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产志贺毒素大肠杆菌O157∶H7的亚碲酸钾抗性基因簇分布和抗性水平 被引量：4
1
作者 李新军 叶长芸 +3 位作者 张晶波 卢珊 白雪梅 徐建国 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期833-836,共4页
目的　了解产志贺毒素大肠杆菌O15 7∶H7的亚碲酸盐抗性基因簇的分布和抗性水平的关系。方法　运用PCR和核酸杂交方法进行基因检测 ,使用平皿法检测亚碲酸钾抗性水平。结果在所检测的志贺菌、沙门菌、霍乱弧菌、耶尔森菌、泌尿道致病性... 目的　了解产志贺毒素大肠杆菌O15 7∶H7的亚碲酸盐抗性基因簇的分布和抗性水平的关系。方法　运用PCR和核酸杂交方法进行基因检测 ,使用平皿法检测亚碲酸钾抗性水平。结果在所检测的志贺菌、沙门菌、霍乱弧菌、耶尔森菌、泌尿道致病性大肠杆菌、肠产毒性大肠杆菌、肠致病性大肠杆菌、肠侵袭性大肠杆菌、肠黏附性大肠杆菌、肠出血性大肠杆菌中 ,只有大肠杆菌O15 7∶H7具有ter(telluriteresistance ,ter)基因簇。所检测的 34株产志贺毒素的大肠杆菌O15 7∶H7有 33株具有ter基因簇 ,所检测的 18株不产生志贺毒素的大肠杆菌O15 7,4株具有ter基因簇 ,但是没有该毒力岛的其它基因。ter基因阳性的 33株菌中 ,亚碲酸钾的抗性水平一般较高 ,4株在 75 0 μg ml以上 ,19株为5 0 0～ 75 0 μg ml,10株为 2 5 0～ 5 0 0 μg ml;而 4株ter基因簇阴性的菌株 ,也表现了高水平的耐药性 ,其抗性水平均为 5 0 0～ 75 0 μg ml。其它ter基因簇阴性的菌株 ,2 0株耐药性为 5～ 10 μg ml,1株 10～ 2 0 μg ml,6株 2 0～ 5 0 μg ml,2株 5 0～ 10 0 μg ml,1株 10 0～ 2 5 0 μg ml。结论　ter基因簇在产志贺毒素的大肠杆菌O15 7∶H7中高频率存在 ,而在其它病原菌中没有检测到。高水平的亚碲酸钾抗性可以作为选择性分离产志贺? 展开更多
关键词 产志贺毒素大肠杆菌 O157:H7 亚碲酸钾抗性 基因簇 分布 抗性水平
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志贺菌福氏2a301菌株torA基因改变的研究
2
作者 张晶波 叶长芸 +3 位作者 李新军 白雪梅 吴龙飞 徐建国 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期173-175,共3页
目的　探讨志贺菌福氏 2a30 1菌株torA基因的改变以及与TorA(trimethylamineN oxideTMAOreductase ,三甲胺N 氧化物还原酶 )转运相关的TAT分泌系统的存在。方法　利用酶活性检测和Westernblot方法来验证志贺菌福氏 2a30 1测序菌株torA... 目的　探讨志贺菌福氏 2a30 1菌株torA基因的改变以及与TorA(trimethylamineN oxideTMAOreductase ,三甲胺N 氧化物还原酶 )转运相关的TAT分泌系统的存在。方法　利用酶活性检测和Westernblot方法来验证志贺菌福氏 2a30 1测序菌株torA基因发生的碱基置换 ,并且利用正常大肠杆菌中torA基因的克隆转化来研究TAT分泌系统的存在。结果　实验表明志贺菌福氏2a30 1菌株不具有TorA酶活性 ,不表达TorA蛋白 ,和序列分析的结果相符 ;但是 ,将torA基因克隆子转化入 30 1菌株后 ,转化子获得了TorA酶活性 ,表达了TorA蛋白。结论　在志贺菌福氏 2a30 1菌株中torA基因发生了改变 ,但具有完整的TAT分泌途径 ,可以转运蛋白。 展开更多
关键词 志贺菌 菌株 福氏 基因改变 Western rA基因 分泌系统 N-氧化物 酶活性检测 TAT blot 分泌途径 基因克隆 序列分析 大肠杆菌 克隆转化 转运蛋白 A蛋白 to 转化子 三甲胺 还原酶
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基因芯片在传染病分子流行病学中的应用 被引量：1
3
作者 曾浔 张建中 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期399-401,共3页
关键词 基因芯片 传染病 分子流行病学 诊断 病因学 病原微生物
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成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因序列分析 被引量：1
4
作者 蒋盛军 纪绍忠 +5 位作者 唐青 杨红彦 崔晓英 毕烨 阚飙 高守一 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期739-742,共4页
目的进一步了解新的成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因特征。方法利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的VP1基因,克隆至pMD18-T中并进行测序。利用DNAStar和PHYLIP软件包进行序列之... 目的进一步了解新的成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因特征。方法利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的VP1基因,克隆至pMD18-T中并进行测序。利用DNAStar和PHYLIP软件包进行序列之间的比较分析并绘制系统发生树。结果J19株的VP1基因为基因1,全长3538个核苷酸,编码1167个氨基酸。氨基酸序列同源性分析表明J19株的VP1蛋白序列对B组轮状病毒IDIR株的一致性为55．7％,对A组轮状病毒SA11株和C组轮状病毒Bristol株的一致性分别为20．4％、19．2％。对J19株的VP1蛋白序列的遗传进化分析表明,J19株在系统发生树上的位置是靠近外群蛋白并靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支。结论J19株的VP1蛋白序列与其他轮状病毒的VP1蛋白序列存在显著差异。J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一。 展开更多
关键词 新成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 序列分析
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新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因克隆和序列分析
5
作者 蒋盛军 纪绍忠 +5 位作者 唐青 杨红彦 崔晓英 毕烨 阚飙 高守一 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期339-342,共4页
目的克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因,并分析其基因序列。方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株NSP4和NSP5基因,克隆到 pMD18-T载体中并进行测序。在此基础上,将J19株NSP4和NSP5的蛋白序列与其他轮... 目的克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因,并分析其基因序列。方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株NSP4和NSP5基因,克隆到 pMD18-T载体中并进行测序。在此基础上,将J19株NSP4和NSP5的蛋白序列与其他轮状病毒蛋白序列进行比较分析和种系进化分析。结果J19株NSP4和NSP5基因为基因10和11,全长为739 bp 和649 bp,它们分别编码213个和176个氨基酸。与J19株NSP4和NSP5蛋白序列一致性较高的分别是B组成人腹泻轮状病毒Bang373株(20．3％)和B组猪轮状病毒db101株(29．5％)。对J19株的 NSP4和NSP5的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置都靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向B组轮状病毒的分支。结论J19株的NSP4和NSP5与其他轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异。J19株NSP4和NSP5的蛋白序列比较和遗传进化分析表明新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒可能有共同起源;但是新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒存在显著差异。 展开更多
关键词 新的成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 序列分析
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新成人腹泻轮状病毒J19株NSP1、NSP2和NSP3基因序列分析
6
作者 蒋盛军 纪绍忠 +5 位作者 唐青 杨红彦 崔晓英 毕烨 阚飙 高守一 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期337-339,共3页
目的克隆新成人腹泻轮状病毒J19株三个非结构蛋白NSP1、NSP2和NSP3基因,并分析其基因序列。方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株三个基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序。在此基础上,将J19株的NSP1、NSP2和NSP... 目的克隆新成人腹泻轮状病毒J19株三个非结构蛋白NSP1、NSP2和NSP3基因,并分析其基因序列。方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株三个基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序。在此基础上,将J19株的NSP1、NSP2和NSP3的蛋白序列与其他轮状病毒蛋白序列进行比较分析和种系进化分析。结果J19株的NSP1、NSP2和NSP3基因为基因5、7和8,它们的全长1307个、1004个和932个核苷酸,编码395个、297个和262个氨基酸。与J19株的NSP1、NSP2和NSP3蛋白序列一致性较高的分别是B组轮状病毒KB63株(26.3%)、WH1株(46.6%)和IDIR株(29.6%)。对J19株的NSP1、NSP2和NSP3的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置都靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支。结论J19株的NSP1、NSP2和NSP3与其他轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异。J19株NSP1、NSP2、NSP3的蛋白序列比较和遗传进化分析表明新成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒可能有共同起源;但是新成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒存在显著差异。 展开更多
关键词 轮状病毒 基因 克隆 分子 序列分析
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一种改良方法克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株的大片段基因
7
作者 蒋盛军 纪绍忠 +5 位作者 唐青 杨红彦 崔晓英 毕烨 阚飙 高守一 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期781-785,共5页
目的扩增、克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株的大片段基因。方法以新成人腹泻轮状病毒J19株的病毒核酸为材料,利用非依赖核酸序列的单引物扩增方法,扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的第5-11基因;根据第5-11基因序列设计7对抑制性引物,通过... 目的扩增、克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株的大片段基因。方法以新成人腹泻轮状病毒J19株的病毒核酸为材料,利用非依赖核酸序列的单引物扩增方法,扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的第5-11基因;根据第5-11基因序列设计7对抑制性引物,通过在PCR扩增体系中添加小片段基因的抑制性引物来提高大片段基因的PCR产量。结果当在PCR反应体系中添加2对抑制性引物时,大于2kd的大片段基因的PCR产量得到显著提高。将扩增的基因片段克隆至pMD18- T后进行测序,最后得到J19株第2、3、4基因的全长eDNA克隆。结论这种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法可以用于对轮状病毒大片段基因的扩增和克隆。 展开更多
关键词 新的成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 抑制性引物
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志贺菌属编码赖氨酸的基因簇缺失情况分析 被引量：2
8
作者 张晶波 李新军 +1 位作者 王敏 徐建国 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期837-839,共3页
目的　探讨编码赖氨酸利用的cadABC基因簇的缺失在志贺菌中的普遍性。方法　根据大肠杆菌K 12MG16 5 5菌株的cadABC基因簇序列设计引物 ,使用PCR和核酸杂交试验检测。结果在志贺菌的 4个群 4 2个血清型 4 3株菌中 ,均发生了cadABC基因... 目的　探讨编码赖氨酸利用的cadABC基因簇的缺失在志贺菌中的普遍性。方法　根据大肠杆菌K 12MG16 5 5菌株的cadABC基因簇序列设计引物 ,使用PCR和核酸杂交试验检测。结果在志贺菌的 4个群 4 2个血清型 4 3株菌中 ,均发生了cadABC基因簇的缺失。其中 2 9(6 7.4 % )株菌发生了cadABC基因簇的全部缺失 ,主要表现在A群和C群。A群的 12个血清型中有 10个发生了完全缺失 ,C群的 18个血清型中有 16个发生了完全缺失。其余 13个血清型中的 14株菌发生了部分缺失或重组。不完全缺失主要发生在B群 ,B群的 11个血清型中的 8个表现为部分缺失。D群的 2个菌株和肠侵袭性大肠杆菌的 2个菌株全部表现出部分缺失 ,但缺失的程度不同。结论　在志贺菌属的 4个群 4 2个血清型中 ,全部发生了cadABC基因簇的缺失 ,表现为完全缺失和部分缺失。结果提示 ,志贺菌的进化可能和cadABC基因簇的缺失有关。 展开更多
关键词 志贺菌属 编码 赖氨酸 基因簇缺失
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