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中国不同省区β地中海贫血基因变异的分布特征 被引量:32
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作者 石西南 褚嘉祐 杨昭庆 《医学综述》 2011年第4期495-497,共3页
β地中海贫血是一种具有高发病率的常染色体遗传病,临床上表现为溶血性贫血,也是我国常见的遗传性疾病之一。已证实β地中海贫血的相关基因有200多个变异位点,我国现已报道了34种突变。β地中海贫血的基因突变分布具有明显的种族特征和... β地中海贫血是一种具有高发病率的常染色体遗传病,临床上表现为溶血性贫血,也是我国常见的遗传性疾病之一。已证实β地中海贫血的相关基因有200多个变异位点,我国现已报道了34种突变。β地中海贫血的基因突变分布具有明显的种族特征和地域差异。广东、广西、海南、福建、台湾五个地区基因变异存在一定的相似性;云南和贵州两个地区基因变异存在一定的相似性;云南、贵州两地区和广东、广西、海南、福建、台湾五个地区之间基因变异相差较大。现就我国不同地区和群体主要基因突变类型予以综述。 展开更多
关键词 Β地中海贫血 β珠蛋白基因 基因变异
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不同海拔高度低氧环境差异对EPAS1基因多态性的影响 被引量:10
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作者 柯金坤 姚宇峰 +8 位作者 刘舒媛 史磊 于亮 林克勤 陶玉芬 史荔 易文 黄小琴 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期583-588,共6页
目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对内皮PAS蛋白1基因(endothelial PAS domain protein1,EPAS1)的选择作用。方法选取西藏藏族58名(居住海拔约3700米)、青海藏族47名(居住海拔约3100米)、云南藏族43名(居住海拔约2500米)、... 目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对内皮PAS蛋白1基因(endothelial PAS domain protein1,EPAS1)的选择作用。方法选取西藏藏族58名(居住海拔约3700米)、青海藏族47名(居住海拔约3100米)、云南藏族43名(居住海拔约2500米)、山东汉族47名(居住海拔约50米)的4个不同海拔高度的群体,应用限制性片段长度多态性一聚合酶链反应技术检测EPAS1基因的14个单核苷酸多态性位点。结果在4个群体中,山东汉族、云南藏族与西藏藏族、青海藏族在大部分位点的等位基因频率、基因型频率以及单倍型频率的差异具有统计学意义;但在山东汉族与云南藏族之间的差异无统计学意义。结论海拔高度不同引起的低氧环境差异有可能对基因EPASj有选择作用。 展开更多
关键词 内皮PAS蛋白1 单核苷酸多态性 低氧环境 海拔 限制性片段长度多态性
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云南4种罕见异常血红蛋白突变型分析 被引量:6
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作者 何建萍 郭薇霞 +5 位作者 唐健 罗胜军 吕梦欣 党峰博 林克勤 杨昭庆 《国际检验医学杂志》 CAS 2019年第8期932-934,938,共4页
目的明确7例血红蛋白电泳检出的异常条带产生的基因分子基础,探讨基因型与血液学表型的关系。方法用血常规指标和血红蛋白电泳进行表型分析,采用PCR-反向点杂交法检测α地贫和β地贫,应用PCR产物测序技术对α、β基因全长进行测序,检测... 目的明确7例血红蛋白电泳检出的异常条带产生的基因分子基础,探讨基因型与血液学表型的关系。方法用血常规指标和血红蛋白电泳进行表型分析,采用PCR-反向点杂交法检测α地贫和β地贫,应用PCR产物测序技术对α、β基因全长进行测序,检测基因突变类型。结果 7例样本中检出4种异常血红蛋白突变型:1例中国首次发现的Hb San Bruno(HBB:c.120G>C)、2例Hb New York(HBB:c.341T>A)、2例Hb J-Bangkok(HBB:c.170G>A)、2例Hb G-Coushatta(HBB:c.68A>C),血常规参数均无明显异常。结论云南存在多种异常血红蛋白突变型,多数单纯异常血红蛋白罕见突变都不产生临床表型,但是云南作为地中海贫血的高发地区,异常血红蛋白病合并地中海贫血的临床意义和危害性有待于进一步研究。 展开更多
关键词 异常血红蛋白 血红蛋白电泳 基因型 血液学表型
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三种培养原代滑膜成纤维细胞方法的比较 被引量:5
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作者 马莎 林俊 +4 位作者 于亮 晋松 李芹 张虹 范宏涛 《昆明医科大学学报》 CAS 2016年第6期52-56,共5页
目的比较3种体外分离培养原代类风湿关节炎滑膜成纤维样细胞(RASFs)的方法,寻求获得快速有效的培养途径.方法将来自关节镜RA滑膜切除术的滑膜组织分别采用胶原酶消化法、改良组织块法、双酶消化法进行培养.采用倒置相差显微镜观察... 目的比较3种体外分离培养原代类风湿关节炎滑膜成纤维样细胞(RASFs)的方法,寻求获得快速有效的培养途径.方法将来自关节镜RA滑膜切除术的滑膜组织分别采用胶原酶消化法、改良组织块法、双酶消化法进行培养.采用倒置相差显微镜观察细胞形态及生长特性,以Vimentin组织化学法进行鉴定.台盼兰计数培养14d后所得活细胞数目.结果3种原代分离培养方法均可成功培养出RASFs,符合RASFs的形态特征,Vimentin阳性细胞>95%,其中:胶原酶消化培养法分离的RASFs16-20d细胞汇合度可达70%,约4周汇合度95%;改良组织块法分离的RASFs10~14d细胞汇合度可达70%以上;双酶消化法分离的RASFs约4周细胞汇合度达85%.处理相同数量滑膜组织获得活细胞数目比较,改良组织块法组为(1.60±0.08)×106个,胶原酶消化法组(1.41±0.08)×106个,双酶消化法组(1.19±0.05)×106个,差异有统计学意义(<0.05).培育原代RASFs细胞所需时间比较,胶原酶消化法需(267.50±16.58)min,双酶消化法需(183.75±11.08)min,改良组织块法需(149.10±13.71)min,差异有统计学意义(<0.05).结论改良组织块培养法能最大限度地利用滑膜组织,获得最多数量原代RASFs细胞,是建立体外RA细胞模型最高效、快捷的方法. 展开更多
关键词 类风湿关节炎 滑膜成纤维细胞 原代培养 方法 比较
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1201例静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的基因型及血液学表型分析 被引量:5
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作者 张志丹 褚焱 +5 位作者 易薇 杨必清 番云华 黄铠 黄小琴 杨昭庆 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第7期774-777,共4页
目的分析1201例静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的基因型及血液学表型特征。方法采用PCR-流式荧光杂交法确定云南省德宏地区静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血携带者的基因型,采用血常规检测获取血液学表型,统计分析各血液学指标。结果1201... 目的分析1201例静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的基因型及血液学表型特征。方法采用PCR-流式荧光杂交法确定云南省德宏地区静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血携带者的基因型,采用血常规检测获取血液学表型,统计分析各血液学指标。结果1201例静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血携带者中检出-α^(3.7)/αα、-α^(4.2)/αα、αα^(CS)/αα及αα^(WS)/αα这4种基因型,其中以缺失型-α^(3.7)/αα(83.51%)和突变型αα^(CS)/αα(11.16%)最为常见。血红蛋白(Hb)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)对静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的诊断价值,灵敏度和准确度较低。在育龄人群中,非缺失型(αα^(CS)/αα、αα^(WS)/αα)的Hb水平低于缺失型(-α^(3.7)/αα、-α^(4.2)/αα),女性携带者Hb水平低于男性,贫血比例高于男性,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论云南省德宏地区静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的基因型和血液学表型存在明显的异质性,血常规指标Hb、MCV、MCH对筛查静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血的漏检率较高,建议有条件的地方加用基因检测指标。 展开更多
关键词 珠蛋白生成障碍性贫血 静止型α-珠蛋白生成障碍性贫血 基因型 表型
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三个不同海拔藏族群体HIF1A基因九个单核苷酸多态性位点研究 被引量:5
6
作者 柯金坤 姚宇峰 +8 位作者 史磊 于亮 林克勤 陶玉芬 史荔 易文 黄小琴 孙浩 褚嘉祏 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期584-589,共6页
目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对基因缺氧诱导因子1a基因(hypoxia inducible factor 1 alpha,HIF1A)的选择作用。方法选取世居于西藏、青海、云南的3个不同海拔高度的藏族群体,利用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术检... 目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对基因缺氧诱导因子1a基因(hypoxia inducible factor 1 alpha,HIF1A)的选择作用。方法选取世居于西藏、青海、云南的3个不同海拔高度的藏族群体,利用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术检测HIF1A基因的9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点。结果所有非同义突变SNP位点的基因型频率与等位基因型频率在3个藏族群体之间差异无统计学意义,而rs11549465位点的基因型频率在云南藏族分别与西藏藏族和青海藏族之间差异有统计学意义(P〈0.05)。4个内含子SNP位点基因型频率与等位基因频率在西藏藏族与青海藏族之间差异均无统计学意义;但在西藏藏族和青海藏族分别与云南藏族比较时,基因型频率与等位基因频率差异均有统计学意义(P〈0.05),且跟海拔差异有相关性。结论海拔高度不同引起的低氧环境差异有可能对HIF1A基因有选择作用。 展开更多
关键词 藏族群体 缺氧诱导因子1Α 单核苷酸多态性 低氧环境 海拔 限制性片段长 度多态性
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云南汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者临床表型及基因型分析 被引量:2
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作者 蒋璐西 葛世军 +5 位作者 番云华 杨必清 易薇 黄铠 褚嘉祐 杨昭庆 《临床检验杂志》 CAS 2020年第9期665-669,共5页
目的探讨云南德宏地区汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者的临床表型和分子遗传学特征。方法收集云南德宏地区3个家系中7例汉族Hb G-Taipei突变携带者的外周血样本,血液学常规检测血细胞参数,血红蛋白电泳分析不同类型的血红蛋白,常见α/... 目的探讨云南德宏地区汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者的临床表型和分子遗传学特征。方法收集云南德宏地区3个家系中7例汉族Hb G-Taipei突变携带者的外周血样本,血液学常规检测血细胞参数,血红蛋白电泳分析不同类型的血红蛋白,常见α/β地贫突变检测及基因DNA测序检测β珠蛋白基因(HBB)及珠蛋白突变,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术分析HBB基因簇单倍型特征及β链基因突变的源流。结果3个家系共检测出7例异常血红蛋白Hb G-Taipei(HBB:c.68 A>G,Glu>Gly)患者,均有Hb D异常血红蛋白电泳条带,其中1例先证者为突变纯合子,其Hb D带比例(96.3%)较杂合子患者(37.0%~40.2%)明显升高。在1个家系中检测出Hb G-Taipei/-α3.7复合突变类型。Hb G-Taipei杂合子临床表现大多为无症状,有1例合并缺铁者表现为轻度小细胞低色素贫血;1例纯合子未表现出贫血表型。-α3.7突变与Hb G-Taipei的复合突变表现为无明显贫血症状。无亲缘关系的患者之间存在相同HBB基因簇单倍型[------+]。结论Hb G-Taipei突变产生异常Hb D血红蛋白电泳条带,患者临床表现为从无症状到轻度贫血。Hb G-Taipei杂合子或纯合子与静止型α地贫共遗传时均不呈现明显贫血表型。云南德宏地区汉族人群中的Hb G-Taipei突变可能具有共同的来源。 展开更多
关键词 Hb G-Taipei 基因型 表型 基因突变 β珠蛋白基因簇单倍型
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1例α_2珠蛋白新突变型分析
8
作者 郭薇霞 唐健 +5 位作者 何建萍 罗胜军 黄铠 林克勤 褚嘉祐 杨昭庆 《国际检验医学杂志》 CAS 2019年第9期1148-1150,共3页
异常血红蛋白是由于珠蛋白基因突变导致珠蛋白分子结构和功能异常的一类血红蛋白,当产生临床表现时称为异常血红蛋白病[1]。异常血红蛋白的种类和分布频率存在地域和人种差异[2],根据人类血红蛋白变异体数据库HbVar(http://globin.bx.ps... 异常血红蛋白是由于珠蛋白基因突变导致珠蛋白分子结构和功能异常的一类血红蛋白,当产生临床表现时称为异常血红蛋白病[1]。异常血红蛋白的种类和分布频率存在地域和人种差异[2],根据人类血红蛋白变异体数据库HbVar(http://globin.bx.psu.edu/hbvar/menu.html)结果显示,目前全世界报道的发生在α珠蛋白肽链上的异常血红蛋白超过490种,我国报道的有38种。大多数异常血红蛋白是由于珠蛋白链上单个碱基替换引起的,不产生临床症状,因此需要借助血红蛋白电泳和基因检测才能确诊[3]。本研究通过对血红蛋白电泳结果异常的1例样本进行了基因诊断,检出了1例α珠蛋白基因新突变型,现报道如下。 展开更多
关键词 异常血红蛋白 α2珠蛋白基因 新突变 血红蛋白电泳
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基诺族、毛南族和佤族人类白细胞抗原C等位基因及Ⅰ类区域内C-B和A-C-B单倍型的分布特征
9
作者 史磊 陶玉芬 +7 位作者 史荔 姚宇峰 于亮 林克勤 黄小琴 易文 孙浩 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期341-346,共6页
目的研究中国西南地区基诺族、佤族和毛南族中人类自细胞抗原(human leukocyte antigen.HLA)C等位基因及HLAI类区域内C—B和A—C—B单倍型分布特点。方法采用聚合酶链反应一序列特异性寡核苷酸分型技术(polymerase chain reaction s... 目的研究中国西南地区基诺族、佤族和毛南族中人类自细胞抗原(human leukocyte antigen.HLA)C等位基因及HLAI类区域内C—B和A—C—B单倍型分布特点。方法采用聚合酶链反应一序列特异性寡核苷酸分型技术(polymerase chain reaction sequence specific oligonucleotide, PCR SSO)对中国西南地区基诺族99名、佤族U5名和毛南族85名进行HLAC高分辨率基因分型,结合前期发表的HLA—A、B分型结果,构建HLAI类区域内HLAA,-B和-C位点的单倍型。结果3个群体中共检出HLA—C等位基因18种,其中基诺族中17种、毛南族中13种和佤族中15种。基因频率〉10%的等位基因在这3个群体中的分布为:基诺族中从高到低依次为C*08:01、C*01:02、C:*03:04和C*07:02;毛南族中依次为C*03:04、C*01:02、C*07:02和C*08:01;佤族依次为C*12:03、C*08:01、C*07:02和c*04:01。基诺族中优势AC—B单倍型包括A*02:07-C*01:02-B*46:01、A*11:01-C*08:01-B*15:02和A*11:01-C*03:04-B*13:01;毛南族中包括A*11:01-C*03:04B*13:01、A*02:07-C*01:02-B*46:01、A*11:01-C*08:01-B*15:02和A*02:03-C*07:02-B*38:02;佤族中包括A*11:01C*08:01B*15:02、A*11:01—C*12:03-B*15:32和A*11:01-C*04:01—B*35:01。结论基诺族、佤族、毛南族中HI。A—C等位基因与HLA—A、B位点构建的单倍型具有各自的分布特点,但单倍型C*08:01B*15:02和A*11:01-C*08:01-B*15:02在3个群体中共有并呈高频分布。推测这两种单倍型可能是中国南方群体的祖先单倍型。另外,在基诺族、佤族和毛南族中各自具有其独特的优势单倍型。因此,HLA基因型和单倍型分布特点对这些群体的起源、迁徙、进化和疾病关联研究具有参考价值。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原C 单倍型 基诺族 毛南族 佤族
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一个LAMA2基因复合杂合突变导致的肢带型肌营养不良症隐性23型家系的临床特征及遗传学分析
10
作者 李文武 张志丹 +6 位作者 王晓辉 边成 孙浩 褚嘉祐 李志宏 赵正科 杨昭庆 《中国优生与遗传杂志》 2021年第12期1762-1766,共5页
目的探讨1例表现为肢带型肌营养不良症(LGMD)患者的临床特征及遗传学特点。方法获取先证者的临床检查资料,采用全外显子组测序技术(WES)筛选患者的候选可疑致病突变,利用Mutation taster、SIFT、Polyphen2等有害性分析软件对候选突变位... 目的探讨1例表现为肢带型肌营养不良症(LGMD)患者的临床特征及遗传学特点。方法获取先证者的临床检查资料,采用全外显子组测序技术(WES)筛选患者的候选可疑致病突变,利用Mutation taster、SIFT、Polyphen2等有害性分析软件对候选突变位点进行功能预测。通过Sanger测序法对候选致病突变位点进行验证,并对该患者的临床特点进行分析。结果先证者临床表现为四肢远端肌肉萎缩及肌无力,血清肌酸激酶(CK)升高,肌电图提示肌源性损害。该家系中2例患者的LAMA2基因存在复合杂合突变,其中c.20_21insCCTC(p.Leu9Profs*42)杂合移码突变遗传自父亲,该突变为首次报道;c.C4591A(p.Pro1531Thr)杂合错义突变来自母亲,突变有害性分析表明两个突变位点均为有害突变。结论结合临床表现与基因检测结果,患者诊断为肢带型肌营养不良症隐性23型(LGMDR23)。LAMA2基因c.20_21insCCTC和c.C4591A复合杂合突变是患者的致病突变。本研究的病例为国内首次报道,进一步丰富了LAMA2基因的致病突变谱,为该病的临床诊断和基因检测提供更多参考依据。 展开更多
关键词 肢带型肌营养不良 LAMA2基因 全外显子组测序
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云南地区汉族人群PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎的关联研究 被引量:9
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作者 于亮 李芹 +6 位作者 林俊 俞娟 李倩 易薇 孙浩 褚嘉祐 杨昭庆 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期222-226,共5页
目的研究云南汉族人群中PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的相关性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法对177例RA患者及288名健康对照PSMB8基因的rs2071543、rs55745125、rs13863540... 目的研究云南汉族人群中PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的相关性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法对177例RA患者及288名健康对照PSMB8基因的rs2071543、rs55745125、rs138635403位点和PSMB9基因的rs17587多态性位点进行基因分型,应用多聚酶链反应扩增阻碍系统法对TAP2基因的rs2228396多态性位点进行基因分型。计算基因型及等位基因频率。采用EpiInfo7软件计算上述多态位点在RA组及正常对照组之间的比值比(OR值)。结果rs138635403及rs17587位点的等位基因及基因型频率在RA组和对照组间差异有统计学意义(P〈0.05),其中RA组rs17587的GG基因型频率(0.672)高于对照组(0.524)(OR=1.862,95%CI:1.261~2.749)。结论云南汉族人群PSMB9基因的rs17587位点多态性与RA存在关联。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 遗传多态性 PSMB基因 TAP基因
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miRNA标志物在诊断云南省宣威地区早期非吸烟女性肺癌中的价值 被引量:9
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作者 李光剑 黄云超 +5 位作者 何越峰 陈金宝 杨凯云 赵光强 雷玉洁 陈颖 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期802-806,共5页
目的初步探索与肿瘤发生相关的miRNA是否可以作为早期诊断云南省宣威地区非吸烟女性肺癌的小分子标志物。方法 (1)应用miRNA微阵列芯片分析技术,检测37例宣威地区非吸烟女性肺癌患者和32例非宣威地区非吸烟女性肺癌患者癌组织中的miRNA... 目的初步探索与肿瘤发生相关的miRNA是否可以作为早期诊断云南省宣威地区非吸烟女性肺癌的小分子标志物。方法 (1)应用miRNA微阵列芯片分析技术,检测37例宣威地区非吸烟女性肺癌患者和32例非宣威地区非吸烟女性肺癌患者癌组织中的miRNA表达谱,应用实时荧光定量PCR(Q-PCR)对生物芯片分析结果进行验证。(2)实时荧光定量PCR检测16例宣威地区Ⅰ期非吸烟女性肺癌患者和宣威肺癌高发区14例良性病变女性血清中miRNA表达水平。用受试者特征曲线(ROC)来评价血清中miRNA作为诊断宣威地区早期非吸烟女性肺癌患者的敏感度和特异性。结果发现与相邻对应非癌肺组织相比癌组织中有31个miRNA表达存在差异,癌组织中表达差异最显著的miRNA通过实时荧光定量PCR证实。其中miR-21、miR-10a、miR-494、miR-22、miR-141及miR-200b在两组癌组织中的表达水平差异有统计学意义(P<0.05),且均在16例宣威地区Ⅰ期非吸烟女性肺癌患者和14例良性病变女性血清中稳定表达,其中miR-494、miR-22和miR-200b在两血清中的表达量显著不同(P<0.01)。用其作为分子标志物筛查早期肺癌患者,其敏感度和特异性为85.26%和94.45%。结论从表达的稳定性、敏感度和特异性上看,miR-494、miR-22和miR-200b可作为早期诊断宣威地区非吸烟女性肺癌患者有潜力的小分子标志物。 展开更多
关键词 MIRNA 非吸烟女性肺癌 分子标志物
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EMILIN1基因多态性与蒙古族原发性高血压相关性研究 被引量:2
13
作者 米冬青 王步云 +8 位作者 孙浩 黄小琴 陈晓晨 宗迪 于亮 史磊 杨昭庆 史荔 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期160-164,共5页
目的 探讨蒙古族人群中EMILIN1基因的3个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与原发性高血压的关系.方法 在内蒙古自治区蒙古族人群中选取201例原发性高血压患者和202名血压正常者进行病例对照研究,应用聚合酶链... 目的 探讨蒙古族人群中EMILIN1基因的3个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与原发性高血压的关系.方法 在内蒙古自治区蒙古族人群中选取201例原发性高血压患者和202名血压正常者进行病例对照研究,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态方法检测rs3754734、rs2011616和rs2304682这3个SNP位点的等位基因和基因型分布,并构建单倍型.结果 在这3个SNP位点中,rs2304682位点的基因频率和基因型频率在高血压组和对照组间差异有统计学意义(P<0.05),并且在rs3754734和rs2304682这2个SNP位点构建的单倍型中,G-C和G-G单倍型在高血压组和对照组之间差异有统计学意义(P<0.05).在舒张压偏高组和舒张压正常组间,rs2304682位点的基因型和等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05),而在收缩压偏高组和收缩压正常组间,各个SNP的基因型和等位基因分布差异无统计学意义(P>0.05).结论 在蒙古族人群中,EMILIN1基因rs2304682多态性位点以及rs3754734和rs2304682这2个SNP位点构建的G-G单倍型可能与原发性高血压的易感相关联,rs2304682的多态性与蒙古族原发性高血压的舒张压的高低可能有关联. 展开更多
关键词 蒙古族 原发性高血压 EMILIN1基因 遗传多态性
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中国壮族和裕固族群体HLA Ⅰ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性 被引量:2
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作者 史磊 姚宇峰 +8 位作者 史荔 陶玉芬 于亮 黄小琴 林克勤 易文 孙浩 杨昭庆 褚嘉祐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期138-146,共9页
近年来研究发现:位于HLAI类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAI类基因区域祖先单倍型和HLAI类基因多样性产生、进化和重组的理想工具。文章对中国壮族和裕固族群体HLAI类基因区域5个Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和Al... 近年来研究发现:位于HLAI类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAI类基因区域祖先单倍型和HLAI类基因多样性产生、进化和重组的理想工具。文章对中国壮族和裕固族群体HLAI类基因区域5个Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和Alu月-进行研究,结合HL4基因分型数据,分析壮族、裕固族、哈尼族、布朗族和傣族5个民族群体中Alu插入与m4卅等位基因的关系。研究结果显示:(1)壮族和裕固族人群中5个Alu插入频率范围分别为1.5%~35.8%和9.2~34.8%,AluMICB、AIuTF和AluHF插入频率在这两个群体中有统计学差异(P〈0.05);(2)在5个研究的群体中,AluHG插入与H幽卅*02的不同亚型关联;AluHJ插入与HLA-A*2402在5个群体中都关联,但AluHJ与HLA-A*1101和HLA-A*2407只在布朗族中关联。表明不同群体HLAI类基因区域内Alu插入具有各自的特征,且Alu插入与不同的m4卅等位基因相关联。这种Alu插入及其与肌爿.爿的关联特征可作为研究群体中HLAI类基因和单倍型系谱变化的重要遗传标记。 展开更多
关键词 HLA Ⅰ类基因 Alu插入 祖先单倍型
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EB病毒转化B淋巴细胞建立的永生细胞株长期传代遗传稳定性的研究 被引量:2
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作者 李彦涵 黄小琴 +5 位作者 林克勤 陶玉芬 易文 姚宇峰 史磊 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期276-279,共4页
目的研究EB病毒转化外周血B淋巴细胞建成的永生细胞株在传代过程中遗传特性是否发生改变。方法对10株永生细胞株进行30代的长期传代培养,采用染色体显带、微卫星DNA及端粒酶活性检测技术,观察不同传代次数的永生细胞株二倍性、染色体... 目的研究EB病毒转化外周血B淋巴细胞建成的永生细胞株在传代过程中遗传特性是否发生改变。方法对10株永生细胞株进行30代的长期传代培养,采用染色体显带、微卫星DNA及端粒酶活性检测技术,观察不同传代次数的永生细胞株二倍性、染色体核型、微卫星DNA及端粒酶活性的改变。结果永生细胞株在30代以内,在染色体二倍性、核型、微卫星DNA方面保持稳定,未检测出端粒酶活性。结论经EB病毒转化的永生细胞株在有限代次内遗传特征是稳定的。 展开更多
关键词 永生细胞株 染色体二倍性 微卫星DNA 端粒酶活性 遗传稳定性
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1例OCRL无义突变所致眼脑肾综合征患儿临床及分子遗传学分析 被引量:2
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作者 张志丹 陶丹 +5 位作者 刘泽源 林克勤 孙浩 马绍辉 褚嘉祐 杨昭庆 《中国优生与遗传杂志》 2021年第10期1436-1440,共5页
目的探讨1例表现为先天性白内障、先天性青光眼男性患儿的临床表现及遗传学病因。方法收集先证者的临床资料,提取先证者及其双亲外周血基因组DNA,采用全外显子组测序技术(WES)筛选患儿候选可疑致病突变后,通过Sanger DNA测序法进行验证... 目的探讨1例表现为先天性白内障、先天性青光眼男性患儿的临床表现及遗传学病因。方法收集先证者的临床资料,提取先证者及其双亲外周血基因组DNA,采用全外显子组测序技术(WES)筛选患儿候选可疑致病突变后,通过Sanger DNA测序法进行验证,并利用UCSF chimera软件对候选基因突变所致蛋白功能改变进行生物信息学分析。结果患儿3月龄时临床检测发现有先天性白内障、先天性青光眼;后脑部成像显示双侧侧脑室、第三脑室扩张,脑室旁见片状低密度灶;此外有轻度智力障碍、蛋白尿、隐睾及佝偻病样改变等特征。全外显子组测序结果显示X染色体上OCRL基因(NM_000276)第13外显子存在一个c.1275T>G(p.Y425X)纯合无义突变,导致OCRL基因编码蛋白在第425位酪氨酸(Try)提前终止,破坏了蛋白的完整性。患儿父母表型未见异常,Sanger测序结果也均未发现此突变。蛋白3D结构建模分析发现该p.Y425X终止密码子突变可导致截短蛋白形成,蛋白部分结构丧失,进而影响了蛋白的功能。结论结合临床表现与基因检测结果,患者诊断为眼脑肾综合征(Lowe综合征),OCRL基因c.1275T>G突变是致病基因突变,该突变为首次报道的新生突变,本研究进一步丰富了Lowe综合征的基因突变谱。 展开更多
关键词 Lowe综合征 OCRL基因 全外显子组测序 无义突变
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两例Menkes病家系的临床表型及基因突变分析 被引量:1
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作者 张志丹 段丽芬 +5 位作者 叶磊 孙莹 王晓辉 孙浩 褚嘉祐 杨昭庆 《中国优生与遗传杂志》 2022年第1期45-49,共5页
目的探讨2例Menkes病(Menkes disease,MD)患儿家系的临床表型及致病基因突变,明确病因。方法收集患者临床资料,提取2例家系中患儿及其父母的基因组DNA,并对两家系中先证者进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES),对候选致病突... 目的探讨2例Menkes病(Menkes disease,MD)患儿家系的临床表型及致病基因突变,明确病因。方法收集患者临床资料,提取2例家系中患儿及其父母的基因组DNA,并对两家系中先证者进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES),对候选致病突变进行生物信息学分析,并利用Sanger测序对先证者及其父母进行突变位点的验证。结果 2例男性患儿临床表现有癫痫、毛发异常及脑电图异常,均检出X染色体上ATP7A基因(NM_000052)突变,1例为c.2938C>T(p.Arg980Ter)无义突变半合子。另1例为c.4127_4127delT(p.F1377LfsTer24)移码突变半合子,该突变尚未见文献报道,在正常人群数据库中未发现该突变。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传突变分类标准与指南,ATP7A基因c.4127_4127delT新突变被判定为可能的致病突变((PVS1+PM2)。结论 ATP7A基因上的c.2938C>T和c.4127_4127delT突变分别是2例Menkes病患儿的致病原因,新突变的检出丰富了Menkes病的基因突变谱。 展开更多
关键词 MENKES病 ATP7A基因 全外显子组测序 基因突变 移码突变
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云南彝族中人群补体受体Ⅰ型基因遗传多态性研究 被引量:1
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作者 吴依霖 黄伟 +5 位作者 林克勤 黄铠 孙浩 黄小琴 褚嘉祐 杨昭庆 《中国优生与遗传杂志》 2016年第9期4-7,3,共5页
目的探讨补体受体Ⅰ型(CR1)基因多态性在云南彝族人群中的分布特点并比较不同人群间的差异。方法用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和DNA测序技术检测216例云南彝族样本中CR1基因的Exon22(rs2274567),Intron27(rs11118133)... 目的探讨补体受体Ⅰ型(CR1)基因多态性在云南彝族人群中的分布特点并比较不同人群间的差异。方法用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和DNA测序技术检测216例云南彝族样本中CR1基因的Exon22(rs2274567),Intron27(rs11118133)和Exon33(rs3811381)多态性位点的基因型,并与千人基因组计划中的人群数据进行比较。结果云南彝族人群中CR1基因Exon22、Intron27、Exon33这3个多态性位点的主要基因型和频率分别为AG41.2%,AA56.9%,CG47.7%。云南彝族与国内外各人群比较:在国内外人群的3位点分布频率数据中,北京汉和非洲人、欧洲人是以非突变基因型(Exon22为AA,Intron27为AA,Exon33为CC)为主,而南方汉、傣族和印度人以突变基因型(Exon22为AG+GG,Intron27为AT+TT,Exon33为CG+GG)为主。彝族的3个多态性位点中,突变率依次递增为Intron27、Exon22、Exon33,Intron27、Exon22位点基因型分布频率与南方汉比较无统计学差异(P分别为0.274、0.177),Exon33与傣族、印度人无差异(P分别为0.409,0.475)。单倍型以AAG、GTG为主。结论云南彝族CR1基因Exon22、Intron27和Exon33存在多态性,三位点分布频率基因型分布频率提示彝族与南方汉、西双版纳傣族、印度人有更近的亲缘关系,单倍型分布具有自身特点,可能与疟疾自然选择压力、种族基因差异等相关,对红细胞相关免疫性疾病的群体分布研究有重要意义。 展开更多
关键词 补体受体Ⅰ型 遗传多态性 少数民族
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东亚群体中高血压GWAS阳性9个SNP在中国傣族及蒙古族群体中的验证研究 被引量:1
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作者 孙浩 杨昭庆 +6 位作者 王秀云 刘舒媛 于亮 林克勤 黄铠 褚嘉祐 黄小琴 《中国优生与遗传杂志》 2014年第5期8-13,共6页
目的为了验证GWAS研究发现的3个高血压一个基因的相关性。方法本研究选取了3个在东亚群体中被GWAS研究证实了与高血压发生相关的基因(AKAP13,ENPEP和CNNM2)上的9个SNP,在傣族和蒙古族群体中进行验证。对这9个SNPs用SNaPshot的方法在774... 目的为了验证GWAS研究发现的3个高血压一个基因的相关性。方法本研究选取了3个在东亚群体中被GWAS研究证实了与高血压发生相关的基因(AKAP13,ENPEP和CNNM2)上的9个SNP,在傣族和蒙古族群体中进行验证。对这9个SNPs用SNaPshot的方法在774例傣族群体和409例蒙古族群体中进行了分型,排布单倍型并进行了统计学分析。结果发现统计学上无法证明这9个SNPs与高血压相关。但是在ENPEP基因的一连锁区段中,rs1126483在傣族群体中呈现与收缩压升高弱阳性关联(χ2=4.53,P=0.033)。同时rs3796889在蒙古族群体中也与收缩压的升高呈现弱阳性关联(χ2=4.35,P=0.037)。虽然这一阳性在进行统计学矫正后消失。结论本研究同时在起源不同,生活环境均差异较大的两个群体中均观察到ENPEP基因这一区段与高血压的关联,这也许暗示了此基因确实可能与高血压发生相关。另一方面本研究的阴性结果,也暗示了中国一些相对封闭的群体可能具有更窄的高血压遗传变异谱。 展开更多
关键词 高血压 全基因组关联分析 易感基因 少数民族
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甲乙肝联合疫苗中不同配比对小鼠Th1/Th2型细胞因子变化的影响 被引量:1
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作者 熊秋霞 谢忠平 +3 位作者 于亮 史荔 孙明 褚嘉祐 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期541-544,548,共5页
目的通过注射甲乙肝联合疫苗和单价甲肝、乙肝疫苗来观察小鼠在免疫过程中细胞因子的变化情况,衡量应答的性质,探讨两种抗原对小鼠细胞因子变化的不同作用以及乙肝抗原对甲肝抗原的作用。方法选用150只Balb/c小鼠随机分成注射联苗640Eu/... 目的通过注射甲乙肝联合疫苗和单价甲肝、乙肝疫苗来观察小鼠在免疫过程中细胞因子的变化情况,衡量应答的性质,探讨两种抗原对小鼠细胞因子变化的不同作用以及乙肝抗原对甲肝抗原的作用。方法选用150只Balb/c小鼠随机分成注射联苗640Eu/mL:10μg/mL组、640Eu/mL:20μg/mL组、单价甲肝抗原640Eu/mL组、单价乙肝抗原10μg/mL组、单价乙肝抗原20μg/mL组和佐剂AL(OH)3对照组,每组25只。于第4周加强免疫1次,分别在初次免疫注射后第1、2、3、4周及加强免疫后第2周,眼眶采血,分离血清,每组各5只小鼠,上流式细胞仪检测小鼠血清5种细胞因子(TNF、IFN-γ、IL-5、IL-4、IL-2)含量。结果疫苗诱导产生的Th1/Th2型细胞因子均随时间的变化而变化,5种细胞因子均约在第3周达最大值,其中小鼠产生最多的是TNF;加强免疫后,640Eu/mL:20μg/mL联苗组刺激小鼠产生细胞因子水平高于640Eu/mL:10μg/mL联苗组。结论甲乙肝联合疫苗能刺激机体产生特异性细胞免疫应答,甲乙肝联合疫苗能诱导机体产生与单价相同或略强的Th1/Th2型细胞因子。 展开更多
关键词 甲乙肝联合疫苗 甲肝疫苗 乙肝疫苗 细胞因子 免疫原性 流式细胞术
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