目的调查丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)感染者血清中自身抗体检出情况,探讨自身免疫在HCV感染中的意义。方法选取2015-2017年来自上海市闵行区中心医院就诊的HCV感染者40例作为感染组,另选该院健康体检者20例作为对照组。用自...目的调查丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)感染者血清中自身抗体检出情况,探讨自身免疫在HCV感染中的意义。方法选取2015-2017年来自上海市闵行区中心医院就诊的HCV感染者40例作为感染组,另选该院健康体检者20例作为对照组。用自身抗体检测芯片筛查检测83种自身抗体;然后建立预包被酶联免疫吸附试验(ELISA)检测13种自身抗原,将两种方法检测到的抗体滴度变化进行比对,分析结果。结果芯片检测83种自身抗体,发现HCV感染者中28种自身抗体滴度显著上调,3种抗体滴度显著下调。将ELISA法能检测到的13种抗体进行吸光度值统计分析,发现11种自身抗体滴度显著升高,2种自身抗体滴度无显著变化,与芯片结果一致。结论 HCV感染可以诱发自身免疫反应,产生多种自身抗体,有助于探索HCV致病机制,并为临床诊断和治疗HCV感染提供依据。展开更多
利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库收集肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的RNA测序信息.首先,通过非负矩阵分解(non-negative m...利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库收集肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的RNA测序信息.首先,通过非负矩阵分解(non-negative matrix factorization,NMF)聚类方法和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出参与HCC免疫反应机制的关键基因.利用套索(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析构建预后基因模型,并用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法分析生物学功能.随后,对不同风险组患者使用单样本基因集富集分析(single sample genes set enrichment analysis,ssGSEA)评估两组间免疫浸润和相关功能差异.使用“RMS”R软件包结合独立危险因素构建列线图以预测患者的总体生存时间.最后,利用人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atlas,HPA)与实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)进行临床初步验证.总之,本文在风险评分的基础上整合患者临床特征,构建了一个可验证、可重复的列线图,为临床肿瘤患者的精准治疗提供可靠的参考.展开更多
目的建立我国Chinese 1优势基因型获得性弓形虫眼病小鼠模型,分析弓形虫感染对眼组织局部NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群的影响。方法C57BL/6小鼠经口感染20个弓形虫Wh6包囊,30d后取眼组织,苏木精和伊红(H&E)染色检查病理变化;采用PC...目的建立我国Chinese 1优势基因型获得性弓形虫眼病小鼠模型,分析弓形虫感染对眼组织局部NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群的影响。方法C57BL/6小鼠经口感染20个弓形虫Wh6包囊,30d后取眼组织,苏木精和伊红(H&E)染色检查病理变化;采用PCR扩增眼组织中的弓形虫ITS-1基因;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫组化方法分析眼组织中的干扰素-γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)等细胞因子的mRNA及蛋白表达水平;对眼组织转录组测序,进行基因表达差异分析、GO(gene ontology)富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析;采用流式细胞术检测眼组织中NK细胞和CD49a^(+)NK细胞亚群水平。结果H&E染色检查感染组小鼠视网膜发生严重的病理改变,PCR扩增眼组织中弓形虫特异性基因ITS-1阳性,qRT-PCR扩增眼组织中细胞因子IFN-γ、TNF-α的mRNA表达上调(P<0.01),免疫组化检查视网膜中IFN-γ、TNF-α表达上调。转录组测序显示,感染组小鼠眼组织中有601个基因表达上调,108个基因表达下调,GO富集分析中差异表达基因在免疫反应、炎症反应等生物过程显著富集,KEGG富集分析显示31个差异表达基因富集在NK细胞介导的细胞毒性通路。流式细胞术检测感染鼠眼组织中NK和CD49a^(+)NK细胞百分比显著增加(P<0.01)。结论成功构建了Chinese 1优势基因型获得性弓形虫眼病小鼠模型,感染鼠眼组织中NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群百分比增加,提示NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群在眼组织中积累可能参与弓形虫眼病的发生过程。展开更多
文摘目的调查丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)感染者血清中自身抗体检出情况,探讨自身免疫在HCV感染中的意义。方法选取2015-2017年来自上海市闵行区中心医院就诊的HCV感染者40例作为感染组,另选该院健康体检者20例作为对照组。用自身抗体检测芯片筛查检测83种自身抗体;然后建立预包被酶联免疫吸附试验(ELISA)检测13种自身抗原,将两种方法检测到的抗体滴度变化进行比对,分析结果。结果芯片检测83种自身抗体,发现HCV感染者中28种自身抗体滴度显著上调,3种抗体滴度显著下调。将ELISA法能检测到的13种抗体进行吸光度值统计分析,发现11种自身抗体滴度显著升高,2种自身抗体滴度无显著变化,与芯片结果一致。结论 HCV感染可以诱发自身免疫反应,产生多种自身抗体,有助于探索HCV致病机制,并为临床诊断和治疗HCV感染提供依据。
文摘利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库收集肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的RNA测序信息.首先,通过非负矩阵分解(non-negative matrix factorization,NMF)聚类方法和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出参与HCC免疫反应机制的关键基因.利用套索(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析构建预后基因模型,并用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法分析生物学功能.随后,对不同风险组患者使用单样本基因集富集分析(single sample genes set enrichment analysis,ssGSEA)评估两组间免疫浸润和相关功能差异.使用“RMS”R软件包结合独立危险因素构建列线图以预测患者的总体生存时间.最后,利用人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atlas,HPA)与实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)进行临床初步验证.总之,本文在风险评分的基础上整合患者临床特征,构建了一个可验证、可重复的列线图,为临床肿瘤患者的精准治疗提供可靠的参考.
文摘目的建立我国Chinese 1优势基因型获得性弓形虫眼病小鼠模型,分析弓形虫感染对眼组织局部NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群的影响。方法C57BL/6小鼠经口感染20个弓形虫Wh6包囊,30d后取眼组织,苏木精和伊红(H&E)染色检查病理变化;采用PCR扩增眼组织中的弓形虫ITS-1基因;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫组化方法分析眼组织中的干扰素-γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)等细胞因子的mRNA及蛋白表达水平;对眼组织转录组测序,进行基因表达差异分析、GO(gene ontology)富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析;采用流式细胞术检测眼组织中NK细胞和CD49a^(+)NK细胞亚群水平。结果H&E染色检查感染组小鼠视网膜发生严重的病理改变,PCR扩增眼组织中弓形虫特异性基因ITS-1阳性,qRT-PCR扩增眼组织中细胞因子IFN-γ、TNF-α的mRNA表达上调(P<0.01),免疫组化检查视网膜中IFN-γ、TNF-α表达上调。转录组测序显示,感染组小鼠眼组织中有601个基因表达上调,108个基因表达下调,GO富集分析中差异表达基因在免疫反应、炎症反应等生物过程显著富集,KEGG富集分析显示31个差异表达基因富集在NK细胞介导的细胞毒性通路。流式细胞术检测感染鼠眼组织中NK和CD49a^(+)NK细胞百分比显著增加(P<0.01)。结论成功构建了Chinese 1优势基因型获得性弓形虫眼病小鼠模型,感染鼠眼组织中NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群百分比增加,提示NK细胞及CD49a^(+)NK细胞亚群在眼组织中积累可能参与弓形虫眼病的发生过程。
