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小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用
被引量：
5
1
作者
孙雪
吴晓微
+1 位作者
李兴文
裴鲁青
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期565-571,共7页
用核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）和叶绿体rbcL基因对小球藻属（Chlorella）6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列（ITS和rbcL序列各为15条）一起进行比较分析。结果显示：ITS序列...
用核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）和叶绿体rbcL基因对小球藻属（Chlorella）6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列（ITS和rbcL序列各为15条）一起进行比较分析。结果显示：ITS序列长度在小球藻种内高度保守，在种间变异较大；而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0．000～0．663之间；而15株小球藻rbcL序列间距离在0．000～0．216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系；蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近；椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远。研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定。
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关键词
小球藻
内转录间隔区
RBCL基因
遗传距离
种间关系
种内关系
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职称材料
题名
小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用
被引量：
5
1
作者
孙雪
吴晓微
李兴文
裴鲁青
机构
宁波大学
教育部
应用
海洋生物工程
重点
实验室
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期565-571,共7页
基金
国家自然科学基金(30700610)
浙江省教育厅项目(20040899)
宁波市自然科学基金项目(2006A610084)
文摘
用核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）和叶绿体rbcL基因对小球藻属（Chlorella）6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列（ITS和rbcL序列各为15条）一起进行比较分析。结果显示：ITS序列长度在小球藻种内高度保守，在种间变异较大；而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0．000～0．663之间；而15株小球藻rbcL序列间距离在0．000～0．216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系；蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近；椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远。研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定。
关键词
小球藻
内转录间隔区
RBCL基因
遗传距离
种间关系
种内关系
Keywords
Chlorella
ITS
rbcL
genetic distance
interspecies relationship
intraspecies relationship
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用
孙雪
吴晓微
李兴文
裴鲁青
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
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参考文献
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