展了作物杂种优势预测的方法研究,取得了富有启示性的研究结果。本文分析和述评了国内外作物杂种优势分子预测的遗传距离法、杂种优...
杂种优势育种是蔬菜作物的一种重要育种技术。国内外利用RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记技术开展了作物杂种优势预测的方法研究,取得了富有启示性的研究结果。本文分析和述评了国内外作物杂种优势分子预测的遗传距离法、杂种优势类群法、QTL法认为基于QTL的杂种优势类群和遗传距离相结合的方法将是作物杂种优势预测研究今后的研究重点和热点,并最有可能在育种实践中得以应用。
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关键词
分子标记
预测预报
杂种优势
蔬菜作物
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职称材料
辣椒自交系的基因型值分析
被引量:
1
6
作者
任羽
王得元
+1 位作者
尹俊梅
张银东
《中国农学通报》
CSCD
2006年第3期53-56,共4页
利用Steuclid遗传距离对31个自交系的10个性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicumannuumvar.grossum变种群和Capsicumannuumvar.longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分...
利用Steuclid遗传距离对31个自交系的10个性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicumannuumvar.grossum变种群和Capsicumannuumvar.longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分为5类。第一类:7号,灯笼椒变种;第二类:9号和5号,植株较高大、晚熟、感病;第三类:25号,中抗、矮杆、早熟;第四类:6、12、10、19、14、11、29、31、30、24、16、20、18、17、21、15、13、23、22、8、4号,这一类在熟性、抗性方面属于中间类型,在植株高度方面存在较大的差异;第五类:27、26、28、3、2、1号,植株高大、晚熟、抗病。这种分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
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关键词
辣椒
基因型值
聚类分析
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职称材料
题名
相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术
被引量:
59
1
作者
任羽
王得元
张银东
机构
热带作物生物
技术
国家
重点
实验室
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
/
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
出处
《中国农学通报》
CSCD
2004年第6期11-13,22,共4页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2002AA207012-2)
国家自然科学基金项目
+5 种基金
广东省重点科技攻关项目(A20202
2002A2070201)
广东省自然科学基金(000162)
广州市重点科技攻关项目(2002Z2-E0192)
广东省农业科学院院长基金项目(2001-基金-08
04-基金-03B)
文摘
SRAP是一种新的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术,其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同以及物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。扩增产物用变性的聚丙烯酰胺凝胶分离,然后用放射自显影检测。本文在阐述SRAP的原理和流程后,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、比较基因组学、杂种优势预测等方面的研究进展及应用前景。
关键词
相关序列扩增多态性
SRAP
分子标记
技术原理
遗传图谱
遗传多样性
基因定位
比较基因组学
杂种优势预测
Keywords
Sequence-related
Amplified Polymorphism
Molecular marker
application
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
被引量:
10
2
作者
任羽
张银东
尹俊梅
王得元
机构
中国热带
农业
科学院
热带作物品种资源
研究所
中国热带
农业
科学院
热带作物生物
技术
研究所
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
/
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2008年第1期47-52,共6页
基金
广东省自然科学基金(000162)
广州市重点科技攻关项目(2002Z2-E0192)
广东省农业科学院院长基金项目(2001-基金-08)资助
文摘
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。31个自交系间的相似系数为0.133~0.997。聚类分析将31个自交系分为:在相似系数D为0.55处,将辣椒的2个变种分开;在相似系数D为0.67处,将辣椒分为4类。结果显示,SRAP是辣椒自交系研究中一种较好标记,其分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
关键词
辣椒
SRAP
聚类分析
Keywords
hot pepper
SRAP
cluster analysis
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
Q781 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
被引量:
26
3
作者
杜晓华
王得元
巩振辉
机构
西北农林科技大学园艺
学院
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2006年第9期45-49,54,共6页
基金
广东省自然科学基金(000162)
广东省农科院院长基金(04-基金-38)
文摘
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18bp的引物,引物的3’端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35C的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20ng,Mg^2+浓度为2.5mmol/L,dNTPs浓度为0.2mmol/L,TaqDNA聚合酶用量为1.5U,2条引物浓度均为600nmol/L;RSAP技术重复性好,适用性广泛,是一种操作简便、产率中等、稳定可靠的DNA标记技术。
关键词
限制性位点扩增多态性
DNA标记技术
蔬菜育种
Keywords
restriction site amplified polymorphism
DNA marker technique
vegetable breeding
分类号
S603.2 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
被引量:
16
4
作者
王得元
王鸣
郑学勤
机构
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
西北农林科技大学园艺
学院
热带作物生物
技术
国家
重点
实验室
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期99-101,87,共4页
基金
广东省重点科技攻关项目 (A2 0 2 0 2
2 0 0 2A2 0 70 2 0 1)
+2 种基金
广东省自然科学基金 (0 0 0 162 )
广州市重点科技攻关项目 (2 0 0 2Z2 E0 192 )
广东省农业科学院院长基金项目 (0 4-基金 -0 3B)
文摘
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0 标记可能与保持系中的保持基因相连锁。对侯选标记OPK 1 7550 进行了克隆和部分序列分析 ,为利用混合群体分离法 (BSA)对分离群体中的不同单株进行SCAR分析的标记验证工作奠定了基础。
关键词
雄性不育基因
RAPD分析
辣椒
细胞质雄性不育系
RAPD标记
近等基因系
分析原理
序列分析
验证工作
SCAR
分离群体
混合群体
保持系
分离法
连锁
单株
Keywords
Capsicum annuum L
cytoplasm male sterile gene
maintainer gene
candidate RAPD markers
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
分子标记预测作物杂种优势的研究进展
被引量:
7
5
作者
任羽
王得元
张银东
机构
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
中国热带
农业
科学院
热带作物生物
技术
国家
重点
实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2004年第3期401-406,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2002AA207012-2)
广东省重点科技攻关项目(A20202、2002A2070201、2002 A2070605)
+2 种基金
广东省自然科学基金(000162)
广州市重点科技攻关项目(2002Z2-E0192、98-Z-03-003)
广东省农业科学院院长基金项目(2001-基金-08、04-基金-O3B)资助。
文摘
杂种优势育种是蔬菜作物的一种重要育种技术。国内外利用RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记技术开展了作物杂种优势预测的方法研究,取得了富有启示性的研究结果。本文分析和述评了国内外作物杂种优势分子预测的遗传距离法、杂种优势类群法、QTL法认为基于QTL的杂种优势类群和遗传距离相结合的方法将是作物杂种优势预测研究今后的研究重点和热点,并最有可能在育种实践中得以应用。
关键词
分子标记
预测预报
杂种优势
蔬菜作物
Keywords
Crop, Heterosis, Molecular marker, Prediction
分类号
S334 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
辣椒自交系的基因型值分析
被引量:
1
6
作者
任羽
王得元
尹俊梅
张银东
机构
中国热带
农业
科学院
热带作物品种资源
研究所
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
广东省
果蔬
新
技术
研究
重点
实验室
中国热带
农业
科学院
热带作物生物
技术
国家
重点
实验室
出处
《中国农学通报》
CSCD
2006年第3期53-56,共4页
基金
广东省自然科学基金"辣椒分子标记图谱构建和QTL定位的研究"(000162)
广州省重点科技攻关项目"分子标记辅助蔬菜新品种选育的研究"(A20202
+1 种基金
2002A2070201)
广东省农业科学院院长基金项目"辣椒自交系的形态特征和SRAP分析及栽培模式的研究"(2001-基金-08)。
文摘
利用Steuclid遗传距离对31个自交系的10个性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicumannuumvar.grossum变种群和Capsicumannuumvar.longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分为5类。第一类:7号,灯笼椒变种;第二类:9号和5号,植株较高大、晚熟、感病;第三类:25号,中抗、矮杆、早熟;第四类:6、12、10、19、14、11、29、31、30、24、16、20、18、17、21、15、13、23、22、8、4号,这一类在熟性、抗性方面属于中间类型,在植株高度方面存在较大的差异;第五类:27、26、28、3、2、1号,植株高大、晚熟、抗病。这种分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
关键词
辣椒
基因型值
聚类分析
Keywords
Hot pepper, Genotype value, Cluster analysis
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术
任羽
王得元
张银东
《中国农学通报》
CSCD
2004
59
下载PDF
职称材料
2
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
任羽
张银东
尹俊梅
王得元
《热带作物学报》
CSCD
2008
10
下载PDF
职称材料
3
一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
杜晓华
王得元
巩振辉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2006
26
下载PDF
职称材料
4
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
王得元
王鸣
郑学勤
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
16
下载PDF
职称材料
5
分子标记预测作物杂种优势的研究进展
任羽
王得元
张银东
《分子植物育种》
CAS
CSCD
2004
7
下载PDF
职称材料
6
辣椒自交系的基因型值分析
任羽
王得元
尹俊梅
张银东
《中国农学通报》
CSCD
2006
1
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职称材料
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