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GridMol:一个基于网格的分子可视化系统
1
作者 姚继锋 卢玥 单桂华 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2005年第22期76-77,100,共3页
介绍了一个基于网格环境、支持大分子显示的远程可视化系统GridMol。系统采用Browser-Server结构,客户端采用Java3D实现,服务器端使用面向对象方法实现了支持多种文件格式的数据处理,同时采用了特定的数据格式以减小网络数据传输。整个... 介绍了一个基于网格环境、支持大分子显示的远程可视化系统GridMol。系统采用Browser-Server结构,客户端采用Java3D实现,服务器端使用面向对象方法实现了支持多种文件格式的数据处理,同时采用了特定的数据格式以减小网络数据传输。整个系统置于网格环境下,用户通过ChinaGrid的VisPortal进行访问。 展开更多
关键词 GridMOL 可视化系统 网格
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稀疏近似逆与多层块ILU预条件技术 被引量：2
2
作者 谷同祥 迟学斌 刘兴平 《应用数学和力学》 EI CSCD 北大核心 2004年第9期927-934,共8页
　设计了一种求解一般稀疏线性方程组的健壮且有效的可并行化预条件子,这种预条件子涉及在多层块ILU预条件子(BILUM)中使用稀疏近似逆(AINV)技术·　所得的预条件子保持了BILUM的健壮性。
关键词 稀疏矩阵 预条件技术 BILUM AINV KRYLOV子空间方法
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基于多层半可分结构矩阵的快速算法与并行实现 被引量：1
3
作者 谢力 王武 冯仰德 《数值计算与计算机应用》 2017年第1期37-48,共12页
基于多层半可分(HSS)结构矩阵的快速算法可有效降低具有数值低秩属性的稠密线性方程组求解的复杂度.采用随机取样和保结构秩显(SPRR)分解相结合的方法替代秩显QR(RRQR)分解可以快速构造HSS结构矩阵.该方法将压缩构造HSS结构矩阵转换成... 基于多层半可分(HSS)结构矩阵的快速算法可有效降低具有数值低秩属性的稠密线性方程组求解的复杂度.采用随机取样和保结构秩显(SPRR)分解相结合的方法替代秩显QR(RRQR)分解可以快速构造HSS结构矩阵.该方法将压缩构造HSS结构矩阵转换成小矩阵计算,减少存储和通信开销,使构造HSS结构矩阵的时间复杂度进一步降低.在分布式机群上采用ScaLapack的二维循环块分布方式存储各矩阵块,将HSS树和处理机网格进行映射.构造HSS结构矩阵的并行算法包括对矩阵的多层块压缩,数据交换和重分布,然后结合并行ULV分解和并行三角求解实现快速并行求解,分析了该并行算法的复杂度.最后以二维电磁散射问题为例,数值结果表明该算法不仅比直接LU分解快一个数量级,而且具有良好的并行可扩展性. 展开更多
关键词 多层半可分 数值低秩 随机取样 ULV分解 并行算法
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无需线搜索的并行非线性共轭梯度法 被引量：1
4
作者 王建 迟学斌 +1 位作者 谷同祥 冯仰德 《计算物理》 CSCD 北大核心 2006年第1期50-56,共7页
给出了一类无需线搜索的无约束最优化并行算法———并行非线性共轭梯度法(NLS-PNCG),用一个固定的公式来计算搜索步长,较常用的共轭梯度法计算量小.并且证明了方法的全局收敛性,给出了数值试验,结果显示NLS-PNCG优于线搜索的非线性共... 给出了一类无需线搜索的无约束最优化并行算法———并行非线性共轭梯度法(NLS-PNCG),用一个固定的公式来计算搜索步长,较常用的共轭梯度法计算量小.并且证明了方法的全局收敛性,给出了数值试验,结果显示NLS-PNCG优于线搜索的非线性共轭梯度法(NCG). 展开更多
关键词 无约束最优化 共轭梯度法 搜索步长 NLS-PNCG
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用并行CG_DY算法进行圆柱体压力场测定
5
作者 王建 迟学斌 张志跃 《计算力学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期674-677,共4页
给出了由Dai和Yuan提出的非线性共轭梯度算法(CG_DY)的并行实现,并应用并行CG_DY算法在高性能计算机上求解圆柱体压力场测定的问题,比较了曙光2000和深腾6800的性能。数值计算给出了满意的结果,发现并行CG_DY算法在最优化问题的设计中... 给出了由Dai和Yuan提出的非线性共轭梯度算法(CG_DY)的并行实现,并应用并行CG_DY算法在高性能计算机上求解圆柱体压力场测定的问题,比较了曙光2000和深腾6800的性能。数值计算给出了满意的结果,发现并行CG_DY算法在最优化问题的设计中具有很好的性质,并显示其具有很好的可扩展性。 展开更多
关键词 并行计算 压力场 加速比 无约束最优化
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数学家和物理学家的趣闻轶事
6
作者 姜金荣 《国外科技新书评介》 2007年第9期16-17,共2页
本书的作者是美国Rutgers大学数学系的Simo Gindikin教授，出生于原苏联。Simo Gindikin教授是表示论、积分几何和多复变函数的专家。本书的译者是美国Wellesley大学数学系的Alan Shuchat教授。Alan Shuchat教授的学术兴趣广泛，特别是... 本书的作者是美国Rutgers大学数学系的Simo Gindikin教授，出生于原苏联。Simo Gindikin教授是表示论、积分几何和多复变函数的专家。本书的译者是美国Wellesley大学数学系的Alan Shuchat教授。Alan Shuchat教授的学术兴趣广泛，特别是喜欢旅行和学习各种外语，使得他能轻松胜任本书的翻译工作。 展开更多
关键词 物理学家 数学家 SIMO ALAN 多复变函数 积分几何 数学系 原苏联
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InsPecT的千核并行及优化
7
作者 涂强 郎显宇 +1 位作者 陆忠华 迟学斌 《科研信息化技术与应用》 2010年第4期76-82,共7页
蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,... 蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,但极高的计算复杂度是阻碍其广泛应用的主要障碍。本文对InsPecT软件进行并行化,并在千核环境下进行测试;此外,还在负载平衡方面和GPU加速方面进行优化。结果显示,并行效率突出,加速效果显著。 展开更多
关键词 蛋白质翻译后修饰鉴定 INSPECT 负载平衡 千核
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电场积分方程的快速求解
8
作者 王武 冯仰德 迟学斌 《数值计算与计算机应用》 CSCD 2008年第1期15-24,共10页
矩量法(MOM)离散电场积分方程(EFIE)得到稠密的线性方程组,它可以用迭代法(比如本文中的TFQMR方法)求解.每次迭代过程中,矩阵与向量的乘积的复杂度为O(N2).采用多层快速多极子方法(MLFMM),可将其降到O(NlogN).采用基于球谐变换的快速傅... 矩量法(MOM)离散电场积分方程(EFIE)得到稠密的线性方程组,它可以用迭代法(比如本文中的TFQMR方法)求解.每次迭代过程中,矩阵与向量的乘积的复杂度为O(N2).采用多层快速多极子方法(MLFMM),可将其降到O(NlogN).采用基于球谐变换的快速傅立叶变换,可进一步加快MLFMM的层间插值计算.数值结果显示MLFMM求解EFIE是可行的. 展开更多
关键词 电场积分方程 矩量法 快速多极子方法 无转置拟极小余量法 快速傅立叶变换
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随机分析和非参数估计
9
作者 Pao—Liu Chow 姜金荣 《国外科技新书评介》 2008年第5期3-3,共1页
为了祝贺RafailZ．Khasminskii教授75岁生日，2006年9月15～17日在韦恩州立大学举办了随机过程、非参数估计及相关问题的渐进分析会议，以表彰他在随机过程和非参数估计理论等许多方面做出的基础性贡献。IMA145卷收集了邀请报告者的论... 为了祝贺RafailZ．Khasminskii教授75岁生日，2006年9月15～17日在韦恩州立大学举办了随机过程、非参数估计及相关问题的渐进分析会议，以表彰他在随机过程和非参数估计理论等许多方面做出的基础性贡献。IMA145卷收集了邀请报告者的论文，他们大多是概率理论、随机过程、随机微分方程组和非参数估计理论方面的著名领军人物。很多邀请报告者是概率和随机过程初期的研究者，他们建立了现代概率理论基础。 展开更多
关键词 非参数估计 随机分析 随机微分方程组 随机过程 概率理论 估计理论 州立大学 基础
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