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深圳市男男性行为人群人类免疫缺陷病毒1型流行株的聚集性分析
被引量:
4
1
作者
王晓辉
鲍毅
+2 位作者
何太平
陈琳
程锦泉
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第14期2892-2894,共3页
目的研究深圳市男男性行为(MSM)人群人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的聚集性,为艾滋病的预防治疗提供科学依据。方法 RT-PCR巢式扩增深圳市MSM人群HIV-1病毒的gag基因和env基因,结合HIV数据库和MEGA4.02软件分析测序结果,确定亚型;建立...
目的研究深圳市男男性行为(MSM)人群人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的聚集性,为艾滋病的预防治疗提供科学依据。方法 RT-PCR巢式扩增深圳市MSM人群HIV-1病毒的gag基因和env基因,结合HIV数据库和MEGA4.02软件分析测序结果,确定亚型;建立进化树,比较各亚型的组内基因离散率。结果深圳市MSM人群中HIV-1流行株以CRF01-AE为主,占53.0%,与CRF07-BC、CRF08-BC、B、C共同存在,各个亚型均形成了簇集(cluster);B亚型cluster的基因离散率最大(gag区:9.5%,env区:16.1%),CRF01-AE形成了3个独立的cluster。结论深圳市MSM人群中流行的HIV-1毒株是复杂的,并且不同亚型的毒株也有各自的变异,以CRF01-AE和B亚型最为典型,病毒基因的变异对病毒的表型,疾病的进程及耐药性的影响尚待进一步研究。
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关键词
人类免疫缺陷病毒1型
男男性行为
基因变异
进化树模型
聚集性分析
原文传递
题名
深圳市男男性行为人群人类免疫缺陷病毒1型流行株的聚集性分析
被引量:
4
1
作者
王晓辉
鲍毅
何太平
陈琳
程锦泉
机构
华中科技大学
深圳
公共卫生
研究院
广东医学
院
临床诊断系
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第14期2892-2894,共3页
基金
深圳市科技计划项目(200802074)
文摘
目的研究深圳市男男性行为(MSM)人群人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的聚集性,为艾滋病的预防治疗提供科学依据。方法 RT-PCR巢式扩增深圳市MSM人群HIV-1病毒的gag基因和env基因,结合HIV数据库和MEGA4.02软件分析测序结果,确定亚型;建立进化树,比较各亚型的组内基因离散率。结果深圳市MSM人群中HIV-1流行株以CRF01-AE为主,占53.0%,与CRF07-BC、CRF08-BC、B、C共同存在,各个亚型均形成了簇集(cluster);B亚型cluster的基因离散率最大(gag区:9.5%,env区:16.1%),CRF01-AE形成了3个独立的cluster。结论深圳市MSM人群中流行的HIV-1毒株是复杂的,并且不同亚型的毒株也有各自的变异,以CRF01-AE和B亚型最为典型,病毒基因的变异对病毒的表型,疾病的进程及耐药性的影响尚待进一步研究。
关键词
人类免疫缺陷病毒1型
男男性行为
基因变异
进化树模型
聚集性分析
Keywords
HIV-1
MSM
Gene mutation
Phylogenetic tree model
Cluster analysis
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳市男男性行为人群人类免疫缺陷病毒1型流行株的聚集性分析
王晓辉
鲍毅
何太平
陈琳
程锦泉
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
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