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禽呼肠孤病毒在我国部分地区蛋鸡群中的血清流行率和风险因素分析
被引量：
1
1
作者
郑好
杨霞
+8 位作者
张素
赵一萌
汤君宇
高丽
曹红
马国明
王占新
郑世军
王永强
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024年第3期1-8,共8页
禽呼肠孤病毒(ARV)在我国流行范围较广,感染家禽后使其出现病毒性关节炎、生长不良和产蛋量下降等表现,对我国养禽业造成较严重的经济损失。为了解我国蛋鸡群中ARV的流行情况及存在的感染风险因素,本试验在2022年11月—2023年3月从北京...
禽呼肠孤病毒(ARV)在我国流行范围较广,感染家禽后使其出现病毒性关节炎、生长不良和产蛋量下降等表现,对我国养禽业造成较严重的经济损失。为了解我国蛋鸡群中ARV的流行情况及存在的感染风险因素,本试验在2022年11月—2023年3月从北京、天津、河北、山东、河南、江苏、陕西、湖北和重庆9个省市的45个蛋鸡养殖场(其中包括祖代蛋鸡群、父母代蛋鸡群和商品代蛋鸡群),收集共计45份调查问卷和968份血清样本。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的ARV抗体,并结合调查问卷,采用单因素分析和逻辑回归分析方法找到蛋鸡出现ARV感染症状的风险因素。ELISA检测结果显示,968份血清样本中检出阳性863份,阳性率为89.15%(95%CI:87.0%~91.0%);单因素分析结果显示,全进全出饲养模式下的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著低于区域性全进全出饲养模式或不同日龄、不同批次混养饲养模式下的蛋鸡,且具有较强程度的关联(P<0.05,0.1<OR<0.3);生物安全防控严格的大、中型规模化养殖场(5万只以上)的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著低于生物安全防控存在不足的小型养殖场(2万~5万只)的蛋鸡,且具有较强程度的关联(P<0.05,0.1<OR<0.3);员工不注意对鸡舍消毒的养殖场饲养的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著高于员工对鸡舍具有较强或一般消毒意识的养殖场饲养的蛋鸡,具有中等程度的关联(P<0.05,1.5<OR<3.0)。综上所述,饲养模式、养殖场规模和员工对鸡舍的消毒意识可能是产蛋鸡群感染ARV的风险因素。
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关键词
蛋鸡
禽呼肠孤病毒(ARV)
抗体检测
风险因素
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职称材料
利用二代测序技术对柔嫩艾美耳球虫T-DNA整合位点的分析及鉴定
被引量：
1
2
作者
郝振凯
汤新明
+5 位作者
张媛媛
谢福杰
陈君敏
索静霞
索勋
刘贤勇
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期183-190,共8页
为建立一种适用于转基因球虫的快速且准确的分析T-DNA整合位点的方法,本研究利用二代测序技术对转基因柔嫩艾美耳球虫EtM2e虫株进行基因组重测序分析,基于嵌合体reads比对分析T-DNA的插入位点,通过T-DNA特有序列以及外源基因与球虫同源...
为建立一种适用于转基因球虫的快速且准确的分析T-DNA整合位点的方法,本研究利用二代测序技术对转基因柔嫩艾美耳球虫EtM2e虫株进行基因组重测序分析,基于嵌合体reads比对分析T-DNA的插入位点,通过T-DNA特有序列以及外源基因与球虫同源序列的测序深度进而分析T-DNA拷贝数,最后利用PCR扩增验证分析位点。结果表明:(1)二代测序下机数据过滤后获得数据7.2 Gb,Q20为96.1%,Q30为89.2%,能够比对至柔嫩艾美耳球虫参考基因组的reads数为23992361×2,平均测序深度为80×,reads全基因覆盖结果表明整个染色体被覆盖的较为均匀,测序的随机性比较好,可以进行后续分析;(2)比对至T-DNA序列的reads数为3106和3036,平均测序深度为140×,嵌合体reads序列信息表明T-DNA只存在一个插入位点,位于HG994969.1:2704213~2705255;(3)T载体骨架特有序列卡那抗性基因的平均测序深度为67×,T-DNA特有序列EYFP基因的平均测序深度为85×,而T-DNA与球虫同源序列His4基因的5′调控区序列的平均测序深度为154×,Actin基因的3′调控区序列的平均测序深度为164×,同源序列的平均测序约为特有序列平均测序深度的2倍,这表明T-DNA为单拷贝,与发现一个插入位点的结果相符合;(4)经PCR验证分析成功鉴定了该整合位点。转基因艾美耳球虫EtM2e虫株T-DNA整合位点的鉴定为后续转基因球虫鉴定提供了技术平台,也为球虫活载体疫苗的研发提供了一个潜在的靶位点。
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关键词
T-DNA整合位点
柔嫩艾美耳球虫
二代测序技术
转基因
原文传递
题名
禽呼肠孤病毒在我国部分地区蛋鸡群中的血清流行率和风险因素分析
被引量：
1
1
作者
郑好
杨霞
张素
赵一萌
汤君宇
高丽
曹红
马国明
王占新
郑世军
王永强
机构
中国农业大学
动物
医学院
兽医
公共卫生
安全
全国
重点
实验室
农业
农村部
动物
流行病学
重点
实验室
北农大科技股份有限公司
温氏食品集团股份有限公司广东省畜禽健康养殖与环境控制企业
重点
实验室
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024年第3期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金(32072850)。
文摘
禽呼肠孤病毒(ARV)在我国流行范围较广,感染家禽后使其出现病毒性关节炎、生长不良和产蛋量下降等表现,对我国养禽业造成较严重的经济损失。为了解我国蛋鸡群中ARV的流行情况及存在的感染风险因素,本试验在2022年11月—2023年3月从北京、天津、河北、山东、河南、江苏、陕西、湖北和重庆9个省市的45个蛋鸡养殖场(其中包括祖代蛋鸡群、父母代蛋鸡群和商品代蛋鸡群),收集共计45份调查问卷和968份血清样本。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的ARV抗体,并结合调查问卷,采用单因素分析和逻辑回归分析方法找到蛋鸡出现ARV感染症状的风险因素。ELISA检测结果显示,968份血清样本中检出阳性863份,阳性率为89.15%(95%CI:87.0%~91.0%);单因素分析结果显示,全进全出饲养模式下的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著低于区域性全进全出饲养模式或不同日龄、不同批次混养饲养模式下的蛋鸡,且具有较强程度的关联(P<0.05,0.1<OR<0.3);生物安全防控严格的大、中型规模化养殖场(5万只以上)的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著低于生物安全防控存在不足的小型养殖场(2万~5万只)的蛋鸡,且具有较强程度的关联(P<0.05,0.1<OR<0.3);员工不注意对鸡舍消毒的养殖场饲养的蛋鸡出现ARV感染症状的概率显著高于员工对鸡舍具有较强或一般消毒意识的养殖场饲养的蛋鸡,具有中等程度的关联(P<0.05,1.5<OR<3.0)。综上所述,饲养模式、养殖场规模和员工对鸡舍的消毒意识可能是产蛋鸡群感染ARV的风险因素。
关键词
蛋鸡
禽呼肠孤病毒(ARV)
抗体检测
风险因素
Keywords
layer chicken
avian reovirus(ARV)
antibody detection
risk factor
分类号
S851.312 [农业科学—预防兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
利用二代测序技术对柔嫩艾美耳球虫T-DNA整合位点的分析及鉴定
被引量：
1
2
作者
郝振凯
汤新明
张媛媛
谢福杰
陈君敏
索静霞
索勋
刘贤勇
机构
中国农业大学
动物
医学院
/
兽医
公共卫生
安全
全国
重点
实验室
/
农业
农村部
动物
流行病学
重点
实验室
中国
农业
科
学院
北京畜牧
兽医
研究所
中国农业大学
生物
学院
出处
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期183-190,共8页
基金
国家重点研发计划(2018YFD0500300,2016YFD0501300)
国家自然科学基金项目(32072884,31873007)。
文摘
为建立一种适用于转基因球虫的快速且准确的分析T-DNA整合位点的方法,本研究利用二代测序技术对转基因柔嫩艾美耳球虫EtM2e虫株进行基因组重测序分析,基于嵌合体reads比对分析T-DNA的插入位点,通过T-DNA特有序列以及外源基因与球虫同源序列的测序深度进而分析T-DNA拷贝数,最后利用PCR扩增验证分析位点。结果表明:(1)二代测序下机数据过滤后获得数据7.2 Gb,Q20为96.1%,Q30为89.2%,能够比对至柔嫩艾美耳球虫参考基因组的reads数为23992361×2,平均测序深度为80×,reads全基因覆盖结果表明整个染色体被覆盖的较为均匀,测序的随机性比较好,可以进行后续分析;(2)比对至T-DNA序列的reads数为3106和3036,平均测序深度为140×,嵌合体reads序列信息表明T-DNA只存在一个插入位点,位于HG994969.1:2704213~2705255;(3)T载体骨架特有序列卡那抗性基因的平均测序深度为67×,T-DNA特有序列EYFP基因的平均测序深度为85×,而T-DNA与球虫同源序列His4基因的5′调控区序列的平均测序深度为154×,Actin基因的3′调控区序列的平均测序深度为164×,同源序列的平均测序约为特有序列平均测序深度的2倍,这表明T-DNA为单拷贝,与发现一个插入位点的结果相符合;(4)经PCR验证分析成功鉴定了该整合位点。转基因艾美耳球虫EtM2e虫株T-DNA整合位点的鉴定为后续转基因球虫鉴定提供了技术平台,也为球虫活载体疫苗的研发提供了一个潜在的靶位点。
关键词
T-DNA整合位点
柔嫩艾美耳球虫
二代测序技术
转基因
Keywords
T-DNA insertion sites
Eimeria tenella
second-generation sequencing
transgene
分类号
S8559.1 [农业科学—临床兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
禽呼肠孤病毒在我国部分地区蛋鸡群中的血清流行率和风险因素分析
郑好
杨霞
张素
赵一萌
汤君宇
高丽
曹红
马国明
王占新
郑世军
王永强
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024
1
下载PDF
职称材料
2
利用二代测序技术对柔嫩艾美耳球虫T-DNA整合位点的分析及鉴定
郝振凯
汤新明
张媛媛
谢福杰
陈君敏
索静霞
索勋
刘贤勇
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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