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宏基因组二代测序技术辅助诊断新生儿埃可病毒18型聚集性感染 被引量：4
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作者 尚永朋 赵宇曦 +5 位作者 邓名贵 欧阳莉丽 彭壬海 李佩玉 余治健 邓启文 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期317-322,共6页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在医院聚集性感染事件中快速识别感染源的可行性和实用性。方法收集某院新生儿中心6例发热伴腹泻或皮疹新生儿的咽、肛拭子和血标本,同时期同病室其他新生儿和医护人员(咽、肛拭子)标本,以及环境标本... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在医院聚集性感染事件中快速识别感染源的可行性和实用性。方法收集某院新生儿中心6例发热伴腹泻或皮疹新生儿的咽、肛拭子和血标本,同时期同病室其他新生儿和医护人员(咽、肛拭子)标本,以及环境标本,采用传统培养方法、肠道病毒通用聚合酶链反应(PCR)、mNGS和肠道埃可病毒18(ECO18)型特异性PCR进行检测。结果6例新生儿血及肛、咽拭子标本细菌培养未检出病原体,肛拭子肠道病毒通用PCR和ECO18型特异性PCR检测均阳性。mNGS从6例新生儿不同标本中至少一份检出ECO18型病原体,阳性率由高至低依次为肛拭子(66.66%)、血(50.00%)和口咽拭子(0)。采用mNGS检测同时期同病房18例无症状新生儿咽和肛拭子标本,2例新生儿肛拭子标本ECO18型检测阳性。医务人员以及环境标本未检出ECO18型或其他肠道病毒。结论mNGS可检测出ECO18型感染患者粪便或血清中低拷贝数的ECO18型病毒,是一种有效的辅助性诊断肠道病毒感染的方法,并且具有追溯医院聚集性肠道病毒感染病原体的潜力。 展开更多
关键词 新生儿 宏基因组测序 快速诊断 埃可病毒18型 聚集性感染
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