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几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂
被引量：
13
1
作者
聂晶
董喜成
潘家祜
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期1129-1135,共7页
由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的...
由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.
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关键词
CoMFA方法
血小板活化因子拮抗剂
比较分子场分析
R^2引导的区域选择法
全取向搜索法
全空间搜索法
配体药物
药物设计
下载PDF
职称材料
PAF拮抗剂的三维定量构效关系研究
2
作者
聂晶
董喜成
潘家枯
《中国药理通讯》
2003年第3期68-68,共1页
关键词
PAF拮抗剂
三维定量构效关系
配体
药物设计
受体
下载PDF
职称材料
题名
几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂
被引量：
13
1
作者
聂晶
董喜成
潘家祜
机构
复旦大
学
药
学院
中国科学院
上海
有机化学
研究所
计算机化
学
重点
实验室
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期1129-1135,共7页
基金
科技部国家重点基础发展规划973项目(No.G1998051115)。
文摘
由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.
关键词
CoMFA方法
血小板活化因子拮抗剂
比较分子场分析
R^2引导的区域选择法
全取向搜索法
全空间搜索法
配体药物
药物设计
Keywords
comparative molecular field analysis (CoMFA) , cross-validated R -guided regional selection (q2-GRS) ,all-orientation search and all-placement search (AOS/APS), comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA), platelet activating fac
分类号
TQ464 [化学工程—制药化工]
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职称材料
题名
PAF拮抗剂的三维定量构效关系研究
2
作者
聂晶
董喜成
潘家枯
机构
复旦大
学
药
学院
中国科学院
上海
有机化学
研究所
计算机化
学
重点
实验室
出处
《中国药理通讯》
2003年第3期68-68,共1页
关键词
PAF拮抗剂
三维定量构效关系
配体
药物设计
受体
分类号
R977 [医药卫生—药品]
R914.2 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂
聂晶
董喜成
潘家祜
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
13
下载PDF
职称材料
2
PAF拮抗剂的三维定量构效关系研究
聂晶
董喜成
潘家枯
《中国药理通讯》
2003
0
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职称材料
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参考文献
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