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基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究
1
作者
廉雪
张丹
+4 位作者
温玉洁
范成艳
刘娜
张荣芳
王东梅
《北京医学》
CAS
2024年第6期510-512,518,共4页
目的 探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法 选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对...
目的 探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法 选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对全部样本进行HLA基因分型,比较两种方法的基因分型结果及性能。结果 TGS法和PCR-SBT法对48份样本的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1的基因检测结果,在高分辨水平上完全一致,TGS法可以对全部样本进行直接指定新基因及单一组合分型结果。TGS法在耗时、新基因判定、读长、机器维护、模棱两可结果和实时数据等性能方面优势更明显。结论 与PCR-SBT测序技术相比,基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在指定HLA基因结果方面准确性更高、耗时更短。
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关键词
人类白细胞抗原
Nanopore测序
PCR-SBT
基因分型
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职称材料
全血白膜层单个核细胞的分离、保存与鉴定
被引量:
3
2
作者
李冬妹
陈小林
+2 位作者
徐彬
王明慧
贾延军
《北京医学》
CAS
2019年第8期726-728,731,共4页
目的建立分离、冻存及鉴定外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的方法,检测PBMC冻存不同时间后各种细胞的含量和活性。方法选择2016年8月至2018年3月北京市红十字血液中心无偿献血志愿者20人,从志愿者全血白膜...
目的建立分离、冻存及鉴定外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的方法,检测PBMC冻存不同时间后各种细胞的含量和活性。方法选择2016年8月至2018年3月北京市红十字血液中心无偿献血志愿者20人,从志愿者全血白膜层中分离出PBMC并用细胞冻存液冻存于液氮中,应用流式细胞术(fluorescence-activated cell sorter, FACS)检测分离出的及冻存复苏的PBMC中粒细胞、单核细胞、淋巴细胞(T细胞、B细胞和NK细胞)的含量及其死细胞的含量。结果 PBMC中淋巴细胞占大多数[(75.45±13.20)%],其次为单核细胞[(13.08±4.97)%]和粒细胞[(11.47±14.40)%]。与白膜层相比,PBMC中粒细胞、单核细胞和淋巴细胞含量分别减少了94%、62%和58%。PBMC冻存后1周、1个月、3个月、1年后,粒细胞死亡比例明显增加,粒细胞占比明显下降(P<0.05);单核细胞占比明显上升(P<0.05),淋巴细胞总数及T细胞、B细胞、NK细胞占比变化很大。结论本研究所确立的方法将为科研人员更好地处理、保存和利用外周血PBMC提供帮助。
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关键词
外周血单个核细胞
白膜层
有核细胞
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职称材料
人类白细胞抗原HLA-A/C座位间基因重组的发现
被引量:
2
3
作者
王中梅
刘娜
+3 位作者
龚治尹
王丽君
李伟
单小燕
《现代检验医学杂志》
CAS
2014年第5期107-108,111,共3页
目的:发现并证实两例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)复合体 HLA-A/C座位间的基因重组。方法采集拟进行 HLA-I,II类 A,B和DRB1位点进行低分辨分型的两个家系共计12人的外周血标本,采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷...
目的:发现并证实两例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)复合体 HLA-A/C座位间的基因重组。方法采集拟进行 HLA-I,II类 A,B和DRB1位点进行低分辨分型的两个家系共计12人的外周血标本,采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和聚合酶链反应-序列特异性引物技术(PCR-SSP)进行 HLA低分辨分型,然后用基于测序的分型方法(SBT)进行高分辨基因分型,再根据结果进行遗传家系分析研究,确定 HLA基因重组相关位点。结果通过 HLA低、高分辨基因分型的结果进行家系分析,其中一个家系 A*30∶01/32∶01-C*06∶02间发生了重组,另一个家系是 A*11∶01/26∶01-C*07∶06间发生了重组,两个家系均是在染色单体减数分裂时 HLA-A和-C基因座位间发生了重组,均是父亲的2条染色单体间发生了交换,重组后产生的新的单倍型又完整的遗传给了下一代。结论发现并证实两例中国汉族人群 HLA-A/C基因座位间的基因重组家系,为更深入研究 HLA重组机制奠定了坚实的基础。
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关键词
人类白细胞抗原
基因重组
H
LA-A/C位点
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职称材料
题名
基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究
1
作者
廉雪
张丹
温玉洁
范成艳
刘娜
张荣芳
王东梅
机构
北京市
红十字
血液
中心
白细胞
室
德必碁生物科技(厦门)有限公司研发部
出处
《北京医学》
CAS
2024年第6期510-512,518,共4页
文摘
目的 探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法 选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对全部样本进行HLA基因分型,比较两种方法的基因分型结果及性能。结果 TGS法和PCR-SBT法对48份样本的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1的基因检测结果,在高分辨水平上完全一致,TGS法可以对全部样本进行直接指定新基因及单一组合分型结果。TGS法在耗时、新基因判定、读长、机器维护、模棱两可结果和实时数据等性能方面优势更明显。结论 与PCR-SBT测序技术相比,基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在指定HLA基因结果方面准确性更高、耗时更短。
关键词
人类白细胞抗原
Nanopore测序
PCR-SBT
基因分型
Keywords
human leukocyte antigen(HLA)
Nanopore sequencing
PCR-SBT
genotyping
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
全血白膜层单个核细胞的分离、保存与鉴定
被引量:
3
2
作者
李冬妹
陈小林
徐彬
王明慧
贾延军
机构
北京市
红十字
血液
中心
白细胞
室
出处
《北京医学》
CAS
2019年第8期726-728,731,共4页
文摘
目的建立分离、冻存及鉴定外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的方法,检测PBMC冻存不同时间后各种细胞的含量和活性。方法选择2016年8月至2018年3月北京市红十字血液中心无偿献血志愿者20人,从志愿者全血白膜层中分离出PBMC并用细胞冻存液冻存于液氮中,应用流式细胞术(fluorescence-activated cell sorter, FACS)检测分离出的及冻存复苏的PBMC中粒细胞、单核细胞、淋巴细胞(T细胞、B细胞和NK细胞)的含量及其死细胞的含量。结果 PBMC中淋巴细胞占大多数[(75.45±13.20)%],其次为单核细胞[(13.08±4.97)%]和粒细胞[(11.47±14.40)%]。与白膜层相比,PBMC中粒细胞、单核细胞和淋巴细胞含量分别减少了94%、62%和58%。PBMC冻存后1周、1个月、3个月、1年后,粒细胞死亡比例明显增加,粒细胞占比明显下降(P<0.05);单核细胞占比明显上升(P<0.05),淋巴细胞总数及T细胞、B细胞、NK细胞占比变化很大。结论本研究所确立的方法将为科研人员更好地处理、保存和利用外周血PBMC提供帮助。
关键词
外周血单个核细胞
白膜层
有核细胞
Keywords
peripheral blood mononuclear cell(PBMC)
buffy coat
nuclear cell
分类号
R446.11 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
人类白细胞抗原HLA-A/C座位间基因重组的发现
被引量:
2
3
作者
王中梅
刘娜
龚治尹
王丽君
李伟
单小燕
机构
北京市
红十字
血液
中心
白细胞
室
出处
《现代检验医学杂志》
CAS
2014年第5期107-108,111,共3页
文摘
目的:发现并证实两例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)复合体 HLA-A/C座位间的基因重组。方法采集拟进行 HLA-I,II类 A,B和DRB1位点进行低分辨分型的两个家系共计12人的外周血标本,采用聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和聚合酶链反应-序列特异性引物技术(PCR-SSP)进行 HLA低分辨分型,然后用基于测序的分型方法(SBT)进行高分辨基因分型,再根据结果进行遗传家系分析研究,确定 HLA基因重组相关位点。结果通过 HLA低、高分辨基因分型的结果进行家系分析,其中一个家系 A*30∶01/32∶01-C*06∶02间发生了重组,另一个家系是 A*11∶01/26∶01-C*07∶06间发生了重组,两个家系均是在染色单体减数分裂时 HLA-A和-C基因座位间发生了重组,均是父亲的2条染色单体间发生了交换,重组后产生的新的单倍型又完整的遗传给了下一代。结论发现并证实两例中国汉族人群 HLA-A/C基因座位间的基因重组家系,为更深入研究 HLA重组机制奠定了坚实的基础。
关键词
人类白细胞抗原
基因重组
H
LA-A/C位点
Keywords
HLA antigens
gene recombination
HLA-A/C loci
分类号
Q784 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究
廉雪
张丹
温玉洁
范成艳
刘娜
张荣芳
王东梅
《北京医学》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
全血白膜层单个核细胞的分离、保存与鉴定
李冬妹
陈小林
徐彬
王明慧
贾延军
《北京医学》
CAS
2019
3
下载PDF
职称材料
3
人类白细胞抗原HLA-A/C座位间基因重组的发现
王中梅
刘娜
龚治尹
王丽君
李伟
单小燕
《现代检验医学杂志》
CAS
2014
2
下载PDF
职称材料
已选择
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