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人参皂苷Rg_(1)生物合成相关候选基因的鉴定和功能初步研究
被引量:
2
1
作者
刘芮岑
李俐
+2 位作者
王超凡
王义
张美萍
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第13期3473-3483,共11页
人参Panax ginseng为五加科人参属多年生草本植物,其主要活性成分为人参皂苷。在已报道的单体皂苷中,人参皂苷Rg_(1)不仅药用功能广泛、含量丰富,且是《中国药典》中用于鉴定人参品质的主要单体皂苷种类之一。人参皂苷Rg_(1)的生物合成...
人参Panax ginseng为五加科人参属多年生草本植物,其主要活性成分为人参皂苷。在已报道的单体皂苷中,人参皂苷Rg_(1)不仅药用功能广泛、含量丰富,且是《中国药典》中用于鉴定人参品质的主要单体皂苷种类之一。人参皂苷Rg_(1)的生物合成主要催化途径目前已较为明晰,这为解析人参皂苷Rg_(1)的生物合成与调控机制奠定了基础。但是人参皂苷Rg_(1)的合成涉及其他复杂过程,可能还有许多调控基因及催化酶基因,需要进行更加深入、全面的研究。因此,该研究基于前期所得的344份四年生人参根样本的转录组数据库及其对应的人参皂苷Rg_(1)含量表型,利用R语言中的DEseq2分析获得了随人参皂苷Rg_(1)含量变化的217条显著差异表达基因,并在此基础上通过WGCNA获得其中的40条hub基因,进一步利用Pearson相关分析得到其中20条与人参皂苷Rg_(1)含量显著相关的候选基因群,以上基因可注释到初级代谢、次生代谢等多个代谢过程中。随后通过在MeJA诱导的人参不定根中的表达分析,初步验证了其中16条基因响应MeJA诱导对人参皂苷Rg_(1)生物合成的影响。最后从16条基因中随机抽取1条,通过遗传转化和荧光定量的方法进一步验证基因的功能,并确认该研究方法的合理性。以上所得结果将为人参皂苷Rg_(1)的合成调控机制深入研究奠定基础,并为人参皂苷Rg_(1)的工厂化生产提供基因资源。
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关键词
候选功能基因
人参皂苷Rg_(1)
差异分析
加权基因共表达网络分析(WGCNA)
茉莉酸甲酯调控
遗传转化
荧光定量PCR
原文传递
题名
人参皂苷Rg_(1)生物合成相关候选基因的鉴定和功能初步研究
被引量:
2
1
作者
刘芮岑
李俐
王超凡
王义
张美萍
机构
吉林
农业大学
生命科学学院
吉林省
人参
基因资源
开发
与
利用
工程研究
中心
、
吉林
农业大学
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第13期3473-3483,共11页
基金
吉林省科技厅项目(20210402043GH)。
文摘
人参Panax ginseng为五加科人参属多年生草本植物,其主要活性成分为人参皂苷。在已报道的单体皂苷中,人参皂苷Rg_(1)不仅药用功能广泛、含量丰富,且是《中国药典》中用于鉴定人参品质的主要单体皂苷种类之一。人参皂苷Rg_(1)的生物合成主要催化途径目前已较为明晰,这为解析人参皂苷Rg_(1)的生物合成与调控机制奠定了基础。但是人参皂苷Rg_(1)的合成涉及其他复杂过程,可能还有许多调控基因及催化酶基因,需要进行更加深入、全面的研究。因此,该研究基于前期所得的344份四年生人参根样本的转录组数据库及其对应的人参皂苷Rg_(1)含量表型,利用R语言中的DEseq2分析获得了随人参皂苷Rg_(1)含量变化的217条显著差异表达基因,并在此基础上通过WGCNA获得其中的40条hub基因,进一步利用Pearson相关分析得到其中20条与人参皂苷Rg_(1)含量显著相关的候选基因群,以上基因可注释到初级代谢、次生代谢等多个代谢过程中。随后通过在MeJA诱导的人参不定根中的表达分析,初步验证了其中16条基因响应MeJA诱导对人参皂苷Rg_(1)生物合成的影响。最后从16条基因中随机抽取1条,通过遗传转化和荧光定量的方法进一步验证基因的功能,并确认该研究方法的合理性。以上所得结果将为人参皂苷Rg_(1)的合成调控机制深入研究奠定基础,并为人参皂苷Rg_(1)的工厂化生产提供基因资源。
关键词
候选功能基因
人参皂苷Rg_(1)
差异分析
加权基因共表达网络分析(WGCNA)
茉莉酸甲酯调控
遗传转化
荧光定量PCR
Keywords
candidate functional genes
ginsenoside Rg_(1)
differential analysis
weighted gene co-expression network analysis(WGCNA)
methyl jasmonate regulation
genetic transformation
qRT-PCR
分类号
S567.51 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人参皂苷Rg_(1)生物合成相关候选基因的鉴定和功能初步研究
刘芮岑
李俐
王超凡
王义
张美萍
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
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