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结核分枝杆菌疫源追踪的基因检测分析
被引量:
2
1
作者
万学勤
曾方银
+4 位作者
唐冬生
李万可兰
蒋泓
翁闪凡
黄永芬
《中国动物检疫》
CAS
2010年第1期43-44,共2页
目的探讨牛源性人结核疫源追踪的基因分析方法。方法采用复方PCR结核杆菌快速鉴定技术,针对特征性分枝杆菌标志基因(MTP40基因、α抗原基因和IS6110),对结核病人和患牛的标本,进行检测。结果患者标本结核分枝杆菌阳性;患牛标本牛分枝杆...
目的探讨牛源性人结核疫源追踪的基因分析方法。方法采用复方PCR结核杆菌快速鉴定技术,针对特征性分枝杆菌标志基因(MTP40基因、α抗原基因和IS6110),对结核病人和患牛的标本,进行检测。结果患者标本结核分枝杆菌阳性;患牛标本牛分枝杆菌和结核分枝杆菌分别阳性。结论结核病奶牛不仅是人类牛型结核的可能来源,也可能成为人类人型结核的潜在来源。
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关键词
核病
传染源
PCR
牛乳
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职称材料
基于FoldX力场的蛋白突变建模方法可用于人工锌指酶辅助设计
2
作者
何祖勇
梅瑰
+1 位作者
赵春鹏
陈瑶生
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2011年第2期121-128,共8页
锌指酶是一种可对动植物基因组内特异序列进行高效遗传修饰的人工重组核酸酶.目前,获取一对有活性的人工锌指酶的常规方法是通过构建大量的锌指蛋白突变体,利用细菌杂交方法从中筛选有结合活性的个体,工作量庞大、专业性强,普通研究人...
锌指酶是一种可对动植物基因组内特异序列进行高效遗传修饰的人工重组核酸酶.目前,获取一对有活性的人工锌指酶的常规方法是通过构建大量的锌指蛋白突变体,利用细菌杂交方法从中筛选有结合活性的个体,工作量庞大、专业性强,普通研究人员往往难以胜任,极大地限制了锌指酶技术的广泛应用.因此,采用计算机辅助人工锌指酶设计的方法降低筛选难度和工作量显得十分有必要.本研究选用FoldX分子力场软件对国际锌指酶协会研究人员采用OPEN方法构建的共420个锌指蛋白突变体进行蛋白-DNA复合体建模,并计算模型中锌指蛋白与靶标DNA的结合自由能.经统计分析发现,模拟复合体中的锌指蛋白-DNA结合自由能与该锌指蛋白在哺乳动物细胞内形成无活性锌指酶的概率存在明显相关关系.当结合自由能低于?13.132kcal/mol时形成无活性锌指酶的概率可降低至5%以下,而当结合自由能大于?5kcal/mol时形成无活性锌指酶的概率高达40%.因此,采用FoldX构建锌指蛋白-DNA复合体模型的方法可以辅助缩小锌指蛋白的筛选范围,提高人工锌指酶设计的成功率.
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关键词
锌指酶
分子力场
蛋白突变建模
原文传递
题名
结核分枝杆菌疫源追踪的基因检测分析
被引量:
2
1
作者
万学勤
曾方银
唐冬生
李万可兰
蒋泓
翁闪凡
黄永芬
机构
佛山科学技术学院医学院检药系
南方医科
大学
南方医院检验科
东北
大学
中荷生物医学信息
与
工程学院
华南农业大学
动物
遗传
育种
与
繁殖
出处
《中国动物检疫》
CAS
2010年第1期43-44,共2页
基金
佛山市科技局医学攻关项目(200808023)
文摘
目的探讨牛源性人结核疫源追踪的基因分析方法。方法采用复方PCR结核杆菌快速鉴定技术,针对特征性分枝杆菌标志基因(MTP40基因、α抗原基因和IS6110),对结核病人和患牛的标本,进行检测。结果患者标本结核分枝杆菌阳性;患牛标本牛分枝杆菌和结核分枝杆菌分别阳性。结论结核病奶牛不仅是人类牛型结核的可能来源,也可能成为人类人型结核的潜在来源。
关键词
核病
传染源
PCR
牛乳
Keywords
tuberculosis
source of infection
polymerase chain reaction
cowmilk
分类号
R183.3 [医药卫生—流行病学]
下载PDF
职称材料
题名
基于FoldX力场的蛋白突变建模方法可用于人工锌指酶辅助设计
2
作者
何祖勇
梅瑰
赵春鹏
陈瑶生
机构
中山
大学
生命科学学院
广东省
农业
科学院畜牧研究所
华南农业大学
动物
科技学院
遗传
育种
与
繁殖
实验室
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2011年第2期121-128,共8页
基金
国家自然科学基金(批准号:30901018)
中国博士后科学基金(批准号:201003388)资助项目
文摘
锌指酶是一种可对动植物基因组内特异序列进行高效遗传修饰的人工重组核酸酶.目前,获取一对有活性的人工锌指酶的常规方法是通过构建大量的锌指蛋白突变体,利用细菌杂交方法从中筛选有结合活性的个体,工作量庞大、专业性强,普通研究人员往往难以胜任,极大地限制了锌指酶技术的广泛应用.因此,采用计算机辅助人工锌指酶设计的方法降低筛选难度和工作量显得十分有必要.本研究选用FoldX分子力场软件对国际锌指酶协会研究人员采用OPEN方法构建的共420个锌指蛋白突变体进行蛋白-DNA复合体建模,并计算模型中锌指蛋白与靶标DNA的结合自由能.经统计分析发现,模拟复合体中的锌指蛋白-DNA结合自由能与该锌指蛋白在哺乳动物细胞内形成无活性锌指酶的概率存在明显相关关系.当结合自由能低于?13.132kcal/mol时形成无活性锌指酶的概率可降低至5%以下,而当结合自由能大于?5kcal/mol时形成无活性锌指酶的概率高达40%.因此,采用FoldX构建锌指蛋白-DNA复合体模型的方法可以辅助缩小锌指蛋白的筛选范围,提高人工锌指酶设计的成功率.
关键词
锌指酶
分子力场
蛋白突变建模
分类号
Q814 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结核分枝杆菌疫源追踪的基因检测分析
万学勤
曾方银
唐冬生
李万可兰
蒋泓
翁闪凡
黄永芬
《中国动物检疫》
CAS
2010
2
下载PDF
职称材料
2
基于FoldX力场的蛋白突变建模方法可用于人工锌指酶辅助设计
何祖勇
梅瑰
赵春鹏
陈瑶生
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2011
0
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