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深色有隔内生真菌(DSE)研究进展 被引量：59
1
作者 刘茂军 张兴涛 赵之伟 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期888-894,共7页
深色有隔内生真菌（dark septate endophytes,DSE）不是一个科学的分类单元,而是泛指一群定殖于植物根内的小型土壤真菌,包括功能和分类关系都不确切的多种真菌。这类真菌的定殖模式在不同植物中是相似的,一般特征是菌丝颜色较深。
关键词 内生真菌 深色 分类单元 土壤真菌 植物根 定殖
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人类syndrome疾病基因编码区碱基突变特征分析
2
作者 谢明杰 张磊 +2 位作者 蔡榕榕 陈曦 季星来 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2010年第2期223-227,共5页
对人类syndrome疾病基因编码区碱基突变(BMCRs)特征进行生物信息学分析.结果表明:syndrome疾病基因密码子的突变类型倾向于C→T和G→A的突变;碱基突变发生类型是转换显著地大于颠换(F=9.02,P=0.013 3<0.05);密码子三联体的第1位和第... 对人类syndrome疾病基因编码区碱基突变(BMCRs)特征进行生物信息学分析.结果表明:syndrome疾病基因密码子的突变类型倾向于C→T和G→A的突变;碱基突变发生类型是转换显著地大于颠换(F=9.02,P=0.013 3<0.05);密码子三联体的第1位和第2位碱基突变在syndrome疾病基因的发生中起主要作用.此外研究结果也显示:syndrome疾病基因的外显子长度及其GC含量与BMCRs存在着显著的正相关(其相关系数各自为r=0.228 74,P<0.000 1和r=0.067 0,P=0.033 3<0.05),并且外显子中顺式作用元件ESE的突变个数也与其相应外显子的BMCRs的个数之间存在着显著的相关性(r=0.200 5,P<0.000 1),表明外显子长度、GC含量与ESE元件等特征对人类syndrome疾病的发生有重要影响.最后全部syndrome被划分成8个与医学分类相关的系统疾病,结果揭示BMCRs更容易发生在代谢与免疫相关的疾病系统、神经系统、心功能相关疾病系统以及机体畸形相关疾病系统当中. 展开更多
关键词 碱基突变 人类syndrome疾病 外显子剪接增强子 外显子剪接沉默子
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长柄链格孢AlCyP1基因的克隆及其在渗透胁迫适应中的作用 被引量：2
3
作者 罗义勇 祝明亮 +3 位作者 路则宝 毕薇 张克勤 杨金奎 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期133-141,共9页
为了阐明烟草赤星病（tobaccobrown-spotdisease）病原真菌长柄链格孢（Alternarialongipes）对二甲酰亚胺类杀菌剂抗性的分子机制，以不同抗性水平的长柄链格孢菌株为实验材料，通过基因钓鱼（GeneFishing）技术进行基因差异表达分析... 为了阐明烟草赤星病（tobaccobrown-spotdisease）病原真菌长柄链格孢（Alternarialongipes）对二甲酰亚胺类杀菌剂抗性的分子机制，以不同抗性水平的长柄链格孢菌株为实验材料，通过基因钓鱼（GeneFishing）技术进行基因差异表达分析；并利用基因敲除技术对已克隆到的AlCyP1基因进行功能分析．结果表明：一个亲环蛋白基因AlCyP1的表达量在不同抗性水平的长柄链格孢中存在明显差异；应用DNA步移（DNAwalking）方法克隆得到AlCyP1基因的DNA序列，其开放阅读框中存在2个翻译起始密码子，可以编码产生2种不同长度的多肽，长、短多肽产物分别具有222和188个氨基酸，其中短多肽起始于长多肽的第35个密码子；另外，氨基酸序列同源性分析发现，AlCyP1和其他真菌的亲环蛋白具有很高的同源性，达50．0％～61.3％；利用基因敲除技术对AlCyP1基因进行功能分析发现，该基因通过表达水平的改变参与了长柄链格孢对渗透胁迫的适应调节过程． 展开更多
关键词 长柄链格孢 基因差异表达 亲环蛋白AlCyP1 渗透胁迫 二甲酰亚胺类杀菌剂
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长柄链格孢四个二甲酰亚胺类杀菌剂胁迫差异表达基因的克隆与序列分析
4
作者 罗义勇 刘卫红 +3 位作者 柳陈坚 毕薇 张克勤 杨金奎 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期213-222,共10页
为了阐明烟草赤星病病原真菌长柄链格孢Alternaria longipes对二甲酰亚胺类杀菌剂(DCFs)抗性的分子机理,前期克隆了16个DCFs胁迫差异表达基因的部分cDNA片段。为了利用基因敲除技术进一步分析这些差异表达基因的功能,本研究选取4个差异... 为了阐明烟草赤星病病原真菌长柄链格孢Alternaria longipes对二甲酰亚胺类杀菌剂(DCFs)抗性的分子机理,前期克隆了16个DCFs胁迫差异表达基因的部分cDNA片段。为了利用基因敲除技术进一步分析这些差异表达基因的功能,本研究选取4个差异表达基因,即AlATP7、AlCIT1、AlGLUT和AlHSP88,应用DNA walking技术对它们两侧的未知序列进行克隆。DNA测序和Blast搜索表明,AlATP7基因开放阅读框为712 bp,含4个外显子和3个内含子,编码169个氨基酸;AlCIT1、AlGLUT和AlHSP88基因未克隆到全长序列,5′末端还有200-300 bp才到达翻译起始密码子ATG;在这些DNA序列中,AlCIT1基因长1 214 bp,含1个内含子,编码386个氨基酸;AlGLUT基因长1 308 bp,含1个内含子,编码417个氨基酸;AlHSP88基因长2 087bp,含2个内含子,编码628个氨基酸。与其他丝状真菌的氨基酸序列同源性比对发现,AlATP7和线粒体ATP合酶D亚基、Al-CIT1和柠檬酸合成酶、AlGLUT和主要易化子超家族(MFS)类型葡萄糖转运子、AlHSP88和热休克蛋白HSP88分别具有很高的同源性。同时,还对4个DCFs胁迫差异表达基因的系统发育进行分析。基于这些蛋白功能的文献报道和前期的研究,推测A.longipes存在着一种新的DCFs抗性机制:A.longipes利用MFS类型葡萄糖转运子将DCFs排除到细胞外解毒,线粒体ATP合酶和柠檬酸合成酶参与能量供给,而热休克蛋白AlHSP88可能在该机制中促进一些重要蛋白的正确折叠和修复过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 长柄链格孢 线粒体 ATP合酶D亚基 柠檬酸合成酶 主要易化子超家族类型葡萄糖转运子 热休克蛋白HSP88
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