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RNA折叠中的最大公共嵌套子图
1
作者
刘国栋
王振佳
刘丙强
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第12期57-63,共7页
在嵌套线状图模型中,寻找ncRNA联配的最大公共二次结构,实际就是寻找其序列导出线状图的最大公共嵌套线状子图。通过对模型的简化,证明该问题在伪平嵌套线状图的情形下是NP-完全的,并给出求最大水平嵌套线状子图的近似算法。
关键词
线状图
嵌套
整子图
子序列
NP-完全
原文传递
题名
RNA折叠中的最大公共嵌套子图
1
作者
刘国栋
王振佳
刘丙强
机构
山东
科技
大学
济南
校区
人力资源部
山东
大学
数学学院
出处
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第12期57-63,共7页
基金
山东省自然科学基金青年基金资助项目(ZR2011FQ010)
山东科技大学科学研究"春蕾计划"项目(2010AZZ052)
山东大学自主创新基金(2010GN028)
文摘
在嵌套线状图模型中,寻找ncRNA联配的最大公共二次结构,实际就是寻找其序列导出线状图的最大公共嵌套线状子图。通过对模型的简化,证明该问题在伪平嵌套线状图的情形下是NP-完全的,并给出求最大水平嵌套线状子图的近似算法。
关键词
线状图
嵌套
整子图
子序列
NP-完全
Keywords
linear graph
nested
integral sub-graph
subsequence
NP-Complete
分类号
O157.6 [理学—数学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
RNA折叠中的最大公共嵌套子图
刘国栋
王振佳
刘丙强
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012
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