棉花陆海染色体片段代换系BC_7F_2群体纤维产量和品质性状表现及相关分析 被引量：3

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作者 苏威 石玉真 +12 位作者 宋威武 李邵琦 孔令磊 龚举武 刘爱英 李俊文 葛群 巩万奎 商海红 刘平 王艳玲 王谧 袁有禄 《中国农学通报》 2017年第14期21-27,共7页

为了揭示棉花染色体片段代换系BC_7F_2纤维产量性状和品质性状之间的相关关系,筛选纤维品质优异的新材料。以1套陆海染色体片断代换系为材料,对BC7F2高代回交群体的产量性状与纤维品质性状的表性数据进行评价及偏相关分析。结果表明:群... 为了揭示棉花染色体片段代换系BC_7F_2纤维产量性状和品质性状之间的相关关系,筛选纤维品质优异的新材料。以1套陆海染色体片断代换系为材料,对BC7F2高代回交群体的产量性状与纤维品质性状的表性数据进行评价及偏相关分析。结果表明:群体各性状的平均值接近于轮回亲本‘中棉所36’,群体内存在丰富的遗传变异。纤维上半部平均长度超轮回亲本比例为30.25%,断裂比强度超轮回亲本比例为71.25%,衣分超轮回亲本比例为29.38%。总体上单铃重与马克隆值、整齐度指数呈极显著正相关,衣分与上半部平均长度、断裂比强度呈显著负相关,与单铃重呈极显著负相关。从中筛选出部分纤维品质突出的单株,纤维上半部平均长度高于30.00 mm,断裂比强度高于31.00 cN/tex。 展开更多

关键词 染色体片段代换系 产量性状 品质性状 偏相关

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亚洲棉Argonaute蛋白家族的生物信息学预测与分析 被引量：2

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作者 蔡娟 商海红 +12 位作者 李伟杰 王中娜 宋威武 张震 巩万奎 刘爱英 陈婷婷 李俊文 龚举武 石玉真 葛群 刘世尧 袁有禄 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第1期61-69,82,共10页

【目的】在全基因组水平上鉴定亚洲棉(Gossypium arboretum L.)AGO蛋白家族成员,分析其进化关系,为亚洲棉遗传改良提供基因资源。【方法】用AGO蛋白保守域在亚洲棉基因组数据库中进行同源比对,并对AGO蛋白家族的进化关系、基因结构、结... 【目的】在全基因组水平上鉴定亚洲棉(Gossypium arboretum L.)AGO蛋白家族成员,分析其进化关系,为亚洲棉遗传改良提供基因资源。【方法】用AGO蛋白保守域在亚洲棉基因组数据库中进行同源比对,并对AGO蛋白家族的进化关系、基因结构、结构域、染色体定位、三级结构及表达模式等进行生物信息学分析。【结果】从亚洲棉蛋白数据库中共鉴定出11个AGO蛋白家族成员,其编码区长度为2 949~9 807bp,定位在6条染色体上,其中第9号染色体上分布有4个基因;11个AGO家族成员分为5个亚族,亚族内各成员间具有很高的保守性;AGO家族成员均具有典型的α-螺旋跨膜结构,属于碱性蛋白;从表达模式看,AGO家族成员在纤维发育不同时期和不同组织中的表达量存在较大差异,其中5个基因在棉纤维次生壁后期高表达,在其他时期表达水平较低,存在组织特异性。【结论】成功鉴定了亚洲棉AGO蛋白家族,明确了其基本结构的进化关系及基因表达特点。 展开更多

关键词 亚洲棉 AGO 生物信息学

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我国棉花轻简化栽培关键技术研究进展 被引量：47

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作者 李亚兵 韩迎春 +3 位作者 冯璐 王国平 王占彪 毛树春 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2017年第B09期80-88,共9页

棉花轻简化栽培是适应中国国情、提高棉花竞争力水平和棉花持续生产的重要技术途径。本文分析了当前我国棉花生产面临的主要问题,回顾了我国棉花轻简化栽培技术的形成和发展,总结了从播种(育苗移栽),到简化整枝、合理密植、简化施肥、... 棉花轻简化栽培是适应中国国情、提高棉花竞争力水平和棉花持续生产的重要技术途径。本文分析了当前我国棉花生产面临的主要问题,回顾了我国棉花轻简化栽培技术的形成和发展,总结了从播种(育苗移栽),到简化整枝、合理密植、简化施肥、植保、灌溉、到采收诸环节轻简化的关键技术;并对轻简化栽培的熟性和株型调控理论等进行了评述,提出了进一步完善和发展轻简化植棉技术,促进棉花持续生产的技术与理论研究设想。 展开更多

关键词 棉花 轻简化栽培 可持续生产

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棉花施肥技术与营养机理研究进展 被引量：24

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作者 李鹏程 郑苍松 +7 位作者 孙淼 庞朝友 张思平 刘绍东 陈静 李亚兵 董合林 赵新华 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2017年第B09期118-130,共13页

综述了近10年来不同棉区、不同基因型品种、不同种植模式、不同产量水平棉花的养分需求规律,对不同棉区棉花氮磷钾施肥阈值及运筹技术进行了总结;并概述了棉花氮磷钾养分高效利用的机理研究进展,提出了未来棉花施肥技术与营养机理的研... 综述了近10年来不同棉区、不同基因型品种、不同种植模式、不同产量水平棉花的养分需求规律,对不同棉区棉花氮磷钾施肥阈值及运筹技术进行了总结;并概述了棉花氮磷钾养分高效利用的机理研究进展,提出了未来棉花施肥技术与营养机理的研究方向。 展开更多

关键词 棉花 施肥技术 营养机理

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棉花育种行业创新与进展 被引量：12

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作者 袁有禄 魏晓文 +7 位作者 毛树春 潘境涛 方红曼 吕慧颖 邓向东 葛毅强 魏珣 杨维才 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期455-463,共9页

对2017年国内外棉花遗传育种领域取得的重要研究进展进行了概括性评述。棉花基因芯片技术得到了广泛应用,一批重要产量、品质性状基因获得定位和克隆。棉花全基因组关联分析(GWAS)取得重大突破,陆地棉高密度遗传图谱构建取得重大进展,... 对2017年国内外棉花遗传育种领域取得的重要研究进展进行了概括性评述。棉花基因芯片技术得到了广泛应用,一批重要产量、品质性状基因获得定位和克隆。棉花全基因组关联分析(GWAS)取得重大突破,陆地棉高密度遗传图谱构建取得重大进展,棉花芽黄、纤维品质性状基因的精细定位及克隆取得较大进展,在棉花转基因新方法、转基因抗虫、抗除草剂新材料等方面进展显著。文中并进一步结合我国棉花发展现状、未来趋势与所面临的机遇,提出了我国棉花发展应采取的一些对策。 展开更多

关键词 棉花 遗传育种 研究进展 2017年

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陆地棉衣分性状的主基因-多基因遗传分析 被引量：8

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作者 龚举武 刘爱英 +10 位作者 李俊文 姜骁 段丽 葛群 邓晓英 巩万奎 石玉真 商海红 陈全家 耿洪伟 袁有禄 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期192-200,共9页

【目的】衣分是决定棉花产量的重要因素之一,有关其遗传研究相对较少,解析衣分性状遗传的特点,明确不同环境下衣分对产量形成的贡献机制。【方法】以国审优质棉中棉所70为基础构建的250个RIL(Recombinant inbred lines)群体,在黄河流域... 【目的】衣分是决定棉花产量的重要因素之一,有关其遗传研究相对较少,解析衣分性状遗传的特点,明确不同环境下衣分对产量形成的贡献机制。【方法】以国审优质棉中棉所70为基础构建的250个RIL(Recombinant inbred lines)群体,在黄河流域、长江流域和西北内陆棉区9个环境下对该RIL群体及其亲本进行了表型鉴定,并利用主基因+多基因混合遗传模型综合研究衣分性状遗传变化特点。【结果】母本s GK中156衣分性状在9个环境下均大于父本901-001,RIL群体衣分分布范围为33.91%～40.18%,平均为38.01%,表现为双向超亲,偏度和峰度绝对值都小于1.0,呈正态分布,变异系数为5.36%～8.17%;不同环境下衣分表现为西北内陆棉区>黄河流域棉区>长江流域棉区的趋势;遗传模型是以2～4对主基因或2对主基因+多基因遗传控制,主基因遗传率在1.26%～83.13%,多基因遗传率在27.35%～90.83%,主基因+多基因遗传率在92.00%～99.35%,一般情况下衣分是以2对主基因+多基因遗传为主,在2015年河南安阳、2016年河南安阳和2016年山东临清环境下以2～4对主基因遗传,遗传效应较高,在2015年河南安阳环境下最多检测到4对主基因的存在。【结论】衣分性状主基因+多基因遗传率大于90%,结果有助于进一步阐明优质棉中棉所70产量性状衣分的遗传特征,为不同生态区条件下相互引种和推广提供科学依据,为提高棉花产量、农民增收、QTL定位和高衣分品种选育提供理论基础。 展开更多

关键词 中棉所70 衣分 主基因-多基因遗传分析 多环境

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棉花陆海渐渗系双交分离群体产量和纤维品质性状的QTL定位 被引量：5

7

作者 孔令磊 石玉真 +10 位作者 李邵琦 黎波涛 李俊文 刘爱英 龚举武 商海红 巩万奎 葛群 王艳玲 宋威武 袁有禄 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期119-127,共9页

【目的】利用海岛棉染色体片段渐渗系对棉花产量和纤维品质相关QTL(Quantitative trait locus)进行定位。【方法】以陆地棉中棉所45和海岛棉海1高代回交自交获得的4个优质海岛棉染色体片段渐渗系MBI7115、MBI 7412、MBI 7153、MBI 7346... 【目的】利用海岛棉染色体片段渐渗系对棉花产量和纤维品质相关QTL(Quantitative trait locus)进行定位。【方法】以陆地棉中棉所45和海岛棉海1高代回交自交获得的4个优质海岛棉染色体片段渐渗系MBI7115、MBI 7412、MBI 7153、MBI 7346为亲本,通过[(MBI 7115×MBI 7412)×(MBI 7153×MBI 7346)]构建双交F_1及F_(1:2)群体。利用微卫星标记(Simple sequence repeat,SSR)对亲本及双交F_1进行基因型分析,并对F_1、F_(1:2)群体的产量和纤维品质相关性状进行QTL定位。【结果】4个渐渗系遗传背景恢复到轮回亲本中棉所45的比例均在97%以上,在2个群体中共检测到41个QTL,分布在11条染色体上。其中与纤维品质相关的有30个,表型贡献率在1.11%~11.80%;与产量相关的有11个,表型贡献率在1.09%~13.57%。【结论】有5个纤维品质相关的QTL能同时在2个群体中检测到且均为新发现的QTL。这一结果为进一步精细定位和开展棉花分子标记辅助育种提供了重要依据。 展开更多

关键词 棉花 染色体片段渐渗系 QTL定位 产量 纤维品质

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陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的结构特征和无序性分析 被引量：5

8

作者 王俊娟 阴祖军 +6 位作者 王德龙 王帅 王晓歌 樊伟丽 郭丽雪 陈超 叶武威 《中国棉花》 2017年第8期17-19,28,共4页

利用生物信息学对陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的氨基酸组成理化性质、保守结构域K片段以及无序性进行分析。结果表明,GhDHN1蛋白无明显跨膜结构,不是分泌蛋白,其2个序列相近的K片段均具有高度亲水性,属于部分无序性蛋白。推测GhDHN1的这些... 利用生物信息学对陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的氨基酸组成理化性质、保守结构域K片段以及无序性进行分析。结果表明,GhDHN1蛋白无明显跨膜结构,不是分泌蛋白,其2个序列相近的K片段均具有高度亲水性,属于部分无序性蛋白。推测GhDHN1的这些结构特性与其调控棉花响应低温胁迫有关。 展开更多

关键词 棉花 脱水素蛋白GhDHN1 结构特征 K片段 无序性

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浅谈陆地棉杂种二代利用 被引量：5

9

作者 陈亮亮 张梦 +7 位作者 郭立平 戚廷香 张学贤 唐会妮 王海林 乔秀琴 吴建勇 邢朝柱 《中国棉花》 2020年第12期1-4,共4页

棉花杂种优势利用是提高棉花产量主要途径之一。研究表明,一些陆地棉F2仍具有明显的产量杂种优势,种子成本低廉的F2具有潜在的应用前景。本文综述了陆地棉F2杂种优势遗传基础、优势表现以及目前生产上出现的问题,并从育种层面提出了有... 棉花杂种优势利用是提高棉花产量主要途径之一。研究表明,一些陆地棉F2仍具有明显的产量杂种优势,种子成本低廉的F2具有潜在的应用前景。本文综述了陆地棉F2杂种优势遗传基础、优势表现以及目前生产上出现的问题,并从育种层面提出了有针对性的解决对策。 展开更多

关键词 棉花 F2杂种优势 性状表现 问题和对策

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陆海渐渗系分离群体(F_2)产量和纤维品质性状的QTL定位 被引量：3

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作者 郭丽雪 石玉真 +8 位作者 李俊文 龚举武 刘爱英 商海红 巩万奎 陈婷婷 葛群 孙杰 袁有禄 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期550-560,共11页

以优异的海岛棉染色体片段渐渗系MBI7455和MBI7358为亲本,构建F2分离群体。利用SSR（Simple sequence repeat）标记对亲本的基因型及F2群体产量和纤维品质的QTL（Quantitative trait locus）进行分析,结果表明母本MBI7455恢复到轮回亲... 以优异的海岛棉染色体片段渐渗系MBI7455和MBI7358为亲本,构建F2分离群体。利用SSR（Simple sequence repeat）标记对亲本的基因型及F2群体产量和纤维品质的QTL（Quantitative trait locus）进行分析,结果表明母本MBI7455恢复到轮回亲本中棉所45背景的比例为96.70%,共渐渗12个海岛棉片段;父本MBI7358恢复到轮回亲本中棉所45背景的比例为95.60%,共渐渗16个海岛棉片段;F2群体平均背景恢复率为96.44%,渐渗海岛棉片段平均值为13.42个,纯合片段平均值为3.90个。QTL定位分析,在F2群体中共检测到26个QTL,其中与纤维品质相关的有19个,表型贡献率为2.52%~13.11%;与产量相关的有7个,表型贡献率为2.93%~11.40%。本研究利用染色体片段渐渗系定位与产量和纤维品质相关的QTL,为棉花分子标记辅助育种奠定了基础。 展开更多

关键词 棉花 染色体片段渐渗系 QTL 纤维品质

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优质棉中棉所127相关杂交分离群体纤维产量和品质性状遗传变异分析 被引量：3

11

作者 张小微 王晓宇 +11 位作者 葛群 龚举武 李俊文 刘爱英 巩万奎 商海红 潘境涛 邓晓英 范森淼 石玉真 陈全家 袁有禄 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期989-999,共11页

为了进一步揭示棉花优质品种的纤维产量和品质性状之间的遗传关系,筛选纤维品质突出的优异材料,本研究以优质品种中棉所127为父本,与高产品系sGK中156为母本杂交,构建F2和F2:3分离大群体,对分离群体的纤维产量与品质进行初步评价分析。... 为了进一步揭示棉花优质品种的纤维产量和品质性状之间的遗传关系,筛选纤维品质突出的优异材料,本研究以优质品种中棉所127为父本,与高产品系sGK中156为母本杂交,构建F2和F2:3分离大群体,对分离群体的纤维产量与品质进行初步评价分析。结果表明F2和F2:3世代中铃重、衣分、纤维上半部平均长度、断裂比强度、马克隆值、伸长率和整齐度性状均呈正态分布,表现双向超亲分离,群体内存在丰富的遗传变异,纤维上半部平均长度的超高亲比例分别为61.38%和69.55%,断裂比强度的超高亲比例分别为42.12%和61.00%,铃重的超高亲比例分别为41.31%和28.43%。2个分离世代纤维上半部平均长度和断裂比强度呈现出极显著正相关,衣分与纤维上半部平均长度和断裂比强度这2个主要纤维品质性状呈极显著负相关,表明同步对纤维产量和品质进行改良具有一定的难度。筛选出同时在F2和F2:3中断裂比强度大于38.00 cN/tex的优异材料10个,且纤维上半部平均长度均大于31.00 mm。本研究为棉花纤维产量和品质QTL挖掘及分子聚合育种等储备了大量的基础材料。 展开更多

关键词 优质棉 品质性状 产量性状 变异分析

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陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列分析 被引量：3

12

作者 王俊娟 王德龙 +6 位作者 王帅 阴祖军 王晓歌 樊伟莉 郭丽雪 郭晓宁 叶武威 《中国棉花》 2017年第5期10-12,共3页

为了筛选棉花抗逆转基因育种的候选启动子,根据陆地棉脱水素基因GhDHN1的cDNA序列和陆地棉基因组序列,利用生物信息学分析方法,获得棉花陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列。结果表明,该启动子上多个位点含有启动子的基本元件TATA-box和C... 为了筛选棉花抗逆转基因育种的候选启动子,根据陆地棉脱水素基因GhDHN1的cDNA序列和陆地棉基因组序列,利用生物信息学分析方法,获得棉花陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列。结果表明,该启动子上多个位点含有启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box,并含有非生物逆境胁迫响应元件、响应植物激素顺式作用元件、多种光调控相关的顺式作用元件以及胚乳表达顺式调控元件等。推测GhDHN1基因的启动子受光诱导,同时受低温和干旱胁迫等非生物逆境的诱导,参与棉花的生长发育。 展开更多

关键词 陆地棉 脱水素基因 GhDHN1 启动子 序列分析

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新型尿素在棉花上的应用效果 被引量：3

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作者 李鹏程 郑苍松 +4 位作者 孙淼 董合林 李亚兵 庞朝友 赵新华 《中国棉花》 2017年第8期29-31,共3页

大田试验研究了控释尿素、聚能网尿素、腐植酸尿素、含锌尿素等新型尿素对棉花产量、纤维品质及氮素利用效率的影响。结果表明,与常规尿素相比,聚能网尿素、腐植酸尿素处理籽棉产量增产5%以上,含锌尿素处理增产1.55%。控释尿素处理产量... 大田试验研究了控释尿素、聚能网尿素、腐植酸尿素、含锌尿素等新型尿素对棉花产量、纤维品质及氮素利用效率的影响。结果表明,与常规尿素相比,聚能网尿素、腐植酸尿素处理籽棉产量增产5%以上,含锌尿素处理增产1.55%。控释尿素处理产量略高于常规尿素,控释尿素1次施用处理产量略高于2次施用。尿素类型对氮肥回收率和棉花纤维品质无显著影响。 展开更多

关键词 棉花 尿素 产量 纤维品质

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近5年全球棉花供求形势分析 被引量：2

14

作者 李鹏程 董合林 《中国棉花》 2017年第10期43-45,共3页

以美国农业部近5年数据分析了全球棉花供求形势,2013/2014至2017/2018年度,全球棉花总产、出口量、进口量、库存量总体下降,而全球棉花消费量总体增加,库存消费比呈下降趋势。中国棉花总产、进口量、库存量下降,棉花消费量上升。印度棉... 以美国农业部近5年数据分析了全球棉花供求形势,2013/2014至2017/2018年度,全球棉花总产、出口量、进口量、库存量总体下降,而全球棉花消费量总体增加,库存消费比呈下降趋势。中国棉花总产、进口量、库存量下降,棉花消费量上升。印度棉花总产较稳定,棉花消费量和库存量增加,出口下降。美国棉花总产、出口、库存量增加。 展开更多

关键词 棉花 产量 消费量 进出口 库存量

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棉花纤维强度主效QTLs分子标记辅助选择及聚合效应研究 被引量：2

15

作者 王天抗 石玉真 +8 位作者 商海红 刘爱英 李俊文 龚举武 王涛 巩万奎 陈婷婷 黎波涛 袁有禄 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期396-403,共8页

利用2个纤维品质优异材料0-153和新陆早24与2个大面积推广品种鲁棉研28和冀棉516为亲本,配制了（冀棉516×0-153）×（冀棉516×新陆早24）（Pop1）、（鲁棉研28×0-153）×（鲁棉研28×新陆早24）（Pop2）组... 利用2个纤维品质优异材料0-153和新陆早24与2个大面积推广品种鲁棉研28和冀棉516为亲本,配制了（冀棉516×0-153）×（冀棉516×新陆早24）（Pop1）、（鲁棉研28×0-153）×（鲁棉研28×新陆早24）（Pop2）组合的双交F1群体,对3个纤维强度主效QTLs连锁的4个SSR标记进行辅助选择,并对不同QTLs的聚合效应进行了研究。结果表明,4个标记的选择都表现出显著的遗传效应,在2个群体中纯合显性基因/显性基因单株平均纤维比强度在31.21~32.62 cN·tex^-1,杂合基因型单株平均纤维比强度在30.77-32.50 cN·tex^-1,单个标记的选择效应在0.80~1.51 cN·tex^-1;QTL^-1×QTL^-3和QTL-2×QTL^-3组合在2个群体中同时聚合该2个QTLs时单株平均纤维比强度达到33.40-34.08 cN·tex^-1,与2个QTLs均无单株相比选择效应在2.73~3.56cN·tex^-1,与只含有其中1个QTL单株相比选择效应在1.12-3.02 cN·tex^-1。此外,聚合效应分析表明,QTL-1与QTL-2可能是同一个QTL,QTL-2与QTL-3之间存在明显的上位效应。本研究进一步明确了开展纤维强度的分子标记辅助聚合育种是可行的。 展开更多

关键词 分子标记 辅助选择 QTL 聚合效应 纤维比强度

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中棉所70分离群体农艺性状相关QTL定位 被引量：2

16

作者 邓晓英 龚举武 +11 位作者 石玉真 李俊文 刘爱英 巩万奎 陈婷婷 商海红 葛群 王艳玲 蒋梦婷 杨玉娥 吴玉香 袁有禄 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期233-240,共8页

【目的】定位棉花产量相关性状的数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)。【方法】以中棉所70的F_2分离群体为遗传作图群体,利用从14 820对简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)引物中筛选出的267对两亲本间的多态性引物检... 【目的】定位棉花产量相关性状的数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)。【方法】以中棉所70的F_2分离群体为遗传作图群体,利用从14 820对简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)引物中筛选出的267对两亲本间的多态性引物检测F_2群体250个单株的标记基因型,利用Joinmap 4.0进行连锁分析,并通过WinQTLCart 2.5复合区间作图法对F_(2:3)群体的株高、单株结铃数和单株果枝数性状进行QTL定位。【结果】在F_2群体中共获得342个SSR标记位点,并构建了包括312个标记、35个连锁群,总长1 929.9 cM的遗传连锁图谱(标记间平均距离为9.2 cM,覆盖棉花基因组的43.4%)。经QTL定位,共检测到19个QTL,其中涉及株高的7个、单株果枝数4个、单株结铃数8个,这些QTL分布在8条染色体上,解释0.25%~11.28%的表型变异。【结论】这些与农艺性状相关的QTL有助于棉花产量分子标记辅助选择。 展开更多

关键词 棉花 分离群体 农艺性状 数量性状基因座 遗传连锁图谱

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陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析 被引量：1

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作者 王俊娟 郭丽雪 +7 位作者 陆许可 阴祖军 王德龙 陈修贵 王帅 樊伟丽 陈超 叶武威 《中国棉花》 2018年第6期10-11,28,共3页

利用生物信息学方法分析陆地棉脱水素基因GhDHN1的DNA序列结构特性,预测其功能。序列分析表明,GhDHN1基因的基因组DNA中AT碱基含量为52.16%,而内含子具有较高的AT碱基含量(63.33%);GhDHN1基因不含CpG岛;其内含子序列含有核心启动子元件T... 利用生物信息学方法分析陆地棉脱水素基因GhDHN1的DNA序列结构特性,预测其功能。序列分析表明,GhDHN1基因的基因组DNA中AT碱基含量为52.16%,而内含子具有较高的AT碱基含量(63.33%);GhDHN1基因不含CpG岛;其内含子序列含有核心启动子元件TATA框、启动子的增强子元件CAAT框,并含有参与光响应的保守DNA模块的部分元件(Box4)、赤霉素响应元件GARE-motif、生长素响应元件TGA元件等,说明该内含子可能参与了该基因的转录活动,可能受光、激素的诱导;GhDHN1内含子具有GT-AG规则的保守序列,推测GhDHN1基因具有保守的内含子剪接机制。 展开更多

关键词 陆地棉 脱水素基因GhDHN1 基因结构 内含子 生物信息学分析

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陆地棉焦磷酸酶基因GhVP的启动子序列分析

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作者 王俊娟 王帅 +7 位作者 阴祖军 王德龙 王晓歌 崔瑞峰 樊伟莉 郭丽雪 郭晓宁 叶武威 《中国棉花》 2017年第4期15-18,共4页

为了筛选棉花耐盐转基因育种所需的诱导型候选启动子,本研究根据陆地棉焦磷酸酶基因GhVP的cDNA序列和陆地棉基因组序列,获得陆地棉焦磷酸酶基因GhVP启动子序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该启动子具有多个基本元件TATA-box和C... 为了筛选棉花耐盐转基因育种所需的诱导型候选启动子,本研究根据陆地棉焦磷酸酶基因GhVP的cDNA序列和陆地棉基因组序列,获得陆地棉焦磷酸酶基因GhVP启动子序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该启动子具有多个基本元件TATA-box和CAAT-box,并含有多种逆境胁迫诱导相关的响应元件,含有丰富的光响应元件以及其他多种顺式作用元件。推测GhVP基因的转录同时受光、高温、干旱、创伤、脱落酸诱导,受生物钟控制的顺式元件调控,参与棉花的生长发育。 展开更多

关键词 棉花 陆地棉焦磷酸酶基因GhVP 启动子 序列分析

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陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南芥AtCOR47基因的比较

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作者 王俊娟 陆许可 +7 位作者 郭丽雪 阴祖军 王德龙 陈修贵 王帅 樊伟丽 陈超 叶武威 《中国棉花》 2018年第5期13-15,19,共4页

利用生物信息学分析了陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南AtCOR47基因的区别。结果发现,GhDHN1与拟南AtCOR47基因均有2个外显子,1个内含子;不同的是,AtCOR47基因的内含子和外显子均长于GhDHN1基因的。两个基因的内含子均有较高的AT含量,AtCO... 利用生物信息学分析了陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南AtCOR47基因的区别。结果发现,GhDHN1与拟南AtCOR47基因均有2个外显子,1个内含子;不同的是,AtCOR47基因的内含子和外显子均长于GhDHN1基因的。两个基因的内含子均有较高的AT含量,AtCOR47内含中AT的含量更高,两者外显子和内含子的剪接符合GT-AG规则。GhDHN1与AtCOR47基因所编码的蛋白质均为酸性,带负电荷,属于亲水性蛋白质,均属于SKn型脱水素,其氨基酸序列的一致性为45.2%;不同的是,AtCOR47比GhDHN1多一个保守性的K片段;GhDHN1和AtCOR47基因的启动子比较发现,2个基因的启动子中含有相似的响应非生物逆境胁迫的顺式作用元件和激素响应顺式作用元件,而GhDHN1拥有AtCOR47不具有的参与保卫与胁迫响应顺式作用元件TC-rich repeats,AtCOR47拥有GhDHN1不具有的乙烯响应元件。 展开更多

关键词 陆地棉 拟南芥 脱水素基因GhDHN1 AtCOR47 生物信息学

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