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c-Jun氨基末端蛋白激酶在人角膜上皮细胞调控NLRP3炎症小体激活中的作用 被引量：3
1
作者 谭秋凡 陈淮程 +3 位作者 朱奕睿 朱韩磊 郑钦象 陈蔚 《温州医科大学学报》 CAS 2018年第1期13-19,共7页
目的:在高渗条件下,人角膜上皮细胞(HCECs)中c-Jun氨基末端蛋白激酶(JNK)对NLRP3炎症小体所介导的炎症因子白细胞介素1β(IL-1β)释放的作用。方法:设等渗、高渗、高渗+JNK抑制剂(SP600125)3组,其中等渗组和高渗组均加入DMSO使其浓度和... 目的:在高渗条件下,人角膜上皮细胞(HCECs)中c-Jun氨基末端蛋白激酶(JNK)对NLRP3炎症小体所介导的炎症因子白细胞介素1β(IL-1β)释放的作用。方法:设等渗、高渗、高渗+JNK抑制剂(SP600125)3组,其中等渗组和高渗组均加入DMSO使其浓度和高渗+JNK抑制剂组DMSO浓度相同。用RT-PCR检测各组JNK、炎症小体各聚合成分(NLRP3、ASC、caspase-1)和炎症因子(IL-1β、TNF-α、IL-8、IL-6)的mRNA水平;用caspase-1活性试剂盒检测细胞中caspase-1的活性,用AOEB染色法检测细胞凋亡情况;用免疫荧光检测NLRP3、IL-1β的蛋白表达变化;用Western blot检测JNK、p-JNK、NLRP3、caspase-1、ASC和IL-1β的蛋白表达情况。结果:RT-PCR检测结果显示JNK抑制剂预处理细胞能抑制高渗刺激引起的JNK1、JNK2、NLRP3、caspase-1、ASC、IL-1β、TNF-α、IL-8和IL-6的mRNA表达上调(P<0.05)。caspase-1活性测定结果显示JNK抑制剂预处理细胞能抑制高渗刺激引起的caspase-1活性增强(P<0.001)。AOEB染色检测显示JNK抑制剂预处理后,细胞凋亡减少。免疫荧光结果显示JNK抑制剂能抑制高渗引起的NLRP3、IL-1β蛋白表达上调。Western blot进一步提示该抑制剂能够抑制高渗刺激引起的p-JNK、炎症小体聚合成分NLRP3、caspase-1和炎症因子IL-1β的蛋白表达上调(P<0.05)。结论:HCECs在高渗条件下,NLRP3炎症小体被激活,从而分泌更多活性IL-1β,而JNK在调控NLRP3炎症小体的激活以及下游的炎症因子释放中起到了重要作用。 展开更多
关键词 高渗 c-Jun氨基末端蛋白激酶 炎症小体 白细胞介素1β 干眼病
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基于生物信息学分析的圆锥角膜相关Hub基因及其通路的鉴定
2
作者 朱叶 谭秋凡 +2 位作者 巩倩文 胡晓建 陈世豪 《温州医科大学学报》 CAS 2021年第2期111-117,共7页
目的:明确圆锥角膜(KC)潜在的目标基因并探讨其潜在的病理机制。方法:从GEO数据库中下载GSE77938的基因芯片数据并进行生物信息学分析。GSE77938数据集包含50个样本,包括25例KC患者和25例正常对照者。采用Cytoscape软件进行GO和KEGG富... 目的:明确圆锥角膜(KC)潜在的目标基因并探讨其潜在的病理机制。方法:从GEO数据库中下载GSE77938的基因芯片数据并进行生物信息学分析。GSE77938数据集包含50个样本,包括25例KC患者和25例正常对照者。采用Cytoscape软件进行GO和KEGG富集分析,并通过Cytoscape软件构建差异表达基因(DEGs)的蛋白相互作用(PPI)网络。结果:在KC中共鉴定出1547个DEGs,包括1103个上调基因和444个下调基因。GO分析结果显示,上调的DEGs在生物过程(BP)中的1220条通路中显著富集、细胞成分(CC)的黑素体的102条通路和分子功能(MF)的102条通路中显著富集。下调DEGs的富集功能在BP、CC和MF中分别为99、64和47个通路。KEGG通路分析显示上调的DEGs富集于72条通路,而下调的DEGs富集于8条通路。从PPI网络中鉴定出Hub基因TNF、JUN、IFNG、PTPRC、ICAM1、FOS、IL6、CXCL8、LCK、CSF2、MMP9、ITGAX、CD40LG和IL10,ClueGO分析发现这些基因涉及GO术语中的6条显著通路和KEGG中的3条通路。结论:所鉴定的DEGs和枢纽基因促进了对KC发生的分子机制的理解,其可能作为KC治疗的分子靶点和诊断性生物标志物。 展开更多
关键词 差异表达基因 生物信息学分析 圆锥角膜 蛋白质-蛋白质相互作用网络 ClueGO
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