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基于生物信息学的急性阑尾炎的差异表达基因和富集分析
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作者 欧阳文浩 徐宏鑫 +2 位作者 徐丹丹 杨志聪 石永泉 《中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生》 2023年第3期157-160,共4页
借助生物信息学分析工具认识急性阑尾炎的组织和血液学相关基因和功能的改变。方法 1.从GEO数据库下载急性阑尾炎组织数据集GSE9579和血液数据集GSE83091。2.GEO2R筛选差异表达基因,利用R语言进行热图和火山图可视化分析。3.借助DAVID... 借助生物信息学分析工具认识急性阑尾炎的组织和血液学相关基因和功能的改变。方法 1.从GEO数据库下载急性阑尾炎组织数据集GSE9579和血液数据集GSE83091。2.GEO2R筛选差异表达基因,利用R语言进行热图和火山图可视化分析。3.借助DAVID将差异表达基因进行基因本体论和KEGG通路富集分析,Hipolt对富集分析可视化。4.GSEA对组织表达矩阵进行全基因通路富集分析。5. Venny2.0对组织和血液数据集的差异表达基因进行VENN分析,并进行富集分析。6.Metascape在线分析工具对交集基因进行疾病相关性分析。结果 急性阑尾炎组织富集免疫反应、细胞黏附、中性粒细胞趋化、细胞色素P450等结果,血液出现对真菌和细菌的抵抗作用,联合筛选确定了7个差异表达基因,与急性胰腺炎、急性心肌梗塞、急性肝损伤关联密切。结论 中性粒细胞脱粒和趋化、IL6的瞬时表达等在急性阑尾炎疾病中扮演重要角色,FCGR3B、CXCL1、DEFA1B在组织和血液内都参与重要的免疫反应,并与其他急性炎症疾病相关。 展开更多
关键词 生物信息学 急性阑尾炎 免疫反应 中性粒细胞
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