两个马氏珠母贝养殖群体遗传多样性微卫星分析 被引量：12

1

作者 闫学春 佟广香 +2 位作者 匡友谊 梁利群 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2009年第1期5-9,共5页

以两个马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker)养殖群体为对象,采用微卫星分子标记技术对两个群体的遗传结构进行了研究,分析了各群体内的遗传多样性和两个群体间的遗传分化。结果表明,在广东养殖贝和三亚养殖贝群体中,分别获得232和23... 以两个马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker)养殖群体为对象,采用微卫星分子标记技术对两个群体的遗传结构进行了研究,分析了各群体内的遗传多样性和两个群体间的遗传分化。结果表明,在广东养殖贝和三亚养殖贝群体中,分别获得232和230条扩增片段,两群体的平均观测杂合度分别为0.28和0.29,平均多态信息含量分别为0.44和0.46,平均有效等位基因数分别为2.25和2.13,显示两个群体的群体遗传多样性水平相差较小(p<0.05),两群体间遗传变异性小,其遗传多样性处于中等水平。两个养殖群体的基因分化系数(GST)为0.0448,群体之间属于轻度偏中度分化水平。 展开更多

关键词 马氏珠母贝 微卫星 养殖群体 遗传多样性

下载PDF 职称材料

鲤鱼和斑马鱼同义密码子使用偏性分析 被引量：10

2

作者 张晓峰 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2010年第4期23-29,共7页

本研究利用鲤鱼454测序所获得的基因的表达序列和GeneBank中斑马鱼全部基因的编码序列,采用多重变量分析软件CodonW对鲤鱼和斑马鱼影响密码子用法的因素进行了分析。结果表明,两个在59种同义密码子中有27种为最优密码子。同时还指出,最... 本研究利用鲤鱼454测序所获得的基因的表达序列和GeneBank中斑马鱼全部基因的编码序列,采用多重变量分析软件CodonW对鲤鱼和斑马鱼影响密码子用法的因素进行了分析。结果表明,两个在59种同义密码子中有27种为最优密码子。同时还指出,最优密码子的使用频率（Fop）与基因的G＋C含量（GC）,尤其是第三位密码子的G＋C百分含量（GC3S）、密码子适应指数（CAI）和密码子偏爱指数（CBI）之间均呈现极显著的正相关（鲤鱼和斑马鱼的相关系数分别为r=0.4108和0.4087、0.5354和0.5628、0.7547和0.7771、0.9803和0.9741）,而与有效等位基因数ENc存在显著负相关（相关系数r=-0.2832和-0.2390）。表明基因GC含量直接影响密码子使用的偏性,同时基因的表达水平越高,对密码子的使用偏向性越强。 展开更多

关键词 鲤鱼 斑马鱼 同义密码子使用偏性 最优密码子 GC含量

下载PDF 职称材料

利用EST-SSR座位对鲤鱼4种生长性状的单标记回归分析 被引量：6

3

作者 徐美佳 张研 +3 位作者 鲁翠云 张晓峰 刘继红 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2009年第1期15-18,共4页

获得与经济性状连锁的分子标记或基因是开展该性状分子育种的工作基础。本研究以大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的雌核发育群体为试验材料,利用Windows Map Manager2.0的标记回归法进行QTL单标记定位分析,从70个微卫星座位对吻长、头长、尾长... 获得与经济性状连锁的分子标记或基因是开展该性状分子育种的工作基础。本研究以大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的雌核发育群体为试验材料,利用Windows Map Manager2.0的标记回归法进行QTL单标记定位分析,从70个微卫星座位对吻长、头长、尾长、眼间距性状的标记回归研究中,共得到5个标记与性状相关。其中HLJE190、HLJE217、HLJE268与吻长相关,HLJE1与头长、尾长、眼间距相关;C88433与头长、眼间距相关。将C88433通过BLAST比对,结果显示与斑马鱼上控制V型离子泵(ATPase)的基因相关。 展开更多

关键词 鲤鱼 EST—SSR 吻长 头长 尾长 眼间距 相关性

下载PDF 职称材料

微卫星标记与镜鲤部分生长性状的相关分析 被引量：3

4

作者 马磊 张晓峰 +1 位作者 张天奇 孙效文 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期453-458,共6页

利用41个SSRs标记对德国镜鲤抗寒品系F1代的68个个体基因组DNA进行检测,共检测到100个等位基因,各座位等位基因2～4个,片段长度91～376bp,有效等位基因1.4287～3.9454个,观察杂合度0.3676～1.0000,期望杂合度0.3023～0.7521,平均位点多... 利用41个SSRs标记对德国镜鲤抗寒品系F1代的68个个体基因组DNA进行检测,共检测到100个等位基因,各座位等位基因2～4个,片段长度91～376bp,有效等位基因1.4287～3.9454个,观察杂合度0.3676～1.0000,期望杂合度0.3023～0.7521,平均位点多态信息含量0.4059.利用统计软件SPSS的GLM程序,对41个微卫星标记与镜鲤体重、体高、头长和吻长的相关性进行分析.结果表明,标记hlj354与体重、体高、头长显著相关;标记hlj855与体重、体高和吻长显著相关;标记hlj919、hlj585与头长显著相关,标记hlj895、hlj704与吻长显著相关. 展开更多

关键词 微卫星标记 镜鲤 生长性状

下载PDF 职称材料

一个镜鲤家系的遗传多样性及经济性状的遗传连锁分析 被引量：5

5

作者 金舒博 张晓峰 +2 位作者 贾智英 郑先虎 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2011年第1期14-18,33,共6页

本试验在一个镜鲤家系中,随机选取68尾作为实验鱼,在测量体重、体长、全长等数量性状的同时,利用15个微卫星分子标记对其进行遗传检测,共检测到40个等位基因,每个基因座的等位基因数为1～4个不等,平均等位基因2.66个,片段长度在132-551... 本试验在一个镜鲤家系中,随机选取68尾作为实验鱼,在测量体重、体长、全长等数量性状的同时,利用15个微卫星分子标记对其进行遗传检测,共检测到40个等位基因,每个基因座的等位基因数为1～4个不等,平均等位基因2.66个,片段长度在132-551之间,有效等位基因数(Ne)为1.3721～3.8278,平均观察杂合度(Ho)为0.3235～1.0000,平均期望杂合度(He)为0.3464～0.7442,平均多态信息含量(PIC)为0.4754。结果表明:该镜鲤家系的遗传多样性处于中等水平,但在较大的选择压力下已严重偏离Hardy-Wenberg平衡。利用SPSS程序下的GLM过程对15个微卫星位点与主要经济性状的相关性进行分析,结果发现:HLJ021、HLJ354、HLJ551共3个微卫星位点对镜鲤体重显著影响(p<0.05),其中,位点HLJ021、HLJ044、HLJ551、HLJ1330还对体高存在显著影响(p<0.05),HLJ354对体长、体厚、全长存在显著影响(p<0.05)。本研究所鉴定的与生长性状相关的标记可为德国镜鲤分子标记辅助育种提供重要信息。 展开更多

关键词 微卫星标记 镜鲤 遗传多样性 经济性状

下载PDF 职称材料

MicroRNAs对斑马鱼发育的调控 被引量：5

6

作者 丁雷 闫学春 +1 位作者 孙效文 滕春波 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1179-1184,共6页

microRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的非编码小RNA,从单细胞到多细胞真核生物中都广泛存在,在进化过程中高度保守,对动物发育、生理功能及病理过程都具有重要调控作用。斑马鱼(Danio rerio)是现代生物学研究中广泛使用的模式动物,以... microRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的非编码小RNA,从单细胞到多细胞真核生物中都广泛存在,在进化过程中高度保守,对动物发育、生理功能及病理过程都具有重要调控作用。斑马鱼(Danio rerio)是现代生物学研究中广泛使用的模式动物,以斑马鱼为模型研究miRNAs可以揭示miRNAs在脊椎动物中的功能。文章就miRNAs整体缺失对斑马鱼胚胎发育的影响及一些miRNAs在斑马鱼早期发育过程中的调控机制进行了综述,从而为探索miRNAs在脊椎动物中的功能及鱼类的生产育种提供理论基础。 展开更多

关键词 MICRORNAS 斑马鱼 发育

下载PDF 职称材料

鲤雌核发育子代基因的杂合度分析 被引量：4

7

作者 闫学春 张研 +2 位作者 孙效文 梁利群 曹顶臣 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期47-53,共7页

通过热休克法抑制第一次有丝分裂(抑制第一次卵裂)和减数分裂(抑制第二极体排除),分别获得鲤(Cyprinus carpioL.)的2个雌核发育家系。利用13对具有高多态性的微卫星分子标记,分别对2个雌核发育家系的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、... 通过热休克法抑制第一次有丝分裂(抑制第一次卵裂)和减数分裂(抑制第二极体排除),分别获得鲤(Cyprinus carpioL.)的2个雌核发育家系。利用13对具有高多态性的微卫星分子标记,分别对2个雌核发育家系的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、等位基因频率(P)和有效等位基因数(Ne)等进行遗传背景调查。结果表明,抑制第一次有丝分裂家系的等位基因频率为0.063～1.000,平均观测杂合度为0.22,平均期望杂合度为0.24,平均有效等位基因数为1.41,该家系在6个微卫星座位上表现为纯合子,在7个微卫星座位上表现为杂合子,其中位点MFW4完全表现为杂合子;抑制减数分裂的等位基因频率为0.056～0.889,观测杂合度的平均值为0.37,期望杂合度的平均值为0.47,平均有效等位基因数为1.93,该家系中没有得到完全纯合的个体,其中在2个位点上全部表现为杂合子。在所分析的鲤雌核发育群体中,有3个基因座位(HLJ034、HLJ044和HLJ071)有重组现象,重组率为20.00%。综合上述结果推断,鲤2个雌核发育家系在个体和群体上都具有一定的基因杂合性。 展开更多

关键词 鲤 雌核发育 杂合位点 微卫星

下载PDF 职称材料

同源与异源精子对方正银鲫子代存活、生长及性别的影响 被引量：3

8

作者 曹顶臣 贾智英 +4 位作者 鲁翠云 徐伟 常玉梅 梁利群 吴学农 《水产学杂志》 CAS 2012年第3期11-14,共4页

5月中下旬繁殖季节,用方正银鲫(Carassius auratus gibelio)的卵子分别与麦穗鱼(Pseudorasbora parva)(方正银鲫♀×麦穗鱼♂,简称FM)、方正银鲫(方正银鲫♀×方正银鲫♂,FF)和荷包红鲤(Cyprinus carpio)(方正银鲫♀×荷包... 5月中下旬繁殖季节,用方正银鲫(Carassius auratus gibelio)的卵子分别与麦穗鱼(Pseudorasbora parva)(方正银鲫♀×麦穗鱼♂,简称FM)、方正银鲫(方正银鲫♀×方正银鲫♂,FF)和荷包红鲤(Cyprinus carpio)(方正银鲫♀×荷包红鲤♂,FH)的精子进行人工授精,孵出的仔鱼在网箱中饲养,测定和统计各组子代的存活率、绝对增重率和性比等。结果表明:FF子代的成活率(91.15±1.78%)极显著地高于FM(87.50±2.13%)和FH(85.00±1.04%)(P<0.01),FM和FH之间差异不显著(P>0.05);FM(20.17±4.33 g)、FH(23.13±3.58 g)子代的出池体质量显著高于FF(18.90±3.82 g)(P<0.05),无论雌性还是雄性子代,组间差异均极显著(P<0.01),而组内、性别间生长差异不显著(P>0.05);FM(99%)、FF(73%)和FH(99%)子代的雌性百分比明显偏向雌性(P<0.01),且组间差异极显著,异源精子受精后子代中雌鱼比例明显增高(P<0.01)。本研究结果证明:银鲫生长性状中存在"异精效应",异源精子对子代的存活率和性别比例有显著影响,对生产中积极利用异源精子提供了数据支持。 展开更多

关键词 方正银鲫 异源精子 绝对增重率 存活率 性别比例 异精效应

下载PDF 职称材料

两种鲤鲫杂交回交子代染色体核型分析及比较 被引量：3

9

作者 闫学春 梁利群 葛彦龙 《水产学杂志》 CAS 2011年第2期4-8,共5页

采用PHA和秋水仙素体内注射制备两种鲤鲫杂交回交子代鱼(鲤鲫杂交♀×德国镜鲤♂;鲤鲫杂交♀×鲤♂)的染色体。结果表明:两种鲤鲫杂交回交子代染色体组由150条染色体组成,按着丝粒位置染色体组型可分为四组,每个染色体小组均由... 采用PHA和秋水仙素体内注射制备两种鲤鲫杂交回交子代鱼(鲤鲫杂交♀×德国镜鲤♂;鲤鲫杂交♀×鲤♂)的染色体。结果表明:两种鲤鲫杂交回交子代染色体组由150条染色体组成,按着丝粒位置染色体组型可分为四组,每个染色体小组均由三条同源染色体组成。其中鲤鲫杂交♀×鲤♂回交的染色体数目为3n=150,染色体臂数NF=234,其核型公式为:3n=60m+24sm+36st+30t;鲤鲫杂交♀×德国镜鲤♂回交染色体数目为3n=150,染色体臂数NF=258,其核型公式为:3n=63m+45sm+12st+30t。 展开更多

关键词 鲤 德国镜鲤 远缘杂交 回交子代 染色体

下载PDF 职称材料

从第五次世界渔业大会报告看水产生物技术的发展方向 被引量：1

10

作者 孙效文 《水产学杂志》 CAS 2009年第1期1-4,共4页

作者介绍了2008年在日本横滨召开的第五次世界渔业大会上的学术报告情况。着重分析生物技术领域各专业的口头报告的数量、内容,并综述了各专业主旨报告及大会主旨报告中生物技术报告等所涉及的新技术和新的学术思想。最后,作者根据自己... 作者介绍了2008年在日本横滨召开的第五次世界渔业大会上的学术报告情况。着重分析生物技术领域各专业的口头报告的数量、内容,并综述了各专业主旨报告及大会主旨报告中生物技术报告等所涉及的新技术和新的学术思想。最后,作者根据自己的体会论述了水产生物技术的主要发展趋势,推荐了不久将用于水产养殖业并可能起到对产业技术发展有较大推进作用的几项技术。 展开更多

关键词 渔业大会 生物技术 发展方向

下载PDF 职称材料

显微介导的远缘基因渐渗技术在鲤育种中的应用 被引量：11

11

作者 闫学春 张晓峰 +5 位作者 刘翠 孙效文 梁利群 曹顶臣 李超 葛彦龙 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期275-282,共8页

以中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)为外源DNA供体,运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾总DNA直接导入鲤(Cyprinus carpioL.)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系,并利用AFLP分子标记技术和肌肉营养成分分析,对显微介导中国明对虾... 以中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)为外源DNA供体,运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾总DNA直接导入鲤(Cyprinus carpioL.)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系,并利用AFLP分子标记技术和肌肉营养成分分析,对显微介导中国明对虾基因鲤进行外源DNA检测与蛋白质和氨基酸含量进行测定,结果表明:(1)在30对AFLP引物中,有8对所扩增带,其显微介导中国明对虾基因鲤亲本和子代中都有和中国明对虾基因相同而对照鲤没有的带。说明受体鱼中,肯定有一段序列与目的基因序列一致,研究证明了亲缘关系甚远的异源DNA片段的超远缘杂交的可行性。(2)导入中国明对虾总DNA片段的显微介导中国明对虾基因鲤的蛋白质含量分别为18.37%、18.47%、17.99%,均高于对照组(17.06%);而氨基酸的总量分别为17.16%、17.56%、16.92%,也高于对照组(16.13%),其中天门冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸、丙氨酸等4种鲜味氨基酸含量明显超过对照组,经数理统计分析,均有显著差异(P<0.05)。说明直接导入中国明对虾总DNA对显微介导中国明对虾基因鲤的营养成分和氨基酸含量均产生影响,这可对鲤的品质改进,丰富鲤的遗传基础,为显微介导的超远缘杂交技术的应用提供思路。 展开更多

关键词 显微介导 远缘基因 总DNA 渐渗杂交 中国明对虾 鲤

下载PDF 职称材料

双齿围沙蚕昼夜代谢规律的初步研究 被引量：14

12

作者 王玲 陈爱华 +4 位作者 杨大佐 赵啸 张剑诚 王亮 周一兵 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期48-54,共7页

在20℃下测定了双齿围沙蚕的常规代谢和标准代谢的昼夜变化规律。按沙蚕体湿重分别设置S[0.50±0.05g]、M[0.90±0.05g]、L[1.50±0.05g]3个组,投喂人工合成的牙鲆饵料,结果表明:(1)常规代谢和标准代谢均随体重的增加而降低... 在20℃下测定了双齿围沙蚕的常规代谢和标准代谢的昼夜变化规律。按沙蚕体湿重分别设置S[0.50±0.05g]、M[0.90±0.05g]、L[1.50±0.05g]3个组,投喂人工合成的牙鲆饵料,结果表明:(1)常规代谢和标准代谢均随体重的增加而降低,符合幂函数方程R=aWb,b值分别为-0.5988、-0.4817;(2)在标准代谢的昼夜变化中,S、M、L各组表现出相同的规律,即夜间代谢增强,白天相对低缓;(3)对双齿围沙蚕常规代谢和标准代谢昼夜变化的比较表明,S、M和L组特殊动力代谢的峰值分别为3.936、1.5222和1.2853mg·(g·h)-1,持续时间相近,S、M、L总耗能分别为:271.62、73.56和70.56J·g-1。 展开更多

关键词 双齿围沙蚕 体重 标准代谢 常规代谢 特殊动力代谢

下载PDF 职称材料