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高通量测序技术在产前筛查和产前诊断中的应用 被引量:20
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作者 刘颖迪 邬玲仟 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1037-1042,共6页
高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术经过十余年的飞速发展,衍生出无创产前筛查(noninvasive prenatal testing,NIPT)、扩展性无创产前筛查(noninvasive prenatal testing-plus,NIPT Plus)、低深度全基因组测序(copy number... 高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术经过十余年的飞速发展,衍生出无创产前筛查(noninvasive prenatal testing,NIPT)、扩展性无创产前筛查(noninvasive prenatal testing-plus,NIPT Plus)、低深度全基因组测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)和外显子测序(exome sequencing,ES)等一系列被临床广泛采用的新技术,并在出生缺陷防控工作中发挥着重要作用。随着NGS技术的深入开展,其优越性逐渐被临床医生认可,但在实际应用过程中同样面临着诸多挑战。本文针对NGS技术在国内外产前筛查和产前诊断领域的发展现状、技术突破和未来展望等方面进行阐述。 展开更多
关键词 高通量测序 产前筛查 产前诊断
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内源逆转录病毒在肿瘤和人类其他疾病中的研究进展
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作者 李书瑶 张敬恒 +6 位作者 冉致 黄璨华 王序娟 李银双 刘晶 匡春梅 袁凯 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第11期2167-2180,共14页
内源逆转录病毒(endogenous retroviruses,ERVs)是在物种进化的漫长过程中,由于外源逆转录病毒感染并整合至宿主基因组所遗留的原病毒序列.近年来的研究表明,人类(Homo Sapiens)基因组中的人内源逆转录病毒(human endogenous retrovirus... 内源逆转录病毒(endogenous retroviruses,ERVs)是在物种进化的漫长过程中,由于外源逆转录病毒感染并整合至宿主基因组所遗留的原病毒序列.近年来的研究表明,人类(Homo Sapiens)基因组中的人内源逆转录病毒(human endogenous retroviruses,HERVs)既可以调控胚胎发育,也与肿瘤、衰老和神经退行性疾病有一定的联系.本文对HERVs的起源和表达调控机制,及其在恶性肿瘤、衰老与神经退行性疾病中发挥的功能予以综述,重点讨论HERVs在肿瘤中的双面作用.这有助于人们更加全面深刻地了解HERVs的各项生理和病理功能,探讨其作为潜在新型生物标志物与干预靶点的前景,并为相关疾病的防治提供新思路. 展开更多
关键词 人内源逆转录病毒 肿瘤 衰老 神经退行性疾病 病毒拟态 肿瘤特异性抗原
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中国先天性低促性腺激素性性腺功能减退症患者ANOS1的突变 被引量:1
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作者 曾旺 李家大 +2 位作者 王新颖 姜芳 门美超 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期847-857,共11页
目的:先天性低促性腺激素性性腺功能减退症(congenital hypogonadotropic hypogonadism,CHH)是一种罕见的先天性疾病,由于下丘脑促性腺激素释放激素的合成、分泌或信号转导缺陷引起先天性性腺发育不良。CHH以青春期发育延迟或缺乏、性... 目的:先天性低促性腺激素性性腺功能减退症(congenital hypogonadotropic hypogonadism,CHH)是一种罕见的先天性疾病,由于下丘脑促性腺激素释放激素的合成、分泌或信号转导缺陷引起先天性性腺发育不良。CHH以青春期发育延迟或缺乏、性激素及促性腺激素水平低下为主要表现,同时可能伴有其他临床表型。一部分CHH患者伴有嗅觉丧失或低下,被称为卡尔曼综合征(Kallmann syndrome,KS)。ANOS1基因是第一个被发现的CHH致病基因,位于X染色体上,其突变可导致X-连锁隐性遗传的CHH。本研究拟通过分析CHH患者中ANOS1的基因突变图谱以及临床表型和基因型的关系,为CHH的遗传学诊断奠定基础。方法:利用全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)的方法筛选来自中国的165名男性CHH患者中ANOS1基因的罕见变异(rare sequencing variants,RSVs)。利用Polyphen2、Mutation tastaster、SIFT和CADD(Combined Annotation Dependent Depletion)4种常见的生物信息学工具预测编码区变异的功能,基于神经网络的剪接位点预测(Splice Site Prediction by Neural Network,NNSPLICE)软件对检测到的内含子区的RSVs进行注释,并利用美国医学遗传学和基因组学学院(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)遗传变异分类标准与指南判断ANOS1 RSVs是否具有致病性。初步建立中国人群CHH患者ANOS1的遗传突变谱,通过收集部分患者详细的临床资料,建立临床表型和基因型的相关性。结果:WES分析显示165名CHH患者中17例患者发生了ANOS1突变,突变频率为10.3%。在17名CHH患者中共检测到13个ANOS1 RSVs,包括5个无义突变(p.T76X、p.R191X、p.W257X、p.R262X和p.W589X),2个剪切位点突变(c.318+3A>C和c.1063-1G>C)和6个错义突变(p.N402S、p.N155D、p.P504L、p.C157R、p.Q635P及p.V560I)。在17名携带ANOS1 RSVs的患者中,很多同时伴有其他临床表型,其中最常见的为隐睾(10/17),其次是单侧肾脏发育不全(3/17),牙齿� 展开更多
关键词 先天性低促性腺激素性性腺功能减退症 ANOS1 卡尔曼综合征 隐睾
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间充质干细胞在肿瘤治疗中的应用
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作者 唐香玲 张钰 +1 位作者 刘雄昊 刘慕君 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1444-1453,共10页
间充质干细胞(mesenchyal stem cells,MSCs)是一种广泛存在于人体内的具有自我更新及多向分化潜能的多能干细胞。由于其具有肿瘤组织趋向性、易于工程化操作等优势,近年来已被广泛应用于肿瘤治疗研究。但MSCs的促瘤或抑瘤效果颇具争议,... 间充质干细胞(mesenchyal stem cells,MSCs)是一种广泛存在于人体内的具有自我更新及多向分化潜能的多能干细胞。由于其具有肿瘤组织趋向性、易于工程化操作等优势,近年来已被广泛应用于肿瘤治疗研究。但MSCs的促瘤或抑瘤效果颇具争议,尤其对于未修饰的MSCs。因此,研究者们更倾向于以MSCs为载体,对其进行工程化修饰。随着对囊泡认识的深入,发现以MSCs来源的囊泡作为载体更具优势。目前,MSCs在肿瘤治疗中的研究已经进入临床,但其在临床应用之前仍有许多问题需要解决。 展开更多
关键词 MSCS 肿瘤治疗 胞外囊泡 遗传修饰 组合治疗
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伴有室间隔缺损和7q11.23q21.3三体的双胞胎产前诊断1例
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作者 刘轶 文娟 +2 位作者 刘娜 牟凯 程翠云 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2019年第1期22-25,共4页
目的明确孕妇宫内双胞胎的遗传信息和发育情况,为产前诊断及遗传咨询提供依据。方法对孕妇实施羊膜穿刺术,获得羊水胎儿脱落细胞,利用染色体核型分析、SNP array和FISH技术获得胎儿遗传信息,并根据超声评价其胎儿宫内发育情况。同时抽... 目的明确孕妇宫内双胞胎的遗传信息和发育情况,为产前诊断及遗传咨询提供依据。方法对孕妇实施羊膜穿刺术,获得羊水胎儿脱落细胞,利用染色体核型分析、SNP array和FISH技术获得胎儿遗传信息,并根据超声评价其胎儿宫内发育情况。同时抽取孕妇夫妇、孕妇的儿子和父母的外周血,进行染色体核型分析和SNP array检测。并于孕妇孕29周时,进行胎儿系统超声检查。结果胎儿染色体核型分析提示该双胞胎都有一条衍生的4号染色体,SNP array提示胎儿是7q11.23q21.3三体,FISH提示衍生的4号染色体是由片段7q11.23q21.3插入4号染色体长臂所致。在外周血的检测中,我们发现孕妇、孕妇儿子及其母亲都是7q11.23q21.3三体的携带者,其他人未见异常。孕妇29周的超声结果提示胎儿存在室间隔缺损。结论双胞胎的7q11.23q21.3三体遗传于母亲,家族中的携带者表型都正常,提示胎儿表型正常可能性极高。导致室间隔缺损的原因十分复杂,与7q11.23q21.3三体是否有关无法确定,基于缺损很小,且目前手术能够修复,我们建议孕妇继续妊娠,并定期进行超声监测。 展开更多
关键词 产前诊断 室间隔缺损 SNParray FISH 7q11.23q21.3三体
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杜氏进行性肌营养不良的临床实践指南 被引量:45
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作者 谭虎 +1 位作者 梁德生 邬玲仟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第3期258-262,共5页
杜氏进行性肌营养不良(Duchemiemusculardystmphy.DMD)是最常见的X连锁隐性遗传性肌肉变性疾病,在男性新生儿中的发病率约为1/3500。DMD是由于Xp21.2区的抗肌萎缩蛋白基因(dystrop,DMD)突变所致,患者的主要临床表现包括进行性、对称性... 杜氏进行性肌营养不良(Duchemiemusculardystmphy.DMD)是最常见的X连锁隐性遗传性肌肉变性疾病,在男性新生儿中的发病率约为1/3500。DMD是由于Xp21.2区的抗肌萎缩蛋白基因(dystrop,DMD)突变所致,患者的主要临床表现包括进行性、对称性肌无力。由于呼吸肌和心肌受累,通常在30岁前死亡。通过基因检测,可以为93.1%的患者找到遗传学病因,为早期治疗和指导家庭成员的生育奠定基础,有利于改善患者的生存质量,预防这些家庭再次生育DMD患儿。本指南结合了国内外的相关研究和指南共识,总结了DMD相关的医学遗传学知识和临床处置要点,期望能给予临床工作者帮助,为DMD患者及其家庭提供规范的诊断、治疗和预防。 展开更多
关键词 杜氏进行性肌营养不良 DMD基因 基因检测 实践指南
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脊髓性肌萎缩症的临床实践指南 被引量:35
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作者 潘建延 +3 位作者 谭虎 周妙金 梁德生 邬玲仟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第3期263-268,共6页
脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)为最常见的婴幼儿致死性常染色体隐性遗传病之一,由运动神经元存活基因1(SMN1)突变所致,新生儿发病率为1/10000〜1/6000,人群携带率约为1/72〜1/47,且具有种族差异性。临床表现为进行性、对... 脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)为最常见的婴幼儿致死性常染色体隐性遗传病之一,由运动神经元存活基因1(SMN1)突变所致,新生儿发病率为1/10000〜1/6000,人群携带率约为1/72〜1/47,且具有种族差异性。临床表现为进行性、对称性、以肢体近端为主的肌无力和肌萎缩,根据发病时间与临床表型又分为Ⅰ〜Ⅳ型。约95%的SMA患者是由于SMN1基因第7外显子的纯合缺失所致。患者表型差异大、SMN1基因拷贝数变化多、存在假基因干扰、人群携带率高等因素,给SMA的早期诊断、遗传咨询、治疗和预防造成了较大的闲难。本指南总结了国内外的相关研究和指南共识,并结合中国人群的实际情况,介绍了SMA患者的临床表现和发病机制,总结了诊断与遗传咨询等方面的相关经验,期望对临床医师及相关工作者有所帮助,以促进SMA的规范诊治,降低患儿的出生率。 展开更多
关键词 脊髓性肌萎缩症 SMN1基因 诊断 遗传咨询 实践指南
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溶酶体生成转录调节因子TFEB的调控机制研究进展 被引量:5
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作者 彭晓霞 谭洁琼 《生命的化学》 CAS CSCD 2020年第12期2261-2269,共9页
转录因子EB(transcription factor EB, TFEB)是小眼畸形相关转录因子(microphthalmia/transcription factor E,MiTF)家族成员之一,是控制影响溶酶体功能、自噬和细胞代谢等相关基因表达的转录因子。TFEB的活性主要受哺乳动物雷帕霉素靶... 转录因子EB(transcription factor EB, TFEB)是小眼畸形相关转录因子(microphthalmia/transcription factor E,MiTF)家族成员之一,是控制影响溶酶体功能、自噬和细胞代谢等相关基因表达的转录因子。TFEB的活性主要受哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1(mammalian target of rapamycin complex 1,mTORC1)磷酸化修饰的影响并和其亚细胞定位有着密切的关系,但是越来越多的研究表明其他的一些激酶也可以以不依赖于mTORC1的方式对TFEB进行磷酸化修饰,除此之外,一些其他的修饰也会参与调控TFEB的活性,TFEB的活性状态直接影响了细胞的生理状态及肿瘤、神经退行性等疾病的发生。因此,TFEB调控机制的阐明有助于深入了解这些疾病的发病机制,也为防治这些疾病提供了新的靶点。 展开更多
关键词 转录因子EB 磷酸化 乙酰化 溶酶体
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高效智能染色体核型精准辅助诊断系统的临床应用专家共识
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作者 高效智能染色体核型精准辅助诊断系统的临床应用协作组 王昊 +2 位作者 文娟 赖怡 邬玲仟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第9期1025-1031,共7页
染色体核型分析是细胞遗传学诊断的"金标准",也是出生缺陷防控的有效手段。但传统的染色体核型分析主要依靠人工识别,费时费力。将高效智能染色体核型精准辅助诊断系统应用于染色体核型分析的临床实践,可缩短分析时间,大幅提... 染色体核型分析是细胞遗传学诊断的"金标准",也是出生缺陷防控的有效手段。但传统的染色体核型分析主要依靠人工识别,费时费力。将高效智能染色体核型精准辅助诊断系统应用于染色体核型分析的临床实践,可缩短分析时间,大幅提高分析效率,提高低比例嵌合体的检出率,加强实验室之间的同质化,有效提升细胞遗传学诊断的服务能力和水平。随着该系统在核型分析领域的不断深入应用,现已积累大量的临床应用数据和经验,经高效智能染色体核型精准辅助诊断系统的临床应用协作组组织专家通过多轮讨论制定了本共识,旨在为业界同行更好地在染色体核型分析中应用智能辅助诊断系统提供参考,推动染色体核型分析技术的规范发展。 展开更多
关键词 智能辅助诊断系统 染色体核型分析 专家共识
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新型冠状病毒感染暴发中病人的分诊管理
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作者 黄国庆 曾维倩 +19 位作者 王文波 宋延民 莫晓叶 李佳 伍平 王若龙 周芳意 吴静 易斌 熊曾 周露 汪凡祺 田阳婧 胡文宝 徐霞 袁凯 李湘民 邱新建 邱健 王爱民 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期295-303,共9页
为控制SARS-CoV-2的传播,避免院内感染,长沙市某医院实施了基于流行病学史的分诊管理,将有流行病学史的患者分流至区域A,将无流行病学史的患者分流至区域B。本回顾性研究对分诊期间收集的数据进行分析,发现区域A中COVID-19最终确诊病例... 为控制SARS-CoV-2的传播,避免院内感染,长沙市某医院实施了基于流行病学史的分诊管理,将有流行病学史的患者分流至区域A,将无流行病学史的患者分流至区域B。本回顾性研究对分诊期间收集的数据进行分析,发现区域A中COVID-19最终确诊病例占比是区域B的7倍,而区域B接诊患者是区域A接诊患者的近3倍。在247名疑似患者中,发现了8例COVID-19患者。50%以上疑似患者接受了多轮核酸检测。在239名被诊断为病毒感染阴性的患者中,有188人复检并确定为COVID-19阴性病例。8例COVID-19患者中,有3例经多轮核酸检测最终确诊。除了合并症之外,流行病学信息的延迟获得也增加了实际诊断的复杂性。本文的分诊经验和策略将对今后传染病的控制具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 分诊 传染病 冠状病毒 COVID-19
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46,XY,inv(7)(q21.2q32)1例
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作者 伍仙 蒋晶 文娟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2023年第5期629-630,共2页
男,51岁,2020年5月30日因"妻子孕11周自然流产"就诊。其妻32岁,双方外观及智力均无明显异常,否认近亲结婚以及放射或有毒有害物质接触史。双方肝肾功能、血脂、血常规、尿常规、凝血功能以及女方妇科检查均未发现明显异常。... 男,51岁,2020年5月30日因"妻子孕11周自然流产"就诊。其妻32岁,双方外观及智力均无明显异常,否认近亲结婚以及放射或有毒有害物质接触史。双方肝肾功能、血脂、血常规、尿常规、凝血功能以及女方妇科检查均未发现明显异常。先证者家族中有头发早白者,曾与前妻生育1个健康女儿。本研究通过了本院伦理委员会的审查(KY-2020052501),双方均签署了临床研究知情同意书。 展开更多
关键词 伦理委员会 先证者 知情同意书 近亲结婚 有毒有害物质 自然流产 凝血功能 血常规
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