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基于原位Hi-C技术对人肝细胞癌细胞系PLC/PRF/5和正常人肝细胞系L02的三维基因组对比测序分析(英文)
1
作者 胡昊麟 柴小强 +2 位作者 王立勇 蔡加彬 蓝斐 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期331-341,共11页
肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的肿瘤发生是基因组突变和表观遗传修饰变化积累的结果,但是HCC发生过程中的三维基因组构造变化仍然缺乏研究。基于此,在人源HCC细胞系PLC/PRF/5和人源正常肝细胞系L02中进行了原位Hi-C分析,并... 肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的肿瘤发生是基因组突变和表观遗传修饰变化积累的结果,但是HCC发生过程中的三维基因组构造变化仍然缺乏研究。基于此,在人源HCC细胞系PLC/PRF/5和人源正常肝细胞系L02中进行了原位Hi-C分析,并辅以转录组测序以及SMC3/CTCF/H3K27ac的染色质免疫共沉淀测序分析,借此比较两细胞系的三维基因组差异。结果显示,相较于正常肝细胞系,在PLC/PRF/5中发生了显著的染色体结构区域(Compartment)转换、三维拓扑结构域(Topologically associating domains,TAD)滑动和染色质环(Loop)的变化。以上这些染色质空间结构的差异与HCC细胞系中肿瘤特异性基因表达和启动子开放性增高具有相关性。因此,在PLC/PRF/5细胞系中的染色质三维结构差异可能在HCC肿瘤发生的表观遗传学机制中具有重要作用。 展开更多
关键词 肝细胞癌 三维基因组 原位Hi-C 染色质拓扑结构域 染色质环
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肝局灶性结节性增生的临床病理学研究 被引量：23
2
作者 纪元 朱雄增 +3 位作者 谭云山 曾海英 叶青海 汤钊猷 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期334-338,共5页
目的　探讨肝局灶性结节性增生的病理形态学特点。方法　分析 2 5例肝局灶性结节性增生患者的临床资料 ,采用HE染色并结合组织化学PAS、Masson三色网状纤维染色及免疫组织化学EnVisionTM法观察该病的形态特点 ,并观察 2例的超微结构特... 目的　探讨肝局灶性结节性增生的病理形态学特点。方法　分析 2 5例肝局灶性结节性增生患者的临床资料 ,采用HE染色并结合组织化学PAS、Masson三色网状纤维染色及免疫组织化学EnVisionTM法观察该病的形态特点 ,并观察 2例的超微结构特征。结果　 2 5例肝局灶性结节性增生 ,男性 17例 ,女性 8例 ,年龄 14～ 5 8岁 ,平均 38岁。均发生于甲胎蛋白阴性的中青年人 ,2 2例无肝炎背景。组织学上 16例有特征性的中央纤维瘢痕 ,由纤维结缔组织和扭曲的血管组成 ,并向外放射状形成许多纤维间隔。纤维间隔围绕无明显异形的肝细胞形成硬化样结节。结节周边肝细胞与纤维间隔内增生的胆小管细胞相移行 ,这些肝细胞与增生的胆小管细胞角蛋白的表达情况相似。电镜下瘤细胞与正常肝细胞相似。 2 0例随访 6～ 47个月 ,均无瘤生存。 展开更多
关键词 肝局灶性结节性增生 HE染色 病理学形态
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6种胃液游离microRNAs对胃腺癌的诊断价值 被引量：2
3
作者 陈妍洁 吴昊 +2 位作者 董玲 刘韬韬 沈锡中 《中国临床医学》 2018年第1期13-17,共5页
目的:探讨6种胃液游离microRNAs(以下简称miRNAs)对胃癌的潜在诊断价值。方法:选择2013年于复旦大学附属中山医院进行胃镜检查的53例患者为研究对象。提取胃液并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其中6种游离miRNAs表达量。按疾病诊断... 目的:探讨6种胃液游离microRNAs(以下简称miRNAs)对胃癌的潜在诊断价值。方法:选择2013年于复旦大学附属中山医院进行胃镜检查的53例患者为研究对象。提取胃液并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其中6种游离miRNAs表达量。按疾病诊断情况将患者分为胃癌组(24例胃腺癌患者)和对照组(16例胃溃疡患者和13例慢性胃炎患者),采用非参数Mann-Whitney检验比较两组患者胃液游离miRNAs的表达差异,采用ROC曲线下面积计算诊断效能。结果:与对照组相比,胃癌组患者胃液中miR-17、miR-18a、miR-20a、miR-21和miR-378的表达差异均有统计学意义(P<0.05)。miR-17、miR-18a、miR-21和miR-378具有中等诊断效能,miR-20a和miR-106b有较低诊断效能。结论:胃液6种游离miRNAs对于胃癌具有潜在诊断价值。 展开更多
关键词 MIRNAS 胃腺癌 胃液 诊断 肿瘤标志物
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