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地被菊CmbZIPs基因的生物信息及表达模式分析
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作者 陈慧 杨雯婷 +6 位作者 何子涵 张佳凝 张发赓 殷铭 王耀莹 朱佳琪 高日 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第13期4203-4211,共9页
地被菊(Chrysanthemum morifolium)为菊科菊属多年生草本花卉,其具有花朵繁密、花色丰富、抗逆性强等特点,是园林绿化美化的优良品种。土壤的盐渍化和低温严重限制地被菊的分布。植物中HD-ZIP基因家族广泛参与植物非生物胁迫。本研究以... 地被菊(Chrysanthemum morifolium)为菊科菊属多年生草本花卉,其具有花朵繁密、花色丰富、抗逆性强等特点,是园林绿化美化的优良品种。土壤的盐渍化和低温严重限制地被菊的分布。植物中HD-ZIP基因家族广泛参与植物非生物胁迫。本研究以地被菊为材料,根据转录组数据克隆了CmbZIP12、CmbZIP24、CmbZIP10、CmbZIP3基因,对其氨基酸序列、保守结构域等进行了生物信息学分析。在低温胁迫和NaCl胁迫处理下,利用RT-qPCR分析了这些基因的表达特性。结果表明,CmbZIP12、CmbZIP24、CmbZIP10、CmbZIP3基因ORF在453~630 bp之间,CmbZIP12和CmbZIP3为酸性蛋白,CmbZIP24和CmbZIP10为碱性蛋白,CmbZIP12、CmbZIP10和CmbZIP3为不稳定蛋白,CmbZIP24为稳定蛋白;利用MEME软件预测CmZIPs基序组成,共鉴定出4个保守基序;系统发育分析显示,CmbZIP12和CmbZIP3为HD-ZIPⅠ亚家族,CmbZIP10为HD-ZIPⅡ亚家族,CmbZIP24为HD-ZIPⅢ亚家族;互作网络预测发现CmbZIP12与GBF3、SNRK2.3、OST1等蛋白存在网络互作关系;CmbZIP24与AT5G04840、ZIP2、BZIP34等蛋白互作。低温和盐处理地被菊幼苗发现,CmbZIP12、CmbZIP24、CmbZIP10、CmbZIP3相对表达量都明显增加。本研究可为地被菊CmbZIP12、CmbZIP24、CmbZIP10、CmbZIP3基因功能的研究提供参考。 展开更多
关键词 地被菊 CmbZIP 蛋白互作 低温胁迫 盐胁迫
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