在动物全基因组关联分析(Genome-Wide Association Studies,GWAS)中,线性混合模型通过校正群体分层、个体间亲缘关系和微效多基因对标记关联检验的影响有效地控制了数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)检测的假阳性率。文章...在动物全基因组关联分析(Genome-Wide Association Studies,GWAS)中,线性混合模型通过校正群体分层、个体间亲缘关系和微效多基因对标记关联检验的影响有效地控制了数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)检测的假阳性率。文章综述了混合模型之于GWAS基因定位的求解策略和方法,包括逐个标记的GWAS方法和联合多标记的GWAS方法。评论了这些方法在计算效率、QTL检测效率和模型拟合度方面的优缺点。指出了完善的全基因组关联分析方法不仅能够高效率地检测QTL,还能够最优地拟合性状表型值和预测基因组育种值。展开更多
文摘在动物全基因组关联分析(Genome-Wide Association Studies,GWAS)中,线性混合模型通过校正群体分层、个体间亲缘关系和微效多基因对标记关联检验的影响有效地控制了数量性状基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)检测的假阳性率。文章综述了混合模型之于GWAS基因定位的求解策略和方法,包括逐个标记的GWAS方法和联合多标记的GWAS方法。评论了这些方法在计算效率、QTL检测效率和模型拟合度方面的优缺点。指出了完善的全基因组关联分析方法不仅能够高效率地检测QTL,还能够最优地拟合性状表型值和预测基因组育种值。
