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酿酒酵母26S rDNA D1/D2区域序列分析及其系统发育研究
被引量:
24
1
作者
李金霞
刘光全
程池
《酿酒》
CAS
2007年第1期37-39,共3页
利用26SrDNAD1/D2区序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)保藏的22株酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)和1株威尔酵母(S.willianus)进行了复核鉴定,通过序列比对及构建系统发育树分析后,结果显示:21株菌株与原名称一致,...
利用26SrDNAD1/D2区序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)保藏的22株酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)和1株威尔酵母(S.willianus)进行了复核鉴定,通过序列比对及构建系统发育树分析后,结果显示:21株菌株与原名称一致,与酿酒酵母CBS1171T序列相似性在99.0%以上;CICC1313原定名为威尔酵母,此次鉴定结果为酿酒酵母,与酿酒酵母CBS1171T序列相似性为99.8%;CICC1859与异常毕赤酵母(Pichiaanomala)CBS5759T相似性为100%,鉴定为异常毕赤酵母。进一步对酿酒酵母与酵母属内其他种之间的发育关系进行了分析,通过构建酵母属内各菌种模式株的26SrDNAD1/D2区系统发育树,发现酿酒酵母与属内其他菌种间差异均大于1%,表明26SrDNAD1/D2区域序列分析方法能够应用于酿酒酵母的分子生物学鉴定。
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关键词
酿酒酵母
26SrDNAD1/D2区
序列分析
系统发育树
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职称材料
55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
被引量:
9
2
作者
程池
刘光全
+1 位作者
李金霞
姚粟
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期20-24,共5页
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S r...
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S rRNA基因序列扩增,PCR产物纯化后直接进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA3.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果表明:55株枯草芽孢杆菌中有52株菌种与原鉴定结果一致,有3株菌种与原鉴定结果存在差异,其中2株鉴定结果为巨大芽孢杆菌(B.megaterium),另1株鉴定结果为地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)。
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关键词
枯草芽孢杆菌
16S
RRNA基因
TD-PCR
序列分析
系统发育树
下载PDF
职称材料
题名
酿酒酵母26S rDNA D1/D2区域序列分析及其系统发育研究
被引量:
24
1
作者
李金霞
刘光全
程池
机构
中国
工业
微生物
菌种
保藏
管理
中心
中国
食品
发酵
工业
研究院
出处
《酿酒》
CAS
2007年第1期37-39,共3页
基金
国家科技基础平台建设项目(2005DKA21204)
文摘
利用26SrDNAD1/D2区序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)保藏的22株酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)和1株威尔酵母(S.willianus)进行了复核鉴定,通过序列比对及构建系统发育树分析后,结果显示:21株菌株与原名称一致,与酿酒酵母CBS1171T序列相似性在99.0%以上;CICC1313原定名为威尔酵母,此次鉴定结果为酿酒酵母,与酿酒酵母CBS1171T序列相似性为99.8%;CICC1859与异常毕赤酵母(Pichiaanomala)CBS5759T相似性为100%,鉴定为异常毕赤酵母。进一步对酿酒酵母与酵母属内其他种之间的发育关系进行了分析,通过构建酵母属内各菌种模式株的26SrDNAD1/D2区系统发育树,发现酿酒酵母与属内其他菌种间差异均大于1%,表明26SrDNAD1/D2区域序列分析方法能够应用于酿酒酵母的分子生物学鉴定。
关键词
酿酒酵母
26SrDNAD1/D2区
序列分析
系统发育树
Keywords
Saccharomyces cercvisiae
26S rDNA D 1/D2 domain gene
sequence analysis
phylogenetic tree
分类号
TS261.11 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
被引量:
9
2
作者
程池
刘光全
李金霞
姚粟
机构
中国
工业
微生物
菌种
保藏
管理
中心
中国
食品
发酵
工业
研究院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期20-24,共5页
基金
国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21204)
文摘
采用16S rRNA基因序列分析法对中国工业微生物菌种保藏管理中心(CCIC)保藏的55株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)进行复核鉴定。菌株经纯化培养,以改良CTAB法提取总DNA,采用细菌16S rRNA通用引物、TD-PCR方法(touchdown-PCR)进行16S rRNA基因序列扩增,PCR产物纯化后直接进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA3.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果表明:55株枯草芽孢杆菌中有52株菌种与原鉴定结果一致,有3株菌种与原鉴定结果存在差异,其中2株鉴定结果为巨大芽孢杆菌(B.megaterium),另1株鉴定结果为地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)。
关键词
枯草芽孢杆菌
16S
RRNA基因
TD-PCR
序列分析
系统发育树
Keywords
Bacillus subtilis, 16S rRNA gene, TD-PCR, Gene sequence analysis, Phylegenetic tree
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
酿酒酵母26S rDNA D1/D2区域序列分析及其系统发育研究
李金霞
刘光全
程池
《酿酒》
CAS
2007
24
下载PDF
职称材料
2
55株芽孢杆菌16S rRNA基因序列测定与系统发育学分析
程池
刘光全
李金霞
姚粟
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2006
9
下载PDF
职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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