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甜菜坏死黄脉病毒内蒙分离物自然缺失突变体缺失区域的定位分析 被引量:2
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作者 韩成贵 李大伟 +3 位作者 于嘉林 秦树才 杨莉莉 刘仪 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期49-53,共5页
以甜菜坏死黄脉病毒内蒙分离物 (BNYVVNM )总RNA为模板 ,经RT -PCR扩增 ,分别获得RNA2、RNA3和RNA4自然缺失突变体的cDNA克隆。序列分析结果表明 ,RNA2自然缺失突变体在 75kD通读蛋白编码区C端缺失 34 8个核苷酸 (缺失位置nt1488~nt183... 以甜菜坏死黄脉病毒内蒙分离物 (BNYVVNM )总RNA为模板 ,经RT -PCR扩增 ,分别获得RNA2、RNA3和RNA4自然缺失突变体的cDNA克隆。序列分析结果表明 ,RNA2自然缺失突变体在 75kD通读蛋白编码区C端缺失 34 8个核苷酸 (缺失位置nt1488~nt1835 )。RNA3在其 2 5kD蛋白编码区内缺失 36 0个核苷酸 (缺失位置nt72 9~nt10 88)。RNA4的自然缺失区域位于 31kD蛋白编码区 ,缺失 40 2个核苷酸 (nt70 2~nt110 3) ,缺失未造成移码 ,仍可编码产生一个由 148个氨基酸组成的蛋白。BNYVV内蒙分离物上述 3个RNA组分的自然缺失突变体的缺失区域 ,与国外报道的德国G1分离物和日本S分离物的自然缺失区域非常相似。同时 ,对自然缺失的可能机制及其在病害防治上的应用进行了讨论。 展开更多
关键词 甜菜坏死黄脉病毒 自然缺失突变体 序列分析
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我国部分省市草莓种苗中黄瓜花叶病毒的检测分析 被引量:8
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作者 王佳 周宇 +5 位作者 祝宁 陈柳 任俊达 杨爱珍 韩成贵 尚巧霞 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期649-656,共8页
为明确黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)在草莓上的发生和危害情况,利用RT-PCR方法对不同产地的不同品种草莓种苗进行检测,并对CMV草莓分离物的部分核苷酸序列进行了分析。结果表明,CMV侵染草莓后产生的症状主要为植株不同部位... 为明确黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)在草莓上的发生和危害情况,利用RT-PCR方法对不同产地的不同品种草莓种苗进行检测,并对CMV草莓分离物的部分核苷酸序列进行了分析。结果表明,CMV侵染草莓后产生的症状主要为植株不同部位的畸形、变色,但有些无明显症状的植株也可以检测出CMV。共检测了我国7个不同省市的220个草莓种苗样品,其中北京、云南、辽宁、河北、四川和陕西的草莓种苗样品中均可检出CMV,内蒙古的种苗中未检出CMV。检测的6个不同草莓品种均含CMV,但北京和内蒙古的‘红颜’种苗未检出CMV,云南的‘圣诞红’种苗CMV检出率仅为2.6%。利用RT-PCR技术扩增草莓种苗中CMV的特异性核苷酸片段并对PCR产物测序,得到包含部分外壳蛋白基因及3′端非编码区共430 bp的2个草莓分离物序列。获得的2个分离物序列的核苷酸序列同源性为90.97%,序列比对分析结果表明2个分离物分属于CMV不同亚组,其中北京草莓分离物Bjcmz归属于亚组IA,河北分离物Hbcmc归属于亚组IB。 展开更多
关键词 草莓 黄瓜花叶病毒 病害调查 RT-PCR
原文传递
小麦黄色花叶病毒RNA2自然缺失突变体的筛选和定位分析 被引量:4
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作者 张卫华 杨军 +2 位作者 韩成贵 李大伟 于嘉林 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第1期80-85,共6页
许多真菌介体传播的病毒在机械接种过程中易于发生自然缺失。利用在小麦上连续机械接种WYMV的方法,自第27代起,利用RT-PCR和Northern blot方法在感病小麦中检测到一个WYMV RNA2的缺失突变株,序列分析发现缺失区域位于RNA2的214~280... 许多真菌介体传播的病毒在机械接种过程中易于发生自然缺失。利用在小麦上连续机械接种WYMV的方法,自第27代起,利用RT-PCR和Northern blot方法在感病小麦中检测到一个WYMV RNA2的缺失突变株,序列分析发现缺失区域位于RNA2的214~2808nt,共计2595nt,并在缺失区域的两端存在7个碱基的反向互补序列。缺失区域上游紧邻这7个碱基双链区存在一富含AU的短序列,并据此对此D-RNA2的缺失机制进行了讨论。 展开更多
关键词 WYMV 机械接种 RNA2缺失突变株
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小麦黄色花叶病毒不同分离物外壳蛋白(CP)基因序列的比较分析
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作者 韩成贵 李大伟 +5 位作者 于嘉林 邢怡明 朱坤 田兆丰 蔡祝南 刘仪 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期216-220,共5页
核苷酸序列分析结果表明, 小麦黄色花叶病毒(W YMV) 不同分离物的外壳蛋白基因存在一定的差异。邓州分离物CP基因在其31~33nt处均缺失了3个核苷酸,其余分离物与潢川分离物及日本分离物长度一致, 均为882nt。不... 核苷酸序列分析结果表明, 小麦黄色花叶病毒(W YMV) 不同分离物的外壳蛋白基因存在一定的差异。邓州分离物CP基因在其31~33nt处均缺失了3个核苷酸,其余分离物与潢川分离物及日本分离物长度一致, 均为882nt。不同分离物CP基因核苷酸序列同源性为97.3% ~98.9% , 由此推导的氨基酸序列同源性为97.6% ~99.3% ,外壳蛋白N 末端的110个氨基酸和 C末端的55个氨基酸在各个分离物间是高度保守的。潢川分离物有5个氨基酸与其它5个分离物明显不同。W YM V 不同分离物外壳蛋白序列分析结果进一步确认了W YM V 与 WSSMV 为 Bym ovirus 属的2种不同病毒。 展开更多
关键词 小麦 黄色花叶病毒 分离物 外壳蛋白基因
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