目的:探讨磷酸果糖激酶1(phosphofructokinase 1,PFK1)不同亚型对肺癌预后的预测价值及其可能参与的生物学过程。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载表达PFK1不同亚型(PFKP、PFKL和PFKM)表达谱资料及临...目的:探讨磷酸果糖激酶1(phosphofructokinase 1,PFK1)不同亚型对肺癌预后的预测价值及其可能参与的生物学过程。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载表达PFK1不同亚型(PFKP、PFKL和PFKM)表达谱资料及临床信息资料。分别分析这三个基因的表达与肺癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)方法预测关键基因的相关通路。结果:PFKP亚型与肺癌患者预后存在显著相关性(P<0.05),且高表达患者预后更差。PFKP表达水平与肿瘤浸润深度(T分期)、淋巴结转移数量(N分期)和性别相关。PFKP高表达样本富集了糖酵解、细胞周期、细胞黏附连接等基因集。结论:肺癌中PFKP高表达是预后不良因素,其表达水平可作为预测肺癌患者预后的潜在生物标志物。展开更多
文摘目的:探索血管生成素1(angiopoietin 1,ANGPT1)在肺腺癌组织中的表达及预后意义。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集肺腺癌和肺鳞癌数据,并下载ANGPT1基因表达谱资料及临床信息资料。采用t检验明确ANGPT1在肺癌组织和正常组织中的表达差异,χ2检验分析ANGPT1基因表达与肺腺癌患者临床病理特征的相关性,Log-rank检验进行生存分析;利用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)方法,预测肺腺癌中可能受ANGPT1调控的相关通路。结果:ANGPT1基因在肺癌组织中低表达;其表达水平与T分期(P=0.013)呈负相关;ANGPT1低表达的肺腺癌患者预后明显差于高表达患者(P=0.006),是影响肺腺癌预后的独立保护因素(P<0.05)。GSEA结果显示,ANGPT1可能通过调节G2M检查点、DNA损伤修复、凋亡、mTOR信号、MYC信号、有丝分裂纺锤体等细胞增殖相关通路影响肺腺癌的发生发展。结论:ANGPT1是肺腺癌的独立预后保护因素,可能成为肺腺癌的潜在预后标志物和治疗靶点。
文摘目的:探讨磷酸果糖激酶1(phosphofructokinase 1,PFK1)不同亚型对肺癌预后的预测价值及其可能参与的生物学过程。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载表达PFK1不同亚型(PFKP、PFKL和PFKM)表达谱资料及临床信息资料。分别分析这三个基因的表达与肺癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)方法预测关键基因的相关通路。结果:PFKP亚型与肺癌患者预后存在显著相关性(P<0.05),且高表达患者预后更差。PFKP表达水平与肿瘤浸润深度(T分期)、淋巴结转移数量(N分期)和性别相关。PFKP高表达样本富集了糖酵解、细胞周期、细胞黏附连接等基因集。结论:肺癌中PFKP高表达是预后不良因素,其表达水平可作为预测肺癌患者预后的潜在生物标志物。
