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燕麦幼苗对低氮胁迫响应的表型及转录组分析
1
作者
柴明娜
朱志强
+8 位作者
路素香
王婷
王媛
张安旗
强泽
王梦旭
王媛媛
韩冰
林克剑
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024年第7期1-10,共10页
本研究对燕麦低氮不敏感材料As581和低氮敏感材料As533幼苗(3叶1心期)进行低氮胁迫处理,于胁迫处理12 h采集根系和叶片进行转录组测序,以期揭示燕麦低氮胁迫相关的分子及信号通路,同时为低氮胁迫响应候选基因的克隆与功能验证奠定基础...
本研究对燕麦低氮不敏感材料As581和低氮敏感材料As533幼苗(3叶1心期)进行低氮胁迫处理,于胁迫处理12 h采集根系和叶片进行转录组测序,以期揭示燕麦低氮胁迫相关的分子及信号通路,同时为低氮胁迫响应候选基因的克隆与功能验证奠定基础。结果表明,与As581相比,低氮条件下敏感材料As533株高、叶绿素含量、氮含量、叶长、叶宽、叶面积、根冠比、最长主根长和根面积的差异更明显。低氮条件下,As581中有466个差异表达基因,As533中有1090个差异表达基因,两个材料叶片中的差异表达基因均比根系多,且多为下调。GO分析表明,As533和As581根系和叶片生物学过程都富集到代谢过程,细胞组分都富集到细胞和细胞组分,分子功能都富集到催化活性、结合和转运活性。KEGG分析表明,As533根系和叶片都富集在苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、淀粉和蔗糖代谢通路,As581根系和叶片都富集在氮代谢、ABC转运、TCA循环、氧化磷酸化以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路中。RT-qPCR分析表明,6个低氮相关差异表达基因的表达量变化趋势与RNA-seq结果一致。
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关键词
燕麦
低氮胁迫
表型
转录组分析
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职称材料
题名
燕麦幼苗对低氮胁迫响应的表型及转录组分析
1
作者
柴明娜
朱志强
路素香
王婷
王媛
张安旗
强泽
王梦旭
王媛媛
韩冰
林克剑
机构
内蒙古农业大学
生命科学
学院
/
麦类
种质
创新
利用
自治区
高等学校
重点
实验室
/
草地
资源
教育部
重点
实验室
/
内蒙古
生物
制造
重点
实验室
张家口市万全
区
农业
农村局
中国
农业
科学
院草原研究所
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024年第7期1-10,共10页
基金
内蒙古科技厅中央引导地方科技发展资金项目(2022ZY0047)
内蒙古农业大学生命科学学院团队发展基金(TD202103)
麦类种质创新利用自治区高等学校重点实验室支持。
文摘
本研究对燕麦低氮不敏感材料As581和低氮敏感材料As533幼苗(3叶1心期)进行低氮胁迫处理,于胁迫处理12 h采集根系和叶片进行转录组测序,以期揭示燕麦低氮胁迫相关的分子及信号通路,同时为低氮胁迫响应候选基因的克隆与功能验证奠定基础。结果表明,与As581相比,低氮条件下敏感材料As533株高、叶绿素含量、氮含量、叶长、叶宽、叶面积、根冠比、最长主根长和根面积的差异更明显。低氮条件下,As581中有466个差异表达基因,As533中有1090个差异表达基因,两个材料叶片中的差异表达基因均比根系多,且多为下调。GO分析表明,As533和As581根系和叶片生物学过程都富集到代谢过程,细胞组分都富集到细胞和细胞组分,分子功能都富集到催化活性、结合和转运活性。KEGG分析表明,As533根系和叶片都富集在苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、淀粉和蔗糖代谢通路,As581根系和叶片都富集在氮代谢、ABC转运、TCA循环、氧化磷酸化以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路中。RT-qPCR分析表明,6个低氮相关差异表达基因的表达量变化趋势与RNA-seq结果一致。
关键词
燕麦
低氮胁迫
表型
转录组分析
Keywords
Oat
Low nitrogen stress
Phenotype
Transcriptome analysis
分类号
S544.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
燕麦幼苗对低氮胁迫响应的表型及转录组分析
柴明娜
朱志强
路素香
王婷
王媛
张安旗
强泽
王梦旭
王媛媛
韩冰
林克剑
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
已选择
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