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题名基于纳米计算结构上的生物序列模体发现算法
被引量：3
- 1
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作者
沈一飞
陈国良
张强峰
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机构
中国科学技术大学计算机科学技术系高性能计算及应用省部共建重点实验室
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出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2007年第4期635-639,共5页
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基金
国家自然科学基金项目(60533020)资助.
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文摘
模体发现对于预测基因特殊功能位点和鉴别药物作用目标等有重要的应用价值.本文介绍了一种纳米计算平台系统结构模型—CellMatrix以及在其上实现的DNA序列模体发现算法.CellMatrix是一种针对纳米计算平台提出的由同构晶格组成的可重构系统结构.这种结构既便于大规模工业生产,也很容易使得各种计算机软硬件系统在其上实现,同时这种结构又具备良好的可扩放性,是未来实现成熟纳米计算平台的一种选择.基于CellMatrix结构,本文首先在晶格结构上设计基本字符比较单元,而后在此基础上逐层构建更高层次的子序列测试单元和单条序列处理架构,从而实现了基于模式驱动的模体发现算法.最后用晶格开销数目和晶格延迟给出该算法的时空开销.
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关键词
纳米计算平台
模体发现
CELL
MATRIX
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Keywords
nanocomputing
motif finding
cell matrix
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分类号
TP302
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名高可用应用开发平台的设计与实现
被引量：3
- 2
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作者
吴俊敏
李黄海
黄刘生
鲍春健
王文韬
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机构
中国科学技术大学计算机科学技术系高性能计算及应用省部共建重点实验室
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出处
《计算机工程》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第24期283-284,F0003,共3页
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基金
中科院高水平大学建设基金资助项目(KY2706)
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文摘
设计并实现了一个高可用应用开发平台,该平台提供了一个灵活的高可用编程环境,不仅包含高可用应用开发框架,还包含了应用开发所必需的检查点服务、分布式锁服务、事件服务、消息服务和成员服务等。采用该平台使得应用程序的开发只需要集中于具体的业务流程上,而不需要过多地考虑其他高可用特性,同时还可提供更强的可移植性。
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关键词
高可用性
并行与分布式计算
组通信
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Keywords
High availability
Parallel and distributed computation
Group communication
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分类号
TP311.52
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名支持动态负载平衡的分层消息队列模型
被引量：1
- 3
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作者
鲍春健
吴俊敏
许胤龙
李黄海
王文韬
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机构
中国科学技术大学计算机科学技术系高性能计算及应用省部共建重点实验室
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2007年第1期155-158,共4页
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基金
中科大青年基金资助项目(KA1125)
中科院高水平大学建设基金资助项目(KY2706)。
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文摘
中间件技术为解决异构分布式环境下的负载平衡问题提供了有力的工具,但传统的消息中间件负载平衡的实现较为复杂,其动态参数繁多且容易带来额外开销。提出了一种分层消息队列模型,该模型中利用队列组管理器对分布式队列进行组管理,并提供了丰富的任务分配策略。在该模型的基础上提出动态负载平衡实现方案:通过基于队列的阈值阈长模型实时监控成员队列的负载情况,采用集中式调度进行负载信息搜集和负载平衡决策,结合负载迁移和队列组管理进行过载处理。
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关键词
分布式系统
消息队列
动态负载平衡
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Keywords
distributed system
message queue
dynamic load balancing
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分类号
TP311.52
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名弱一致性模型下的分布式垃圾回收算法RRDGC
被引量：1
- 4
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作者
吴俊敏
宋振华
陈国良
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机构
中国科学技术大学计算机科学技术系高性能计算及应用省部共建重点实验室
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出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2006年第7期1304-1307,共4页
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基金
中科院高水平大学建设项目(KY2706)资助
中国科学技术大学校青年基金(KA1125)资助.
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文摘
垃圾回收有效地减轻了编程人员的负担、优化了程序的设计.在基于弱一致性模型的分布式共享存储系统中进行自动垃圾回收是非常困难的和低效的.本文提出了一种基于跟踪策略的实时分布式垃圾回收算法—RRDGC,使得各节点回收进程可以和应用程序并发执行,同时有效减少了弱一致性模型下额外的通信开销,降低了程序的响应时间.算法确保了垃圾回收的正确性和有效性,体现了增量和实时性的特点.最后通过仿真实验对比论证了该算法的正确性和高效性.
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关键词
弱一致性模型
分布式共享存储
垃圾回收算法
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Keywords
relaxed consistency model
DSM
garbage collection algorithm
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分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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