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云南大理某农村猪星状病毒分子流行病学调查 被引量：2
1
作者 刘承波 宿凌云 +5 位作者 邹莉 杨琳娜 董薇 马倩 闫雪兰 冯云 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2017年第6期596-599,606,共5页
目的了解云南大理某农村猪群中星状病毒(astrovirus,AstV)感染情况,为AstV的防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对云南大理某农村采集的42份猪粪便样品进行PAstV799 bp基因部分片段扩增、克隆,并测... 目的了解云南大理某农村猪群中星状病毒(astrovirus,AstV)感染情况,为AstV的防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对云南大理某农村采集的42份猪粪便样品进行PAstV799 bp基因部分片段扩增、克隆,并测序;利用NCBI BLAST进行数据库比对,Mega 4.1软件进行序列同源性比较和系统进化树构建。结果 Trizol试剂提取42份猪粪便样品上清总RNA,经RT-nested PCR扩增,5份样品可见799 bp的目的基因片段,阳性率为11.90%;PAstV 799 bp片段同源性分析显示,5个毒株与PAstV-1、2、3、4和5的同源性为46.3%~87.9%,与PAstV-4的同源性最高,为75.5%~87.9%;PAstV 799 bp片段的系统进化分析显示,分离的毒株属于PAstV-4,同源性为80.0%~99.5%。结论云南省PAstV-4流行病学调查将有利于中国AstV的预防及治疗。 展开更多
关键词 猪星状病毒 逆转录巢式聚合酶链反应 流行病学
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云南大理猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查
2
作者 彭福春 刘承波 +4 位作者 曹文涛 李云龙 龙飞燕 王珏 黄芬 《医学分子生物学杂志》 CAS 2017年第1期10-13,17,共5页
目的了解云南大理农村的猪群中戊型肝炎病毒（hepatitis Evirus，HEV）感染情况，为HEV的防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应（RT-nested PCR）技术，对所采集大理41份猪粪便样品进行HEVORF2基因部分片段扩增，经琼脂糖... 目的了解云南大理农村的猪群中戊型肝炎病毒（hepatitis Evirus，HEV）感染情况，为HEV的防控提供理论依据。方法利用逆转录巢式聚合酶链反应（RT-nested PCR）技术，对所采集大理41份猪粪便样品进行HEVORF2基因部分片段扩增，经琼脂糖凝胶电泳后对目的条带进行回收纯化及克隆测序，序列利用DNAStar和MEGA4．0软件进行同源性比较和进化树构建。结果RT-nested PCR方法扩增出348bp目的基因序列，系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型HEV。此次实验共检测41份猪粪便样品，其中23份为阳性，阳性率为56．10％。结论大理猪群存在较高的HEV感染率，存在HEV跨种间感染人的风险,应该加强防控以免HEV爆发流行。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 逆转录巢式PCR 进化分析
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