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柳枝稷质膜型水通道蛋白基因PvPIP1的克隆和序列分析
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作者 石锦 李仁 +8 位作者 王晋芳 吴新新 张娜 孙倩倩 齐艳 邢燕霞 周春蕾 赵冰 郭仰东 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期840-846,共7页
利用同源克隆结合RACE技术从柳枝稷(Panicum virgatum)中克隆得到了cDNA全长为1215 bp的柳枝稷质膜型水通道蛋白基因(PvPIP1),包含867 bp开放阅读框序列,编码288个氨基酸,将该基因提交到GenBank,获得登录号KC955176。生物信息学分析表明... 利用同源克隆结合RACE技术从柳枝稷(Panicum virgatum)中克隆得到了cDNA全长为1215 bp的柳枝稷质膜型水通道蛋白基因(PvPIP1),包含867 bp开放阅读框序列,编码288个氨基酸,将该基因提交到GenBank,获得登录号KC955176。生物信息学分析表明PvPIPI基因分子量为30.78 kD,含有6个跨膜区,2个高度保守的NPA模体结构,存在PIPs的高度保守序列GGGANXXXXTGY和TGI/TNPARSK/FGAAI/VI/VF/YN。对其同源性的分析表明,PvPIP1基因与黑麦草(Lolium pereune)和大麦(Hordeum vulgare)的质膜型水通道蛋白同源性高达98%和93%。荧光定量PCR结果显示。在PEG胁迫的任何时间点PvPIP1基因的表达与对照相比都表现上调,在ABA和NaCl胁迫的9h内其相对表达量高于对照,推测PvPIP1基因能参与柳枝稷对逆境的抗性反应。研究结果将为今后进一步探讨该基因在非生物逆境胁迫中的作用提供依据与信息。 展开更多
关键词 柳枝稷 质膜型水通道蛋白 同源克隆 亚细胞定位 非生物逆境
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