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基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究
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作者 廉雪 张丹 +4 位作者 温玉洁 范成艳 刘娜 张荣芳 王东梅 《北京医学》 CAS 2024年第6期510-512,518,共4页
目的 探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法 选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对... 目的 探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法 选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对全部样本进行HLA基因分型,比较两种方法的基因分型结果及性能。结果 TGS法和PCR-SBT法对48份样本的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1的基因检测结果,在高分辨水平上完全一致,TGS法可以对全部样本进行直接指定新基因及单一组合分型结果。TGS法在耗时、新基因判定、读长、机器维护、模棱两可结果和实时数据等性能方面优势更明显。结论 与PCR-SBT测序技术相比,基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在指定HLA基因结果方面准确性更高、耗时更短。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 Nanopore测序 PCR-SBT 基因分型
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全血白膜层单个核细胞的分离、保存与鉴定 被引量:3
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作者 李冬妹 陈小林 +2 位作者 徐彬 王明慧 贾延军 《北京医学》 CAS 2019年第8期726-728,731,共4页
目的建立分离、冻存及鉴定外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的方法,检测PBMC冻存不同时间后各种细胞的含量和活性。方法选择2016年8月至2018年3月北京市红十字血液中心无偿献血志愿者20人,从志愿者全血白膜... 目的建立分离、冻存及鉴定外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的方法,检测PBMC冻存不同时间后各种细胞的含量和活性。方法选择2016年8月至2018年3月北京市红十字血液中心无偿献血志愿者20人,从志愿者全血白膜层中分离出PBMC并用细胞冻存液冻存于液氮中,应用流式细胞术(fluorescence-activated cell sorter, FACS)检测分离出的及冻存复苏的PBMC中粒细胞、单核细胞、淋巴细胞(T细胞、B细胞和NK细胞)的含量及其死细胞的含量。结果 PBMC中淋巴细胞占大多数[(75.45±13.20)%],其次为单核细胞[(13.08±4.97)%]和粒细胞[(11.47±14.40)%]。与白膜层相比,PBMC中粒细胞、单核细胞和淋巴细胞含量分别减少了94%、62%和58%。PBMC冻存后1周、1个月、3个月、1年后,粒细胞死亡比例明显增加,粒细胞占比明显下降(P<0.05);单核细胞占比明显上升(P<0.05),淋巴细胞总数及T细胞、B细胞、NK细胞占比变化很大。结论本研究所确立的方法将为科研人员更好地处理、保存和利用外周血PBMC提供帮助。 展开更多
关键词 外周血单个核细胞 白膜层 有核细胞
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人类白细胞抗原HLA-A/C座位间基因重组的发现 被引量:2
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作者 王中梅 刘娜 +3 位作者 龚治尹 王丽君 李伟 单小燕 《现代检验医学杂志》 CAS 2014年第5期107-108,111,共3页
目的:发现并证实两例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)复合体 HLA-A/C座位间的基因重组。方法采集拟进行 HLA-I,II类 A,B和DRB1位点进行低分辨分型的两个家系共计12人的外周血标本,采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷... 目的:发现并证实两例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)复合体 HLA-A/C座位间的基因重组。方法采集拟进行 HLA-I,II类 A,B和DRB1位点进行低分辨分型的两个家系共计12人的外周血标本,采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和聚合酶链反应-序列特异性引物技术(PCR-SSP)进行 HLA低分辨分型,然后用基于测序的分型方法(SBT)进行高分辨基因分型,再根据结果进行遗传家系分析研究,确定 HLA基因重组相关位点。结果通过 HLA低、高分辨基因分型的结果进行家系分析,其中一个家系 A*30∶01/32∶01-C*06∶02间发生了重组,另一个家系是 A*11∶01/26∶01-C*07∶06间发生了重组,两个家系均是在染色单体减数分裂时 HLA-A和-C基因座位间发生了重组,均是父亲的2条染色单体间发生了交换,重组后产生的新的单倍型又完整的遗传给了下一代。结论发现并证实两例中国汉族人群 HLA-A/C基因座位间的基因重组家系,为更深入研究 HLA重组机制奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 基因重组 H LA-A/C位点
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