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基于转录组测序筛选乌苏里白鲑肌肉生长关键候选基因研究
1
作者 李文文 徐革锋 +7 位作者 黄天晴 谷伟 刘恩慧 王高超 潘玉财 周金鑫 姜再胜 王炳谦 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第3期87-100,共14页
为了挖掘调控乌苏里白鲑(Coregonus ussurinsis Berg)肌肉生长的关键候选基因,本研究对不同生长速度乌苏里白鲑的肌肉组织进行转录组测序,以期为乌苏里白鲑群体选育提供基础数据。首先,在同等条件下(从混合池中)随机选择乌苏里白鲑F2个... 为了挖掘调控乌苏里白鲑(Coregonus ussurinsis Berg)肌肉生长的关键候选基因,本研究对不同生长速度乌苏里白鲑的肌肉组织进行转录组测序,以期为乌苏里白鲑群体选育提供基础数据。首先,在同等条件下(从混合池中)随机选择乌苏里白鲑F2个体进行实验分组(快长组和慢长组)。接着分别从快长组[体重为(219.20±38.66)g]和慢长组[体重为(74.30±17.86)g]中随机选取10尾样本,取其背部肌肉进行转录组测序。以FDR(false discovery rate)<0.05且|log2(FC)|>1(FC,fold change)为条件筛选差异表达基因并对其进行GO(gene ontology)和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析,并通过qPCR验证转录组数据的准确性。转录组测序结果显示,共筛选出2211个差异表达基因,与慢长组相比,快长组中583个差异基因表达上调及1628个基因表达下调。GO功能注释结果显示,差异基因主要参与细胞过程和结合过程,差异基因显著富集到251条KEGG通路(P<0.05),其中,MAPK信号通路(MAPKsignalingpathway)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、紧密连接(tight junction)、胰岛素信号通路(insulin signaling pathway)、糖酵解/糖异生(glycolysis/gluconeogenesis)和PPAR信号通路(PPAR signaling pathway)参与细胞生长。之后结合功能注释结果和KEGG,鉴定出肌浆/内质网钙ATP酶基因atp2a1和atp2a2、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因g6pc、生长因子结合蛋白1基因igfbp1以及肌球蛋白重链基因myh1、myh4、myh6、myh7、myh9和myh13等可能与肌肉生长密切相关的基因。本研究共筛选出10个可能与乌苏里白鲑肌肉生长相关的关键候选基因,为今后乌苏里白鲑分子标记辅助育种提供了基础数据。 展开更多
关键词 乌苏里白鲑 转录组测序 差异表达基因 肌肉生长
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虹鳟倍性鉴定SSR标记筛选与应用研究
2
作者 马海兵 黄天晴 +9 位作者 徐革锋 刘恩慧 谷伟 王高超 郭福元 董福霖 郑龙华 张黎黎 姜再胜 王炳谦 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第4期43-52,共10页
虹鳟(Oncorhynchusmykiss)是我国冷水性鱼类的主要养殖品种。与二倍体相比,虹鳟三倍体具有生长速度快、肉质好和不育等优点。目前,鉴定虹鳟倍性主要是通过流式细胞术进行DNA含量分析,但这种方法需要采集鱼类血液或组织样本,会对其造成... 虹鳟(Oncorhynchusmykiss)是我国冷水性鱼类的主要养殖品种。与二倍体相比,虹鳟三倍体具有生长速度快、肉质好和不育等优点。目前,鉴定虹鳟倍性主要是通过流式细胞术进行DNA含量分析,但这种方法需要采集鱼类血液或组织样本,会对其造成伤害。为了实现利用微创方法收集样本鉴定虹鳟倍性,本研究利用PCR扩增以及电泳分离技术对153个微卫星标记(SSR标记)进行分析,其中139个SSR标记能够在二倍体和三倍体中成功扩增,筛选出132个SSR标记具有多态性,最终鉴定出7个标记在三倍体中表现出较高的变异性。通过在52个已知倍性水平的参考样本和48个未知倍性的样本上进行验证,进一步从中筛选出3个SSR标记(SSR1054、SSR1056和SSR1468)足以区分倍性水平,并且根据3个标记序列重新设计了3对具有良好稳定性的引物序列进行倍性分析应用。本研究所筛选的SSR标记解决了现有虹鳟倍性鉴定中存在的技术流程复杂、耗材昂贵的问题,并有助于不同倍性虹鳟的遗传多样性研究。 展开更多
关键词 虹鳟 鲑科鱼类 微卫星 三倍体 倍性检测
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渔业养殖循环水系统及养殖方法
3
作者 姜再胜 陶健 《世界热带农业信息》 2024年第7期85-87,共3页
水产养殖作为一项重要的经济活动,在全球范围内都受到了广泛关注和发展。随着养殖规模的不断扩大和养殖技术的不断进步,养殖过程中产生的污染问题逐渐凸显,而循环水系统作为一种高效、环保、可持续的养殖方式,已经成为水产养殖领域的热... 水产养殖作为一项重要的经济活动,在全球范围内都受到了广泛关注和发展。随着养殖规模的不断扩大和养殖技术的不断进步,养殖过程中产生的污染问题逐渐凸显,而循环水系统作为一种高效、环保、可持续的养殖方式,已经成为水产养殖领域的热门技术之一,故此,有必要对渔业养殖循环水系统及养殖方法进行分析研究,以促进渔业产业实现健康稳定发展。1渔业养殖循环水系统基本原理和构建过程1.1基本原理渔业养殖循环水系统是指将使用过的水再次利用于养殖过程中的系统。基本原理是通过物理、生物和化学处理将废水处理成适合再次使用的水。通过这种方式,可以减少对自然水资源的依赖,同时减少养殖过程中的废水排放量。 展开更多
关键词 渔业养殖 养殖方法 水产养殖 循环水系统 渔业产业 养殖规模 废水处理 全球范围
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匙吻鲟水库网箱生态养殖技术
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作者 杨启 《农家科技》 2021年第6期54-55,共2页
水库网箱生态养殖匙吻鲟是充分利用大水面良好的生态环境发展绿色无公害水产品的一种投资小、见效快、便于管理的养殖模式,2019-2020年在安徽省桐城市大石坂水库进行了网箱生态养殖匙吻鲟,取得了良好的经济效益。本文从养殖条件、网箱... 水库网箱生态养殖匙吻鲟是充分利用大水面良好的生态环境发展绿色无公害水产品的一种投资小、见效快、便于管理的养殖模式,2019-2020年在安徽省桐城市大石坂水库进行了网箱生态养殖匙吻鲟,取得了良好的经济效益。本文从养殖条件、网箱设置、鱼种放养、日常管理方面介绍了水库网箱养殖匙吻鲟技术要点。 展开更多
关键词 水库网箱养殖 匙吻鲟 生态养殖技术 鱼种放养 养殖条件 养殖模式 无公害水产品 安徽省桐城市
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稻田鱼虾养殖技术研究
5
作者 姜再胜 陶健 《世界热带农业信息》 2024年第3期72-74,共3页
稻田鱼虾养殖技术是一种将鱼类和虾类生长在稻田内的综合养殖模式。稻田鱼虾养殖技术充分利用了稻田的生态环境和水资源,具有降低养殖成本、增加农民收益、改善水土环境等多种优点。随着近年来对食品安全和生态环境的重视,越来越多的农... 稻田鱼虾养殖技术是一种将鱼类和虾类生长在稻田内的综合养殖模式。稻田鱼虾养殖技术充分利用了稻田的生态环境和水资源,具有降低养殖成本、增加农民收益、改善水土环境等多种优点。随着近年来对食品安全和生态环境的重视,越来越多的农民开始尝试使用稻田鱼虾养殖技术进行生产。 展开更多
关键词 农民收益 生态环境 养殖成本 食品安全 养殖技术研究 水土环境 稻田 水资源
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