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胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱的研究
被引量：
3
1
作者
张岱
王振宁
+4 位作者
罗阳
徐岩
刘彦山
杨威
张学
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010年第4期283-290,共8页
目的研究胃癌中表达失调的miRNA及其生物学功能，从而进一步阐明miRNA在胃癌发生中的分子机制。方法将总RNA加ploy（A）尾后进行反转录PCR扩增特异miRNA，使用QuantityOne软件进行定量分析，计算每对样本胃癌与癌旁组织比值（T／NRatio...
目的研究胃癌中表达失调的miRNA及其生物学功能，从而进一步阐明miRNA在胃癌发生中的分子机制。方法将总RNA加ploy（A）尾后进行反转录PCR扩增特异miRNA，使用QuantityOne软件进行定量分析，计算每对样本胃癌与癌旁组织比值（T／NRatio），使用SAM软件进行统计分析。MTT法检测miR-21和miR-17-5p对胃癌细胞系生长的影响。结果在8对胃癌及癌旁组织样本中对237个miRNA进行了表达谱分析。对于检测到表达的161个miRNA，使用SAM软件进行统计分析，确认22个在胃癌中表达上调，2个在胃癌中表达下调（FDR=0．0963）。进一步通过生长抑制试验证实在胃癌组织中表达异常增高的miR-21和miR-17-5p对胃癌细胞的生长有明显的促进作用。结论这些在胃癌中异常表达的miRNAs具有成为新一代胃癌标记物的潜力，能够为胃癌的精确诊断分型提供依据，同时针对这些靶点可以开发新的核酸治疗技术，通过抑制或增强其功能来达到治疗胃癌的目的。
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关键词
胃癌
MIRNA
表达谱
miR-17-5p
MIR-21
原文传递
野生型ADAR1蛋白与其R916W突变体在哺乳动物细胞中相互作用的研究
被引量：
1
2
作者
刘扬
柳青
+4 位作者
赵谨
吕丹
华芮
罗阳
张学
《山东大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2007年第5期450-454,共5页
目的:应用酵母双杂交和哺乳动物双杂交系统研究野生型双链RNA腺苷酸脱氨基酶ADAR1蛋白(ADAR1WT)与其突变体R916W(ADAR1R916W)之间的相互作用,从而探讨ADAR1基因错义突变在遗传性对称性色素异常症中的分子致病机制。方法:通过RT-PCR方法...
目的:应用酵母双杂交和哺乳动物双杂交系统研究野生型双链RNA腺苷酸脱氨基酶ADAR1蛋白(ADAR1WT)与其突变体R916W(ADAR1R916W)之间的相互作用,从而探讨ADAR1基因错义突变在遗传性对称性色素异常症中的分子致病机制。方法:通过RT-PCR方法从患者外周血白细胞中获得含ADAR1基因R916W突变的全长cDNA,将野生型和突变cDNA分别克隆到相关质粒载体上,利用MatchmakerTMGAL4酵母双杂交系统3和CheckMateTM哺乳动物双杂交系统检测蛋白单体间的相互作用。结果:在酵母细胞中未检测到野生型-野生型ADAR1蛋白及野生型-突变体ADAR1蛋白间的相互作用;与对照细胞相比,pBIND-ADAR1WT和pACT-ADAR1WT共转染的HeLa细胞中荧光素相对活性显著升高(P<0.05);与共转染pBIND-ADAR1WT和pACT-ADAR1WT的HeLa细胞比较,pBIND-ADAR1R916W和pACT-ADAR1WT共转染的细胞中荧光素相对活性明显降低(P<0.05),为前者的66%。结论:在哺乳动物细胞中ADAR1WT自身相互作用,ADAR1WT和ADAR1R916W突变体蛋白相互作用依然存在但作用明显减弱。
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关键词
ADAR1蛋白
R916W突变
酵母双杂交系统
哺乳动物双杂交系统
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职称材料
题名
胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱的研究
被引量：
3
1
作者
张岱
王振宁
罗阳
徐岩
刘彦山
杨威
张学
机构
中国医学科学院
基础医学
研究所
医学
遗传学
系
医学
分子生物学
国家
重点
实验室
中国
医科大
学
附属第一医院肿瘤外科
中国
医科大
学
基础医学
院
医学
基因组
学
教研
室
卫生部细胞
生物
学
重点
实验室
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010年第4期283-290,共8页
基金
资助项目：国家杰出青年科学基金（No.30125017）,国家自然科学基金（No.30370640）,国家重点基础研究发展规划项目（973计划）（No.G1998051203）
文摘
目的研究胃癌中表达失调的miRNA及其生物学功能，从而进一步阐明miRNA在胃癌发生中的分子机制。方法将总RNA加ploy（A）尾后进行反转录PCR扩增特异miRNA，使用QuantityOne软件进行定量分析，计算每对样本胃癌与癌旁组织比值（T／NRatio），使用SAM软件进行统计分析。MTT法检测miR-21和miR-17-5p对胃癌细胞系生长的影响。结果在8对胃癌及癌旁组织样本中对237个miRNA进行了表达谱分析。对于检测到表达的161个miRNA，使用SAM软件进行统计分析，确认22个在胃癌中表达上调，2个在胃癌中表达下调（FDR=0．0963）。进一步通过生长抑制试验证实在胃癌组织中表达异常增高的miR-21和miR-17-5p对胃癌细胞的生长有明显的促进作用。结论这些在胃癌中异常表达的miRNAs具有成为新一代胃癌标记物的潜力，能够为胃癌的精确诊断分型提供依据，同时针对这些靶点可以开发新的核酸治疗技术，通过抑制或增强其功能来达到治疗胃癌的目的。
关键词
胃癌
MIRNA
表达谱
miR-17-5p
MIR-21
Keywords
gastric cancer
miRNA
expression profile
miR-17-5p
miR-21
分类号
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
原文传递
题名
野生型ADAR1蛋白与其R916W突变体在哺乳动物细胞中相互作用的研究
被引量：
1
2
作者
刘扬
柳青
赵谨
吕丹
华芮
罗阳
张学
机构
中国
医科大
学
基础医学
院
医学
基因组
学
教研
室
中国医学科学院
基础医学
研究所
医学
遗传学
系
医学
分子生物学
国家
重点
实验室
出处
《山东大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2007年第5期450-454,共5页
基金
国家杰出青年科学基金资助课题(30125017)
文摘
目的:应用酵母双杂交和哺乳动物双杂交系统研究野生型双链RNA腺苷酸脱氨基酶ADAR1蛋白(ADAR1WT)与其突变体R916W(ADAR1R916W)之间的相互作用,从而探讨ADAR1基因错义突变在遗传性对称性色素异常症中的分子致病机制。方法:通过RT-PCR方法从患者外周血白细胞中获得含ADAR1基因R916W突变的全长cDNA,将野生型和突变cDNA分别克隆到相关质粒载体上,利用MatchmakerTMGAL4酵母双杂交系统3和CheckMateTM哺乳动物双杂交系统检测蛋白单体间的相互作用。结果:在酵母细胞中未检测到野生型-野生型ADAR1蛋白及野生型-突变体ADAR1蛋白间的相互作用;与对照细胞相比,pBIND-ADAR1WT和pACT-ADAR1WT共转染的HeLa细胞中荧光素相对活性显著升高(P<0.05);与共转染pBIND-ADAR1WT和pACT-ADAR1WT的HeLa细胞比较,pBIND-ADAR1R916W和pACT-ADAR1WT共转染的细胞中荧光素相对活性明显降低(P<0.05),为前者的66%。结论:在哺乳动物细胞中ADAR1WT自身相互作用,ADAR1WT和ADAR1R916W突变体蛋白相互作用依然存在但作用明显减弱。
关键词
ADAR1蛋白
R916W突变
酵母双杂交系统
哺乳动物双杂交系统
Keywords
ADAR1 protein
R916W mutant
Yeast two-hybrid system
Mammalian two-hybrid system
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱的研究
张岱
王振宁
罗阳
徐岩
刘彦山
杨威
张学
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010
3
原文传递
2
野生型ADAR1蛋白与其R916W突变体在哺乳动物细胞中相互作用的研究
刘扬
柳青
赵谨
吕丹
华芮
罗阳
张学
《山东大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2007
1
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