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云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究 被引量:55
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作者 兰宏 熊习昆 +2 位作者 林世英 刘爱华 施立明 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第5期419-425,共7页
本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南... 本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南黄牛的相类似。云南黄牛可能具有两种起源,即普通黄牛起源和瘤牛起源。今天的云南黄牛群体是这两种类型的混合。大额牛的限制性类型与瘤牛相同,表明大额牛的起源与瘤牛有密切关系。 展开更多
关键词 云南黄牛 MTDNA 遗传 多态现象
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西南地区家猪和野猪mtDNA遗传多样性研究 被引量:42
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作者 兰宏 王文 施立明 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1995年第1期28-33,共6页
本实验用ApaI、AvaI、BamHI、BclI、BglII、BglII、ClaI、EcoRI、EcoRV、HindIII、Hpal、KpnI、PstI、PvuII、SacI、SalI、ScaI、SmaI、XbaI和... 本实验用ApaI、AvaI、BamHI、BclI、BglII、BglII、ClaI、EcoRI、EcoRV、HindIII、Hpal、KpnI、PstI、PvuII、SacI、SalI、ScaI、SmaI、XbaI和XhoI等20种限制性内切酶分析来自中国西南地区的家猪和野猪的mtDNA群体遗传多样性。结果表明:在全部28只个体中,共检出26种限制性态型(morph),归结为6种不同的限制性类型,限制性类型的差异主要来源于少数几个限制性位点的偶然突变。利用现代分子群体遗传学方法,对这些猪的遗传多样性进行评估,结果表明中国西南地区猪的mtDNA变异度很低,遗传多样性贫乏,提示西南地区的猪起源于一个共同的祖先,在品种形成的早期可能受到创立者效应的制约。 展开更多
关键词 遗传 MTDNA 多态性 遗传多样性
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西南地区地方品种猪血液蛋白遗传多样性研究 被引量:27
3
作者 聂龙 施立明 《生物多样性》 CAS CSCD 1995年第1期1-7,共7页
本实验采用水平板淀粉凝胶电泳技术,研究滇南小耳猪、迪庆藏猪、明光小耳猪、福贡猪、越南野猪和贵州从江香猪共20个个体共计42个基因座位的蛋白质多态性,发现其基因型和基因频率大部分相似,只有Tf、HP、EsD、Amy-1... 本实验采用水平板淀粉凝胶电泳技术,研究滇南小耳猪、迪庆藏猪、明光小耳猪、福贡猪、越南野猪和贵州从江香猪共20个个体共计42个基因座位的蛋白质多态性,发现其基因型和基因频率大部分相似,只有Tf、HP、EsD、Amy-1、CEs和6PGD等六个座位具有多态性;多态座位百分比和平均杂合度分别为P—0.0714,H—0.051。用UPGMA法分别对由基因频率所计算的标准遗传距离和欧氏几何距离进行聚类分析,结果表明贵州从江香猪和其他几个云南猪品种(系)的距离最远。 展开更多
关键词 血液 蛋白 遗传多样性
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系统发育研究中“长枝吸引”假象概述 被引量:12
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作者 黎一苇 于黎 张亚平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期659-667,共9页
系统发育研究(phylogeny)不仅有助于重建地球所有生物体的进化历史,而且还可以揭示进化生物学领域中的一些基本问题。清晰了解各生物物种进化历程及不同物种之间的进化关系,是进一步研究和探索生物学其他学科的基础。但是现今广泛应用... 系统发育研究(phylogeny)不仅有助于重建地球所有生物体的进化历史,而且还可以揭示进化生物学领域中的一些基本问题。清晰了解各生物物种进化历程及不同物种之间的进化关系,是进一步研究和探索生物学其他学科的基础。但是现今广泛应用的所有系统发育分析方法都存在一定的局限性,在一定程度上不能有效消除各种误差,从而不能客观地处理和分析数据,也就不能成功重建生物进化历程,真实反映物种进化关系。系统发育研究中,"长枝吸引"(Long-branch Attraction,LBA)假象是最为困扰研究者的问题。文章从"长枝吸引"问题的产生原由、检测方法以及消除策略等多个方面进行详尽概述,并通过列举典型实例,阐述了解决"长枝吸引"问题的途径。 展开更多
关键词 系统发育研究 长枝吸引 系统发育分析方法
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中国地方黄牛的遗传多样性 被引量:5
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作者 涂正超 张亚平 《生物多样性》 CAS CSCD 1997年第2期90-94,共5页
中国黄牛起源复杂,我国地方黄牛群体不同品种在毛色、形态外貌、细胞遗传学、血液蛋白座位分析均表现出多样性。计算我国黄牛群体6个毛色座位平均杂合度和6个血液蛋白座位平均杂合度分别为0.3144和0.4873,表明我国地方... 中国黄牛起源复杂,我国地方黄牛群体不同品种在毛色、形态外貌、细胞遗传学、血液蛋白座位分析均表现出多样性。计算我国黄牛群体6个毛色座位平均杂合度和6个血液蛋白座位平均杂合度分别为0.3144和0.4873,表明我国地方黄牛群体的遗传多样性非常丰富。计算我国黄牛群体的6个毛色座位和6个血液蛋白座位的基因分化系数分别为0.3404和0.095,表明我国黄牛群体毛色差异中有3404%是由品种间的差异造成的。血液蛋白的多态性有95%是由品种间的差异造成的。我国黄牛群体的遗传多样性主要来自品种内的遗传多样性。保存我国黄牛品种资源多样性不仅要从整个中国黄牛群体上考虑。 展开更多
关键词 中国黄牛 遗传多样性
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梭鱼的分子系统地理学研究——晚更新世西北太平洋边缘海隔离分化及其有限的扩散能力 被引量:9
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作者 刘进贤 高天翔 +1 位作者 吴世芳 张亚平 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期931-938,共8页
西北太平洋具有独特的板块特征和地质历史,几个边缘海将亚洲大陆和太平洋隔开。在更新世冰期的低海平面时期,海洋生物群体可能会被隔离在日本海、东海和南海。伴随冰后期海平面的上升,以往的研究认为被隔离在3个边缘海的群体会因为扩散... 西北太平洋具有独特的板块特征和地质历史,几个边缘海将亚洲大陆和太平洋隔开。在更新世冰期的低海平面时期,海洋生物群体可能会被隔离在日本海、东海和南海。伴随冰后期海平面的上升,以往的研究认为被隔离在3个边缘海的群体会因为扩散的作用而重新混匀。为了检验该假说,本研究探讨了梭鱼的系统地理格局。采集梭鱼分布范围内9个地点的272个梭鱼个体,分析其线粒体控制区5’端435 bp的片段。共检测到3个不同的单倍型类群,这3个单倍型类群可能是在更新世冰期被隔离在3个边缘海内而产生的分化。这一研究结果与以往的假设相反,3个单倍型类群在地理上的频率分布存在很大差异。分子方差分析和群体多样性指数都表明3个边缘海内的梭鱼群体间存在显著的遗传差异。这些结果表明:与基于生物学特性预期的梭鱼具有较高的扩散能力相反,梭鱼群体空间上的基因交流是很有限的。东海的梭鱼群体间缺乏系统地理格局,这可能是因为末次冰盛期后梭鱼群体发生了近期的栖息地扩张,群体间没有足够的进化时间在迁移-漂变间取得平衡。 展开更多
关键词 梭鱼 控制区 幼体扩散 海洋生物地理学 更新世冰期
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中国人精母细胞和卵母细胞联会复合体的电镜观察 被引量:6
7
作者 施立明 马昆 杨凤堂 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1992年第5期403-409,共7页
以微铺展技术结合硝酸银染色,对中国人精母细胞和流产胎儿卵巢联会复合体的形态和行为作了电镜观察。列出中国人的SC核型和模式图。根据减数分裂前期XY的复杂形态变化,XY的配对可分为5种类型。对XY短臂之间形成的SC和XY长臂顶端的次级... 以微铺展技术结合硝酸银染色,对中国人精母细胞和流产胎儿卵巢联会复合体的形态和行为作了电镜观察。列出中国人的SC核型和模式图。根据减数分裂前期XY的复杂形态变化,XY的配对可分为5种类型。对XY短臂之间形成的SC和XY长臂顶端的次级联合以及XY配对的性质和机理作了描述和讨论。本文还报道了一个罕见的三倍体精母细胞,对三倍体精母细胞中SC的配对行为以及和人类染色体疾病病因的可能关系作了分析和讨论。 展开更多
关键词 卵母细胞 联会复合体 精母细胞
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苦味受体与甜味、鲜味受体具有不同的进化途径(英文) 被引量:1
8
作者 施鹏 黄京飞 张亚平 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第4期346-353,共8页
通过生物信息学和系统发育学分析,研究了苦味受体和甜味 /鲜味受体的进化途径。结果显示,苦味受体和甜味 /鲜味受体在进化上具有远相关,并且具有不同的进化途径,提示这可能是导致这些受体具有不同功能,传导不同味觉的原因。
关键词 进化途径 苦味受体 甜味受体/鲜味受体 基因融合 跨膜区
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蛋白质对核酸专一性识别的一种可能的方式
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作者 李许卿 刘次全 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第22期2413-2418,共6页
对来自几种基因启动子上的7组蛋白质结合位点进行了分析, 暗示着蛋白质对双螺旋核酸专一性识别的一种可能方式. 这种识别方式涉及双链DNA的一种特别的拓扑性质, 称为DNA片段的碱基空间模式(base spatial pattern, BSP), 它是仅由双链DN... 对来自几种基因启动子上的7组蛋白质结合位点进行了分析, 暗示着蛋白质对双螺旋核酸专一性识别的一种可能方式. 这种识别方式涉及双链DNA的一种特别的拓扑性质, 称为DNA片段的碱基空间模式(base spatial pattern, BSP), 它是仅由双链DNA片段上的碱基在空间中的排列方式所决定的一种空间拓扑性质. 展开更多
关键词 蛋白质 识别 碱基空间模式 双螺旋核酸 专一性
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一种简捷有效的组蛋白提取法 被引量:5
10
作者 文建凡 李靖炎 《Zoological Research》 CAS CSCD 1994年第4期44-44,72,84,共3页
一种简捷有效的组蛋白提取法文建凡,李靖炎(中国科学院昆明动物研究所细胞及分子进化实验室昆明650223)关键词小牛胸腺,组蛋白提取ASIMPLE,EFFICIENTPROCEDUREFORISOLATINGHISTO... 一种简捷有效的组蛋白提取法文建凡,李靖炎(中国科学院昆明动物研究所细胞及分子进化实验室昆明650223)关键词小牛胸腺,组蛋白提取ASIMPLE,EFFICIENTPROCEDUREFORISOLATINGHISTONE¥WenJianfan;LiJ... 展开更多
关键词 小牛 胸腺 组蛋白 提取
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动物线粒体DNA多态性的研究概况 被引量:193
11
作者 张亚平 施立明 《Zoological Research》 CAS CSCD 1992年第3期289-298,共10页
从Nass等(1962)发现线粒体DNA(mtDNA)以来,在mtDNA的结构、组成、复制、转录、基因表达及调控等方面已积累大量的资料(Brown,1983)。人、小鼠、牛、非洲爪蟾(Xenopus laevis)、果蝇和海胆的mtDNA全序列已经清楚。
关键词 动物 多态性 线粒体 脱氧核糖核酸
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从DNA序列到物种树 被引量:82
12
作者 张亚平 《Zoological Research》 CAS CSCD 1996年第3期247-252,共6页
从DNA序列到物种树张亚平(中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室650223)关键词DNA序列,基因树,物种树Keywords:DNASequence,Genetree,SpeciestreeDNA不... 从DNA序列到物种树张亚平(中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室650223)关键词DNA序列,基因树,物种树Keywords:DNASequence,Genetree,SpeciestreeDNA不仅是主要的遗传物质,同时也是生物进... 展开更多
关键词 DNA序列 基因树 物种树 进化
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随机扩增多态DNA影响因素的研究 被引量:101
13
作者 陈永久 张亚平 《Zoological Research》 CAS CSCD 1997年第2期221-227,共7页
随机扩增多态DNA(RAPD)分析受诸多因素的影响,我们发现不同厂家制造的PCR扩增仪,不同厂家出品的TaqDNA聚合酶和PCR缓冲液,RAPD反应体系中的引物浓度,Mg2+浓度,dNTP浓度,BSA(牛血清白蛋白)... 随机扩增多态DNA(RAPD)分析受诸多因素的影响,我们发现不同厂家制造的PCR扩增仪,不同厂家出品的TaqDNA聚合酶和PCR缓冲液,RAPD反应体系中的引物浓度,Mg2+浓度,dNTP浓度,BSA(牛血清白蛋白)和明胶,以及模板DNA的量等均可能对RAPD结果有不同程度的影响。为了使RAPD结果在不同实验室间具有重复性和可比性,提高RAPD数据的科学价值,我们建议在RAPD分析过程和文章写作中应规范化。方法部分,除一般写明的引物浓度、TaqDNA聚合酶单位数、dNTP浓度、每一次PCR反应的循环条件和循环数等外,还应注明PCR仪的制造厂家及型号、TaqDNA聚合酶生产厂家、PCR缓冲液的成分、Mg2+浓度。 展开更多
关键词 DNA 检测 RAPD 影响因素
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一种改进的动物线粒体DNA提取方法 被引量:118
14
作者 王文 施立明 《Zoological Research》 CAS CSCD 1993年第2期197-198,共2页
线粒体DNA(mtDNA)已被广泛用于动物群体遗传学和进化生物学的研究,并取得了许多有意义的结果。有效的mtDNA提取方法无疑是开展这方面研究的前提。关于动物mtDNA的提取方法,国内外已有不少报导。概括起来,可分为:1)氯化铯超速离心法,2)... 线粒体DNA(mtDNA)已被广泛用于动物群体遗传学和进化生物学的研究,并取得了许多有意义的结果。有效的mtDNA提取方法无疑是开展这方面研究的前提。关于动物mtDNA的提取方法,国内外已有不少报导。概括起来,可分为:1)氯化铯超速离心法,2)柱层析法,3)DNase法,4)碱变性法。本文报道了一种改进的碱变性提取法,与其它方法相比,具有应用范围广、简便、经济等优点。 展开更多
关键词 MTDNA 碱变性提取法 线粒体 DNA
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大熊猫微卫星DNA的筛选及其应用 被引量:71
15
作者 张亚平 王文 +4 位作者 宿兵 范志勇 张和民 何廷美 Oliver A.Ryder 《Zoological Research》 CAS CSCD 1995年第4期301-306,共6页
经DpnⅡ限制酶消化大熊猫基因组DNA后,选取150-500bp大小的片段构建了DNA文库。用合成的(CA)(15)探针从这一文库中克隆筛选了10个大熊猫特异的微卫星DNA座位。在测定DNA序列的基础上设计并合成了1... 经DpnⅡ限制酶消化大熊猫基因组DNA后,选取150-500bp大小的片段构建了DNA文库。用合成的(CA)(15)探针从这一文库中克隆筛选了10个大熊猫特异的微卫星DNA座位。在测定DNA序列的基础上设计并合成了10个座位特异的引物,以PCR技术扩增了7份抽提自组织细胞和6份抽提自毛发的大熊猫DNA样品。发现除座位g(007)外,其余9个座位均呈多态性,而且所有座位均为偶数碱基的长度变异。对有准确谱系记录的家系的研究结果证明,这10个微卫星DNA座位严格按孟德尔方式遗传。因而这些座位能有效地应用于大熊猫的亲子鉴定,从而为建立各地大熊猫谱系和制定有效的繁殖计划提供了一个有效的遗传学手段。根据这10个微卫星座位的分析,我们澄清了两组未知的父系关系。 展开更多
关键词 大熊猫 微卫星DNA 亲子鉴定 筛选
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单核苷酸多态性的研究技术 被引量:55
16
作者 罗怀容 施鹏 张亚平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期471-476,共6页
本文在对人类基因组单核苷酸多态性 (SNP)的概念做简要说明的基础上 ,系统地介绍 14种检测分析SNP的技术和方法的原理、操作要点及其优缺点。
关键词 单核苷酸多态性 研究技术 突变 检测
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贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化 被引量:60
17
作者 贾永红 史宪伟 +6 位作者 简承松 朱文适 张亚平 何正权 廖正录 余应淮 李通权 《Zoological Research》 CAS CSCD 1999年第2期88-92,共5页
采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。... 采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。单倍型Ⅰ和Ⅱ在贵州山羊4个品种中分布频率较高,分别为7742%和2150%,单倍型Ⅲ分布频率较低(108%);品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而与小香羊的亲缘关系最远。推测贵州山羊mtDNA单倍型Ⅰ和Ⅱ可能来源于两个母系祖先,其分化时间约在19万年前。 展开更多
关键词 山羊 MTDNA RFLP 起源分化
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中国5种珍稀绢蝶非损伤性取样的mtDNA序列及系统进化 被引量:45
18
作者 陈永久 张亚平 +4 位作者 沈发荣 张云武 杨大荣 聂龙 杨跃雄 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期203-207,共5页
应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,... 应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,该5种绢蝶间DNA序列变异丰富。PAUP3.1.1(简约法)数据分析软件构建该5个种绢蝶的分子系统树显示,爱珂绢蝶(Parnassiusacco)和巴裔绢蝶(Parnassiusbaileyi)的亲缘关系比较接近,阿波罗绢蝶(Parnassiusapollo)、珍珠绢蝶(Parnassiusorlears)和西猴绢蝶(Parnassiussimo)3种绢蝶均为相对独立的一支,其中西猴绢蝶分化较早,与形态学研究结果相吻合。 展开更多
关键词 绢蝶 非损伤性取样 MTDNA 系统进化
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山羊品种间线粒体DNA限制性片段长度多态性研究 被引量:36
19
作者 李祥龙 张亚平 +3 位作者 陈圣偶 曾凡同 邱祥聘 刘相模 《Zoological Research》 CAS CSCD 1997年第4期421-428,共8页
本试验利用ApaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HaeⅡ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ计18种限制性内切酶... 本试验利用ApaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HaeⅡ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ计18种限制性内切酶,研究了来自欧洲、非洲及国内的5个山羊品种共计33只个体的mtDNA,共检测出27种限制性态型,可归结为8种单倍型。结果表明,国内2个山羊品种的基本单倍型为BamHⅠ-A、BclⅠ-B、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-C和PvuⅡ-A,以及为BamHⅠ-A、BclⅠ-A、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-C和PvuⅡ-A,而欧洲及非洲3个山羊品种基本的单倍型为BamHⅠ-B、BclⅠ-A、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-B和PvuⅡ-A,这一结果提示本研究几个受试山羊品种可能有两种不同的母系来源;同时,各品种的分子聚类图也表明国内2个山羊品种间具有较近的亲缘关系,而欧洲品种和非洲3个品种间的亲缘关系较近,这一结果也支持上述几个受试山羊品种可能有不同野生祖先的结论,同时也验证了欧洲? 展开更多
关键词 山羊 线粒体DNA RFLP 遗传多样性
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银鲴自然群体线粒体DNA的遗传分化 被引量:31
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作者 肖武汉 张亚平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期1-10,共10页
运用21种限制性内切酶对银鲴自然群体进行了mtDNA的限制性片断长度多态性(RFLP)分析。发现银鲴自然群体存在丰富的mtDNA多态性,从4个群体39个个体中,共检测到12种单倍型,对这一现象的成因进行了探讨。依据单倍型和群体的系统发育... 运用21种限制性内切酶对银鲴自然群体进行了mtDNA的限制性片断长度多态性(RFLP)分析。发现银鲴自然群体存在丰富的mtDNA多态性,从4个群体39个个体中,共检测到12种单倍型,对这一现象的成因进行了探讨。依据单倍型和群体的系统发育关系,结合地理分布的资料,对其现今分布区相互间的历史联系及其对银鲴起源和分化的影响进行了分析。 展开更多
关键词 银鲴 自然群体 线粒体DNA 遗传分化
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