文摘目的旨在构建结肠腺癌(colonic adenocarcinoma,COAD)中铜死亡相关基因(Cuproptosis-related genes,CRGs)的预后模型,探讨CRGs在COAD中的表达与预后的关系。方法从TCGA数据库下载了正常和COAD患者的转录组和临床数据,并从GEO数据库下载数据集GSE39582作为外部验证集。基于铜死亡相关基因表达量,对TCGA数据进行共识聚类以确定新的肿瘤亚型。采用单因素Cox回归分析、LASSO回归分析筛选预后基因并构建预后风险模型。并通过Kaplan-Meier生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)和一致性指数(concordance index,C-index)对模型进行评价。用GSE44001数据集对模型进行外部验证。基于风险评分及临床因素构建列线图,预测患者的生存率。并进行免疫浸润、GSEA分析、免疫检查点、药敏分析、肿瘤微环境和干细胞指数的研究,系统地阐述COAD中CRGs和免疫的相关性。结果21个CRGs在COAD组织及正常组织中差异表达。单变量Cox回归及Lasso回归分析确定了五个预后相关基因(SDHB,CCS,DLAT,FDX1,CP)并构建模型。Kaplan-Meier分析表明,高风险患者OS显著低于低风险患者(P<0.01),并在GEO队列中取得了验证(P<0.05)。风险模型的AUC值为0.734,表明预后值有统计学意义,模型具有一定的准确性。一致性分析和ROC结果表明,列线图模型有较好的预后预测准确性。这5个CRGs主要参与线粒体、免疫应答和代谢途径,是COAD预后的独立因素,并与免疫细胞浸润、免疫检查点以及肿瘤微环境和干细胞指数密切相关。结论构建了5个铜死亡相关基因的结肠腺癌预后模型,有可能作为未来临床实践中有效的预后标志物。
