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云南省2022年手足口病病例中柯萨奇病毒B5型VP1区基因特征分析
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作者 罗定富 姜黎黎 +6 位作者 寸建萍 杨溪 周晓芳 曹亿会 伏晓庆 郭天巧 田炳均 《国际病毒学杂志》 北大核心 2024年第4期322-326,共5页
目的对云南省2022年从手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中分离到的7株CVB5病毒进行分子生物学鉴定并对它们的VP1区基因特征进行分析。方法对2022年云南省手足口病实验室监测网络收集到的病例粪便标本进行病毒分离,对阳... 目的对云南省2022年从手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中分离到的7株CVB5病毒进行分子生物学鉴定并对它们的VP1区基因特征进行分析。方法对2022年云南省手足口病实验室监测网络收集到的病例粪便标本进行病毒分离,对阳性标本先进行VP4/VP2结合区逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)和基因测序分型,再对VP1区进行RT-PCR和测序,用MEGA 7.0软件构建病毒VP1区基因进化树,进行基因特征分析。结果2022年云南省共从HFMD病例粪便标本中检测到7株CVB5病毒,基于VP1区基因序列同源性分析表明,该7株病毒最接近2010年分离于河南省1株CVB5病毒COXB5-Henan-2010,7株病毒之间的核苷酸相似性为98.00%~99.65%,氨基酸同源性为99.30%~100%;7株病毒与河南株的核苷酸相似性为87.36%~88.68%,氨基酸同源性为82.96%~84.85%。基因进化分析表明,CVB5可分为4个基因型(基因型A~D),云南分离株属于基因型C并单独成为一个进化分支。4个基因型之间的核苷酸差异率为18.90~22.30%,大于75%,符合肠道病毒基因分型惯例。结论云南省手足口病实验室检测网络2022年共检测到7株CVB5,虽然数量不多,但证明该病毒是HFMD的病原体之一并在云南省HFMD病例中存在,且单独为一个进化分支。应进一步加强对非EV-A71和非CVA16等其他肠道病毒尤其是CVB5的检测和分子流行病学分析。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒B组5型 VP1基因 基因特征分析
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