目的:探索趋化因子 CXCL10 及其受体 CXCR3 基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其临床意义。方法:通过挖掘癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中HCC数据库和国际肝癌研究所(Liver Cancer Institute,LCI...目的:探索趋化因子 CXCL10 及其受体 CXCR3 基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其临床意义。方法:通过挖掘癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中HCC数据库和国际肝癌研究所(Liver Cancer Institute,LCI)中乙肝相关肝癌数据库,分析 CXCL10 基因和 CXCR3 基因在HCC及癌旁组织中的表达以及与患者术后总生存率的关系;采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)方法检测45例乙肝相关HCC患者临床样本中 CXCL10 基因和 CXCR3 基因的表达情况,并分析 CXCL10 和 CXCR3 基因表达的相关性。结果: TCGA数据库中 CXCL10 基因在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织(非配对样本:3.379±2.081 vs. 2.213± 2.274, P <0.001;配对样本:3.159±2.267 vs. 2.213±2.274, P =0.018),LCI数据库中 CXCL10 基因在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织(7.625±1.683 vs. 7.287±1.328, P =0.009),TCGA和LCI数据库中 CXCL10 基因高表达HCC患者术后总体生存率高于 CXCL10 基因低表达患者( P =0.107, P =0.002)。TCGA数据库中 CXCR3 基因在HCC组织的表达显著高于癌旁组织(非配对样本:-0.906±1.697 vs.-1.978±1.629, P <0.001;配对样本:-1.329±1.732 vs.-1.978±1.629, P =0.037),而LCI数据库中 CXCR3 基因在乙肝相关HCC组织的表达显著低于癌旁组织(3.989±0.339 vs. 4.074±0.309, P =0.003),但两个数据库中HCC组织 CXCR3 基因高表达患者的术后总体生存率均显著高于 CXCR3 基因低表达患者( P =0.004, P =0.014)。TCGA数据库中 CXCL10 基因与 CXCR3 基因在HCC和癌旁组织里的表达水平均呈正相关( r =0.584, P <0.001;r =0.776, P < 0.001 )。临床样本检测结果显示, CXCL10 基因在乙肝相关HCC和配对癌旁组织里的表达水平分别为0.479( 0.223 ,1.094)和 0.484 (0.241,0.846),均显著高于正常肝组织的0.131(0.106,0.159)( P =0.010, P <0.001), CXCR3 基因在HCC和配对癌旁组织里的表达水平分别为0.011(0.006,0.019)和0.016(0.011,0.021),也显著高于正常�展开更多
文摘目的:探索趋化因子 CXCL10 及其受体 CXCR3 基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其临床意义。方法:通过挖掘癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中HCC数据库和国际肝癌研究所(Liver Cancer Institute,LCI)中乙肝相关肝癌数据库,分析 CXCL10 基因和 CXCR3 基因在HCC及癌旁组织中的表达以及与患者术后总生存率的关系;采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)方法检测45例乙肝相关HCC患者临床样本中 CXCL10 基因和 CXCR3 基因的表达情况,并分析 CXCL10 和 CXCR3 基因表达的相关性。结果: TCGA数据库中 CXCL10 基因在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织(非配对样本:3.379±2.081 vs. 2.213± 2.274, P <0.001;配对样本:3.159±2.267 vs. 2.213±2.274, P =0.018),LCI数据库中 CXCL10 基因在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织(7.625±1.683 vs. 7.287±1.328, P =0.009),TCGA和LCI数据库中 CXCL10 基因高表达HCC患者术后总体生存率高于 CXCL10 基因低表达患者( P =0.107, P =0.002)。TCGA数据库中 CXCR3 基因在HCC组织的表达显著高于癌旁组织(非配对样本:-0.906±1.697 vs.-1.978±1.629, P <0.001;配对样本:-1.329±1.732 vs.-1.978±1.629, P =0.037),而LCI数据库中 CXCR3 基因在乙肝相关HCC组织的表达显著低于癌旁组织(3.989±0.339 vs. 4.074±0.309, P =0.003),但两个数据库中HCC组织 CXCR3 基因高表达患者的术后总体生存率均显著高于 CXCR3 基因低表达患者( P =0.004, P =0.014)。TCGA数据库中 CXCL10 基因与 CXCR3 基因在HCC和癌旁组织里的表达水平均呈正相关( r =0.584, P <0.001;r =0.776, P < 0.001 )。临床样本检测结果显示, CXCL10 基因在乙肝相关HCC和配对癌旁组织里的表达水平分别为0.479( 0.223 ,1.094)和 0.484 (0.241,0.846),均显著高于正常肝组织的0.131(0.106,0.159)( P =0.010, P <0.001), CXCR3 基因在HCC和配对癌旁组织里的表达水平分别为0.011(0.006,0.019)和0.016(0.011,0.021),也显著高于正常�
