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基因芯片技术应用研究进展 被引量:2
1
作者 左绍远 《大理医学院学报》 2001年第2期72-74,共3页
目的:综述基因芯片技术在医药领域的应用研究进展。方法:检索相关文献进行分析、归纳总结。结果:基因芯片技术是近年出现的高新生物技术,因具有高通量、并行性、微型化与自动化等特点而在生命科学中日益显示出其重要的理论与实际应... 目的:综述基因芯片技术在医药领域的应用研究进展。方法:检索相关文献进行分析、归纳总结。结果:基因芯片技术是近年出现的高新生物技术,因具有高通量、并行性、微型化与自动化等特点而在生命科学中日益显示出其重要的理论与实际应用价值。结论:基因芯片技术已成为一种高新生物技术平台,其发展与应用前景十分广阔。 展开更多
关键词 基因芯片 DNA集微列阵 高新生物技术 应用 进展
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人线粒体转录终止因子3在胃癌组织中的表达及其意义 被引量:13
2
作者 自加吉 杨勇琴 +4 位作者 孙美涛 梅雯 于成和 张晓娟 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期84-87,共4页
目的分析hMTERF3 mRNA和蛋白质在胃癌组织及正常组织中的表达,探讨其与胃癌发生、发展的关系。方法分别采用半定量RT-PCR和免疫组化SP法,检测61例胃癌组织及正常组织中hMTERF3 mRNA和蛋白质表达水平,分析hMTERF3表达与胃癌临床分期、病... 目的分析hMTERF3 mRNA和蛋白质在胃癌组织及正常组织中的表达,探讨其与胃癌发生、发展的关系。方法分别采用半定量RT-PCR和免疫组化SP法,检测61例胃癌组织及正常组织中hMTERF3 mRNA和蛋白质表达水平,分析hMTERF3表达与胃癌临床分期、病理分级、肌层浸润和淋巴结转移的关系。结果 hMTERF3 mRNA和蛋白质在胃癌组织中的表达水平显著高于正常胃组织。hMTERF3蛋白在正常胃组织阳性率为24.6%(15/61),胃癌组织中的阳性率为86.9%(53/61),差异具有统计学意义。hMTERF3蛋白的表达与胃癌临床分期、病理分级、肌层浸润和淋巴结转移有关。结论 hMTERF3蛋白的表达异常可能是胃癌发生、发展的分子机制之一,可为预测胃癌的发生提供可能的生物学标志物,也可为胃癌基因诊断和基因治疗提供潜在的靶标。 展开更多
关键词 胃肿瘤 人线粒体转录终止因子3 RT-PCR 免疫组织化学
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医学检验专业临床分子生物学检验课程的教学反思 被引量:13
3
作者 熊伟 左绍远 +3 位作者 周静华 孙美涛 梅雯 徐春萍 《基础医学教育》 2016年第10期828-832,共5页
临床分子生物学检验是大理大学医学检验专业的必修课程。针对临床分子生物学检验课程特点和教学实践中存在的问题,从学生正确学习方法和学习目的的培养,教学手段的合理运用,实验教学模式和内容的优化,考试内容和考试制度的改革等方面进... 临床分子生物学检验是大理大学医学检验专业的必修课程。针对临床分子生物学检验课程特点和教学实践中存在的问题,从学生正确学习方法和学习目的的培养,教学手段的合理运用,实验教学模式和内容的优化,考试内容和考试制度的改革等方面进行教学总结和反思。结果表明,合理运用多种教学方法,坚持教学反思对提高临床分子生物学检验课程教学质量非常必要。 展开更多
关键词 临床分子生物学检验 医学检验专业 教学反思
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恶性胸膜间皮瘤中LOX基因的表达及其预后意义 被引量:6
4
作者 自加吉 李彬 +5 位作者 杨娜 普元倩 李素芬 王唯斯 张态 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期699-706,共8页
目的探讨赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)基因在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma,MPM)细胞和组织中的表达及预后意义。方法采用RT-qPCR和Western blot法分析人胸膜间皮细胞系MeT-5A和MPM细胞系NCI-H28、NCI-H2052、NCI-... 目的探讨赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)基因在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma,MPM)细胞和组织中的表达及预后意义。方法采用RT-qPCR和Western blot法分析人胸膜间皮细胞系MeT-5A和MPM细胞系NCI-H28、NCI-H2052、NCI-H2452中LOX mRNA和蛋白表达水平;采用RT-qPCR检测9例MPM组织及配对正常胸膜组织中LOX基因mRNA表达量;通过Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中LOX基因的表达差异进行分析;通过R 3.6.3对TCGA数据库中LOX mRNA表达量与MPM临床病理特征的相关性进行分析;采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier模型探究LOX mRNA表达量对MPM患者预后的影响,并分别对LOX基因与MPM肿瘤标志物基因和赖氨酰氧化酶样蛋白1~4(LOXL1~4)基因表达的相关性进行分析。结果与MeT-5A细胞相比,3种人MPM细胞中LOX mRNA和蛋白的表达水平均提高(P<0.05)。RT-qPCR检测发现,与正常胸膜组织相比,MPM组织中LOX mRNA的表达量增加(P<0.05)。LOX基因表达量与MPM患者T分期相关(P<0.05)。LOX基因高表达者的总生存率和无瘤生存率均低于LOX基因低表达者(P<0.05)。MPM肿瘤标志物间皮素(MSLN)、钙结合蛋白2(CALB2)基因与LOX基因表达呈负相关(P<0.05),而血小板反应蛋白2(THBS2)基因与LOX基因的表达呈正相关(P<0.05)。LOXL2和LOXL4基因与LOX基因表达呈正相关(P<0.05)。结论LOX基因在MPM细胞和组织中高表达,LOX基因高表达提示MPM患者预后不良。 展开更多
关键词 恶性胸膜间皮瘤 LOX 数据挖掘 预后意义
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基于TCGA数据分析NEK2基因在恶性胸膜间皮瘤中的表达及预后意义
5
作者 李锦松 李彬 +4 位作者 刘如爱 普元倩 自加吉 余敏 熊伟 《右江医学》 2024年第2期103-111,共9页
目的 分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基... 目的 分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基因在MPM中的差异分析、临床病理相关性分析、COX单因素和多因素分析以及基因富集分析,并绘制ROC曲线;利用TIMER2.0数据库分析MPM中NEK2表达与常见的免疫细胞浸润的相关性。选取12例MPM组织和6例非MPM胸膜组织,通过RT-qPCR的方法验证NEK2基因在MPM与非瘤组织中的表达情况。结果 与正常肺组织相比,NEK2在MPM组织中高表达(P<0.001)。NEK2基因mRNA表达量与MPM淋巴结分期具有显著相关性(P<0.05);NEK2高表达与MPM患者预后不良相关(P<0.001);NEK2基因表达与MPM中B淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(P<0.05),并在细胞周期、DNA复制、剪接体、mRNA监测等通路显著富集。在收集到的病例样本中,与非MPM胸膜组织相比,NEK2基因在MPM组织中的表达量显著增高(P<0.01)。结论 NEK2在MPM组织中高表达,且NEK2在MPM中高表达提示预后不良,可能成为治疗MPM的潜在靶点。 展开更多
关键词 恶性胸膜间皮瘤 永不有丝分裂基因A相关激酶2 癌症基因组图谱 预后 生物信息学
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人线粒体单链DNA结合蛋白1在恶性肿瘤发生、发展中的作用及研究进展
6
作者 林亚茹 王心萌 +4 位作者 普元倩 刘如爱 自加吉 余敏 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期744-747,共4页
人线粒体单链DNA结合蛋白1(mitochondrial single-strand DNA-binding protein 1, mtSSBP1)是定位于线粒体中的单链DNA结合蛋白,参与线粒体DNA(mtDNA)的复制、转录和修复,在维持线粒体基因组的稳定性和功能等发挥重要作用。mtSSBP1与肿... 人线粒体单链DNA结合蛋白1(mitochondrial single-strand DNA-binding protein 1, mtSSBP1)是定位于线粒体中的单链DNA结合蛋白,参与线粒体DNA(mtDNA)的复制、转录和修复,在维持线粒体基因组的稳定性和功能等发挥重要作用。mtSSBP1与肿瘤细胞增殖、转移和侵袭等恶性生物学行为相关,在多种人类恶性肿瘤中表达上调,其与肿瘤组织浸润加深、分化能力减弱、肿瘤增大和临床分期增加均相关。该文现对mtSSBP1的结构、功能及其在不同类型恶性肿瘤中的作用机制进行阐述,旨在为mtSSBP1与肿瘤的基础研究和临床应用提供参考。 展开更多
关键词 恶性肿瘤 线粒体单链DNA结合蛋白1 生物学标志物 预后 文献综述
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基于TCGA数据库分析SSBP1基因在肝细胞癌中的表达及预后
7
作者 林亚茹 杨玺 +5 位作者 李锦松 刘如爱 普元倩 李建康 余敏 熊伟 《宁夏医科大学学报》 2024年第2期146-152,共7页
目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究SSBP1基因在肝细胞癌(HCC)组织中的表达情况,并探讨SSBP1基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性。方法基于TCGA数据库提取374例HCC组织及50例正常肝组织中SSBP1基因表达量数据、患者的临... 目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究SSBP1基因在肝细胞癌(HCC)组织中的表达情况,并探讨SSBP1基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性。方法基于TCGA数据库提取374例HCC组织及50例正常肝组织中SSBP1基因表达量数据、患者的临床病理参数资料,利用R 4.1.2分析SSBP1在HCC中的表达情况及其与HCC患者的临床病理特征和预后的相关性,通过基于基因表达水平值的交互式分析平台(GEPIA)数据库和R 4.1.2联合分析SSBP1在HCC各临床病理分期间的表达差异,利用TIMER数据库分析SSBP1表达与免疫细胞浸润的相关性,通过R软件pROC程序包制作ROC生存曲线评估SSBP1表达量对HCC的诊断效果。结果TCGA数据库分析表明,无论是配对样本还是非配对样本,SSBP1 mRNA在HCC组织中的表达水平均高于正常肝组织(P均<0.001),且表达水平与性别和M分期有关(P均<0.05),与年龄、T分期、AJCC分期等无关(P均>0.05)。进一步进行单因素和多因素Cox回归分析发现,SSBP1高表达是影响HCC患者总生存期(OS)的独立危险因素(HR=1.713,P=0.016)。免疫细胞浸润分析发现,HCC组织中SSBP1表达与幼稚B细胞浸润水平呈负相关,而与记忆B细胞和巨噬细胞呈正相关(|r|>0.2,P均<0.05)。ROC曲线分析显示,SSBP1 mRNA表达水平对HCC的早期诊断和预后均具有良好的评估价值(AUC>0.50)。结论SSBP1 mRNA在HCC中的表达增高,且高表达是预后不良的独立危险因素,同时SSBP1对HCC具有良好的诊断价值,可成为HCC患者预后判断一种潜在的分子标志物以及免疫治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 线粒体单链DNA结合蛋白 癌症基因组图谱 肝细胞癌 生物标志物 预后
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自噬相关基因5在人恶性胸膜间皮瘤中的表达及其意义
8
作者 刘如爱 王播勇 +3 位作者 李锦松 普元倩 余敏 熊伟 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第8期673-679,共7页
目的探讨自噬相关基因5(ATG5)在人恶性胸膜间皮瘤(MPM)细胞和组织中的表达情况,分析ATG5与MPM患者临床病理参数和预后的相关性。方法实时定量PCR(RT-qPCR)和Western blotting检测正常人胸膜间皮细胞和MPM细胞、非MPM胸膜间皮组织和MPM... 目的探讨自噬相关基因5(ATG5)在人恶性胸膜间皮瘤(MPM)细胞和组织中的表达情况,分析ATG5与MPM患者临床病理参数和预后的相关性。方法实时定量PCR(RT-qPCR)和Western blotting检测正常人胸膜间皮细胞和MPM细胞、非MPM胸膜间皮组织和MPM组织中ATG5的表达差异。应用TCGA数据库分析ATG5与MPM患者临床病理特征和预后的相关性。构建Cox回归模型,分析影响MPM患者预后的因素。GEPIA数据库评估ATG5与MPM肿瘤标志物和新型血清标志物的相关性。TIMER数据库分析ATG5与MPM免疫细胞浸润和关键免疫调节基因的相关性。结果ATG5在MPM细胞和组织中显著高表达,且与MPM患者的肿瘤分期呈正相关(P<0.05)。生存分析显示,ATG5高表达组MPM患者的预后更差,肿瘤病理类型可能是患者预后不良的危险因素(P<0.05)。ATG5与多种MPM肿瘤标志物(MTAP、SETD2、NF2、FIB3)和新型血清标志物(HMGB1、SMPR、THBS2、KRAS)显著相关(P<0.05)。ATG5表达与MPM中免疫细胞浸润(B细胞、CD4^(+)T细胞和巨噬细胞)和免疫相关基因(CD28、CUL48B、CD166、MMP14)呈显著正相关(P<0.05)。结论ATG5在MPM中表达上调,且与患者不良预后和免疫浸润水平相关,有望成为MPM早期筛查、诊断和预后评估的重要生物标志物。 展开更多
关键词 恶性胸膜间皮瘤 自噬相关基因5 自噬 预后 免疫浸润
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赖氨酰氧化酶样蛋白4在人类恶性肿瘤发生与发展中的作用 被引量:4
9
作者 普元倩 余敏 熊伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1164-1173,共10页
赖氨酰氧化酶样蛋白4(lysyl oxidase like 4,LOXL4)是一种属于赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)蛋白质家族的分泌型铜依赖性胺氧化酶,参与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)的组装和维持。LOXL4蛋白在人类肝癌、胃癌、乳腺癌、宫颈... 赖氨酰氧化酶样蛋白4(lysyl oxidase like 4,LOXL4)是一种属于赖氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)蛋白质家族的分泌型铜依赖性胺氧化酶,参与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)的组装和维持。LOXL4蛋白在人类肝癌、胃癌、乳腺癌、宫颈癌、头颈鳞癌、食管癌和结直肠癌中表达上调,而在人类膀胱癌和肺癌中表达下调并抑制肿瘤的生长,表明LOXL4蛋白在不同类型的人类恶性肿瘤中具有促癌或抑癌的双向作用。肿瘤细胞外泌体中的LOXL4蛋白通过催化作用产生过氧化氢,后者直接激活FAK/Src信号通路,并促进细胞基质粘附和细胞迁移。外泌体介导的LOXL4还可以通过激活PI3K/Akt信号通路来促进肿瘤细胞的增殖和免疫逃逸。肿瘤细胞中的LOXL4可以经外泌体转运至巨噬细胞,进一步通过STAT1和STAT3介导的信号通路激活细胞免疫抑制功能和激活程序性死亡配体1(programmed death ligand 1,PD-L1)表达,触发巨噬细胞的免疫抑制功能,促进肿瘤细胞的免疫逃逸。此外,LOXL4蛋白还能通过激活p53蛋白和抑制Ras/ERK信号转导通路发挥抑癌功能。本文主要总结了LOXL4蛋白的结构、功能及其在人类恶性肿瘤发生发展的作用机制,进一步探讨LOXL4蛋白在恶性肿瘤研究中的应用前景,为恶性肿瘤的临床诊断、治疗和筛选预后标志物提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样蛋白4 细胞外基质 恶性肿瘤 转移 侵袭
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KAP1基因在恶性胸膜间皮瘤的表达及预后意义 被引量:1
10
作者 梅雯 王心萌 +2 位作者 刘如爱 熊伟 张也频 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期258-267,共10页
目的分析KRAB相关蛋白1(KAP1)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达,研究其表达水平与MPM患者的临床特征及预后的关系。方法于2022年4月,通过TCGA数据库中下载的MPM患者KAP1 mRNA二代测序数据及临床病理资料,分析KAP1 mRNA表达量与临床参数相... 目的分析KRAB相关蛋白1(KAP1)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达,研究其表达水平与MPM患者的临床特征及预后的关系。方法于2022年4月,通过TCGA数据库中下载的MPM患者KAP1 mRNA二代测序数据及临床病理资料,分析KAP1 mRNA表达量与临床参数相关性;基于楚雄数据集队列临床样本分析KAP1蛋白表达量与临床病理参数的相关性及其预后价值。用qRT-PCR和Western blotting法分析人正常胸膜间皮细胞系Met-5A和MPM细胞系NCI-H28(上皮型)、NCI-H2052(肉瘤型)、NCI-H2452(双相混合型)和MTSO-211H中KAP1 mRNA和蛋白质的表达水平;用免疫组化和Western blotting法检测KAP1蛋白在MPM组织及正常胸膜组织中的表达。构建Kaplan-Meier模型探讨KAP1表达量对MPM患者预后的影响,Cox多因素回归分析MPM患者的预后影响因素。结果NCI-H28、NCI-H2052、NCI-H2452和MTSO-211H细胞中KAP1基因表达水平均明显高于Met-5A细胞(P<0.05)。与正常胸膜组织比较,MPM组织中KAP1明显高表达(P<0.05),KAP1蛋白表达水平与TP53蛋白表达水平、血清CEA水平相关(P<0.05)。KAP1 mRNA表达水平与总体生存率明显相关,KAP1 mRNA高表达的间皮瘤患者总生存时间均明显缩短(HR=3.7,Logrank P<0.001)。肿瘤类型、年龄与KAP1 mRNA表达水平MPM患者生存预后有关(P<0.05)。多因素分析发现,肿瘤类型和KAP1 mRNA表达水平是影响MPM患者预后的独立因素(P<0.05)。结论KAP1在MPM组织中呈高表达,其表达水平与病理类型可能与患者预后相关。 展开更多
关键词 间皮瘤 基因表达 KAP1基因 TCGA数据库 楚雄队列
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LOXL1和LOXL2基因在恶性胸膜间皮瘤中的表达及临床意义 被引量:3
11
作者 李彬 杨娜 +5 位作者 李素芬 普元倩 张态 自加吉 李正亮 熊伟 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第2期154-160,共7页
目的 赖氨酰氧化酶样蛋白1(LOXL1)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)的表达差异及其预后价值尚不明确。文中旨在探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA在MPM组织中的表达及其临床意义。方法 回顾性收集2017年6月至2019年12月大理... 目的 赖氨酰氧化酶样蛋白1(LOXL1)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)的表达差异及其预后价值尚不明确。文中旨在探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA在MPM组织中的表达及其临床意义。方法 回顾性收集2017年6月至2019年12月大理大学第一附属医院胸外科12例MPM患者的癌组织和配对相邻正常胸膜组织。采用RT-qPCR检测MPM组织及配对正常胸膜组织中LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量。通过Oncomine数据库对非瘤组织与MPM组织中LOXL1和LOXL2基因的表达差异进行分析。通过R4.0.2软件对TCGA数据库中LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量与MPM临床病理特征的相关性进行分析。构建Kaplan-Meier模型分别探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响。采用基因表达谱动态分析(GEPIA)分别对LOXL1和LOXL2与MPM肿瘤标志物基因和LOX家族其他成员基因表达的相关性进行分析。结果 RT-qPCR检测显示,与正常胸膜组织比较,MPM组织中LOXL1和LOXL2基因mRNA的表达量显著增加(P<0.01)。LOXL1基因和LOXL2基因的高表达是导致MPM患者预后不良的影响因素,上皮样型MPM预示着MPM患者预后良好(P<0.05)。LOXL1基因表达与EFEMP1(r=-0.25,P=0.021)、MSLN(r=-0.35,P<0.001)、CALB2(r=-0.36,P<0.001)、THBS2(r=0.32,P=0.003)和CDH11基因(r=0.25,P=0.018)表达具有显著相关性。LOXL1基因表达与LOXL2(r=0.22,P=0.041)、LOXL4(r=0.3,P=0.004)基因具有显著正相关;LOXL2基因表达与LOX(r=0.65,P<0.001)、LOXL1(r=0.22,P=0.041)和LOXL4(r=0.37,P<0.001)基因表达具有显著正相关。结论 LOXL1和LOXL2基因在MPM组织中均呈现显著高表达,其基因表达量是评估MPM患者预后的有效指标。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样蛋白1 赖氨酰氧化酶样蛋白2 RT-QPCR 恶性胸膜间皮瘤 数据挖掘 临床意义
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对医学类本科专业医学生物化学的教学反思 被引量:5
12
作者 熊伟 左绍远 +1 位作者 林春榕 周静华 《基础医学教育》 2015年第7期591-594,共4页
为提高教师的教学理论水平和实践能力,从医学生物化学课程教学对象、教学内容、教学方法、教学模式等方面进行深刻的教学反思。针对医学类专业学生的特点,合理运用多种教学方法,因人施教,因材施教,能有效提高医学生物化学的教学效果。... 为提高教师的教学理论水平和实践能力,从医学生物化学课程教学对象、教学内容、教学方法、教学模式等方面进行深刻的教学反思。针对医学类专业学生的特点,合理运用多种教学方法,因人施教,因材施教,能有效提高医学生物化学的教学效果。通过教学反思,能切实提高医学生物化学课程的教学质量,提升教师教学能力和教学反思能力,促进教师教育智慧的形成。 展开更多
关键词 医学生物化学 本科教育 教学反思
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基于网络药理学探讨丹参治疗类风湿关节炎的潜在分子机制
13
作者 李自霖 王桂花 +2 位作者 张翠香 陈贵元 李雪英 《中国医药科学》 2024年第9期91-95,共5页
目的基于网络药理学探讨丹参治疗类风湿关节炎的分子机制。方法利用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)获取丹参的活性成分及靶点,与GeneCards、OMIM数据库获取的类风湿关节炎疾病基因靶点映射,构建药物-活性成分-疾病靶点网络。DAVI... 目的基于网络药理学探讨丹参治疗类风湿关节炎的分子机制。方法利用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)获取丹参的活性成分及靶点,与GeneCards、OMIM数据库获取的类风湿关节炎疾病基因靶点映射,构建药物-活性成分-疾病靶点网络。DAVID数据库中进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果从丹参中筛选到56种活性成分,作用靶点基因100个;检索类风湿关节炎疾病靶点基因1640个;取丹参与类风湿关节炎疾病靶点基因交集共得到44个共同靶点,其中13个为关键靶点。获得96条GO生物学过程和25条KEGG信号通路,涉及免疫调节、炎症反应及细胞凋亡等。结论丹参可能通过多成分、多靶点网络来治疗类风湿关节炎。 展开更多
关键词 网络药理学 丹参 类风湿关节炎 分子机制
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微RNA在恶性胸膜间皮瘤发生发展中的作用机制研究进展
14
作者 赵丹 普元倩 熊伟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期967-975,共9页
微RNA(microRNA,miRNA)是近年来发现的最短的内源性非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNA)之一,普遍认为其通过调节信使RNA(messenger RNA,mRNA)表达水平来发挥作用,主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等... 微RNA(microRNA,miRNA)是近年来发现的最短的内源性非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNA)之一,普遍认为其通过调节信使RNA(messenger RNA,mRNA)表达水平来发挥作用,主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等多种病理和生理过程中。miRNA在调控癌基因、抑癌基因的表达和信号通路的活性过程中以及在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma,MPM)发生和发展中发挥着重要的作用。本综述对miRNA的生成和miRNA的功能及在MPM发生发展过程中发挥促癌作用和肿瘤抑制作用的相关miRNA进行总结和归纳,以期为MPM的临床诊断以及治疗提供理论参考。 展开更多
关键词 微RNA 恶性胸膜间皮瘤 促癌基因 抑癌基因
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赖氨酰氧化酶样蛋白3在人类恶性肿瘤发生、发展中的研究进展 被引量:3
15
作者 李彬 朱泓 +2 位作者 黄照能 余敏 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期966-970,共5页
赖氨酰氧化酶样蛋白3 (lysyl oxidase like 3,LOXL3)属于LOX蛋白家族成员之一,是一种铜依赖性胺氧化酶,负责细胞外基质中胶原蛋白和弹性蛋白的交联。LOX蛋白家族还包括LOX、LOXL1、LOXL2和LOXL4。LOXL3基因存在两种转录本变体,分别为LOX... 赖氨酰氧化酶样蛋白3 (lysyl oxidase like 3,LOXL3)属于LOX蛋白家族成员之一,是一种铜依赖性胺氧化酶,负责细胞外基质中胶原蛋白和弹性蛋白的交联。LOX蛋白家族还包括LOX、LOXL1、LOXL2和LOXL4。LOXL3基因存在两种转录本变体,分别为LOXL3-sv1和LOXL3-sv2,在人体正常组织中差异表达。LOXL3定位于胃癌细胞胞核,与胃癌的侵袭和预后不良相关。LOXL3蛋白在恶性肿瘤发生、发展中通过诱导上皮-间充质转化,促进肿瘤侵袭和转移;LOXL3与维持DNA稳定性和有丝分裂的蛋白质相互作用,促进肿瘤进展和持续增殖。该文现就LOXL3蛋白的结构、功能及其在人类恶性肿瘤发生、发展中的作用进行综述,以期为恶性肿瘤的临床诊断、治疗和筛选预后标志物,提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 恶性肿瘤 胶原蛋白 LOXL3蛋白 赖氨酰氧化酶
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恶性胸膜间皮瘤中间皮素表达的临床病理相关性及其预后意义 被引量:2
16
作者 李彬 李素芬 +3 位作者 王唯斯 杨娜 自加吉 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2021年第2期50-55,共6页
通过探讨间皮素(MSLN)与恶性胸膜间皮瘤临床病理之间的相关性及其预后意义。采用R 3.6.3对美国公共癌症基因数据库(TCGA)进行数据挖掘和分析,利用Oncomine数据库对非癌组织与癌组织中MSLN的表达量进行比较分析,采用基因表达谱动态分析(G... 通过探讨间皮素(MSLN)与恶性胸膜间皮瘤临床病理之间的相关性及其预后意义。采用R 3.6.3对美国公共癌症基因数据库(TCGA)进行数据挖掘和分析,利用Oncomine数据库对非癌组织与癌组织中MSLN的表达量进行比较分析,采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier生存模型探究MSLN表达量对恶性胸膜间皮瘤患者预后的影响,使用cBioportal进行MSLN基因相关性可视化分析。结果表明,MSLN在正常组织中低表达,恶性胸膜间皮瘤组织中高表达;MSLN的表达水平与恶性胸膜间皮瘤的肿瘤类型及组织学诊断类型相关;在MPM患者中,MSLN高表达的患者总生存率显著高于MSLN低表达的患者。因此,间皮素有望作为恶性胸膜间皮瘤诊断或治疗的潜在新靶点。 展开更多
关键词 恶性胸膜间皮瘤 间皮素 数据挖掘 预后意义
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长链非编码RNA LOXL1-AS1在人类恶性肿瘤中的作用及其分子调控机制 被引量:1
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作者 普元倩 李彬 +2 位作者 自加吉 余敏 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第1期79-83,共5页
长链非编码RNA(lncRNA)广泛参与生物体的各种生理与病理过程。lncRNA作为肿瘤致癌因子或抑癌因子参与恶性肿瘤的多种生物过程,与恶性肿瘤的发生、发展密切相关。赖氨酰氧化酶样蛋白1-反义RNA1(LOXL1-AS1)是近年来发现的一种lncRNA,其在... 长链非编码RNA(lncRNA)广泛参与生物体的各种生理与病理过程。lncRNA作为肿瘤致癌因子或抑癌因子参与恶性肿瘤的多种生物过程,与恶性肿瘤的发生、发展密切相关。赖氨酰氧化酶样蛋白1-反义RNA1(LOXL1-AS1)是近年来发现的一种lncRNA,其在多种恶性肿瘤中表达上调,并与肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移、患者预后等病理特征相关。LOXL1-AS1通过与多种微小RNA竞争性结合,调节下游靶基因的表达及调控相关信号通路发挥促癌作用。该文通过总结LOXL1-AS1参与多种人类恶性肿瘤的生物学过程,不同的分子调控机制影响肿瘤细胞增殖、转移、侵袭和凋亡等恶性生物学行为,探讨潜在的临床意义和应用前景,以期为恶性肿瘤的临床诊断、治疗和筛选预后标志物提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 肿瘤 长链非编码RNA 微小核糖核酸 LOXL1-AS1 文献综述
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SERINC2通过激活TGF-β/Smad3信号通路促进脑胶质瘤细胞的迁移和侵袭
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作者 许杨 袁红平 +3 位作者 李晓全 范耀东 李得意 马雪艳 《中国现代医药杂志》 2024年第11期33-38,共6页
目的探讨丝氨酸整合因子2(Serine incorporator 2,SERINC2)对脑胶质瘤细胞迁移和侵袭的影响及相关分子机制。方法利用GEPIA数据库在线分析脑胶质瘤组织和正常脑组织中SERINC2的表达差异;运用CGGA数据库检测SERINC2 mRNA的表达水平与脑... 目的探讨丝氨酸整合因子2(Serine incorporator 2,SERINC2)对脑胶质瘤细胞迁移和侵袭的影响及相关分子机制。方法利用GEPIA数据库在线分析脑胶质瘤组织和正常脑组织中SERINC2的表达差异;运用CGGA数据库检测SERINC2 mRNA的表达水平与脑胶质瘤患者生存率的关系;利用shRNA构建敲低SERINC2的U251细胞株,qRTPCR和Western blot检测敲低效率;采用划痕实验、Transwell实验分别检测SERINC2对U251细胞迁移和侵袭能力的影响;Western blot检测上皮-间质转化(EMT)和转化生长因子-β(TGF-β)/Smad3通路相关蛋白的表达。结果SERINC2 mRNA在脑胶质瘤中的表达高于正常脑组织,且SERINC2 mRNA高表达患者的10年生存率明显低于低表达患者(P<0.05);与对照组相比,敲低SERINC2后U251细胞的迁移和侵袭能力下降(P<0.05),且E-cadherin蛋白表达水平上升,TGF-β、Smad2/Smad3、p-Smad3和N-cadherin蛋白表达水平下降。结论SERINC2在脑胶质瘤中高表达,并且通过激活TGF-β/Smad3信号通路影响脑胶质瘤细胞EMT,从而促进脑胶质瘤细胞的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 SERINC2 TGF-β/Smad3 通路 迁移 侵袭
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线粒体转录延伸因子:调控线粒体DNA复制与转录转换的分子开关 被引量:2
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作者 李素芬 余敏 熊伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期504-511,共8页
线粒体转录延伸因子(TEFM)最早是基于其氨基酸序列与真核细胞核转录因子Spt6具有同源性而被鉴定,其包括两个串联重复的螺旋-发夹-螺旋结构域(Helix-Hairpin-Helix,(HhH)2)和一个RNase H折叠。TEFM二聚化对于TEFM与线粒体RNA聚合酶的结... 线粒体转录延伸因子(TEFM)最早是基于其氨基酸序列与真核细胞核转录因子Spt6具有同源性而被鉴定,其包括两个串联重复的螺旋-发夹-螺旋结构域(Helix-Hairpin-Helix,(HhH)2)和一个RNase H折叠。TEFM二聚化对于TEFM与线粒体RNA聚合酶的结合至关重要。近年的研究发现,TEFM是调控线粒体DNA(mtDNA)复制与转录相互转换的关键分子开关,参与人类线粒体基因转录延伸过程及其表达调控。本文首先介绍了TEFM蛋白的序列同源性、蛋白质结构特征,为后续功能研究奠定结构基础。其次,阐明了TEFM在线粒体转录延伸过程中的作用和抗转录终止功能,以及线粒体转录延伸复合体的功能。TEFM避免了mtDNA转录和复制过程发生冲突,使线粒体转录延伸复合体具有更高的稳定性和持续合成能力,体内和体外都能增强mtDNA转录延伸活性,在mtDNA的复制和转录调控中发挥重要作用。最后,阐述了TEFM参与线粒体RNA加工,以及在线粒体能量代谢和线粒体相关疾病的发生发展中的作用。TEFM的缺失严重损害氧化呼吸链,证明mtDNA转录延伸对于维持线粒体氧化磷酸化功能是必需的。1型神经纤维瘤、胰腺癌、脑胶质瘤等疾病的发生机制可能与TEFM基因缺失或表达异常有关,因此,本文进一步探讨和展望了TEFM对人类线粒体相关疾病研究的应用前景。 展开更多
关键词 线粒体转录延伸因子 线粒体基因组 线粒体RNA聚合酶 分子开关
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肝细胞性肝癌中线粒体转录延伸因子的表达及意义 被引量:2
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作者 李素芬 李彬 +5 位作者 普元倩 杨娜 王唯斯 自加吉 余敏 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期911-916,共6页
目的探讨线粒体转录延伸因子(mitochondrial transcription elongation factor,TEFM)在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达和临床意义。方法采用Western blot法检测人正常肝细胞(THLE-2)和6种HCC细胞中TEFM蛋白的表达... 目的探讨线粒体转录延伸因子(mitochondrial transcription elongation factor,TEFM)在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达和临床意义。方法采用Western blot法检测人正常肝细胞(THLE-2)和6种HCC细胞中TEFM蛋白的表达差异。对HCC组织芯片进行免疫组化检测,在70例HCC组织和对应的癌旁组织中检测TEFM表达量和细胞阳性率的差异,分析TEFM表达与临床病理学特征及预后的关系。结果TEFM蛋白在6种HCC细胞与人正常肝细胞(THLE-2)相比,其TEFM蛋白均显著上调[(1.803±0.275)倍](P<0.05);HCC组与对应的癌旁组织相比,TEFM蛋白表达量增高,其细胞阳性率也增高(P<0.05)。TEFM蛋白在HCC组织中的表达量与患者AFP含量有相关性(P=0.002),而与患者年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移、分化程度、HBV感染、肝硬化、血管侵犯、肿瘤数量、肿瘤大小、肿瘤包膜完整性和肿瘤复发无相关性(P均>0.05)。TEFM蛋白表达量与HCC患者总生存期(overall survival,OS)和无瘤生存期(disease-free survival,DFS)无相关性。结论TEFM蛋白在HCC细胞和组织中的表达增高,且与HCC患者的血清AFP含量呈正相关。TEFM蛋白表达量与HCC患者预后无关。 展开更多
关键词 肝肿瘤 线粒体转录延伸因子 组织芯片 免疫组织化学
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