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运用内标校准法提高表面增强激光解吸电离飞行时间质谱检测中的重复性
被引量:
15
1
作者
丁银环
胡琼英
+4 位作者
梁双花
姜伟
周明术
严莉
王开正
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期337-339,共3页
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)具有高灵敏度、高通量、高效率等优点,是近年来疾病蛋白组学研究的先进技术,但该技术检测结果的重复性较差。因此,建立SELDI—TOF—MS检测流程的标准化至关重要。我们将色谱分析常...
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)具有高灵敏度、高通量、高效率等优点,是近年来疾病蛋白组学研究的先进技术,但该技术检测结果的重复性较差。因此,建立SELDI—TOF—MS检测流程的标准化至关重要。我们将色谱分析常用的内标法引入SELDI—TOF—MS技术,采用合成多肽分子作为内标物,建立内标校准法以校准SELDI—TOF—MS质谱图的横坐标和纵坐标,以提高该方法检测蛋白质分子量和丰度的重复性。
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关键词
激光解吸电离
飞行时间质谱
质谱检测
表面增强
重复性
内标法
校准
SELDI
原文传递
原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究
被引量:
5
2
作者
胡琼英
王开正
+3 位作者
谭小林
李小琼
丁银环
严莉
《山东医药》
CAS
北大核心
2011年第35期6-8,共3页
目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋...
目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
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关键词
原发性肝癌
表面增强激光解析电离飞行时间质谱
人工神经网络
蛋白标志物
受试者工作特征曲线
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职称材料
鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析
被引量:
3
3
作者
胡琼英
彭瑛
+5 位作者
王开正
郑旅芳
丁银环
谭小林
李小琼
严莉
《山东医药》
CAS
北大核心
2011年第15期22-24,共3页
目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺...
目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比(m/z)分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均<0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。
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关键词
鳞癌
腺癌
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
蛋白标志物
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职称材料
SELDI—TOF—MS二维内标法的建立和应用
被引量:
4
4
作者
丁银环
胡琼英
+5 位作者
姜伟
郭建红
周明术
梁双花
严莉
王开正
《现代检验医学杂志》
CAS
2009年第3期17-19,共3页
目的探索表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)二维内标校准方法,解决SELDI—TOF—MS的准确度和重复性较差的技术瓶颈。方法采用人工合成纯化的多肽分子促肾上腺皮质激素(ACTH,MW:2465.75Da)作为内标物质,加入待...
目的探索表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)二维内标校准方法,解决SELDI—TOF—MS的准确度和重复性较差的技术瓶颈。方法采用人工合成纯化的多肽分子促肾上腺皮质激素(ACTH,MW:2465.75Da)作为内标物质,加入待测样品中进行SELDI—TOF—MS检测,通过内标物质在质谱图中横坐标(质荷比)和纵坐标(丰度)响应值校准,消除因操作条件的波动对分析结果产生的影响,以提高结果的准确度和重复性。结果加入终浓度为4.055μmol/L的ACTH对血清蛋白质谱图无明显影响;加入内标物浓度和其质谱峰丰度呈直线关系(P=0.9763);分子量检测变异系数平均降低5.36倍(P〈0.001);质谱峰丰度检测平均变异系数降低5.19倍(P〈0.001)。结论二维内标法显著提高了SELDI—TOF—MS测定蛋白分子量和丰度的准确度和重复性,是该技术进行质量控制和标准化的有效措施。
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关键词
蛋白组学
内标法
SELDI—TOF—MS
质量控制
标准化
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职称材料
题名
运用内标校准法提高表面增强激光解吸电离飞行时间质谱检测中的重复性
被引量:
15
1
作者
丁银环
胡琼英
梁双花
姜伟
周明术
严莉
王开正
机构
泸州医学院附属医院检验科
北京中
科亚
光
生物工程
公司
出处
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期337-339,共3页
基金
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA02090407)
文摘
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)具有高灵敏度、高通量、高效率等优点,是近年来疾病蛋白组学研究的先进技术,但该技术检测结果的重复性较差。因此,建立SELDI—TOF—MS检测流程的标准化至关重要。我们将色谱分析常用的内标法引入SELDI—TOF—MS技术,采用合成多肽分子作为内标物,建立内标校准法以校准SELDI—TOF—MS质谱图的横坐标和纵坐标,以提高该方法检测蛋白质分子量和丰度的重复性。
关键词
激光解吸电离
飞行时间质谱
质谱检测
表面增强
重复性
内标法
校准
SELDI
分类号
R686 [医药卫生—骨科学]
原文传递
题名
原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究
被引量:
5
2
作者
胡琼英
王开正
谭小林
李小琼
丁银环
严莉
机构
泸州医学院附属医院
北京中
科亚
光
生物工程
公司
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2011年第35期6-8,共3页
基金
四川省卫生厅科研课题项目(100287)
泸州医学院2010年科研课题项目(泸医院[2010]108号)
文摘
目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
关键词
原发性肝癌
表面增强激光解析电离飞行时间质谱
人工神经网络
蛋白标志物
受试者工作特征曲线
Keywords
primary hepatic carcinoma
surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry
artificial neural network
protein markers
receiver operating characteristic curve
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析
被引量:
3
3
作者
胡琼英
彭瑛
王开正
郑旅芳
丁银环
谭小林
李小琼
严莉
机构
泸州医学院附属医院
北京中
科亚
光
生物工程
公司
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2011年第15期22-24,共3页
基金
四川省卫生厅科研课题项目(100287)
文摘
目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比(m/z)分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均<0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。
关键词
鳞癌
腺癌
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
蛋白标志物
Keywords
squamous carcinoma
adenocarcinoma
surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry
protein marker
分类号
R730.4 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
SELDI—TOF—MS二维内标法的建立和应用
被引量:
4
4
作者
丁银环
胡琼英
姜伟
郭建红
周明术
梁双花
严莉
王开正
机构
泸州医学院附属医院检验科
泸州医学院解剖教研室
北京中
科亚
光
生物工程
公司
出处
《现代检验医学杂志》
CAS
2009年第3期17-19,共3页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)重点项目(2006AA02090407).
文摘
目的探索表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)二维内标校准方法,解决SELDI—TOF—MS的准确度和重复性较差的技术瓶颈。方法采用人工合成纯化的多肽分子促肾上腺皮质激素(ACTH,MW:2465.75Da)作为内标物质,加入待测样品中进行SELDI—TOF—MS检测,通过内标物质在质谱图中横坐标(质荷比)和纵坐标(丰度)响应值校准,消除因操作条件的波动对分析结果产生的影响,以提高结果的准确度和重复性。结果加入终浓度为4.055μmol/L的ACTH对血清蛋白质谱图无明显影响;加入内标物浓度和其质谱峰丰度呈直线关系(P=0.9763);分子量检测变异系数平均降低5.36倍(P〈0.001);质谱峰丰度检测平均变异系数降低5.19倍(P〈0.001)。结论二维内标法显著提高了SELDI—TOF—MS测定蛋白分子量和丰度的准确度和重复性,是该技术进行质量控制和标准化的有效措施。
关键词
蛋白组学
内标法
SELDI—TOF—MS
质量控制
标准化
Keywords
proteomics
inner calibration
SELDI-TOF-MS
quality control
standardization
分类号
R392-33 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
运用内标校准法提高表面增强激光解吸电离飞行时间质谱检测中的重复性
丁银环
胡琼英
梁双花
姜伟
周明术
严莉
王开正
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009
15
原文传递
2
原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究
胡琼英
王开正
谭小林
李小琼
丁银环
严莉
《山东医药》
CAS
北大核心
2011
5
下载PDF
职称材料
3
鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析
胡琼英
彭瑛
王开正
郑旅芳
丁银环
谭小林
李小琼
严莉
《山东医药》
CAS
北大核心
2011
3
下载PDF
职称材料
4
SELDI—TOF—MS二维内标法的建立和应用
丁银环
胡琼英
姜伟
郭建红
周明术
梁双花
严莉
王开正
《现代检验医学杂志》
CAS
2009
4
下载PDF
职称材料
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