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衰老动物模型及其研究进展 被引量：12
1
作者 卢延华 管博文 孟爱民 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第9期109-113,共5页
衰老是生物体的必然结局。延缓衰老延长寿命、减少老年病改善老年人生活质量一直是人们的研究热点。构建衰老动物模型,使实验动物呈现与人类相似的衰老表型,是研究人类衰老机制和研发抗衰老药物的重要手段。目前广泛应用的衰老模型,涵... 衰老是生物体的必然结局。延缓衰老延长寿命、减少老年病改善老年人生活质量一直是人们的研究热点。构建衰老动物模型,使实验动物呈现与人类相似的衰老表型,是研究人类衰老机制和研发抗衰老药物的重要手段。目前广泛应用的衰老模型,涵盖了从果蝇、线虫等无脊椎动物,到小型鱼类、啮齿动物和非人灵长类等等。近年来,各种基因修饰小鼠在研究衰老发生、发展及干预评价中起到重要作用;另外在常规模式动物之外,选用寿命不同的生物以及寿命差异较大的同一物种,进行寿命相关生物学分析也为研究衰老提供了新的手段。由于衰老是复杂的生物学过程,影响因素多,只有充分进行比较医学研究才能更好地将研究成果转化,为人类健康老年提供保障。 展开更多
关键词 衰老 动物模型 比较医学
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衰老细胞清除剂研究进展 被引量：9
2
作者 苏路路 管博文 +2 位作者 樊飞跃 李德冠 孟爱民 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1333-1337,共5页
老龄化是许多慢性疾病的首要危险因素。细胞衰老与老龄化的关系一直是人们关注的热点。近年来研究显示,衰老细胞堆积是驱动老龄化和老年性疾病发生、发展的重要机制。衰老细胞成为防治老年病的一个新靶点,研发选择性清除衰老细胞的药物... 老龄化是许多慢性疾病的首要危险因素。细胞衰老与老龄化的关系一直是人们关注的热点。近年来研究显示,衰老细胞堆积是驱动老龄化和老年性疾病发生、发展的重要机制。衰老细胞成为防治老年病的一个新靶点,研发选择性清除衰老细胞的药物也成为热点。该文将对衰老细胞在老年病发生、发展过程中的作用,以及诱导衰老细胞凋亡的药物--衰老细胞清除剂的相关研究进行综述。 展开更多
关键词 细胞衰老 老年性疾病 衰老细胞堆积 衰老相关分泌表型 衰老细胞清除剂 细胞凋亡
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类器官和人源性肿瘤组织异种移植模型在肿瘤研究中的应用 被引量：7
3
作者 刘宏飞 陈晓红 +1 位作者 黄志刚 高苒 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第3期103-108,122,共7页
人源性类器官(patient-derived organoids,PDOs)和人源性肿瘤组织异种移植(patient-derived xenografts,PDXs)作为新型肿瘤研究模型,能够高度模拟原位组织的生理结构及特性,为患者制定合适的用药方案,实现个体化治疗,是基础科研成果快... 人源性类器官(patient-derived organoids,PDOs)和人源性肿瘤组织异种移植(patient-derived xenografts,PDXs)作为新型肿瘤研究模型,能够高度模拟原位组织的生理结构及特性,为患者制定合适的用药方案,实现个体化治疗,是基础科研成果快速转向临床应用的必经之路。此外,还能够利用PDOs和PDXs模型进行肿瘤克隆演化、肿瘤致病机制等方面的基础研究。本文主要综述了PDOs和PDXs模型在肿瘤临床前和基础研究中的应用情况。 展开更多
关键词 类器官 人源性肿瘤组织异种移植 肿瘤研究
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冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库的建立 被引量：6
4
作者 吴玥 向志光 +1 位作者 高苒 孔琪 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期92-99,共8页
目的构建冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库,从基因表达水平比较冠状病毒感染人和动物模型后的异同,为动物实验与临床研究提供数据支撑。方法从GEO、ArrayExpress等数据库中下载冠状病毒(以SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV为主)... 目的构建冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库,从基因表达水平比较冠状病毒感染人和动物模型后的异同,为动物实验与临床研究提供数据支撑。方法从GEO、ArrayExpress等数据库中下载冠状病毒(以SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV为主)感染动物模型与人的转录组数据,对测序数据进行质控、标准化、去除批次效应,分析不同病毒株在感染不同物种、细胞或组织后所引起的基因表达变化,构建基于Django网络应用框架的数据库,建立检索界面,提供数据分析与可视化展示功能。结果本研究系统性整理了43套测序数据集,建立了冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库。数据库包含3种冠状病毒、4个物种、14种组织/细胞、2373个样本。数据库展示不同基因在不同物种、不同病毒株、不同感染时间、不同滴度、不同细胞或组织中的表达差异。同时嵌入生物信息学分析工具可挖掘基因表达差异,富集差异基因的分子功能、信号通路,并预测对细胞的潜在影响。结论本文建立了冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库。可为冠状病毒感染动物模型基因表达水平研究提供数据资源和分析工具。 展开更多
关键词 冠状病毒 数据库 SARS-CoV-2 动物模型 基因表达 比较分析
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国家动物模型资源共享信息平台的建立 被引量：6
5
作者 吴玥 薛婧 +3 位作者 魏强 向志光 陈禹保 孔琪 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1080-1086,共7页
目的为推动我国实验动物领域资源共享,满足不同层次、不同研究目的的需求,建立国家动物模型资源共享信息平台。方法发布实验动物及动物模型资源征集函,广泛收集实验动物及动物模型资源,并从文献与公共数据库补充相关资源信息。结果国家... 目的为推动我国实验动物领域资源共享,满足不同层次、不同研究目的的需求,建立国家动物模型资源共享信息平台。方法发布实验动物及动物模型资源征集函,广泛收集实验动物及动物模型资源,并从文献与公共数据库补充相关资源信息。结果国家动物模型资源共享信息平台对实验动物资源、动物模型及相关产品资源信息进行系统采集和整理,涵盖实验动物资源、动物模型资源的研发、鉴定、评价和应用,以及实验动物专属试剂和仪器设备、基于实验动物的科技外包服务等。通过网络平台推动资源共享,为开展药物筛选和治疗等提供平台与数据支撑。结论本研究团队建立了国家动物模型资源共享信息平台,提供实验动物、动物模型及相关资源数据查询、供求单位需求信息发布和详细资料展示等一站式服务,为科技创新和社会发展提供高质量的实验动物与动物模型资源共享服务。 展开更多
关键词 动物模型 实验动物 资源共享 信息平台 数据库
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心肌肥厚动物模型及代偿机制研究进展 被引量：6
6
作者 刘梦迪 张连峰 吕丹 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期102-106,共5页
心肌肥厚是一种缓慢发展的有效代偿功能,主要发生在长期压力负荷的情况下,是对血流动力学或心肌损伤的适应性反应,心肌肥厚失代偿最终会增加心力衰竭和猝死的发生率,目前尚无有效的治愈方法。本文就心肌肥厚动物模型,包括小鼠、大鼠及... 心肌肥厚是一种缓慢发展的有效代偿功能,主要发生在长期压力负荷的情况下,是对血流动力学或心肌损伤的适应性反应,心肌肥厚失代偿最终会增加心力衰竭和猝死的发生率,目前尚无有效的治愈方法。本文就心肌肥厚动物模型,包括小鼠、大鼠及大型动物的制备方法及各自特点,进行总结和比较。同时对心肌肥厚经典分子信号机制,包括有丝分裂蛋白激酶(MAPKs)信号通路及Ca^2+介导的信号通路等,以及心肌肥厚引发的失代偿分子机制,包括儿茶酚胺及心肌细胞凋亡等信号通路进行的总结和比较。 展开更多
关键词 心肌肥厚 动物模型 机制
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老年和青年C57BL/6J小鼠外周血及免疫细胞分型测定分析 被引量：6
7
作者 管博文 卢延华 +3 位作者 苏路路 王玉全 李德冠 孟爱民 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第7期24-28,共5页
目的比较观察老年C57BL/6J小鼠与年轻C57BL/6J小鼠外周血及免疫系统相关指标的差异。方法19月龄和2月龄的C57BL/6J小鼠分别取材检测外周血细胞计数、免疫脏器指数和外周血免疫细胞分型。结果与年轻小鼠比较,老年小鼠外周血中红细胞和血... 目的比较观察老年C57BL/6J小鼠与年轻C57BL/6J小鼠外周血及免疫系统相关指标的差异。方法19月龄和2月龄的C57BL/6J小鼠分别取材检测外周血细胞计数、免疫脏器指数和外周血免疫细胞分型。结果与年轻小鼠比较,老年小鼠外周血中红细胞和血小板计数升高,中性粒细胞比例升高,淋巴细胞比例下降(P<0.001),CD4^+细胞比例明显降低(P<0.001),胸腺指数明显降低(P<0.001)。结论老年小鼠血细胞发生分化偏移,辅助性T细胞数量下降,与年轻小鼠有明显差异,与人造血免疫老龄化改变类似。本项研究为免疫衰老相关问题研究提供基础数据。 展开更多
关键词 C57BL/6J小鼠 外周血细胞计数 免疫脏器系数 外周血免疫分型
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亚致死剂量γ-射线全身照射对小鼠造血免疫功能远期影响 被引量：6
8
作者 管博文 卢延华 +6 位作者 苏路路 李程程 荆学双 董银萍 王月英 李德冠 孟爱民 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第11期50-57,64,共9页
目的 观察4 Gy、6 Gy全身照射后6个月C57BL/6 J小鼠的造血和免疫等功能指标变化。方法对8~12周的C57BL/6 J小鼠分别进行4 Gy和6 Gy全身照射,照射6个月后检测外周血细胞计数及分类、胸腺系数及脾系数、外周血及脾免疫细胞分型、脾T细胞p1... 目的 观察4 Gy、6 Gy全身照射后6个月C57BL/6 J小鼠的造血和免疫等功能指标变化。方法对8~12周的C57BL/6 J小鼠分别进行4 Gy和6 Gy全身照射,照射6个月后检测外周血细胞计数及分类、胸腺系数及脾系数、外周血及脾免疫细胞分型、脾T细胞p16表达水平。结果 照射后6个月外周血白细胞、红细胞计数仍然明显低于对照组。血小板与对照组无明显差异。外周血细胞分类结果显示照射组小鼠中性粒细胞比例升高、淋巴细胞比例下降,呈现细胞分化偏移现象。与对照组相比,6 Gy照射后6个月,胸腺系数明显降低(P<0. 05)。脾系数无差异。外周血流式分析,结果显示4 Gy、6 Gy照射后,B淋巴细胞、NK细胞仍然低于对照组,提示受照后6个月未完全恢复。受照组CD4比例高于对照组。CD8、单核细胞与对照组未见差异。脾免疫细胞进行流式分析,结果显示4 Gy和6 Gy照射后6个月,B220对于对照组均有明显下降,均具极显著性差异(P<0. 01)。相比于对照组,6 Gy组脾T细胞p16表达有升高的趋势,但无显著性差异。结论 亚致死剂量照射后6个月各项检测基本恢复,但是外周血分类中性粒持续升高,胸腺系数及外周血、脾B淋巴细胞比例仍低于对照组。提示可能有远期损伤。本项实验数据为中高剂量照射后造血免疫功能长期损伤研究提供了基础数据。 展开更多
关键词 亚致死剂量照射 远期 外周血细胞计数 免疫脏器 免疫分型 小鼠
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干细胞治疗2型糖尿病及其并发症的研究进展 被引量：6
9
作者 李欣悦 李倩 +3 位作者 石桂英 黄艺滢 雷雪裴 白琳 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第9期96-102,共7页
2型糖尿病是我国高发的慢性疾病,发生机制为机体对胰岛素抵抗伴随胰岛β细胞功能缺陷引起的胰岛素相对缺乏。2型糖尿病为进展性疾病,随自然病程发展对外源性血糖控制的依赖增大、导致多组织器官病变,引起多种继发性并发症发生。传统治... 2型糖尿病是我国高发的慢性疾病,发生机制为机体对胰岛素抵抗伴随胰岛β细胞功能缺陷引起的胰岛素相对缺乏。2型糖尿病为进展性疾病,随自然病程发展对外源性血糖控制的依赖增大、导致多组织器官病变,引起多种继发性并发症发生。传统治疗对药物依赖性大,且口服药物和外源性胰岛素只能暂时维持血糖或暂时改善胰岛素敏感性,无法根本治愈。随着干细胞研究的深入,干细胞的自我更新和定向分化潜能为修复受损组织恢复胰岛功能进而治疗糖尿病开辟了新思路。本文从不同类型干细胞治疗2型糖尿病的方法、优缺点及研究进展进行综述,希望对研究糖尿病和糖尿病并发症致病机理、应用干细胞移植技术恢复胰岛素独立性以及建立干细胞安全性和有效性的评价提供一定参考。 展开更多
关键词 2型糖尿病 细胞移植 干细胞治疗
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白细胞介素-37在流感病毒感染导致的重症肺炎中作用的研究进展 被引量：5
10
作者 刘明娅 戚菲菲 鲍琳琳 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期99-103,共5页
流感是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病,流感病毒感染机体过程中,常因免疫反应过度促使细胞因子大量分泌,形成细胞因子风暴,导致肺损伤、肺衰竭甚至死亡。流感病毒感染导致的重症肺炎是流感患者死亡的重要原因之一,目前临床上用于流... 流感是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病,流感病毒感染机体过程中,常因免疫反应过度促使细胞因子大量分泌,形成细胞因子风暴,导致肺损伤、肺衰竭甚至死亡。流感病毒感染导致的重症肺炎是流感患者死亡的重要原因之一,目前临床上用于流感治疗的药物主要是抗病毒药物,通常不能调控机体的过度免疫反应,也不能减轻肺部的炎症损伤。白细胞介素-37(interleukin-37,IL-37)是新发现的白细胞介素-1(interleukin-1,IL-1)家族的成员,具有强大的抑炎功能,通过抑制多种炎症因子的分泌阻止细胞因子风暴的发生,在感染性疾病、自身免疫病及肿瘤等疾病中发挥重要的作用。因此,若能将IL-37的抗炎作用运用到H1N1流感病毒感染导致的重症肺炎治疗中,无疑给重症肺炎的治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 流感病毒 重症肺炎 细胞因子风暴 IL-37
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TRPM8参与薄荷醇对炎症因子负调控作用的机制 被引量：5
11
作者 余煊 杜力军 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2021年第6期1-8,共8页
目的薄荷醇通过瞬时受体电位TRPM8对炎症因子负调控作用的机制。方法首先在整体动物实验,检测薄荷醇对小鼠下丘脑中TRPM8,核转录因子NF-κB以及炎症因子TNF-α表达水平的调控。然后通过体外实验,在细胞水平检测薄荷醇对PC12细胞中TRPM8... 目的薄荷醇通过瞬时受体电位TRPM8对炎症因子负调控作用的机制。方法首先在整体动物实验,检测薄荷醇对小鼠下丘脑中TRPM8,核转录因子NF-κB以及炎症因子TNF-α表达水平的调控。然后通过体外实验,在细胞水平检测薄荷醇对PC12细胞中TRPM8、NF-κB和TNF-α表达的调控作用。最后,使用TRPM8表达敲低的PC12细胞系,检测薄荷醇对TRPM8、NF-κB和TNF-α调控作用的变化。结果(1)尾静脉注射薄荷醇,可以激活小鼠脑中TRPM8的表达,抑制核转录因子NF-κB和炎症因子TNF-α的表达。(2)薄荷醇可以激活PC12细胞中TRPM8的表达,抑制NF-κB和炎症因子TNF-α的表达。(3)在TRPM8敲低的PC12细胞中,薄荷醇对TRPM8表达无显著调控作用,对TNF-α表达的抑制作用转为激活作用。结论薄荷醇对炎症因子TNF-α及其上游核转录因子NF-κB的负调控作用依赖于其对TRPM8的激活作用。 展开更多
关键词 瞬时受体电位 神经炎症 核转录因子 炎症因子
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白细胞介素6基因敲除对阿尔茨海默病5×FAD模型小鼠β淀粉样蛋白沉积和认知的影响 被引量：5
12
作者 曹晶晶 潘吉荣 +4 位作者 张东圆 陈博睿 张玲 孟爱民 秦川 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期357-365,共9页
目的探讨白细胞介素6(IL-6)基因敲除对阿尔茨海默病5×FAD转基因小鼠认知及脑组织病理变化的影响。方法IL-6+/-小鼠与5×FAD小鼠杂交,构建5×FAD;IL-6^(-/-)小鼠模型,并选用3、10月龄子代小鼠进行实验。采用行为学实验对小... 目的探讨白细胞介素6(IL-6)基因敲除对阿尔茨海默病5×FAD转基因小鼠认知及脑组织病理变化的影响。方法IL-6+/-小鼠与5×FAD小鼠杂交,构建5×FAD;IL-6^(-/-)小鼠模型,并选用3、10月龄子代小鼠进行实验。采用行为学实验对小鼠的认知记忆功能进行分析;采用HE染色和β淀粉样蛋白(Aβ)免疫组织化学染色检测小鼠脑组织病理变化。结果得到5×FAD;IL-6^(-/-)模型小鼠(3月龄n=20,10月龄n=5)及5×FAD同窝对照小鼠(3月龄n=26,10月龄n=24),子代小鼠数量符合孟德尔定律。新物体识别实验结果显示,与同月龄5×FAD小鼠相比,3月龄5×FAD;IL-6^(-/-)小鼠的探索指数显著升高,差异有统计学意义(q=3.890,P=0.002)。Morris水迷宫空间探索结果显示,与同月龄5×FAD小鼠相比,3月龄5×FAD;IL-6^(-/-)小鼠目标象限停留时间及穿台次数增加,差异有统计学意义(q=3.797,P=0.012;q=2.505,P=0.017)。免疫组织化学染色结果显示,IL-6基因敲除显著减少3、10月龄5×FAD小鼠海马(q=13.490,P=0.002;q=45.680,P<0.001)及皮层(q=16.830,P=0.001;q=14.180,P=0.001)的Aβ沉积,差异有统计学意义。结论IL-6基因敲除可明显改善阿尔茨海默病5×FAD模型小鼠的空间记忆能力,减少小鼠大脑Aβ沉积。 展开更多
关键词 5×FAD转基因小鼠 基因敲除 白细胞介素6 阿尔茨海默病 认知功能
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PM2.5通过增加海马神经炎症引起小鼠的认知障碍 被引量：5
13
作者 付信靖 张钰 +2 位作者 郭建国 张玲 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2021年第4期9-14,共6页
目的空气细颗粒物PM2.5是空气污染物的重要组成部分,能通过多种途径引起呼吸系统及各个器官系统疾病。值得注意的是,PM2.5可引起认知减退,其具体机制尚不明确。本研究旨在探索空气污染物PM2.5的环境暴露影响动物认知功能的机制。方法本... 目的空气细颗粒物PM2.5是空气污染物的重要组成部分,能通过多种途径引起呼吸系统及各个器官系统疾病。值得注意的是,PM2.5可引起认知减退,其具体机制尚不明确。本研究旨在探索空气污染物PM2.5的环境暴露影响动物认知功能的机制。方法本研究采用狭缝分离式PM2.5在线浓缩富集系统进行小鼠的PM2.5富集与暴露造模,选用C57BL/6小鼠,进行每天4 h、每周5 d、共15周的PM2.5暴露,建立小鼠的PM2.5呼吸暴露模型。造模成功后,分别检测动物的行为学症状、病理学变化、以及相关分子机制。结果实验结果表明,PM2.5暴露可造成小鼠肺组织的病理改变,引起小鼠的认知障碍症状,免疫组织化学染色检测到小鼠中枢神经系统海马脑区出现小胶质细胞的激活,小鼠中枢神经系统IL-6含量增加。另外,PM2.5暴露未造成小鼠其他主要脏器损伤。结论本研究表明,空气细颗粒物PM2.5可导致中枢神经系统炎症,促进小胶质细胞激活,从而引起C57BL/6小鼠的认知障碍。 展开更多
关键词 空气细颗粒物 认知障碍 神经炎症 小胶质细胞 IL-6
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心肌纤维化特殊染色方法比较与优化
14
作者 王亚恒 马嘉昕 +2 位作者 雷雨 张连峰 吕丹 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期347-354,共8页
目的 对目前已有心肌纤维化染色方法进行优化,弥补目前心肌纤维常用染色方法在定量分析中存在的胶原纤维漏读及误读等问题,为心肌纤维化半定量及诊断提供参考。方法 利用实验室前期构建的心肌组织特异性cTnT~(R141W)基因突变致扩张型心... 目的 对目前已有心肌纤维化染色方法进行优化,弥补目前心肌纤维常用染色方法在定量分析中存在的胶原纤维漏读及误读等问题,为心肌纤维化半定量及诊断提供参考。方法 利用实验室前期构建的心肌组织特异性cTnT~(R141W)基因突变致扩张型心肌病转基因小鼠模型,制备心脏组织石蜡切片,分别进行马松三色(Masson’s trichrome, Masson)染色法、天狼星红(picric sirius red, PSR)染色法、天狼星红-品红(van Gieson, VG)染色法、天狼星红-固绿(sirius red/fast green staining, SR/FG)染色法染色,利用Image J 2.1.0软件对胶原纤维面积进行定量比较,并从染液浓度、染色时间、酸性溶液预染3个方面对SR/FG染色法进行优化,对后续的胶原纤维定量分析进行应用验证。结果 4种特染方法均可实现胶原纤维的分布观察,其中,优化后的SR/FG染色法,即0.1%天狼星红-苦味酸酸性溶液预染5 min,随后于0.1%天狼星红-苦味酸与0.04%固绿的混合液中染色1 h,在软件识别中具有更低的漏读率和遗失率。结论 本文优化后的SR/FG染色法较其他传统胶原纤维特染方法,胶原纤维与心肌组织着色鲜亮、颜色对比明显、稳定性佳、方便快捷,更适用于后续胶原纤维占比定量分析应用。 展开更多
关键词 心肌纤维化 特殊染色方法 天狼星红-固绿 定量分析
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结核病易感性的研究进展 被引量：4
15
作者 孙萌萌 唐军 +1 位作者 秦川 占玲俊 《中国比较医学杂志》 北大核心 2017年第11期106-112,共7页
大量的遗传学研究表明,结核病是多基因和环境因素共同作用的结果。近年来,结核病易感基因及其单核苷酸多态性(SNP)位点研究成为热点,但与易感性有确切关联的基因和SNP报道较少,并且某些易感基因有种族、人群、地域分布的差异,不同种群... 大量的遗传学研究表明,结核病是多基因和环境因素共同作用的结果。近年来,结核病易感基因及其单核苷酸多态性(SNP)位点研究成为热点,但与易感性有确切关联的基因和SNP报道较少,并且某些易感基因有种族、人群、地域分布的差异,不同种群或地区的局部研究得到的研究结论常不一致,甚至相反,因此,需要进一步寻找能广泛适用的、有确切关联的易感基因。鉴于此,需要在具备基因多样性的实验动物中进行初筛,然后在动物或人群中验证。协同杂交(Collaborative Cross,CC)小鼠具有遗传多样性并且有清晰的背景基因数据库,可为结核易感性研究提供新的工具。本综述总结已报道的结核易感基因及其SNP的研究进展,展望CC小鼠在此研究的应用和重要意义。 展开更多
关键词 结核病 易感性 基因多态性 协同杂交小鼠
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新冠病毒感染转录组学数据及比较医学分析
16
作者 冯婷婷 李依桐 +2 位作者 吴玥 王珏 孔琪 《实验动物与比较医学》 CAS 2024年第1期62-73,共12页
目的通过系统梳理与分析新冠病毒感染相关的转录组数据,为研究新冠病毒感染过程中的生物学变化和致病机制提供更多的比较医学基础信息。方法按照检索策略,以COVID-19和SARS-CoV-2为检索词,从GEO、ArrayExpress、GEN三大转录组数据库收... 目的通过系统梳理与分析新冠病毒感染相关的转录组数据,为研究新冠病毒感染过程中的生物学变化和致病机制提供更多的比较医学基础信息。方法按照检索策略,以COVID-19和SARS-CoV-2为检索词,从GEO、ArrayExpress、GEN三大转录组数据库收集获得2020年1月—2023年5月的新冠病毒感染转录组数据集,分析得到新冠病毒感染转录组的数据资源组成、分布和研究应用情况,并对数据分布进行可视化展示及关联分析。从临床医学和比较医学两个方面,围绕临床相关分子机制、生物标志物及相关免疫反应、治疗干预策略等方面,分析现有新冠病毒感染转录组数据的研究应用和局限性,阐述其研究价值和应用前景。结果共纳入新冠病毒感染转录组数据975组,在3个数据库中样本来源于人的数据集最多,分别占71.9%、77.9%和90.0%。除人以外,小鼠等是数据主要来源物种,呼吸系统和神经系统是数据分布排名在前的两个系统。在临床意义方面关联27个数据集。分析显示,基于转录组数据挖掘得到呼吸道损伤等相关分子机制,cfDNA等生物标志物可作为治疗靶点,以M1型巨噬细胞为代表的细胞变化和失调与新冠病毒感染严重程度相关。比较医学分析表明小鼠、仓鼠等均为新冠病毒易感动物,其中恒河猴和食蟹猴与人类的感染特征高度相似,仓鼠除了呼吸道症状还存在消化系统症状。新冠病毒能在各种易感动物呼吸系统器官、雪貂的肠道及水貂的耳部进行复制,产生肺炎、弥漫性肺损伤等不同程度的病理变化,基于免疫应答差异,可使用仓鼠进行中和抗体反应研究。结论目前新冠病毒感染转录组数据较多,但缺少比较转录组研究,可将转录组学与比较医学进一步结合,从而对新冠病毒感染的比较医学差异进行更深入的挖掘。 展开更多
关键词 新冠病毒 转录组 大数据 分子机制 数据分析
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冠状病毒感染动物模型组学数据集成分析
17
作者 吴玥 李璐 +5 位作者 张阳 王珏 冯婷婷 李依桐 王凯 孔琪 《实验动物与比较医学》 CAS 2024年第4期357-373,共17页
目的分析各个公共数据库中可感染人的冠状病毒感染动物模型的组学数据资源情况,包括数据分布、数据集数量、数据类型、物种、品系、研究内容等,从而深入理解冠状病毒的生物学特征和致病机制,为研究有效的治疗方案和预防措施奠定基础。... 目的分析各个公共数据库中可感染人的冠状病毒感染动物模型的组学数据资源情况,包括数据分布、数据集数量、数据类型、物种、品系、研究内容等,从而深入理解冠状病毒的生物学特征和致病机制,为研究有效的治疗方案和预防措施奠定基础。方法定义特定病毒名称、时间范围和物种等检索策略与纳入排除标准,检索GEO、ArrayExpress等大型公共组学数据库。根据不同字段类型进行二次过滤,获取更精确的数据列表。建立组学数据文本库,进行文献计量学分析,构建共现网络图,分析不同研究主题、技术方法和涉及物种之间的关联强度。同时,分析研究涉及的细胞类型、器官和参与的生物途径,以进一步阐明病原体与宿主之间的致病相互作用。结果含有冠状病毒组学数据的公共数据库有20余个,以新型冠状病毒感染组学数据为主。常用物种为人、小鼠、仓鼠和猴,常用病毒株为Wuhan-Hu-1和USA-WA1/2020。此外,人类相关研究主要集中于气道上皮细胞和Calu-3细胞,动物模型(如小鼠、猕猴与雪貂)则多采用肺组织。表达谱数据显示感染后参与炎症、细胞因子反应、补体途径、细胞损伤、增殖和分化等通路基因显著上调。蛋白组学研究揭示,在不同感染阶段的患者样本中磷酸化蛋白质组、泛素组和全蛋白质组具有显著变化。特定蛋白质类别,包括病毒受体和蛋白酶、转录因子、细胞因子、凝血系统相关蛋白、血管生成相关蛋白及纤维化标志物等六类蛋白均在冠状病毒感染后发生改变。此外,代谢组数据提示磷酸胆碱、磷酸乙醇胺、花生四烯酸和油酸可作为潜在的代谢标志物。表观组学研究结果显示,m6A甲基化在新冠病毒复制、感染和传播过程中发挥作用,并且对宿主细胞-病毒互作产生影响。N、S、非结构蛋白2和3泛素化最为显著。微生物组学研究趋势表明,肠道和废� 展开更多
关键词 冠状病毒感染 动物模型 组学数据 SARS-CoV-2 SARS-COV MERS-CoV 集成分析
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心脏病动物模型比较转录组学数据库的构建 被引量：2
18
作者 吴玥 王珏 +3 位作者 薛婧 魏强 杨志伟 孔琪 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期75-81,共7页
目的整合心脏病动物模型与心脏病患者基因表达谱,系统表征基因表达差异,筛选差异基因,分析基因表达异同,为动物实验与比较医学研究提供依据。方法从公共数据库下载心脏病动物模型与患者的基因芯片、转录组数据。按照物种、病种、病程等... 目的整合心脏病动物模型与心脏病患者基因表达谱,系统表征基因表达差异,筛选差异基因,分析基因表达异同,为动物实验与比较医学研究提供依据。方法从公共数据库下载心脏病动物模型与患者的基因芯片、转录组数据。按照物种、病种、病程等对数据进行整理、标准化处理、批次校正,转换为数据库可用格式,搭建在线数据库。结果心脏病动物模型比较转录组学数据库实现基因、功能通路全局检索查询,分析基因在不同物种(人与小鼠)、不同病种、不同组织、不同病程的表达。交互式展示样品表达谱,可视化基因表达量,进行比较分析。在线差异基因挖掘,功能通路富集鉴定,探索差异、易感基因参与调控的生物过程,解释易感机制,提供在线数据分析。结论本文建立了心脏病动物模型比较转录组学数据库,为心脏病基因水平研究提供数据资源与在线分析工具。 展开更多
关键词 心脏病 数据库 动物模型 基因表达 比较分析
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比较医学大数据平台的建立 被引量：3
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作者 吴玥 魏强 +8 位作者 张连峰 薛婧 鲍琳琳 刘江宁 向志光 孟爱民 杨志伟 高苒 孔琪 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第12期57-65,共9页
目的建立国内外首个比较医学大数据平台服务系统,为研究人员获得有效的实验动物和动物模型科学数据提供服务,为决策者提供数据支撑,解决研究中对于数据的获取及分析问题。方法制定元数据和数据采集相关表格,对实验动物相关数据、比较医... 目的建立国内外首个比较医学大数据平台服务系统,为研究人员获得有效的实验动物和动物模型科学数据提供服务,为决策者提供数据支撑,解决研究中对于数据的获取及分析问题。方法制定元数据和数据采集相关表格,对实验动物相关数据、比较医学相关数据资源进行整合。集成大规模实验动物、动物模型、表型数据、动物实验数据,构建基于PHP(hypertext preprocessor)的比较医学大数据平台。结果比较医学大数据平台(https://com-med.org.cn/)基于国内外比较医学相关研究成果,系统梳理了实验动物、动物模型和动物实验数据,形成多维度跨时空数据比较分析结果。以比较医学科学数据为主体内容,提供实验动物、人类疾病、比较医学、动物实验和相关产品数据。结论本文建立了比较医学大数据平台,实现了科学数据资源的统一保存及比较医学大数据的集成共享。 展开更多
关键词 比较医学 实验动物 动物模型 数据库
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二烯丙基硫醚通过靶向抑制CYP2E1对相关疾病治疗的潜在作用 被引量：3
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作者 庞硕 吕丹 张连峰 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第8期117-121,共5页
细胞色素P450 2E1(cytochrome P450 2E1,CYP2E1)是一种能够代谢内源性或外源性物质的细胞色素P450酶,主要位于内质网上,参与类固醇、脂肪酸、前列腺素和药物、致癌物质和环境污染物等外源性化学物质的氧化代谢。在酒精性肝病、非酒精性... 细胞色素P450 2E1(cytochrome P450 2E1,CYP2E1)是一种能够代谢内源性或外源性物质的细胞色素P450酶,主要位于内质网上,参与类固醇、脂肪酸、前列腺素和药物、致癌物质和环境污染物等外源性化学物质的氧化代谢。在酒精性肝病、非酒精性肝病、心血管疾病、艾滋病、糖尿病、帕金森综合征等疾病的病理进程中,CYP2E1的表达水平升高,产生活性氧(reactive oxygen species,ROS),引起氧化应激、DNA、蛋白质和脂质的失活,进而造成体内重要器官损伤,因此可以通过靶向抑制CYP2E1进而治疗多种疾病的。二烯丙基硫醚(diallyl sulfide,DAS)是大蒜中的一种有效成分,后发现可作为CYP2E1的选择性抑制剂,可以通过抑制CYP2E1,降低ROS、氧化应激的产生,细胞的凋亡。本文主要综述DAS靶向抑制CYP2E1对相关疾病治疗的潜在作用。 展开更多
关键词 二烯丙基硫醚 CYP2E1 活性氧 氧化应激
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