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脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)在分子分型中的应用现状 被引量：130
1
作者 王丽丽 徐建国 《疾病监测》 CAS 2006年第5期276-279,共4页
关键词 脉冲场凝胶电泳 分子分型 应用
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西藏林芝地区蚊媒初步调查研究 被引量：21
2
作者 郭玉红 刘起勇 +17 位作者 尹遵栋 王静林 李艺星 达瓦 李贵昌 王君 宁桂军 罗会明 李铭华 顿珠多吉.崔科 王环宇 梁国栋 冶秀敏 胡松林 徐慧梅 卓玛央金 桑丹拉姆 白菊 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2010年第4期300-302,共3页
目的确定西藏林芝地区墨脱县及米林县流行性乙型脑炎(乙脑)传播媒介三带喙库蚊存在与否,为制定针对性防制措施提供依据;了解林芝地区的媒介蚊虫种类、数量及其分布状况。方法采用诱蚊灯法、人帐诱法和人工捕捉法进行调查。结果在墨脱县... 目的确定西藏林芝地区墨脱县及米林县流行性乙型脑炎(乙脑)传播媒介三带喙库蚊存在与否,为制定针对性防制措施提供依据;了解林芝地区的媒介蚊虫种类、数量及其分布状况。方法采用诱蚊灯法、人帐诱法和人工捕捉法进行调查。结果在墨脱县发现三带喙库蚊,且该蚊密度相对比较高;墨脱县的优势蚊种为三带喙库蚊和多斑按蚊。米林县未发现三带喙库蚊分布,该地区的优势蚊种为米塞按蚊。结论西藏林芝地区墨脱县存在乙脑的传播媒介,该蚊种为该地区的新纪录;且该蚊种尚未扩散至米林县。 展开更多
关键词 流行性乙型脑炎 三带喙库蚊 新纪录
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12株中国艰难梭菌临床分离株的基因分型、毒力和耐药相关基因分子特征研究(英文) 被引量：18
3
作者 程颖 卢金星 +2 位作者 鄢盛恺 贾红兵 李文革 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期401-405,共5页
目的初步研究中国艰难梭菌临床分离株的基因分型、毒力和耐药相关基因分子特征。方法采用常规PCR分别检测艰难梭菌A、B毒素的基因tcdA和tcdB、二元毒素(Binary toxin)的cdtA、cdt B基因、和克林霉素耐药相关基因ermB。对其中的产毒艰难... 目的初步研究中国艰难梭菌临床分离株的基因分型、毒力和耐药相关基因分子特征。方法采用常规PCR分别检测艰难梭菌A、B毒素的基因tcdA和tcdB、二元毒素(Binary toxin)的cdtA、cdt B基因、和克林霉素耐药相关基因ermB。对其中的产毒艰难梭菌用常规PCR检测16S-23S间隔区多态性,进行基因分型,再用E-test检测对氨比西林(AC)、克林霉素(CM)、甲硝唑(MZ)、万古霉素(VA)的药物敏性。结果12株艰难梭菌中8株为毒素阳性,其中A+B+为5株,A-B+为3株,分别占62.5 %和37.5%;二元毒素均为阴性;耐药基因erm(B)阳性为4株,占50%。8株产毒株中有4个基因型别,以ZRI为主,占62.5%。产毒株对氨比西林、克林霉素、甲硝唑、万古霉素的耐药率分别为37 .5%、87.5 %、12.5 %、0。未发现027型和078型高致病株。结论艰难梭菌产毒株分离率高达66.7 %;中国产毒艰难梭菌临床分离株存在明显的基因多态性,分属于以ZRI为主的4个基因型别;艰难梭菌产毒株对氨比西林、克林霉素、甲硝唑均有一定耐药现象,但对万古霉素敏感。 展开更多
关键词 艰难梭菌 基因分型 毒力相关基因 耐药性相关基因
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MLVA技术用于福建105株结核分枝杆菌基因分型的初步研究 被引量：16
4
作者 蒋毅 张丽水 +5 位作者 赵秀芹 黄明翔 刘志广 王琳 董海燕 万康林 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-4,共4页
目的探讨MLVA技术在福建省结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法选取12个分型效果较好的VNTR基因位点。应用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,建立检测结核分枝杆菌DNA指纹多态性的方法,分析结核分枝杆菌DNA多态性。结果共对105株结核... 目的探讨MLVA技术在福建省结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法选取12个分型效果较好的VNTR基因位点。应用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳,建立检测结核分枝杆菌DNA指纹多态性的方法,分析结核分枝杆菌DNA多态性。结果共对105株结核分枝杆菌的12个VNTR位点进行了检测,根据这些菌株的指纹多态性特征,共分为4个基因型(I型I、I型I、II型I、V型),其中Ⅰ型所占比例最大,为66.7%(70/105),Ⅱ型占20%(21/105),Ⅲ型占9.5%(10/105),Ⅳ型占3.8%(4/105)。结论结果提示福建省结核分枝杆菌的传播是以Ⅰ型菌株为主,应加强此型菌株流行的监控。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 MLVA技术 基因分型
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布鲁氏菌胞内存活及疫苗研究进展 被引量：18
5
作者 刘志国 王妙 +1 位作者 崔步云 李振军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期430-439,共10页
布病是当前最为流行的细菌性人兽共患传染病,因导致家畜流产可引发重大经济损失,也是发展中国家面临的最为重要的公共卫生问题。阐明布鲁氏菌的致病机制是设计和研发疫苗的关键,而疫苗免疫是预防布病较为有效的方法。但目前无安全有效... 布病是当前最为流行的细菌性人兽共患传染病,因导致家畜流产可引发重大经济损失,也是发展中国家面临的最为重要的公共卫生问题。阐明布鲁氏菌的致病机制是设计和研发疫苗的关键,而疫苗免疫是预防布病较为有效的方法。但目前无安全有效的人用疫苗,唯一的预防策略是动物免疫,但每年的人间和动物发病率仍然较高,动物免疫可能存在缺陷。当前,布鲁氏菌的多种免疫蛋白已被鉴定、评价,新型亚单位疫苗也表现出了良好的免疫潜能。因此,本文就布鲁氏菌的胞内生存机制、国内外常见疫苗的应用研究情况进行综述,为开展相关研究提供有价值的参考。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 胞内存活 疫苗
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乳酸乳球菌食品级表达载体的研究进展 被引量：14
6
作者 孙强正 徐建国 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期260-260,F0003,共2页
关键词 乳酸乳球菌 食品级表达载体
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71株浙江省结核分枝杆菌临床分离株MLVA基因分型研究 被引量：13
7
作者 柳正卫 吕冰 +4 位作者 王晓萌 董海燕 何海波 赵秀芹 万康林 《中国预防医学杂志》 CAS 2008年第12期1017-1020,共4页
目的初步探讨浙江省结核分枝杆菌的数目可变串联重复序列(VNTR)的分型及分布特征。方法随机选取浙江省结核分枝杆菌临床分离菌株,常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对VNTR位点进行检测分析,基因分型聚类分析采... 目的初步探讨浙江省结核分枝杆菌的数目可变串联重复序列(VNTR)的分型及分布特征。方法随机选取浙江省结核分枝杆菌临床分离菌株,常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对VNTR位点进行检测分析,基因分型聚类分析采用BioNumerics软件。结果对71株结核分枝杆菌临床分离株的15个VNTR位点进行检测。结果显示明显的基因多态性。经基因聚类分析,可分4个基因群(Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群),58个基因型。分别为Ⅰ群占8.5%,含5个基因型,Ⅱ群占18.3%,含13个基因型,Ⅲ群占70.4%,含38个基因型,Ⅳ群占2.8%,含2个基因型。结论初步证实浙江省结核分枝杆菌VNTRs基因存在明显的多态性,至少存在4个VNTR型,主要流行型为Ⅲ型。 展开更多
关键词 结核病 结核分枝杆菌 基因分型 多为点数目可变串联重复序列分析
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多位点序列分型及其应用 被引量：14
8
作者 张少敏 徐建国 《疾病监测》 CAS 2008年第10期648-650,共3页
多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法。这种方法通过PCR扩增多个管家基因内部片段并测定其序列,分析菌株的变异。MLST操作简单,结果能快速得到并且便于不同实验室的比较,已经用于多... 多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法。这种方法通过PCR扩增多个管家基因内部片段并测定其序列,分析菌株的变异。MLST操作简单,结果能快速得到并且便于不同实验室的比较,已经用于多种细菌的流行病学监测和进化研究。随着测序速度的加快和成本的降低,以及分析软件的发展,MLST逐渐成为细菌的常规分型方法。 展开更多
关键词 管家基因 多位点序列分型 应用
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金黄色葡萄球菌肠毒素检测方法新进展 被引量：11
9
作者 王铜 陶晓霞 +3 位作者 孟凡亮 张建中 闫笑梅 王国庆 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第12期1475-1480,共6页
金黄色葡萄球菌肠毒索(Staphylococcus aureus enterotoxins,SEs)引起的食物中毒是全球性的食品安全问题之一。快速、准确的SEs检测,对于诊断及有效控制金黄色葡萄球菌引起的食物中毒具有重要意义。本文针对近年SEs检测的分子生物学方... 金黄色葡萄球菌肠毒索(Staphylococcus aureus enterotoxins,SEs)引起的食物中毒是全球性的食品安全问题之一。快速、准确的SEs检测,对于诊断及有效控制金黄色葡萄球菌引起的食物中毒具有重要意义。本文针对近年SEs检测的分子生物学方法、免疫学方法、质谱分析技术和生物传感器检测等方面的最新进展进行简要介绍。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌肠毒素 检测 食物中毒 综述
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基因预测方法的研究进展 被引量：8
10
作者 张恩民 海荣 俞东征 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2009年第3期271-273,共3页
基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类:一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用... 基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类:一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用统计学模型训练出相应参数,再对基因进行预测,这种方法可不依赖已知的DNA序列进行预测。现就基因预测的方法、基因预测中存在的一些问题等做一概述。 展开更多
关键词 基因预测 剪接联配 开放读码框 马尔可夫模型
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钩端螺旋体病预警指标体系研究 被引量：9
11
作者 马芬 卢亮平 +5 位作者 王丽 曾宪嘉 阳波 潘利 万康林 李辉 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期891-894,共4页
目的建立钩端螺旋体病预警指标体系。方法首先采用文献调研和专家会议法拟订钩体病预警指标体系初始框架和指标,然后应用德尔菲法确定预警指标和指标权重,权重法比较各指标间作用的大小。结果共筛选出7个一级预警指标、27个二级预警指标... 目的建立钩端螺旋体病预警指标体系。方法首先采用文献调研和专家会议法拟订钩体病预警指标体系初始框架和指标,然后应用德尔菲法确定预警指标和指标权重,权重法比较各指标间作用的大小。结果共筛选出7个一级预警指标、27个二级预警指标,并针对钩体病流行区及暴发流行潜在风险地区分别建立预警指标体系,同时从理论上探讨了用于征兆预警、早期预警和发布预警三级预警的指标组合模式。结论初步建立了钩端螺旋体病暴发流行预警指标体系,可对该病的预测、预警提供参考。 展开更多
关键词 钩端螺旋体病 预警 德尔菲法
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荧光定量PCR技术用于模拟临床标本单增李斯特菌检测的研究 被引量：8
12
作者 王艳 赵爱兰 叶长芸 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期511-514,共4页
目的利用荧光定量PCR(real-time PCR)技术,建立针对模拟临床标本中单增李斯特菌快速检测方法。方法以单增李斯特菌特异性基因hlyO的部分片段作为靶基因,克隆到pMD18-T载体,制作标准曲线,以确定方法的检测下限。利用各种血清型单增李斯... 目的利用荧光定量PCR(real-time PCR)技术,建立针对模拟临床标本中单增李斯特菌快速检测方法。方法以单增李斯特菌特异性基因hlyO的部分片段作为靶基因,克隆到pMD18-T载体,制作标准曲线,以确定方法的检测下限。利用各种血清型单增李斯特菌以及常见致病菌(如副溶血弧菌、霍乱弧菌、沙门菌、O157∶H7大肠杆菌等)验证引物探针的特异性,通过制备模拟粪便和血液感染标本,直接提取DNA进行检测,以达到快速检测的目的。结果采用real-time PCR技术对模拟临床标本检测结果显示,只有单增李斯特菌有荧光信号,其他常见致病菌以及李斯特菌属中的无害李斯特菌均没有荧光信号;由标准曲线可知该方法可以检测到22copy/反应管的目的基因,而粪便中6.35×103CFU/g和血液中7.0×102CFU/ml的细菌含量即可被检出;粪便标本在2h内可出报告,血液标本1.5h即可出报告。结论以hlyO为靶基因的Real-time PCR单增李斯特菌的检测技术具有特异性好、敏感性高、快速易操作等优点,可用于临床标本的快速诊断、疾病监测和疫情暴发的病原调查。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 real—time PCR 快速检测
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AFLP技术在细菌学分型和流行病学调查中的应用 被引量：6
13
作者 娄静 祁国明 阚飙 《疾病监测》 CAS 2006年第6期321-324,共4页
关键词 片段长度多态性(RFLP) 细菌分型 流行病学
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人兽共患传染病暴发流行预警指标体系的研究 被引量：7
14
作者 卢亮平 马芬 +5 位作者 王丽 阳波 曾宪嘉 潘利 李辉 万康林 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期676-679,共4页
目的探讨建立人兽共患传染病暴发流行预警指标体系的理论框架。方法采用文献调研和专家会议法拟订人兽共患传染病的初始框架;通过Delphi专家咨询法完成预警指标体系指标的筛选及其权重评分。结果共对55名专家进行了2轮问卷调查,确立了... 目的探讨建立人兽共患传染病暴发流行预警指标体系的理论框架。方法采用文献调研和专家会议法拟订人兽共患传染病的初始框架;通过Delphi专家咨询法完成预警指标体系指标的筛选及其权重评分。结果共对55名专家进行了2轮问卷调查,确立了包括宿主动物及媒介、病原、气象因素、易感人群、社会环境、新发病例、发病水平等7个一级预警指标,一级指标下又包括主要宿主动物数量和/或密度等在内的22个二级预警指标的人兽共患传染病暴发流行预警指标体系。结论该预警指标体系可为人兽共患传染病的早期预警提供理论基础,但需要利用历史疫情对该指标体系的信度和效度进行评价,并在实际应用中进一步完善。 展开更多
关键词 人兽共患病 预警 指标体系
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全基因组数据应用于多克隆副溶血弧菌感染暴发的病原学分析 被引量：5
15
作者 张巍巍 李颖 +8 位作者 王群 赵林 冯宝立 蒋会婷 郝帅 李清 张颖 马红梅 逄波 《疾病监测》 CAS 2020年第6期518-522,共5页
目的应用实时荧光PCR方法和基因组重测序分析等技术对一起副溶血弧菌(VP)导致的腹泻暴发事件进行病原学分析。方法收集暴发事件的病例信息,采集病例样本,使用实时荧光PCR方法筛选常见腹泻致病菌,分离鉴定VP并进行血清型鉴定,检测菌株毒... 目的应用实时荧光PCR方法和基因组重测序分析等技术对一起副溶血弧菌(VP)导致的腹泻暴发事件进行病原学分析。方法收集暴发事件的病例信息,采集病例样本,使用实时荧光PCR方法筛选常见腹泻致病菌,分离鉴定VP并进行血清型鉴定,检测菌株毒力基因,采用微量肉汤稀释法检测菌株对抗菌药物的敏感性,使用全基因组测序技术进行菌株的遗传学分析。结果9份肛拭子共分离出13株VP菌株,其中O4∶KUT血清型7株(trh-/tdh+),O1∶KUT血清型6株(5株trh+/tdh+,1株trh-/tdh-)。在检测的30种抗菌药物中,所有菌株仅对氨苄西林耐药,对其他29种抗菌药物均敏感。在基于全基因组序列的遗传学分析中,13株VP形成4个相互独立且遗传距离较远的分支,Lineage 1(O4∶KUT、trh-/tdh+,2株)、Lineage 2(O1∶KUT、trh-/tdh-,1株)、Lineage 3(O1∶KUT、trh+/tdh+,5株)和Lineage 4(O4∶KUT、trh-/tdh+,5株),其中3例患者由来源于3个不同遗传分支的VP混合感染。结论本次事件由多血清型、多克隆的VP感染导致,基因组重测序技术在腹泻病暴发的病原分析中有较好的应用前景。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 暴发 多克隆 基因组重测序 耐热相关溶血素基因
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中国西北部两省区结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping分型初步分析 被引量：6
16
作者 刘洁 同重湘 +5 位作者 李君莲 姜元 綦迎成 赵秀芹 刘海灿 万康林 《实用预防医学》 CAS 2014年第5期522-525,共4页
目的初步了解新疆和甘肃结核分枝杆菌的基因型、主要流行型及其分布特点,比较两省区之间基因型分布。方法采用随机抽样的方法挑选新疆地区结核分枝杆菌临床分离株179株,甘肃地区结核分枝杆菌临床分离株176株,采用间隔寡核苷酸分型(Spoli... 目的初步了解新疆和甘肃结核分枝杆菌的基因型、主要流行型及其分布特点,比较两省区之间基因型分布。方法采用随机抽样的方法挑选新疆地区结核分枝杆菌临床分离株179株,甘肃地区结核分枝杆菌临床分离株176株,采用间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术对所收集的临床分离株进行分型研究,分析我国西北部相邻的两省区结核分枝杆菌的基因型分布、主要流行型及其地区特征。结果新疆地区菌株分为47个基因型,其中28个基因型为新的型别,新疆菌株中北京家族占68.72%(123/179),其次为T家族(6.70%,12/179),H家族(3.91%,7/179)和CAS家族(2.23%,4/179);甘肃地区菌株分为29种基因型,其中10个基因型为新的型别,甘肃菌株中北京家族占86.93%(153/176),其次为T家族(4.55%,8/176),H家族(1.14%,2/176),MANU2(1.14%,2/176)和CAS(0.57%,1/176)。结论北京基因型菌株在新疆和甘肃地区均为主要流行株,但甘肃地区北京基因型菌株比例明显高于新疆地区。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 基因分型 间隔寡核苷酸分型 北京基因型
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鸟分枝杆菌病 被引量：5
17
作者 朱艳伶 万康林 沈国顺 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期507-511,共5页
关键词 分枝杆菌病 MAC感染 支气管扩张 免疫力低下 结节状 Myco 组织器官 临床病症
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贝叶斯判别分析在布氏杆菌常见种别鉴定中的应用 被引量：6
18
作者 肖培 崔步云 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2013年第6期802-804,共3页
目的建立布氏杆菌常见种别的Bayes判别模型,为布氏杆菌种别的鉴定提供依据。方法以多位点可变数目串联重复序列分析方法所选择的基因组上16个具有多态性串联重复序列位点为判别指标,应用逐步判别分析方法筛选关键序列位点并构建布氏杆... 目的建立布氏杆菌常见种别的Bayes判别模型,为布氏杆菌种别的鉴定提供依据。方法以多位点可变数目串联重复序列分析方法所选择的基因组上16个具有多态性串联重复序列位点为判别指标,应用逐步判别分析方法筛选关键序列位点并构建布氏杆菌常见种别的Bayes判别模型。结果待选的16个多态性串联重复序列位点全部进入判别函数,建立的模型自身验证的准确率为98.21%,交互验证的准确率为97.75%。结论建立的Bayes判别模型判断布氏杆菌的常见种别正确率很高,是布氏杆菌常见种别判断的有效方法。 展开更多
关键词 布氏杆菌 Bayes判别模型 多位点可变数目串联重复序列分析
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结核分枝杆菌KatG Asn329Val突变导致异烟肼耐药 被引量：5
19
作者 邓艳琴 陈亮 +5 位作者 张丽水 王加熊 赵秀芹 肖方震 万康林 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1101-1105,共5页
目的研究结核分枝杆菌katG基因Asn329Val突变导致异烟肼耐药的机制。方法扩增含有突变位点和野生型的全长katG基因,经TA克隆、定向克隆构建表达载体,原核表达KatG蛋白,纯化后比较重组KatG酶活性。结果获得了katG基因的高效表达。重组蛋... 目的研究结核分枝杆菌katG基因Asn329Val突变导致异烟肼耐药的机制。方法扩增含有突变位点和野生型的全长katG基因,经TA克隆、定向克隆构建表达载体,原核表达KatG蛋白,纯化后比较重组KatG酶活性。结果获得了katG基因的高效表达。重组蛋白酶活性显示,Asn329Val突变导致重组KatG过氧化氢酶活性完全丧失,但仍保持一定的过氧化物酶活性;Ser315Thr突变导致重组KatG过氧化氢酶和过氧化物酶活性部分丧失;Arg463Leu突变对过氧化氢酶活性和过氧化物酶活性影响均不大。结论 katG Asn329Val突变引起了KatG过氧化氢酶活性的完全丧失,可能是导致菌株对异烟肼耐药的机制。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 KATG基因 异烟肼 耐药性
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巢式PCR及序列分析用于恙虫病早期诊断的实验研究 被引量：5
20
作者 于昌军 张守印 +4 位作者 李国兰 徐雷 张景山 付秀萍 贺金荣 《中国卫生检验杂志》 CAS 2009年第11期2524-2525,共2页
目的:建立一种快速检测患者血液标本中恙虫病东方体的方法,用于恙虫病的早期实验室诊断。方法:收集患者血液标本,提取全基因组DNA;根据恙虫病东方体56 kD蛋白编码基因特异基因引物,采用巢式PCR方法对其进行检测,扩增的基因片段进行序列... 目的:建立一种快速检测患者血液标本中恙虫病东方体的方法,用于恙虫病的早期实验室诊断。方法:收集患者血液标本,提取全基因组DNA;根据恙虫病东方体56 kD蛋白编码基因特异基因引物,采用巢式PCR方法对其进行检测,扩增的基因片段进行序列分析。结果:132份标本中,34份得到预期片段大小的PCR扩增产物,随机选取3份扩增产物TA克隆后测序分析,证实PCR扩增产物为恙虫病东方体基因片段。结论:该方法灵敏、特异、快速,可直接用于患者血液标本的恙虫病东方体特异性基因的检测,可为恙虫病东方体感染的早期诊断提供实验室依据。 展开更多
关键词 恙虫病东方体 聚合酶链反应 序列分析
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