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豆类食品摄入及EGFR、ESR2基因多态性在非吸烟女性肺癌发生中的作用 被引量：5
1
作者 王晓波 李来芳 +3 位作者 程成全 赵浩 汪鑫 黄邵鑫 《公共卫生与预防医学》 2019年第1期23-26,共4页
目的研究豆类食品的摄入及EGFR、ESR2基因多态性与非吸烟女性肺癌发病的关系。方法调查收集非吸烟女性肺癌患者和对照,分析豆类食品与女性肺癌发病风险的关系。对非吸烟女性肺癌患者和对照组进行SNPS检测,分析EGFR和ESR2基因多态性与非... 目的研究豆类食品的摄入及EGFR、ESR2基因多态性与非吸烟女性肺癌发病的关系。方法调查收集非吸烟女性肺癌患者和对照,分析豆类食品与女性肺癌发病风险的关系。对非吸烟女性肺癌患者和对照组进行SNPS检测,分析EGFR和ESR2基因多态性与非吸烟女性肺癌的关联关系,并对大豆异黄酮的摄入、EGFR和ESR2基因多态性与非吸烟女性肺癌两两之间的交互作用进行分析。结果分析发现豆类食品的摄入能够降低非吸烟女性肺癌的发病风险(P=0.015),随着膳食豆类食品摄入量的增加,女性肺癌的风险效应值减少。经Bonferroni校正后,发现EGFR基因的rs11534100位点与非吸烟女性肺癌的发生之间存在关联。未发现豆类食品的摄入与EGFR、ESR2的SNPs在非吸烟女性肺癌发生的交互作用。结论豆类食品能降低女性非吸烟肺癌的发病风险,增加膳食大豆异黄酮的摄入量能减少女性肺癌的风险效应值。EGFR、ESR2基因多态性与非吸烟女性肺癌的发病存在关联。 展开更多
关键词 肺癌 非吸烟女性 表皮生长因子受体 雌激素受体 单核苷酸基因多态性
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基于GEO数据库结合CT影像预测肺癌临床分期的分子标志物及其诊断预测模型的建立 被引量：2
2
作者 欧阳锦 罗亭 +2 位作者 余石群 黄邵鑫 汪鑫 《南昌大学学报（医学版）》 2021年第5期1-7,共7页
目的基于高通量基因表达(GEO)数据库结合CT影像预测肺癌临床分期的分子标志物,并建立相应的诊断模型及预测列线图。方法从GEO数据库中获取小结节肺癌患者包括训练队列和验证队列的基因表达谱数据,按临床分期将2个队列分别分为2组:早期(... 目的基于高通量基因表达(GEO)数据库结合CT影像预测肺癌临床分期的分子标志物,并建立相应的诊断模型及预测列线图。方法从GEO数据库中获取小结节肺癌患者包括训练队列和验证队列的基因表达谱数据,按临床分期将2个队列分别分为2组:早期(Ⅰ期)组和中晚期(Ⅱ、Ⅲ期和Ⅳ期)组;分析2组基因的差异表达及功能富集;通过单因素分析筛选共差异基因后进行Logistic回归分析和ROC分析,并在训练队列中绘制诊断列线图。结果对训练队列和验证队列的差异分析分别获得161和437个差异基因,并筛选获得7个共差异表达基因(SLC16A14、LHX2、PRAME、ZNF257、SOX2、KCNJ16、GSTA1)。Logistic回归分析显示,高表达的ZNF257和低表达的SOX2、KCNJ16、GSTA1与中晚期肺癌显著相关(均P<0.05),以此四基因构建的模型灵敏度为83.3%,特异度为92.9%,建立的诊断列线图在小结节肺癌的恶性诊断预测中显示出极好的潜力。结论成功预测肺癌临床分期的4个分子标志物(ZNF257、SOX2、KCNJ16、GSTA1);以这4个差异表达基因可建立小结节肺癌诊断模型及诊断预测列线图;该诊断模型具有较好的特异度和灵敏度,列线图具有预测CT筛查小结节肺癌的潜能。 展开更多
关键词 肺癌 肺小结节 高通量基因表达数据库 CT影像 诊断预测
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肺腺癌预后相关坏死性凋亡基因标志物的构建及验证
3
作者 罗亭 欧阳锦 +4 位作者 余石群 曾凡凡 高丽云 黄邵鑫 汪鑫 《南昌大学学报（医学版）》 2022年第5期1-7,24,共8页
目的构建肺腺癌(LUAD)预后相关坏死性凋亡基因标志物并对其进行评估。方法KEGG数据库筛选坏死性凋亡相关基因(NRGs);TCGA和GEO数据库中分别下载LUAD样本和正常样本的RNA测序及其相应临床数据,并以TCGA数据集作为训练队列,以GEO数据集作... 目的构建肺腺癌(LUAD)预后相关坏死性凋亡基因标志物并对其进行评估。方法KEGG数据库筛选坏死性凋亡相关基因(NRGs);TCGA和GEO数据库中分别下载LUAD样本和正常样本的RNA测序及其相应临床数据,并以TCGA数据集作为训练队列,以GEO数据集作为验证队列,对筛选的NRGs进行差异和功能富集分析;单因素Cox及Lasso Cox回归分析构建NRGs的LUAD预后标志物;采用Kaplan-Meier生存分析、timeROC分析、多因素Cox回归分析和临床列线图评估该预后标志物;以GEO数据集(GSE31210)外部验证该预后标志物。结果筛选获得159个NRGs;在训练队列中鉴定出26个差异表达的NRGs(DENRGs);富集分析发现DENRGs主要参与坏死性凋亡和NOD样受体等信号通路;构建由6个NRGs(PLA2G4F、IL33、TLR4、RNF103.CHMP3、ALOX15、IL1A)组成的预后标志物;生存分析显示高风险组总体生存率(OS)明显低于低风险组(log-rank P<0.001);该预后标志物预测1年、3年和5年OS的AUC分别为0.672、0.631和0.624,且与LUAD患者OS显著相关(HR:2.30,95%CI:1.30~4.00,P<0.01);建立的列线图能较好地预测LUAD患者的生存;验证队列的分析结果与训练队列一致。结论成功构建一种新的NRGs预后标志物,其可用于预测LUAD患者的预后,且该预后标志物的预测能力良好。 展开更多
关键词 肺腺癌 坏死性凋亡 预后 标志物
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