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基于孟德尔随机化研究探讨肠道菌群与肌少症表型的因果关联
1
作者
王宁
刘彦哲
+4 位作者
吴紫莺
曾超
雷光华
沙婷婷
王伊伦
《中华老年骨科与康复电子杂志》
2023年第6期333-342,共10页
目的:本研究拟采用MR研究设计,以探讨肠道菌群与肌少症表型指标——握力和骨骼肌质量之间的因果关联。方法:数据来源于英国生物银行数据库和公开发表且可获取数据的全基因组关联研究,选择131种肠道具体菌属的遗传变异作为工具变量。单...
目的:本研究拟采用MR研究设计,以探讨肠道菌群与肌少症表型指标——握力和骨骼肌质量之间的因果关联。方法:数据来源于英国生物银行数据库和公开发表且可获取数据的全基因组关联研究,选择131种肠道具体菌属的遗传变异作为工具变量。单核苷酸多态性(SNPs)筛选标准包括在全基因组水平显著关联、SNP之间相互独立以及工具变量的强度足够高。只有当F>10才被认为是一个足够强的工具变量,具有较低的工具偏倚可能性。采用逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法,采用加权中位数法、MR Pleiotropy RESidual Sum and Outlier(MR-PRESSO)法以及"留一法"作为敏感性分析方法,评估131种肠道具体菌属与握力和骨骼肌质量之间的因果关联。使用MR-PRESSO方法检验水平多效性和解决异质性。结果:本研究共纳入324976名研究对象。工具变量SNPs数量为3~22,遗传预测因子效度检验的最小F值为14.6。IVW结果提示,共计9个经遗传学预测的肠道特定菌属与握力之间存在因果关联(P<0.05),其中Alloprevotella菌属(β=0.012 kg,95%CI:0.002,0.022)和Sellimonas菌属(β=0.014 kg,95%CI:0.006,0.022)相对丰度与握力水平呈现正向因果关联;Olsenella菌属(β=-0.012 kg,95%CI:-0.023,-0.001)和Paraprevotella菌属(β=-0.014 kg,95%CI:-0.023,-0.004)和握力水平呈现负向因果关联。并且,此4个肠道特定菌属与宿主握力之间的因果关联在不同MR敏感性分析方法中均存在统计学差异,提示结果稳定可靠,MR-PRESSO结果提示受水平多效性和异质性影响的可能较小。此外,本研究还发现,共计7个经遗传学预测的肠道特定菌属与骨骼肌质量之间存在因果关联(P<0.05),其中Eubacterium nodatum group菌属(β=0.069 kg,95%CI:0.012,0.125)与骨骼肌质量呈现正向因果关联;Erysipelatoclostridium菌属(β=-0.090 kg,95%CI:-0.162,-0.019)和Ruminococcaceae UCG011菌属(β=-0.104 kg,95%CI:-0.199,-0.010)与骨骼肌质量呈现负向因�
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关键词
肠道菌群
肌少症
孟德尔随机化
原文传递
题名
基于孟德尔随机化研究探讨肠道菌群与肌少症表型的因果关联
1
作者
王宁
刘彦哲
吴紫莺
曾超
雷光华
沙婷婷
王伊伦
机构
中南大学
湘雅医院
骨
科
中南大学
湘雅医院
老年
骨关节
疾病防治
教育部
重点
实验室
中南大学
湘雅医院
国家
老年
疾
病
临床医
学
研究中心
中南大学
湘雅医院
骨关节
退变与损伤湖南省
重点
实验室
出处
《中华老年骨科与康复电子杂志》
2023年第6期333-342,共10页
基金
湖南省自然科学基金项目(2022JJ40821)
中南大学湘雅医院青年科研基金项目(2021Q14)。
文摘
目的:本研究拟采用MR研究设计,以探讨肠道菌群与肌少症表型指标——握力和骨骼肌质量之间的因果关联。方法:数据来源于英国生物银行数据库和公开发表且可获取数据的全基因组关联研究,选择131种肠道具体菌属的遗传变异作为工具变量。单核苷酸多态性(SNPs)筛选标准包括在全基因组水平显著关联、SNP之间相互独立以及工具变量的强度足够高。只有当F>10才被认为是一个足够强的工具变量,具有较低的工具偏倚可能性。采用逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法,采用加权中位数法、MR Pleiotropy RESidual Sum and Outlier(MR-PRESSO)法以及"留一法"作为敏感性分析方法,评估131种肠道具体菌属与握力和骨骼肌质量之间的因果关联。使用MR-PRESSO方法检验水平多效性和解决异质性。结果:本研究共纳入324976名研究对象。工具变量SNPs数量为3~22,遗传预测因子效度检验的最小F值为14.6。IVW结果提示,共计9个经遗传学预测的肠道特定菌属与握力之间存在因果关联(P<0.05),其中Alloprevotella菌属(β=0.012 kg,95%CI:0.002,0.022)和Sellimonas菌属(β=0.014 kg,95%CI:0.006,0.022)相对丰度与握力水平呈现正向因果关联;Olsenella菌属(β=-0.012 kg,95%CI:-0.023,-0.001)和Paraprevotella菌属(β=-0.014 kg,95%CI:-0.023,-0.004)和握力水平呈现负向因果关联。并且,此4个肠道特定菌属与宿主握力之间的因果关联在不同MR敏感性分析方法中均存在统计学差异,提示结果稳定可靠,MR-PRESSO结果提示受水平多效性和异质性影响的可能较小。此外,本研究还发现,共计7个经遗传学预测的肠道特定菌属与骨骼肌质量之间存在因果关联(P<0.05),其中Eubacterium nodatum group菌属(β=0.069 kg,95%CI:0.012,0.125)与骨骼肌质量呈现正向因果关联;Erysipelatoclostridium菌属(β=-0.090 kg,95%CI:-0.162,-0.019)和Ruminococcaceae UCG011菌属(β=-0.104 kg,95%CI:-0.199,-0.010)与骨骼肌质量呈现负向因�
关键词
肠道菌群
肌少症
孟德尔随机化
Keywords
Gut microbiota
Sarcopenia
Mendelian randomization
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于孟德尔随机化研究探讨肠道菌群与肌少症表型的因果关联
王宁
刘彦哲
吴紫莺
曾超
雷光华
沙婷婷
王伊伦
《中华老年骨科与康复电子杂志》
2023
0
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