题名 日本沼虾遗传多样性的ISSR分析(英文)
被引量：16
1
作者
杨频 陈立侨 王伟 禹娜 宋大祥 刘占江
机构
华东师范大学 生命科学学院 大连海洋大学 生命科学与技术学院 奥本 大学 水产 学院
出处
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期913-921,共9页
基金
Chinese Natural Science Foundation(30771670) National Key Project of Scientific and Technical Supporting Programs Funded by Ministry of Science&Technology of China(2006BAD01A13) +1 种基金 Zhejiang Key Science and Technology Program of China(2006C12005) E-institute of the Shanghai Municipal Education Commission(E03009)~~
文摘
日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是中国分布范围广、经济价值较大的一种重要淡水虾类。随着养殖规模的不断扩大,如何保持养殖群体的遗传品质已引起了人们的重视。但迄今为止,养殖的日本沼虾均来自未经系统遗传选育的野生群体,而养殖病害的日趋严重和养成规格、品质的下降已严重影响到日本沼虾养殖产业的健康发展。研究野生群体的遗传结构和遗传分化,揭示其遗传多样性是制定合理有效的保护和管理策略的前提和基础。ISS(RInter-simple sequence repeats,简单重复序列中间区域)标记技术具有实验重复性好、信息量大、多态性高等优点,是一种理想的检测群体遗传变异的分子标记。因此,本研究应用ISSR标记技术对日本沼虾5个地理群体进行了初步的遗传分析,以期为合理开发和利用日本沼虾天然资源,以及建立和保护日本沼虾种质资源库及基因库提供理论依据。本研究对采自江苏苏州、江西南昌、云南西双版纳、湖北宜都和新疆博湖的5个地理群体进行了初步研究。从50个ISSR引物中筛选出9个条带清晰、稳定性和重复性好,且产生相对较多条带的引物用于全部DNA样品的PCR扩增。对日本沼虾5个地理群体的群体遗传分析表明,在所有检测到的清晰且可重复的142个有效位点中,多态位点有138个。物种水平上,多态位点百分率(PPL)、等位基因数(No)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为97.18%、1.972、0.312、0.120和0.323。而在群体水平上,5个地理群体的多态位点百分率为29.58%～61.97%;等位基因数(No)为1.296～1.620;有效等位基因数(Ne)为1.165～1.281;Nei’s基因多样性指数(H)为0.098～0.172;Shannon信息指数(I)为0.147～0.267。从各个地理群体看,江西南昌群体的遗传多样性最高(PPB:61.97%,No:1.620,Ne:1.281,H:0.172,I:0.267),而湖北宜都群体最低(PPB:29.58%,No:1.296,Ne:
关键词
日本沼虾 遗传多样性 ISSR
Keywords
Macrobrachium nipponense genetic diversity ISSR
分类号
S96
[农业科学—水产养殖]
